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司基于信息熵的目标物种特异性引物设计的及基于信息熵的目标物种特异性引物设计的系同一性和覆盖度大于或等于80%的短序列片段数等于80%的短序列片段数据进行处理,筛选出覆盖90%基因组的短序列片段,获得该短序列片段2数据筛选模块,用于对目标物种的参考基因组序列进行处理,第一数据获取单元,用于对目标物种的所有基因组序列考基因组序列和目标物种的其他基因组序列;第二比对单元,用于将候选片段比对到目标物种的其他基因选同一性和覆盖度大于或等于80%的目标片段作为第一计算单元,用于统计优化片段在目标物种的所有基因组评分单元,用于根据优化片段的熵值和优化片段的覆盖度信息对优化片优化单元,用于对评分靠前的优化片段中的碱基进行37.基于信息熵的目标物种特异性引物设计的方对目标物种的参考基因组序列进行处理,获得同一性和覆盖度大于或等于80%的短序对同一性和覆盖度大于或等于80%的短序列片段数据进行处理,筛选根据优化后的短序列片段数据进行引物设计,并确保引物的3'末端避开高熵值位点,9.基于信息熵的目标物种特异性引物设计的装置,其特征述计算机程序在处理器上运行时执行如权利要求4的DNA结合。如果引物的结合位点包含单核苷酸多态性(SNP尤其是位于引物3'末端的[0003]引物设计通常优先选择目标序列中的保守区域作为结合位点,以尽可能规避SNP数据优化模块,用于对同一性和覆盖度大于或等于80%的短序列片段数据进行处理,筛选出覆盖90%基因组的短序列片段数据,获得筛选后的短序列片段中每个碱基的熵5第一比对单元,用于将短序列片段比对到目标物种的近缘物种的参考基因组序计算单元,用于计算目标片段在目标物种的其他基因组序列中的同一性和覆盖对目标物种的参考基因组序列进行处理,获得同一性和覆盖度大于或等于80%的6所述计算机程序在处理器上运行时执行如本发明基因组的保守性片段及每个碱基位点的熵值,基于信息熵评估片段的保守性并进行排序,[0025]图1是本发明实施例提供的基于信息熵的目标物种特异性引物设计的系统的工作本实施例提供基于信息熵的目标物种特异性引物设计的系统,系统包括以下模7数据优化模块,用于对同一性和覆盖度大于或等于80%的短序列片段数据进行处第一比对单元,用于将短序列片段比对到目标物种的近缘物种的参考基因组序计算单元,用于计算目标片段在目标物种的其他基因组序列中的同一性和覆盖8本实施例提供基于信息熵的目标物种特异性引物设计的方法,方法包括以下步对目标物种的参考基因组序列进行处理,获得同一性和覆盖度大于或等于80%的库中获取肺炎链球菌的5~10个近缘物种的参考基因组序列。[0040]使用blastn等比对工具将上述保留的短序列片段比对到肺炎链球菌的去冗余后出基因组覆盖度大于或等于90%的片段;收集这些片段在肺炎链球菌基因组中所有比对上的不确定性;熵值高表示该位点的碱基变异性大(SNP位点引物在此位点的错配风险较9[0047]定义片段的熵值为其所有位点熵值的总和,并将片段的覆盖度与片段的熵值相[0051]使用Primer3软件

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