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文档简介
1、新技术在精准医学中的应用美吉生物2016年11月 美吉生物集团位于上海国际医学园区拥有自主产权的办公与实验大楼集团注册资金:2902万占地面积:8000平方米员工:600人 目录Contents展望胚胎植入前筛查/诊断液体活检之循环肿瘤细胞(CTC)检测液体活检之循环肿瘤DNA(ct-DNA)胎儿游离DNA检测技术胎儿游离DNA检测技术胎儿的DNA通过胎盘源源不断地释放到母体血液中游离DNA(cff-DNA)发现史传统唐筛综合征筛查与诊断痛点-“无创产前基因检测技术的精准医疗应用”成为解决传统唐筛痛点的优选方案血清学筛查无创产前基因检测(NIPT)过去十年基因组测序成本以超摩尔根定律持续下降是
2、NIPT成为消费级产品的现实基础。/27565109/传统方法NIPT筛查诊断早期中期核型分析颈项透明(NT)hCGPAPP-AAFPHCGE3inhibin-A绒毛活检羊膜腔穿刺脐血管穿刺通过孕妇外周血分离胎儿游离DNA,检测染色体异常孕周11-13+69-13+614-20+610-13+616-22+61812-26+6检出率70%85%60-95%98%99%90%99.99%胎儿丢失率无无无1-2%0.5-1%1-2.3%无需要时间1d7d7d3-4周3-4周3-4周7-14d传统唐氏综合症筛查与诊断方法与NIPT比较数字化核型技术基因组污染识别胎儿浓度评估胎儿游离DNA富集技术区分
3、胎儿和孕妇的CNV液体活检技术CTC&ctDNA来源分布资料来源:PubMedCTC历年论文发表数量统计图ctDNA历年论文发表数量统计图传统活检与液体活检的比较(传统活检的痛点)例如组织活检,需要患者进行手术从肿瘤上取样切片,这给患者带来很大痛苦,并且不能频繁进行。传统活检往往只能对单一器官进行检测,局限性也非常大,不适合在常规体检时使用。更严重的是,从肿瘤上切片提取组织会对肿瘤进一步刺激,容易激发癌细胞的快速增长。1. 能在早期检测到ctDNA(肠镜没发现瘤变,但ctDNA能检测到KRas突变)2. 预后、复发与ctDNA的关系比较大3. 癌症病人血浆内的cfDNA量远高于(至少3倍)正常
4、人4. ctDNA与肿瘤标志物(甲胚蛋白等)相关性很高5. 实现“体液活检”,解决某些癌症难以获得活检样本的问题液体活检之循环肿瘤DNA(circulating cell-free tumor DNA) -癌症和ctDNAGenetic alterations detectable in circulating cell-free tumor DNALiquid Biopsies: Genotyping Circulating Tumor DNA, CLINICAL ONCOLOGY,2014 突变积累 肿瘤干细胞 肿瘤组织形成 肿瘤血管搭建(2mm) 肿瘤组织的生长 癌细胞扩散PET/CT能
5、发现直径大于5mm的肿瘤组织但2mm是肿瘤生长的关键时期癌症和ctDNActDNA临床运用Bettegowda C et al.Sci Transl Med. 2014 Feb 19;6(224):224ra24. ctDNA靶向治疗耐药监测复发监控疗效评估早期筛查ctDNA作为组织样本无法获取时的补充检测材料已逐渐形成共识非小细胞肺癌血液EGFR基因突变检测中国专家共识中国晚期原发性肺癌诊治专家共识(2016年版)非小细胞肺癌靶向药物治疗相关基因检测的规范建议中国表皮生长因子受体基因敏感性突变和间变淋巴瘤激酶融合基因阳性非小细胞肺癌诊断治疗指南(2015版)第十三届中国肺癌高峰论坛检测已知的
6、、多个平行临床可药物抑制的靶点,液体活检技术推荐NGS用于发现未知基因,探索疗效监测、预后判断和发现耐药机制等,液体活检技术建议使用NGS14液体活检之循环肿瘤细胞(Circulating Tumor Cells) -癌症和CTCsAlix-Panabires C, Pantel K.Clin Chem. 2013 Jan;59(1):110-8CTCs as a real-time liquid biopsyCTCs富集CTCs鉴定CTCs显微捕获单细胞测序临床用药指导等精准肿瘤检测&辅助诊断癌症和CTCs胚胎植入前筛查/诊断技术(PGS/PGD)我国不孕不育及出生缺陷现状其中,不孕不育和出
7、生缺陷中都发现了相当大比例的染色体异常:不孕不育(10-15%)自然流产胚胎(50%)出生缺陷(25%)。作为重要的辅助生殖技术-传统试管婴儿技术的痛点: 传统试管婴儿的移植成功率偏低,妊娠率较低体外发育的胚胎染色体异常高发,流产率偏高胚胎植入前筛查/诊断技术(PGS/PGD)PGD:通过采用单细胞全基因组扩增技术,并结合NGS技术对致病基因进行检测;同时,对所有23对染色体的非整倍性进行分析,为医生优选无致病基因和无染色体异常的胚胎,提供可靠依据,达到对胚胎致病基因进行诊断的目的;阻断家族性单基因病的垂直传递,提高单基因病者或患者生育健康婴儿的几率。PGS:通过采用单细胞全基因组扩增技术,并
8、结合NGS技术对胚胎23对染色体进行筛查,可精确分析染色体拷贝数、嵌合、微缺失和微重复等异常,为医生优选胚胎进行种植提供可靠的依据,提高试管婴儿的受孕率及活产率。二代高通量测序NGS技术开始应用于PGD/PGS领域Handyside AH. 24-chromosome copy number analysis: a comparison of available technologies,Fertil Steril,2013;100(3):595-602美吉:国家权威的资质认定上海市卫生和计划生育委员会批准的独立第三方检验机构,获得医疗机构执业许可证通过CMA(China Metrology Accreditation)认证即中国计量认证参加的上海市临床检验中心室间质评项目全部以满分通过获得了上海市司法局颁发的司法鉴定许可证获得临床基因扩增
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