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文档简介
ICS11.220
B41
DB34
安徽省地方标准
DB34/T3660—2020
鸭肝炎病毒1型和3型双重RT-PCR
检测方法
DuplexRT-PCRassayfordetectionofduckhepatitisvirustype1andtype3
文稿版次选择
2020-08-03发布2020-09-03实施
安徽省市场监督管理局发布
DB34/T3660—2020
前言
本标准按照GB/T1.1-2009给出的规则起草。
本标准由安徽省农业科学院畜牧兽医研究所提出。
本标准由安徽省农业标准化技术委员会归口。
本标准起草单位:安徽省农业科学院畜牧兽医研究所、安徽省动物疫病预防与控制中心、太湖县小
池镇农业农村综合服务中心、合肥野生动物园、铜陵市动物疫病预防与控制中心、铜陵市义安区畜牧兽
医局。
本标准主要起草人:潘孝成、占松鹤、沈学怀、何学丰、郭长进、范萍萍、尹磊、赵瑞宏、戴银、
何为俊、吴娟、胡晓苗、侯宏艳、周学利、张丹俊、周迎春、王军。
I
DB34/T3660—2020
鸭肝炎病毒1型和3型双重RT-PCR检测方法
1范围
本标准规定了鸭肝炎病毒1型(DHV-1)和鸭肝炎病毒3型(DHV-3)双重RT-PCR检测方法的技术要求。
本标准适用于鸭病变肝组织、接种疑似病料的鸭胚尿囊液或细胞培养物中DHV-1型和DHV-3型核酸的
检测。
2缩略语
下列缩略语适用于本文件。
DHV:鸭肝炎病毒(duckhepatitisvirus)
RT-PCR:反转录聚合酶链式反应(reversetranscription-polymerasechainreaction)
RNA:核糖核酸(ribonucleicacid)
DNA:脱氧核糖核酸(deoxyribonucleicacid)
DEPC:焦炭酸二乙酯(diethylpyrocarbonate)
Taq酶:TaqDNA聚合酶(TaqDNApolymerase)
dNTP:脱氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleosidetriphosphate)
M-MLV:莫洛尼氏鼠白血病病毒(moloneymurineleukemiavirus)
PBS:磷酸缓冲液(phosphatebuffersolution)
TAE:Tris-乙酸电泳缓冲液(trisacetate-EDTAbuffer)
EB:溴化乙锭(ethidiumbromide)
3主要仪器
3.1PCR扩增仪。
3.2台式低温高速离心机(最大离心力12000g以上)。
3.3电泳仪。
3.4凝胶成像系统。
3.5冰箱(-20℃;-80℃)。
3.6微波炉。
3.7分析天平(感量0.01g)。
3.8水浴锅。
3.9微量移液器(2.5µL;10µL;200µL;1000µL)。
4试剂
4.1RNA抽提试剂:Trizol或其他商品化RNA提取试剂。
4.2氯仿、异丙醇、无水乙醇,均为分析纯。
1
DB34/T3660—2020
4.3M-MLV反转录酶。
4.4RNA酶抑制剂。
4.5DEPC处理的灭菌水。
4.6TaqDNA聚合酶。
4.7dNTP。
4.8DNA分子标准(DNAMarker)。
4.9RT-PCR反应试剂。
4.10EB(10µg/µL)或核酸染料。
4.11磷酸盐缓冲液(PBS,0.01mol/L,pH7.2),见附录A中的A.1。
4.1250×TAE电泳缓冲液,见附录A中的A.2。
4.131%琼脂糖凝胶,见附录A中的A.3。
4.14引物:DHV-1扩增上游引物,5’-GGTGATTCTAACCAGTTGGGG-3’,下游引物,
5’-TTCAATTTCCAGATTGAGTTCAAA-3’;DHV-3扩增上游引物,5’-GATGTAGTTATGGTGCTTAGACGC-3’,下游
引物,5’-ACGAACCAGCCATTGACG-3’,引物浓度均为10pmol/µL。
4.15阳性对照样品:DHV-1和DHV-3鸭胚接种尿囊液毒;阴性对照样品:正常鸭胚尿囊液。
5样品的采集及处理
5.1采样工具
15mL离心管、1.5mL离心管、剪刀、镊子和研钵,经121(±2)℃,15min高压灭菌并烘干。
5.2采样与处理
5.2.1鸭病变肝组织
