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文档简介
细胞基因组的提取演示文稿第一页,共22页。(优选)细胞基因组的提取第二页,共22页。核酸制备时应注意的事项:①尽量简化操作步骤,缩短提取过程。②减少化学因素对核酸的降解。③减少物理因素对核酸的降解:机械剪切力和高温④防止核酸的生物降解。
3、核酸制备的一般原则一、实验原理第三页,共22页。核酸制备的步骤:破碎细胞提取纯化I.材料准备II.破碎细胞或包膜-内容物释放III.核酸分离、纯化IV.沉淀或吸附核酸,并去除杂质
V.核酸溶解在适量缓冲液或水中第四页,共22页。核酸酶的抑制和抑制剂降低温度,改变pH及盐的浓度,都利于对核酸酶活性的抑制,但均不如利用核酸酶抑制剂更有利,当然,几个条件并用更好。对于DNA,抑制DNase活力很容易,但防止机械张力拉断则更重要。对于RNA,因分子较小,不易被机械张力拉断,但抑制RNase活力较难,故在RNA提取中设法抑制RNase更重要。4、核酸制备的一般方法和原理一、实验原理第五页,共22页。核酸酶的抑制和抑制剂DNase抑制
①加入少量金属离子螯合剂,如0.01mol/LEDTA或柠檬酸钠,DNase基本可以全部失活。②去垢剂、蛋白变性剂及DNase抑制剂也可使DNase失活。第六页,共22页。核酸酶的抑制和抑制剂RNase抑制①操作要带手套。②所有器皿要严格消毒,③试剂处理④低温操作⑤在分离过程中要加入一定的RNase抑制剂。
第七页,共22页。核酸制备中常用的去垢剂核酸本身带负电荷,结合带正电荷的蛋白质。用于核酸提取的去垢剂,一般都是阴离子去垢剂,去垢剂的作用:1.溶解膜蛋白及脂肪,使细胞膜破裂;2.溶解核糖体上面的蛋白质,使其解聚,将核酸释放出来;3.对RNase、DNase有一定的抑制作用。如:SDS、脱氧胆酸钠、4-氨基水杨酸钠、萘-1.5-二磺酸钠、三异丙基萘磺酸钠第八页,共22页。核酸制备中常用的蛋白质变性剂
蛋白质变性剂的作用:1.使蛋白质变性、沉淀,从核酸提取液中分离除去,以防造成蛋白污染。2.使蛋白质变性,故可使核糖体解聚释放出核酸。3.某些蛋白质变性剂也有抑制RNase活性和破裂细胞的作用。
如:苯酚、氯仿、盐酸胍、DEPC第九页,共22页。核酸制备中常用的酶
DNaseRNase蛋白酶K溶菌酶
第十页,共22页。核酸提取的一般过程1)破碎细胞(防止核酸酶的作用)
微生物:溶菌酶、SDS裂解。
高等植物:捣碎器破碎、液氮研磨。酶法:蛋白酶,如胰蛋白酶,冰冻法:反复冻融或液氮冻后组织捣碎。
动物:液氮处理后用匀浆器破碎。
细胞器DNA:首先纯化细胞器。
以上处理时均要同时加入核酸酶抑制剂第十一页,共22页。核酸提取的一般过程2)破碎抽提核酸除去杂质1.首先使脱氧核糖核蛋白、核糖体、病毒的核蛋白与其它成分分离2.使核酸与蛋白质分离3.除去脂类4.多糖的除去第十二页,共22页。核酸提取的一般过程3)核酸的纯化根据所需核酸的性质和特点除去其它核酸污染,并除去提取过程中的系列试剂(盐、有机溶剂等)杂质,最后得到均一的核酸样品。
第十三页,共22页。4)核酸样品的保存核酸保存的主要条件是温度和介质
温度:4℃(5℃)最佳和最简单-70℃是长期保存的良好温度,为一次性保存-20℃保存
保存介质:TE缓冲溶液(最常用)10mmol/LTris-ClpH8.01mmol/LEDTApH8.0第十四页,共22页。实验目的第十五页,共22页。材料与试剂第十六页,共22页。实验操作与注意事项,1000rpm,5min离心第十七页,共22页。第十八页,共22页。第十九页,共22页。四、注意事项——材料准备最好使用新鲜材料,低温保存的样品材料不要反复冻融提取血液基因组DNA时,要选择有核细胞(白细胞)组培细胞培养时间不能过长,否则会造成DNA降解含病毒的液体材料DNA含量较少,提取前先富集第二十页,共22页。四、注意事项——细胞裂解材料应适量,过多会影响裂解,导致DNA量少,纯
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