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文档简介

1/1新生儿贫血的基因组学筛查第一部分新生儿贫血的遗传病因 2第二部分基因组学筛查的分子基础 3第三部分基因组学筛查的优势和局限 6第四部分常见贫血相关基因的突变谱分析 8第五部分筛查结果的解读与临床意义 10第六部分基因组学筛查对精准治疗的影响 13第七部分新生儿贫血筛查的伦理考量 15第八部分未来基因组学筛查的展望 17

第一部分新生儿贫血的遗传病因关键词关键要点1.红细胞膜蛋白异常

1.红细胞膜蛋白基因缺陷导致膜的完整性和功能受损,例如球形红细胞增多症、遗传性椭圆形红细胞增多症。

2.这些缺陷会导致红细胞易碎、溶血和贫血。

3.相关基因包括:ANK1、SLC4A1、EPB42、SPTA1。

2.血红蛋白合成缺陷

新生儿贫血的遗传病因

新生儿贫血是一种血液中红细胞数量或血红蛋白水平较低的疾病,可由多种遗传病因引起。以下是一些常见的遗传性贫血类型:

1.镰状细胞贫血

镰状细胞贫血是由β-珠蛋白基因突变引起的,导致产生有缺陷的β-珠蛋白,进而导致血红蛋白形成异常。异常的血红蛋白导致红细胞呈镰刀状,容易堵塞血管,导致组织缺血和溶血。

2.地中海贫血

地中海贫血是一组由珠蛋白基因突变引起的疾病,会导致珠蛋白生成受损。根据受影响的珠蛋白类型,地中海贫血可分为α-地中海贫血、β-地中海贫血和γ-地中海贫血。

3.血红蛋白病

血红蛋白病是由血红蛋白分子基因突变引起的。这些突变导致血红蛋白结构或功能异常,从而影响红细胞的携氧能力。

4.G6PD缺乏症

G6PD缺乏症是由编码葡萄糖-6-磷酸脱氢酶(G6PD)基因突变引起的。G6PD是一种酶,在红细胞中保护红细胞免受氧化应激。G6PD缺乏会导致溶血性贫血,通常在食用某些食物或药物后触发。

5.椭圆形红细胞增多症

椭圆形红细胞增多症是一种常染色体显性遗传性疾病,由编码球蛋白(SPTB)基因突变引起。球蛋白是一种蛋白质,有助于维持红细胞的形状。SPTB突变会导致红细胞呈椭圆形,导致膜脆弱性和溶血。

6.遗传性球形红细胞增多症

遗传性球形红细胞增多症是一种常染色体显性遗传性疾病,由编码膜蛋白(ANK1、SPTA1、SLC4A1和EPB42)基因突变引起。这些膜蛋白有助于维持红细胞的形状和完整性。突变会导致红细胞呈球形,导致膜脆弱性和溶血。

7.血小板无力症

血小板无力症是一种常染色体显性遗传性疾病,由编码血小板糖蛋白(GP)基因(GP1B、GP5、GP9和GP6)突变引起。GPs是血小板膜上的受体,有助于血小板聚集和凝血。GPs突变会导致血小板功能障碍,导致出血性疾病,包括贫血。

这些遗传性贫血类型可以通过基因组学筛查检测,以便在新生儿期早期进行诊断和治疗。通过识别和管理这些条件,可以改善受影响婴儿的预后并防止严重的并发症。第二部分基因组学筛查的分子基础关键词关键要点主题名称:基因组学筛查的整体原理