采取病死或剖杀鸭的肝组织1g左右,按1:5倍体积加入0.01mol/LpH7.2PBS,研磨冻融3
次,装入15mL灭菌离心管中,8000g离心10min,取上清液转入1.5mL离心管中,-80℃保存备
用。
5.2.2鸭胚尿囊液和细胞培养物
鸭胚尿囊液、细胞培养物冻融3次,转入1.5mL离心管中,-80℃保存备用。
6RT-PCR检测
6.1RNA提取
6.1.1用Trizol或其他商品化RNA提取试剂提取待测样品、阳性对照和阴性对照样品的RNA。
6.1.2200μL的样品和800μLTrizol置于一个1.5mL离心管,反复颠倒混匀,室温静置5min。
6.1.312000g4℃离心5min,吸取上清液移入新的离心管中,加入200μL氯仿,剧烈振荡15s,
室温静置5min。
6.1.412000g4℃离心15min,吸取上清液移入新的离心管中(注意不要吸出中间层),加入等体
积异丙醇,上下颠倒混匀,室温静置10min。
6.1.512000g4℃离心10min,小心弃去上清液,加入75%乙醇1mL(DEPC水配制)。
6.1.612000g4℃离心5min,弃去乙醇,室温干燥2~5min,加入适量DEPC水,-80℃保存备用。
2
DB34/T3660—2020
6.2反转录(cDNA合成)
6.2.1在PCR反应管中依次加入:OligodTPrimerorRandomPrimers1μL,dNTPs(10mmol/L)1μL,
检测样品RNA3μL,DEPC水6μL。
6.2.2水浴锅或PCR仪中,65℃作用5min,冰上急冷2min。
6.2.3在上述反应管中再依次加入:
——5×RTBuffer4μL,RNaseInhibitor(40U/μL)0.5μL,M-MLV反转录酶(200U/μL)1μL,
DEPC水3.5μL。
6.2.4PCR仪中,42℃作用60min,再70℃作用15min,-20℃保存备用。
6.3PCR反应
6.3.1PCR反应体系
10×PCRBuffer2.5μL,DHV-1和DHV-3上游引物各1μL,DHV-1和DHV-3下游引物各1μL,
dNTPs(2.5mmol/L)2μL,TaqDNA聚合酶0.25μL,反转录产物5μL,灭菌去离子水11.25μL,
总反应体系25μL。
6.3.2PCR反应条件
94℃5min;94℃1min,52℃50s,72℃1min,35个循环;72℃10min。
6.4电泳检测
将PCR扩增产物5μL与2μL上样缓冲液混合,点样于1%琼脂糖凝胶板加样孔中,琼脂糖凝
胶板一侧点样孔加入DNAMarkerIII,缓冲液为1×TAE,以5V/cm电压电泳30min左右。电泳后,
置于凝胶成像系统下观察,根据DNA分子质量大小(DNAmarker)判断RT-PCR扩展产物大小。
7结果判定
7.1当阳性对照在预期大小的位置720bp和642bp出现特异性条带,阴性对照均未出现预期大小
目的条带时,实验结果成立。
7.2被检样品在720bp位置出现特异性条带为DHV-1核酸阳性,被检样品在642bp位置出现特异
性条带为DHV-3核酸阳性。如图1所示。
3
DB34/T3660—2020
图中:
M——DL2000Marker;
1——阳性对照样品;
2——DHV-1阳性样品;
3——DHV-3阳性样品;
4——阴性对照样品。
图1PCR扩增电泳图
4
DB34/T3660—2020
AA
附录A
(规范性附录)
试剂配制
A.10.01mol/LpH7.2磷酸盐缓冲液(PBS)的配制
A.1.10.2mol/L磷酸氢二钠溶液:称取磷酸氢二钠(Na2HPO4·12H2O)71.6g,先加适量灭菌去离子
水溶解,最后定容至1000mL,混匀。
A.1.20.2mol/L磷酸二氢钠溶液:称取磷酸二氢钠(NaH2PO4·H2O)27.6g,先加适量灭菌去离子水
溶解,最后定容至1000mL,混匀。
A.1.3量取0.2moL/L磷酸氢二钠溶液36mL,0.2mol/L磷酸二氢钠溶液14mL,称取氯化钠8.
5g,加灭菌去离子水800mL,调pH值至7.2,最后定容至1000mL,4℃保存。
A.2电泳缓冲液(50倍)
A.2.10.5mol/L乙二铵四乙酸二钠(EDTA)溶液(pH8.0)
二水乙二铵四乙酸二钠(分析纯)18.61g
灭菌双蒸水80mL
氢氧化钠(分析纯)
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