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1301I 2 3 4 5本文件按照GB/T1.1—2020《标准化工作导则第1部分：标准化文件的结构和起草规则》的规定请注意本文件的某些内容可能涉及专利。本文件的发布机构不承担识别专利的责任。1太行鸡保种效果评价技术规范本文件规定了太行鸡保种效果评价的基本要求、评价项目、赋分规则及结果判定等要GB/T30989高通量基因测序NY/T823家禽生产性能名词术语和度量计算方法NY/T1901—2010鸡遗传资源保种场保种技术规范NY/T2996—2016家禽遗传资源濒危等级评定4基本要求4.2保种群4.2.1数量4.2.2外貌特征4.3档案记录1)全国畜牧总站组编.中国畜禽遗传资源（2011-2020年）[M].北京2现场应有完整规范的档案记录，包括保种技术方案、系谱记录、群体性能观测记录等，符合NY/T5评价项目5.1.1测定指标及数量表1太行鸡保种效果评价常规指标、测定日123455.1.2测定方法5.1.3测定频次5.2遗传多样性指标5.2.1测定指标有效群体含量(Ne)、多态信息含量（PIC）5.2.2测定方法5.2.2.1系谱分析法35.2.2.2全基因组重测序法代30只公鸡和至少每个家系3只继代母鸡个体血样，共应至少采集12利用全基因组重测序技术获取测定个体SNP等遗传变异5.2.2.2.3近交系数（FROROH——基因组上的长纯合片段；k——个体中ROH的数量，单位为个；L——基因型数据覆盖的常染色体基因组5.2.2.2.4多态信息含量（pIC）计算公式pIC=1-∑1pi2-∑-11∑EQ\*jc3\*hps15\o\al(\s\up4(n),j)=i+12pi2pj2············pi——第i个等位基因频率；pj——第j个等位基因频率；n——等位基因数。6.1.2与资源志描述的太行鸡指标相比，指标的实测值在其范围内得满分，数值上下浮动30%以上不Cn=100-sn×100···································································(3)sn——实测平均值超出资源志指标范围的百分数。6.2档案资料4世代观测群饲养数量有一代低于NY/T1901—2010中第6章的规定，应判定保种效果评价结果为不7.1.3.1基于系谱分析的遗传多近交系数F100＞0.05或有效群体含量（Ne）＜650只均判定保种效果评价结果为不合格。7.1.3.2基于全基因组的遗传多7.2合格评价结果为合格，其中80分≤综合赋分≤90分判定为良好，90分＜综合赋分≤100分判定为优秀。5保种群家系、继代繁育的母鸡//////性/近交系数F100＞0.05或有效群体含量//基于全基因组测序：近交系数息含量（PIc）///

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