DB65新疆褐牛种牛遗传评估方法

新疆褐牛种牛遗传评估方法TheTechnicalRegulationofGeneticEvaluationinXinjiangBrownCattle2017-05-20实施2017-05-20实施新疆维吾尔自治区质量技术监督局发布本标准根据GB/T1.1-2009《标准化工作导则第1部分：标准的结构和编写》的要求编写。本标准由新疆维吾尔自治区畜牧厅提出并归口。本标准由新疆农业大学负责起草。本标准主要起草人：黄锡霞、王雅春、付雪峰、田可川、郭志I库七七标准下载1范围2术语和定义种牛Cattlestud数量性状Quantitativetrait经济性状Economictrait1库七七标准下载是对两个性状间遗传关系的强度和方向(正或负)的估计，是由于基因不平衡造成的。系谱Pedigree系谱鉴定Thepedigreeappraising3遗传参数估计4.2.1突出主要经济性状，一般以2个~4个为宜；2DB65/T3991—20174.2.3对希望数值变小的性状选择，加权值为负；4.2.4对负相关的性状尽可能合并为一个性状来处理；4.2.5选择指数法参照附录C。4.3最佳线性无偏预测法BLUP(BestLinearUnbiasedPrediction)4.3.1适用于大群体中的育种值估计；4.3.2实际应用时可用相关软件进行计算和估测；4.3.3BLUP育种值估计方法参照附录D。3库七七标准下载..…..自由度母亲平方和女儿平方和母女乘积和公牛间公牛内4库七七标准下载rw——为各测量的表型值间的表型相关，当信息来源是一个个体多次度量均值时，r,等于多次度量的重复率re;bw——公牛内母女回归系数；SSw——公牛内组内乘积和平方和；SPw——公牛内平方和；D.,——为供测后裔该性状的表型平均值；0——为供测后裔同期畜群该性状的表型平均值；表A.2产奶量统计n233号274号435号5库七七标准下载由表1计算方差、协方差、自由度分析结果如下表A.3:表A.3公牛内女母平方和及乘积和自由度母亲平方和女儿平方和母女乘积和公牛间4公牛内利用回归系数计算遗传力可得：利用相关系数计算遗传力可得：A.2同胞资料估计遗传力一般有半同胞组内相关法和全同胞组内相关法两种，在牛的某些性状遗传力估计中，一般利用半同胞资料估计遗传参数。利用半同胞组内相关法估计遗传力，所有随机模型如下：式中：y;;为观测值；u为总体均值；s;为公牛效应；e,为随机误差效应；各效应均以偏差形式表示，即，如有S头公牛，每一头公牛有ni个半同胞子女，其中第j个子女的表型值为X;,利用单因素方差分析方法得到表2的结果，k₀是有效平均子女数，在近似条件下，因半同胞间的亲缘系数r(HS=0.25;因此遗传力估计值为公式(A.4):6o³——公牛间方差；k₀——种公牛的有效(加权)平均女儿头数，如各公牛(s)子女数不相等需要套用加权平均自由度平方和公牛间公牛内估计值的准确性(抽样方差):7库七七标准下载当后代总数(N=sn)固定时，可使抽样方差达到最小。k₀种公牛的有效(加权)平均女儿头数，如各公牛(s)子女数不相等需要套用加权平均8表A.5半同胞资料遗传力估计显著所需最低样本量遗传力9876549库七七标准下载库七七www.kqqw库七七标准下载公牛号123456789X12自由度公牛间公牛内a)模块一，MTDFNRM是用来计算分子血缘相量的影响不显著(P>0.05);年*季、年*胎次2组交互作用对产奶量有极显著影响(P<0.01);季*初产月龄、产犊间隔*初产月龄2组交互作用对产奶(2)利用单性状重复观测值模型，把所有个体的各种效应直接列入MME(混合模型方程组)中，运(3)方差组分和遗传力估计值，结果在76,如下表A.8重复力遗传力残差比例信息表型值可剖分为决定该表型值的育种值和剩余值，P'=A+R,一般情况下均设可得库七七标准下载—h²(这时n=2)非近交，两亲本解：代入公式(B.1):根据半同胞表型值估算个体育种值的公式为：n——半同胞个数；bAP——个体育种值对信息表型值的回归系数或加权系数；P₅——供选个体该性状的平均表型值；P——供选个体同胞同期畜群该性状的平均表型值；B.2.4根据后裔资料估计育种值根据后裔的生产性能和外貌等特征来估测种畜的育种值和遗传组成，以评定其种用价值，是家畜选种的重要技术和方法。