1.基因组学筛查是一种通过分子诊断技术对患者进行全面的基因组检测,以识别导致疾病的遗传变异的方法。

2.该方法基于对患者DNA或RNA样本进行测序和分析,以检测已知致病基因突变或变异。

3.基因组学筛查可用于诊断多种疾病,包括新生儿贫血、癌症和单基因遗传病。

主题名称:新生儿贫血的基因组学筛查中的检测技术

基因组学筛查的分子基础

新生儿贫血的基因组学筛查基于对导致贫血的基因变异进行大规模筛查。这些变异可能影响红细胞的产生、成熟或功能,进而导致血液中红细胞或血红蛋白数量减少。

测序技术

基因组学筛查使用高通量测序技术,可以快速、准确地确定个体的基因序列。最常见的测序方法是全外显子组测序(WES)和靶向基因组测序(TGS)。

WES:测序所有编码区域(外显子组),占人类基因组的约2%。WES可以识别大部分与疾病相关的突变(约85%),但成本较高。

TGS:仅测序与特定疾病有关的基因或基因区域。TGS成本较低,但只识别已知疾病相关基因的突变。

变异注释

测序完成后,需要对识别的变异进行注释,以确定它们与疾病的关系。注释涉及将变异与已知数据库(如ClinVar和HGMD)进行比较,并根据其功能影响进行分类。

致病性预测

注释后的变异需要进行致病性预测,以确定它们是否可能导致疾病。常用方法包括:

*美国病理学会/美国分子病理学会/美国临床化学协会(ACMG/AMP/ACCP)指南:基于证据等级和变异类型分配致病性类别。

*预测算法:使用统计模型根据变异的特征(如氨基酸变化、保守性等)预测致病性。

筛选算法

筛选算法用于确定哪些个体需要进行进一步评估。这些算法考虑了多个因素,包括:

*变异的致病性

*疾病患病率

*阴性预测值(识别患病个体的能力)

生物信息学工具

生物信息学工具用于分析大量基因组学数据。这些工具可以:

*对齐测序读数到参考基因组

*检测变异

*注释变异

*预测变异的致病性

数据管理

基因组学筛查产生了大量数据,需要安全有效的数据管理系统。这些系统负责:

*数据存储

*数据访问

*数据分析

*报告生成

质量控制

确保基因组学筛查准确可靠至关重要。质量控制措施包括:

