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文档简介
1/16种疱疹类病毒特异性酶切图谱的建立及其应用分析2003渐江大学硕士学位论文6种疱疹类病毒特异性酶切图谱的建立及其应用研究浙江大学医学院儿科学硕士研究生董关萍导师尚世强主任医生中文摘要疱疹病毒属中具有代表性的是单纯疱疹病毒I型与II型(HSVI/II)、爱一马尔病毒(EBV)、入巨细胞病毒(CMV)、水痘一带状疱疹病毒(VZV)和人类毒6型(HHV6)这6种病毒,它们是免疫功能低下者临床常见的病原体,尤其胞、体液免疫系统不成熟,易导致疱疹类病毒感染。
疱疹类病毒感染后其临床体征没有特异性,而且临床又缺乏有效的诊断方法。
在本研究中,我们在疱疹较保守的DNA多聚酶基因上自行设计两对共用引物,分别对6种病毒进行聚反应(PCR)及限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP),最终建立了PCR-RFL快速检测病毒DNA的方法,并对临床标本迸行检测取得较好结果。
第一部分疱疹类病毒特异性酶切图谱的建立厂。
方法:
在疱疹类病毒高度同源序列。
NA多聚酶基因中设计两对通用引物扩增单纯疱疹病毒I型与II型、爱泼斯坦一马尔病毒、人巨细胞病毒四种病毒,另一2003浙江大学硕士学位论文HSVII(G株)、CMV(ADl69株)、EBV(B95-8株)、VZV(EF株)和(HHVPCR扩增,并对扩增产物进行分子克隆、序列分析,选择B锄HI和BstUI两种内切--PCR产物进行酶切。
结果:
6种标准病毒株PCR扩增后产物为510~592bp,其最小检出量为龟,与乙型肝炎病毒、真菌、细菌和人类基因组无交叉反应。
发现G卜C含量在EBV、HSVI/II中较多,分别为60.2%、61.5%、66.2%和67.5%,VzVHHV6则较低分别为40.5%、,13.2%。
CMV扩增产物(592bp)内含8个BstUI点,经BstUI酶切后产生170bp、130bp、80bp、62bp、50bp、40bp、316bp和14bp9个DNA片段,但不能被BamHI酶切;EBV520bp长度内含1BamHI和1个BstUl酶切位点,经BamHI酶切成250bp和270bp,被Bst成254bp和266bp;HSVI全长含7个BstUI酶切位点,经BstUI酶切后230bp、130bp、50bp、40bp、23bp、20bp、15bp和10bp8个段,但无BamHl酶切位点;HSVII含1个BamHl及9个BstUI酶切位点,经mHI酶切成230bp和288bp,但被BstUI切成168bp、90bp、80bp、60bp、40bp、30bp、20bp、15bp、10bp、和5bpl0个D段。
酶切后凝胶电泳能将HSVI/HSVII、EBV、CMV鉴别出来。
VZV无BamHl点,而含1个BstUI酶切位点,切成280bp和230bp两个片段;HHV6被切成243bp和2
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