同胞测定的最宜数目，设测定总容量为T,若选留S头公畜，则每一公畜可测定的子女数，测定比为k=T/S.若每一公畜测定n个子女，则可测定的公畜数为。因此公畜留种率p:式中：S——选留的公畜数；S-——可测定的公畜数；k——测定比。……库七七标准下载库七七标准下载解：将已知数据代入公式(B.5)、(B.6):利用半同胞兄妹信息可得：根据计算结果，可与其他个体相应的估计育种值进行高低对比，确定是否选留。B.3多种亲属信息育种值估计利用各种亲属信息估计个体育种值时，单独利用一项信息总有一定的局限性，不能达到充分利用信息、尽可能提高育种效率的目的。利用多种亲属信息估计育种值时，可用多元回归的方法，公式如下：X₁——第i种亲属信息的表型值；b,——被估个体育种值的偏回归系数；X——信息表型值向量；b——偏回归系数向量。解：先求矩阵V、C,计算偏回归系数b₁:库七七标准下载(规范性附录)I Ih;第i个性状的遗传加权值(遗传力);P.待评估性状表型值之间的方差-协方差矩阵；A各信息性状与目标性状育种值之间的协方差矩阵；x'--[x₁X₂…xm].在制定选择指数时，首先获得性状遗传力、表型方差、经济加权值、表型相关和遗传相关等参数，然后建立性状表型方差、协方差矩阵和育种值方差，根据公式求解出各偏回归系数，最后将各个性状表型值X,或它的离均差值代入公式计算个体的指数值。示例8:对某公牛站的青年公牛进行综合选择指数计算，目标性状为乳脂量和日增重。已知一状记录：母亲乳脂量PDi=170kg,对应均数为140kg;父亲日增重Ps₂=1180g,对应均数为1290g;本身日增重两性状的经济加权值和有关遗传参数为：W乳脂率(1)日增重(2)1.3元解：先求矩阵V,D,A,w,结果如下：Cov(PD₁,PE₂)=rA(P₃,Pr₂)·Cov(A₁,A₂)=0.5×6Cov(P₂,Pe₂)=Cov(As₂,Az₂)=FACP₂P₃)×σ²₂=0.5于是：…新疆乌鲁木齐种牛场1985年6月-2008年8月754头新疆褐牛4014个泌乳期和17962条月测定记PTAM——PTAF——产奶量育种值；PTASDC——外貌评分育种值；其中，公式中20为指数系数，50、22.5、5为各性状相对经济重要性加权指数，分母为各性状表型值的遗传标准差，分子为各性状估计育种值。将产奶量、乳脂率、乳蛋白率和体型评分的EBV值(EstimatedBreedingValue)依据相对经济重要性加权构成一个总性能指数(TPI,TotalPerformanceIndex),TPI值反映育种目标性状的综合育种值，公式如下：制定出新疆褐牛总性能指数如下：EBVM——产奶量育种值；EBVP——乳蛋白率育种值；其中，公式中20为指数系数，50、22.5、5为各性状相对经济重要性加权指数，分母为各性状表型值的遗传标准差，分子为各性状估计育种值。库七七标准下载库七七标准下载(规范性附录)D.1BLUP的混合模型公式a——该个体的加性遗传效应(育种值),是随机效应；e随机残差(主要由随机环境效应所致)。如有n个个体的观察值，需要对s个个体估计育种值(s≥n),则对这n个观测值用下面的以矩阵表b——所有(固定)环境效应的向量；差矩阵为：var(e)=R=Io²。e——随机残差(主要由随机环境效应所致)。对公式(D.5)用矩阵形式表示为令b₁——所有(固定)环境效应的向量；Z₁——a₁的关联矩阵；第二个性状的模型为Y₂——所有n个观测值的向量；b₂——所有(固定)环境效应的向量；a₂——s个个体的育种值向量；e2——随机残差效应向量。令则令y=Xb+Za+e其中g₁和g₂2分别为第一个性状和第二个性