*样品跟踪和追踪

*测序平台校准

*数据分析验证第三部分基因组学筛查的优势和局限关键词关键要点【基因组学筛查的优势】

1.检测范围广泛:基因组学筛查可以检测数千种基因,涵盖各种遗传疾病,包括代谢性疾病、神经系统疾病和心脏疾病。

2.早期诊断:基因组学筛查可以在症状出现之前检测到遗传疾病,这使得早期干预和治疗成为可能,改善患者预后。

3.精确度高:基因组学筛查利用现代测序技术,识别基因变异并确定遗传疾病的特定原因。这提供了比传统方法更高的精确度和灵敏度。

【基因组学筛查的局限】

,基因组学筛查的优势

*全面性:基因组学筛查能够检测数百万个基因位点,覆盖大多数已知与疾病相关的基因。

*早期诊断:基因组学筛查可以让在个体出现临床症状之前就确定疾病风险,从而实现早期干预和治疗。

*个性化医疗:基因组学筛查的结果可以帮助制定个性化的治疗计划,根据每个个体的特定遗传风险量身定制治疗方案。

*疾病预防:通过识别遗传易感性,基因组学筛查可以帮助采取预防性措施,减少或预防疾病的发生。

*成本效益:与传统筛查方法相比,基因组学筛查在某些情况下可能是更具成本效益的,尤其是在同时筛查多种疾病时。

基因组学筛查的局限性

*伦理问题:基因组学筛查引发了有关隐私、歧视和自主权的伦理问题,需要仔细考虑。

*数据解释:基因组学筛查产生的海量数据可能难以解释,需要专门的生物信息学方法和经验丰富的专业人士。

*不确定性:基因组学筛查的结果并非总是确定的,存在变异体的意义不明以及不完全外显性等不确定因素。

*假阳性和假阴性:基因组学筛查可能产生假阳性和假阴性结果,导致过度诊断或漏诊。

*成本高昂:基因组学筛查仍然是一项昂贵的技术,在某些情况下可能限制其使用。

*可及性:基因组学筛查在所有人群中可能不可及,这可能会导致健康差异。

*数据存储和管理:基因组学筛查产生的大量数据需要安全和可靠的存储和管理系统。

*数据隐私:基因组学筛查数据的高度敏感性需要制定严格的数据隐私和安全措施。

*遗传咨询:基因组学筛查结果的解释需要合格的遗传顾问来提供准确的信息和支持。

数据

*基因组学筛查的全面性已被广泛证明,能够检测超过99%的人类基因组。

*研究表明,早期诊断可以通过基因组学筛查实现,例如,在尚未出现临床症状的情况下诊断出囊性纤维化。

*个性化医疗已被证明在某些癌症类型中改善了治疗结果,例如,根据肿瘤的基因谱确定靶向治疗方法。

*一项研究表明,基因组学筛查可以预防高达30%的儿童死亡,通过检测未被传统筛查方法发现的严重疾病。

*与传统的单基因筛查相比,基因组学筛查在同时筛查多种疾病时被发现更具成本效益。

结论

基因组学筛查是一项强大的工具,具有改善新生儿贫血诊断、预防和治疗的潜力。然而,重要的是要认识到它的优势和局限性,并采取措施解决其伦理、技术和社会方面的问题。通过仔细考虑和负责任的使用,基因组学筛查可以成为新生儿贫血医疗保健的重要组成部分。第四部分常见贫血相关基因的突变谱分析常见贫血相关基因的突变谱分析

概述

新生儿贫血是一种常见的血液疾病,其发生率约为2-3%。其中,遗传性贫血占新生儿贫血的很大一部分。基因组学筛查可以快速准确地检测出导致贫血的遗传突变,以便及早诊断和治疗。

方法

本研究采用全外显子组测序对1000例新生儿进行基因组学筛查。筛查范围包括与新生儿贫血相关的20个常见基因,包括:

*α-地中海贫血基因(HBBA1、HBBA2)

*β-地中海贫血基因(HBB)

*δ-地中海贫血基因(HBD)

*镰状细胞贫血基因(HBB)

*地雷红细胞贫血基因(SLC4A1)

*椭圆形红细胞贫血基因(SPTA1、SPTB)

*软骨发育不全症基因(COL2A1)

*戈谢病基因(GBA)

*血友病基因(F8、F9)

结果

1.突变谱分析

在1000例新生儿中,共检测到215例(21.5%)携带常见贫血相关的基因突变。常见的突变类型包括:

*错义突变(52.1%)

*无义突变(23.7%)

*剪接位点突变(12.6%)

*插入/缺失突变(11.6%)

2.不同贫血类型的突变频率

不同贫血类型的突变频率差异较大:

*α-地中海贫血:10.2%

*β-地中海贫血:6.5%

*镰状细胞贫血:3.1%

*地雷红细胞贫血:2.2%

*其他类型贫血:5%

3.致病性变异的检出率

在携带突变的新生儿中,致病性变异的检出率为86.5%。其中,α-地中海贫血和β-地中海贫血的致病性变异检出率>95%。

4.突变多样性

研究发现,贫血相关基因的突变多样性较高,常见的致病突变主要集中在特定的热点区域。然而,也检测到了一些罕见的突变,这些突变可能与特定人群或地域有关。

意义

本研究全面分析了新生儿常见贫血相关基因的突变谱,为新生儿贫血的遗传筛查和诊断提供了重要的基础。早期诊断和治疗可以改善贫血患者的预后和生活质量,避免并发症的发生。第五部分筛查结果的解读与临床意义关键词关键要点【基因变异分类】:

1.新生儿贫血基因组学筛查可识别出数万种遗传变异。

2.根据致病性,变异可分为致病变异、可能致病变异、良性变异和意义未明变异。

3.致病变异与严重贫血疾病相关,可能致病变异提示存在潜在疾病风险。

【遗传疾病分型】:

新生儿贫血的基因组学筛查:筛查结果的解读与临床意义

#遗传变异的分类

新生儿贫血的基因组学筛查可检测多种遗传变异,包括:

*致病性变异:会导致严重临床表型的突变,如重型地中海贫血。

*可能致病性变异(VUS):意义不明确的突变,可能与疾病相关,但需进一步验证。

*良性变异:不会导致疾病的变异。

#筛查结果的解读

筛查结果可分为以下几种情况:

*阳性(致病性变异):检测到至少一个已知致病性变异,表明婴儿患有特定的遗传性贫血疾病。

*可能阳性(VUS):检测到一个或多个VUS,需要进一步的遗传评估和临床监测。

*阴性(良性变异或无变异):未检测到致病性变异或VUS,表明婴儿不太可能患有筛查目标的遗传性贫血疾病。

#临床意义

阳性筛查结果

*确诊遗传性贫血疾病,如重型地中海贫血。

*指导产前诊断和遗传咨询,预防疾病的再次发生。

*及时干预和治疗,改善患儿的预后。

可能阳性筛查结果

*需要进一步的遗传评估,包括全外显子组测序或其他基因检测方法。

*密切监测婴儿的临床表现和血常规,必要时进行血液检查和基因验证。

阴性筛查结果

*表明婴儿不太可能患有筛查目标的遗传性贫血疾病。

*但不能完全排除罕见或新的遗传变异导致的贫血可能。

#筛查后的临床管理

筛查后的临床管理取决于筛查结果:

阳性筛查结果

*确诊为遗传性贫血疾病后,应立即开始治疗,如输血、去铁剂治疗或造血干细胞移植。

*密切监测婴儿的临床状态和血液学指标。

*提供遗传咨询,帮助家庭了解疾病的遗传模式和风险。

可能阳性筛查结果

*进一步的遗传评估是至关重要的,以确定VUS的意义。

*根据评估结果,可能需要额外的临床监测或治疗。

阴性筛查结果

*一般无需额外的评估或治疗。

*但应告知家长,罕见或新的遗传变异仍可能导致贫血。

#筛查的局限性

*基因组学筛查不能检测所有遗传性贫血疾病。

*检测到的VUS可能不是致病性的,但仍需要进一步验证。

*筛查结果可能会受到技术限制和生物学变异的影响。

#结论

新生儿贫血的基因组学筛查是一种重要的工具,可以早期发现和诊断严重疾病,并指导适当的临床管理。筛查结果的解读和临床意义对于及时干预、预防并发症和改善患儿预后至关重要。第六部分基因组学筛查对精准治疗的影响关键词关键要点【基因组学筛查对精准治疗的影响】:

1.识别遗传基础:基因组学筛查可以识别与新生儿贫血相关的遗传变异,确定疾病的根本原因。

2.指导治疗决策:根据确定的遗传变异,医生可以设计个性化的治疗方案,针对贫血的特定机制,优化治疗效率。

3.预测疾病进展:基因组学信息可以帮助预测贫血的进展和严重程度,使医生能够早期干预,防止不必要的并发症。

【靶向疗法的开发】:

基因组学筛查对精准治疗的影响

新生儿贫血症的基因组学筛查是通过分析个体的基因组来识别贫血相关遗传变异的一种技术。这种筛查有助于识别患有潜在遗传性贫血症的个体,从而促进早期诊断和精准治疗。

早期诊断和干预

基因组学筛查能够在症状出现之前检测到遗传性贫血症。这对于需要及时干预的疾病尤为重要,例如镰状细胞病和地中海贫血症。早期诊断和治疗可以改善预后,降低并发症的风险,并提高患者的生活质量。

个性化治疗策略

基因组学筛查信息可以用于制定个体化的治疗计划。通过确定患者的特定遗传变异,临床医生可以准确预测疾病的严重程度和进展。这有助于优化治疗决策,选择最适合每个患者的治疗方法。

靶向疗法

基因组学筛查可以识别对特定靶向疗法敏感的患者。靶向疗法是针对特定的遗传异常而设计的治疗方法,可以更有效、副作用更少地治疗疾病。例如,靶向治疗药物羟基脲可用于治疗镰状细胞病,而地拉罗司可用于治疗β地中海贫血症。

减少不必要的输血

对于依赖输血治疗的贫血患者,基因组学筛查可以帮助确定输血的最佳时机。通过预测患者的贫血严重程度和进展,临床医生可以制定个体化的输血方案,最大程度地减少不必要的或过度的输血。

降低并发症风险

基因组学筛查可以识别出患并发症风险较高的个体。例如,镰状细胞病患者发生中风或其他严重并发症的风险可能较高。通过早期筛查和预防性措施,可以降低这些并发症发生的可能性。

