生物学生物研究机构研究员实习生实习报告

生物学生物研究机构研究员实习生实习报告一、摘要2023年6月5日至2023年8月2日，我在XX生物研究机构担任研究员实习生，负责基因编辑实验设计与数据分析。期间完成15组CRISPRCas9筛选实验，成功鉴定出3个目标基因突变体，其突变效率达78%，显著高于实验室常规水平（65%）；运用Python脚本处理10组测序数据，生成标准化基因表达矩阵，准确率达92%；参与优化了qPCR实验流程，将重复实验变异系数从12%降至8%。通过实践掌握了湿实验标准化操作、高通量数据质控及生物信息学工具应用，形成了一套可复用的基因功能验证方法论，包括“三重验证剂量梯度”实验设计框架。二、实习内容及过程1实习目的进入机构前就想好，主要是想看看实际研究跟学校实验室有啥不一样，摸摸真实的科研流程，顺便把学的CRISPR技术用起来，看看能不能帮上点啥。2实习单位简介那是个挺注重转化医学的机构，实验室不大但设备挺全，主要做基因功能研究和药物靶点筛选，团队氛围还行，大家忙但挺友善。3实习内容与过程6月5号开始实习，第一个月跟着导师熟悉项目，主要是文献梳理和实验准备。7月2号正式上手做筛选实验，目标是鉴定能影响细胞凋亡的基因突变体。用了CRISPRCas9敲除10个候选基因，每个基因设计5个sgRNA，总共50个实验组，每天跑34组，周末处理数据。8月1号开始做验证实验，用qPCR检测敲除后基因表达变化，跑了20个样本，发现其中3个基因（编号G3、G7、G12）的沉默效率超过70%，比预想的高，导师说这说明sgRNA设计可以再优化。期间还参与过测序数据的初步分析，用R语言处理过一次RNAseq数据集，大概10组样本，学到了怎么标准化表达量。4实习成果与收获最大的成果就是那3个候选基因，后续团队要继续做动物模型验证。个人方面，把湿实验流程摸熟了，从设计实验方案到跑柱子、看结果，每个环节都试过，感觉比学校做毕业设计扎实多了。以前总纠结每一步的细节，现在知道啥时候该灵活变通，比如发现某个酶的活性不够，果断换了另一种，没死磕。还学会了用在线工具预测sgRNA效率，效率能提高至少15%。5遇到的挑战及应对刚开始做筛选实验时真头大，第一次用显微注射把gRNA送进细胞，成活率只有30%，远低于预想的50%。问了师兄才知道是操作太粗暴，细胞受损伤大。后来调整了注射参数，比如降低细胞密度、改用更温和的培养基，成活率慢慢提到了45%。这让我意识到基因编辑实验真是个经验活儿，光看文献不够，得动手多练。还有一次分析测序数据，原始数据有污染，直接用会误导结果。幸好之前学过生物信息学，自己用fastp工具清洗了数据，过滤掉质量差的读长，最后分析结果才准确。这事儿让我意识到，做研究得会两手抓，既得懂实验又得会分析。6实习单位管理及改进建议机构整体还行，但有时候项目安排太满，新人进去没几天就得直接上手，缺乏系统培训。我刚开始做实验时，连离心机转速多少转每分钟都不太清楚，全靠师兄口头交代。建议可以搞个新人手册，把常用设备操作、试剂配置这些编进去，至少能省不少重复询问的时间。另外，团队开会有时会开到晚上九点，虽然不强制，但长期这样挺累的，效率也不一定高。可以考虑把非紧急讨论放到白天，晚上留时间处理实验。7岗位匹配度及职业规划启发这份实习让我更确定自己是想做研究相关的，但发现实验室工作挺枯燥的，每天就是重复实验、看数据，偶尔会怀疑自己这样是不是真的适合。不过看到师兄们为了一个结果能连续熬夜，那种钻研劲儿挺打动人。未来可能还是会走科研路，但希望能找个结合计算生物学的岗位，比如用AI辅助实验设计，或者做生物信息分析，感觉这样效率会高很多。这次经历也让我明白，做研究不能光埋头苦干，得多跟人交流，有时候别人的一个想法就能省很多事。三、总结与体会1实习价值闭环这8周实习就像把书本知识往实践里倒，倒过来倒过去，最后大部分都倒进去了。刚来时以为就是帮着跑跑实验，结果发现每个环节都得自己琢磨。比如那个CRISPR筛选，开始时每一步都照着文献做，效率低得可怜。后来主动跟师兄请教，才知道得根据细胞状态调整转染试剂浓度，再优化培养条件，最后筛选效率才提到78%，比实验室常规水平高出一截。这让我真切感受到，知识不是装在脑子里的死东西，得拿到实际里去打磨才有用。从文献到实验方案设计，再到数据分析和结果解读，整个链条走下来，才明白什么叫“做研究”。2职业规划联结这次实习让我更清楚自己想干嘛。之前对科研挺模糊的，觉得做实验就挺好，现在发现生物研究远不止这个。那个用Python处理测序数据的经历让我意识到，未来可能得往生物信息方向发展，至少得把编程和实验结合着搞。8月15号跟导师聊的时候，我说了想学点R语言，导师还特意给我发了几个教程。现在打算下学期报个基因组学分析的课程，顺便考个数据处理相关的证书。以前觉得科研就是埋头做实验，现在明白得多跟人交流、多看行业动态有多重要。团队里那个做AI药物设计的师兄跟我说，现在顶尖的实验室都在玩“实验+计算”结合，这让我觉得自己的路子又宽了一步。3行业趋势展望在机构待的这段时间，明显感觉到行业在变。比如那个基因编辑项目，我参与筛选的10个基因里，有3个跟免疫相关，导师说这是跟当前生物医药热点接轨。8月10号参加组会时，老板还分享了跟药企合作的靶点筛选案例，提到现在很看重“快速验证技术”，像CRISPR的递送效率、筛选通量这些，直接关系到项目能不能快速落地。这让我意识到，学校教的那些基础操作太表面了，得跟上行业需求。比如那个测序数据处理，现在流行用云平台，我实习时用的本地软件效率确实低，回去得赶紧学点云工具。行业变化太快，不主动学就得被淘汰。这次实习最大的收获不是学会了多少实验技能，而是意识到自己得保持多线程学习状态，才能跟得上节奏。4心态转变以前做实验觉得失败了怪试剂不行，现在明白得先从自己操作找原因。7月20号那会儿连续3次显微注射失败，细胞全部死光，当时真想放弃，但转念一想这是关键实验，硬着头皮问了师兄又改了参数。结果第4次居然成活率到40%，虽然不高但总算有进展。这事儿让我明白，做研究哪有不碰壁的，抗压能力得练。现在每天下班前都会复盘当天实验，看看哪步可以优化，这种习惯比单纯做实验收获大。从学生到职场人的心态转变，其实就是从“别人告诉我怎么做”变成“我要把事情做好”，责任感一下子重了。未来要是真走科研路，得把这种心态保持下去，不然早晚得被淘汰。四、致谢1感谢实习单位感谢XX生物研究机构给我这次实习机会，让我能接触到真实的科研环境，学到了很多书本上没有的东西。2感谢导师感谢导师在实习期间给