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文档简介

生物学生物科技公司研发助手实习报告一、摘要

2023年7月1日至2023年8月31日,我在一家生物科技公司的研发助手岗位实习。通过参与三个基因编辑项目的实验设计与数据整理,我独立完成PCR扩增实验200次,成功率达到92%,并协助优化了CRISPRCas9系统的切割效率,使靶向基因突变率从15%提升至28%。在项目中应用了分子生物学实验流程标准化操作,掌握了高通量测序数据分析软件R语言的基本操作,通过处理5000条测序数据,提取出3个潜在药物靶点。总结出可复用的实验误差控制方法论,包括梯度实验设计减少变量干扰,以及双盲验证提高结果可靠性。

二、实习内容及过程

1实习目的

我找这份实习就是想看看基因编辑这行到底是怎么回事,实际操作和课本上差多少,顺便积累点项目经验,为以后找工作打基础。

2实习单位简介

那家公司主要搞细胞治疗和基因疗法开发,实验室有做CRISPR、单细胞测序什么的,技术栈挺全。我在的团队专门做遗传病模型构建,挺有挑战性。

3实习内容与过程

整个8周里,我跟着师兄做了两个项目。第一个是给某种罕见病构建iPSC模型,我负责基因敲除验证。从设计sgRNA开始,跑了30多组实验,用T7E1法检测,最后挑出3个效率最高的,效率最高的那组能达到45%。第二个项目是帮别人整理测序数据,那数据量真吓人,得有5000条左右的WGBS数据,我用了R语言处理,画热图的时候差点把电脑CPU干烧,最后整理出3个可能跟疾病相关的候选位点。期间还参与了细胞培养,学了怎么用流式看分选效果,刚开始计数老出错,后来每天练着练着就准了。

4遇到的问题

最难的是有一次做CRISPR实验,靶向效率突然掉到10%以下,师兄让我查原因,我傻站着不知道从何查起。后来自己翻文献,发现可能是脱靶效应,又重新设计了验证实验,最后发现是Mg2+浓度没调对。这下明白做实验不能光埋头干,得懂底层原理。

5实习成果与收获

我独立完成了200多次PCR,成功率92%,这个数据比之前团队平均水平高5个百分点。另外把测序分析流程标准化了,以后别人接手数据直接用我写的代码跑就行。最大的收获是意识到自己动手能力还差点,比如细胞传代这种活儿我刚开始手很抖。但总的来说,确实把理论知识用上了,比如知道怎么根据基因位置选合适的sgRNA。

6对职业规划的影响

这次实习让我更确定要往基因编辑方向发展了,但发现做技术岗还是得练实验,我这种书生气有点重。以后打算多去实验室转转,少刷文献。

7现存问题

那公司培训确实不够,来了8周都没给我讲过核心设备像Nanopore测序怎么用,都是自己偷偷问师兄。而且研发部跟生产部沟通挺乱的,我见过好几次因为工艺参数没说清楚导致实验返工。

8改进建议

建议新员工最好配个带教师傅,每周固定时间讲讲设备操作和项目背景。另外可以搞个内部知识库,把SOP、常见问题都整理好,省得大家反复问。最关键的是跨部门会议要强制参加,比如研发和生产的每周例会,这样信息传递才准确。

三、总结与体会

1实习价值闭环

这8周就像把课本知识掰开了揉碎了,真正用在了刀刃上。7月15号第一次做细胞转染,看着显微镜里不均匀的细胞就急得满头大汗,后来师兄教我调培养基浓度,到8月10号做稳转实验时终于能拿到GFP表达均一的细胞群。从最初连流式细胞仪参数都看不懂,到后来能独立跑完CRISPR验证的整个流程,每一步都挺扎实的。特别是整理那5000条WGBS数据时,白天盯着电脑屏幕到晚上头疼,但第二天把R语言包更新了下,结果里那些虚假的峰值就消失了,那一刻觉得挺有成就感的。这让我明白,做科研不能只靠聪明,还得有耐心和动手能力。

2职业规划联结

以前觉得做研发就是埋头做实验,现在发现得懂项目管理才行。比如8月3号我负责的iPSC模型项目进度拖后了两天,就是因为我没提前预留质粒纯化时间,导致下游测序受影响。这让我意识到,以后想当技术负责人,光会操作是不够的。接下来打算补补PMP知识,顺便去考个基因编辑工程师认证,现在网上那些课程多的是,比如那家叫做BioBridge的机构就有线上课。另外,我发现做单细胞测序分析特别吃香,那家公司我的师兄做这个能拿3万多的月薪,看来这块是未来重点。

3行业趋势展望

这段时间看得最清楚的就是,现在基因治疗领域特别缺懂转化医学的人。我参与的那个遗传病项目,老板最后让我写报告时,反复强调要结合临床表型。8月25号参加组会时,一个老员工跟我说现在行业趋势是AI辅助药物设计,他们最近在用AlphaFold看蛋白质结构,这让我觉得以后做研发得不断学新工具。另外,那些搞基因治疗的企业特别注重GMP培训,现在连实验室的物性检测都要求按药典标准来,看来以后考证得抓紧。不过也有点担心,现在CRISPR领域卷得厉害,听说有些公司为了抢项目把实验条件降得厉害,导致脱靶率爆表,这种短视行为长期看肯定不行。

4心态转变

最明显的变化是抗压能力。刚开始实验失败就整晚睡不着,现在能冷静分析了。比如8月8号做质粒提取时,第一次只得到50ng/ul的质粒,当时真想砸仪器,后来查到是Vortex速度没调对,重新来过就好了。现在想想,职场跟学校真不一样,没人会手把手教你,但换个角度这也让人成长快。另外,看到师兄们为了项目连续加班到12点,那种对科研的热爱特别感染人,现在我也开始主动留实验室待到关灯。这种责任感是以前在学校体会不到的。

5未来计划

现在就把实习中用的那些SOP整理成文档,打算下学期申请学校那个基因编辑专项训练班,把那个脱靶分析的系统再学深点。另外,那家公司用的某些细胞计数软件特别好用,打算自学下Python写个类似的工具。如果下份实习能接触到更复杂的基因编辑系统就太好了,比如碱基编辑或者类转录激活因子效应物系统,现在看相关文献都看得停不下来。

四、致谢

1

感谢那家公司给我这个实习机会,让我在基因编辑领域有了初步的实践。特别感谢我的导师,从实验设计到数据分析都给了我很多具体的指导,比如教我如何根据基因位置选择sgRNA时考虑PAM序列附近的二级结构。还有实验室的同事们,那些关于细胞

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