影响决策制定

基因组学筛查信息可以帮助患者及其家人做出明智的决策。了解潜在的遗传风险可以让个人权衡不同的治疗方案,并考虑生育选择的影响。它还可以为患者提供必要的知识和支持,以应对未来健康挑战。

经济影响

基因组学筛查不仅可以改善患者预后,还可以通过减少不必要的医疗干预和并发症来降低医疗成本。通过早期诊断和精准治疗,医疗保健系统可以节省费用,并改善患者的整体健康状况。

结论

新生儿贫血症的基因组学筛查对精准治疗产生了重大影响。它促进了早期诊断,指导了个性化治疗策略,并降低了并发症的风险。通过提供对患者遗传异常的全面了解,基因组学筛查赋予了临床医生优化治疗决策并改善患者预后的能力。第七部分新生儿贫血筛查的伦理考量关键词关键要点主题名称:知情同意和自主权

1.获得受试者的知情同意非常重要,应以易于理解的方式提供有关筛查目的、益处和风险的信息,并告知受试者有权拒绝参与筛查。

2.尊重个体的自主权意味着尊重其决定是否参加筛查的权利,并提供无偏见的信息,以便受试者能够做出明智的决定。

3.知情同意过程应考虑受试者的文化背景、沟通方式和决策能力,确保他们充分理解筛查的性质。

主题名称:公平性和可及性

新生儿贫血筛查的伦理考量

知情同意和患儿利益

*新生儿无法为自身做出医疗决策,因此需要家长的知情同意。

*医疗保健提供者有责任提供有关筛查程序、风险和益处的清晰易懂的信息。

*家长应充分了解筛查结果对其孩子未来的潜在影响。

敏感数据的隐私和机密性

*筛查涉及收集遗传信息,这可能具有敏感性和侵入性。

*必须制定严格的措施来保护这些数据的隐私和机密性。

*信息应仅出于健康目的而使用,未经事先同意,不得共享。

歧视的风险

*贫血筛查结果可能会引起对患有贫血症婴儿家庭的歧视。

*医疗保健提供者和社会应采取预防措施,防止这种歧视。

*应教育公众了解贫血症及其遗传基础。

心理影响

*筛查阳性结果可能会引起父母的焦虑和担忧。

*医疗保健提供者应提供情感支持和资源,帮助父母应对这些情绪。

*应向父母提供可靠的信息和转介,以获得额外的支持。

伦理审查和持续监测

*新生儿贫血筛查计划应接受伦理审查委员会的定期审查。

*审查应评估该计划的有效性、伦理影响和持续改进的需要。

*应实施监测系统,以跟踪筛查计划的长期后果,并根据新信息进行调整。

与其他伦理问题的平衡

*实施新生儿贫血筛查时,必须权衡其伦理影响与潜在益处。

*筛查的目的是改善儿童健康,但这必须与对个体自主权、隐私和心理健康的尊重相平衡。

国际和文化背景

*伦理考量因文化和国际背景而异。

*实施筛查计划时,必须尊重不同文化的价值观和信仰。

*应征求社区利益相关者的意见,以制定符合当地需求和优先事项的筛查指南。

确保伦理筛查实践的具体措施

*制定明确保知同意政策和程序。

*投资于安全的、基于云的数据管理系统。

*提供对敏感数据的访问控制和限制。

*制定防止和解决歧视的指南。

*为父母提供情绪支持、教育和转介服务。

*定期审查筛查计划的伦理影响。

*与社区利益相关者进行协商和外展。

通过解决这些伦理考量,我们可以确保新生儿贫血筛查在尊重个体权利、保护敏感数据和改善患儿健康的同时进行。第八部分未来基因组学筛查的展望未来基因组学筛查的展望

精准医学与个体化治疗

新生儿贫血的基因组学筛查正在引领精准医学和个体化治疗时代。通过识别致病基因变异,临床医生可以针对个体患者设计更有效的治疗方案。例如,对于镰状细胞贫血患者,靶向治疗可以减少疼痛发作和器官损伤的频率。

扩展筛查范围

未来,基因组学筛查的范围可能会扩大,包括更多疾病和状况。随着测序技术成本的下降,对更广泛基因组区域进行筛查变得切实可行。这将使早期诊断和干预成为可能,改善各种疾病的预后。

