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1、环介导等温扩增技术,胡星星 20150511 2015.10.20,主要内容,定义 原理 操作步骤 优缺点及,定义,环介导等温扩增技术(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)是指在等温(60-65)条件下,利用链置换DNA聚合酶短时间(通常1h)内进行核酸扩增,是一种“简便、快速、精确、低价”的基因扩增方法。 其检测结果可直接肉眼观察白色沉淀或者绿色荧光,是一种适合现场、基层快速检测的方法。,原理,扩增启动阶段,FIP F3,(5):有1个环状构造(Fc1末端5端游离)的单链,BIP B3,(8):有2个环状构造(F1末端即3端游离和Bc1末端
2、即5端游离)的单链,循环扩增阶段,FIP F1末端延伸至形成一个环状构造(B1末端即3端游离);FIP 退火到茎环结构(8)上,引导链置换DNA 合成反应,产生结构(9)的产物;随后产物(9)的B1末端即3 端自动引导链置换DNA 的合成,生成产物(10)和茎环结构(8)(与开始的产物(8)序列互补的); BIP B1末端延伸至形成一个环状构造(F1末端即3端游离);BIP 退火到茎环结构(8)上,引导链置换DNA 合成反应,产生结构(9)的产物;随后产物(9)的F1末端即3 端自动引导链置换DNA 的合成,生成产物(10)和茎环结构(8),产物( 8 )开始新一轮的循环扩增。,延伸循环步骤,
3、产物(10)和(10)进入延伸循环步骤,分别形成(11)和(11);内部引物又可以(11)和(11)作为模板,引导链置换DNA 的合成,使产物的序列不断延伸、环化、再延伸,最终的产物是一些具有不同茎长度茎环结构的DNA 和带有许多环的折叠结构的DNA 的混合物。,LAMP法实验室常规操作步骤,优缺点,优点:灵敏度高(比传统的PCR方法高25个数量级);反应时间短(3060分钟就能完成反应);临床使用不需要特殊的仪器(试剂盒研发阶段推荐用实时浊度仪);操作简单(不论是DNA还是RNA,检测步骤都是需将反应液、酶和模板混合于反应管中,置于水浴锅或恒温箱中63左右保温3060分钟,肉眼观察结果)。 缺点:灵敏度高,一旦开盖容易形成气溶胶污染,故在进行试剂盒的研发过程中可采用实时浊度仪,不要把反应后的反应管打开;引物设计要求比较高,有些疾病的基因可能不适合使用环介导等温扩增方法。,应用,LAMP 技术因其快速、高效、特异、灵敏和经济等优点,已经应用于病原菌、寄生虫、病毒、疾病
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