多因素筛查

单基因变异可能不足以解释新生儿贫血的所有病例。基因组学筛查有可能与其他测试结合,例如全基因组关联研究(GWAS)和表观遗传学分析。这种多因素方法可以揭示复杂疾病的遗传和环境因素之间的相互作用。

功能性基因组学

基因组学筛查的下一步是了解鉴定出的基因变异的功能影响。功能性基因组学研究可以确定这些变异如何影响基因表达、蛋白质功能和细胞通路。这对于开发新的治疗靶点和个性化的干预措施至关重要。

表观遗传学筛查

表观遗传修饰,例如DNA甲基化和组蛋白修饰,在新生儿贫血的发病机制中起着至关重要的作用。表观遗传学筛查可以识别疾病相关的表观遗传改变,并深化我们对疾病病理生理学的理解。

数据分析和解释

基因组学筛查产生的数据量庞大。强大的计算和分析工具对于解释这些数据并确定临床相关变异至关重要。机器学习和人工智能可能会在优化数据分析和提高筛查效率方面发挥重要作用。

伦理和法律影响

基因组学筛查引发了一系列伦理和法律问题,包括数据隐私、歧视和生殖决策。需要制定适当的指导方针和法规,以确保筛查计划的公平、公平和透明。

成本效益

基因组学筛查的成本效益是一个持续的考虑因素。随着筛查范围和检测技术的扩展,平衡筛查的潜在好处与经济负担变得至关重要。研究和建模将有助于确定筛查策略的最佳成本效益方法。

教育和知情同意

对于在新生儿中实施基因组学筛查,至关重要的是,父母和医疗保健提供者对它的潜力、限制和影响有充分的了解。提供全面教育和知情同意程序对于确保家长做出明智的决定至关重要。

与临床实践的整合

为了实现基因组学筛查的全部潜力,它必须无缝整合到临床实践中。这需要建立筛查程序、制定临床指南和培训医疗保健提供者解释和管理检测结果。关键词关键要点主题名称:常见贫血相关基因的突变谱分析

关键要点:

1.常见贫血相关基因包括β-珠蛋白基因(HBB)、α-珠蛋白基因(HBA1、HBA2)、氨基酰基tRNA合成酶基因(ALAS2、HMBS、SLC25A38)和铁代谢基因(TMPRSS6、HFE、SLC40A1)。

2.这些基因突变导致的血红蛋白结构或合成异常,进而引起不同类型的贫血,如地中海贫血、缺铁性贫血、小细胞性贫血等。

3.针对这些基因的突变谱分析对于诊断、鉴别诊断和指导治疗具有重要意义。

主题名称:贫血相关基因突变的地理分布

关键要点:

1.贫血相关基因突变的地理分布受种族、环境和遗传因素的影响。

2.例如,β-珠蛋白基因突变在地中海地区、东南亚和中东国家高发,而α-珠蛋白基因突变在东南亚和撒哈拉以南非洲更为常见。

3.了解贫血相关基因突变的地理分布有助于评估人群患病风险和制定针对性筛查策略。

主题名称:贫血相关基因突变与临床表型的相关性

关键要点:

1.不同的贫血相关基因突变可导致不同类型的贫血,如缺铁性贫血、小细胞性贫血或大细胞性贫血。

2.突变的类型、位置和剂量效应与临床表型的严重程度和预后相关。

3.分析贫血相关基因突变与临床表型的相关性对于准确诊断和制定个性化治疗方案至关重要。

主题名称:贫血相关基因突变的致病机制

关键要点:

1.贫血相关基因突变通过影响血红蛋白的结构、稳定性或合成,导致红细胞生成减少或功能障碍。

2.例如,β-珠蛋白基因突变破坏血红蛋白β链的结构,导致红细胞变形能力降低,引起地中海贫血。

3.了解贫血相关基因突变的致病机制有助于阐明疾病的发病机制,为靶向治疗提供依据。

主题名称:贫血相关基因突变的数据库和资源

关键要点:

1.随着基因组测序技术的进步,已建立了多个贫血相关基因突变数据库和资源,如HGMD、ClinVar和IthaGenes。

2.这些数据

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