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文档简介

原核生物的转录一、原核生物启动的开始RNA聚合酶首先结合到DNA的启动子启动转录过程。启动子:DNA分子上被RNA聚合酶识别并结合形成转录起始复合物的区域。在结构基因的上游总是有40~60bp的保守序列,能与RNA酶相互作用,这段序列就是启动子。描述碱基位置时,把DNA上开始转录生成RNA5'端第一个核苷酸的位置定为+1,下游的碱基依次为+2、+3……上游的碱基依次为-1、-2……分析了100多个大肠杆菌启动子结构后发现,它们含有的保守序列大致分为四个区域。1.起始点开始转录的位点,标示为+1,编码链上与+1相应的碱基,通常是A或G。转录起始点和翻译起始点不在一块,翻译的起始点在下游。2.-10区保守序列的中心之一,位于转录起始点上游-10bp处,其保守序列为TATAAT。在RNA聚合酶诱导下,该区域是首先溶解使封闭复合物转化为开放复合物,便于转录起始的区域。3.-35区(识别位点)另一保守序列的中心位于-35bp,其序列是TTGACA。TTGACA是σ因子的识别位点,RNA聚合酶首先识别并结合于此,形成转录起始复合物4.-10区~-35区之间序列为RNA聚合酶提供合适的空间结构利于转录。基因启动子-35和-10区的保守序列是σ因子识别位点,不同的σ因子识别位点不同。原核生物RNA转录的起始,不需要引物

——RNA聚合酶与DNA聚合酶的重大区别。转录起始生成RNA的第一位,也就是5'-端,总是三磷酸嘌呤核苷酸GTP/ATP,以GTP常见。当5'-GTP(5'-pppG-OH)与第二位NTP聚合生成磷酸二酯键后,仍保留其5'-端3个磷酸,这个结构在RNA脱落后仍保留着。归纳起来,转录起始可分为四个阶段:(1)核心酶在σ因子的参与下与DNA模板接触,生成非专一的、不稳定复合物在模板移动。(2)σ因子辨认启动子-35区,全酶与该区结合,形成疏松复合物,此时双链未打开,称为“封闭型”的RNA聚合酶-启动子复合物。(3)RNA聚合酶向-10区移动,在-10区附近DNA发生局部解链,RNA聚合酶与DNA结合更紧密,形成“开放型”的复合物。(4)RNA聚合酶按照模板催化第一个磷酸二酯键生成,σ因子从全酶脱离(可再次与核心酶结合重复利用),形成“RNA核心酶-启动子-NTP”三元复合物。启动子调控转录的起始序列,决定着基因的表达强度。RNA聚合酶与启动子亲和力越高,转录起始的频率就越多。二、原核生物转录的延伸核苷酸链中第一个磷酸二酯键形成后,σ因子从全酶脱落,核心酶就能沿DNA开始移动。在转录延伸过程中,DNA双链解开10~20bp,形成局部单链区像一个小泡,称为转录泡(转录泡也指RNA聚合酶-DNA模板-转录产物RNA结合在一起的复合物)当然,DNA解链需要解旋酶和拓扑异构酶帮助。在转录局部形成的RNA:DNA杂化双链之间的引力比DNA双链的弱,所以延长的RNA双链的5'-端会被重新合成的DNA双链挤出,使合成中的RNA的5'端游离于复合物。在电镜下观察原核生物的转录现象,可看到“羽毛状”图形。这说明:同一DNA模板上,有多个转录同时进行。RNA链上的小黑点是核糖体,正在翻译。所以原核生物是边转录边翻译。真核不同,转录在细胞核内,翻译在细胞质内。三、原核生物转录的终止根据体外试验中RNA聚合酶是否需要辅助蛋白参与终止,分为两类。1.依赖ρ因子的转录停止ρ因子是一种蛋白质,依赖ρ因子的终止位点,没有特殊的DNA序列,但ρ因子可以和转录中的RNA结合。ρ因子被RNA包绕,激活其ATP酶活性,使其沿着RNA向3'端滑动,滑到RNA聚合酶附近时使其失活,让RNA:DNA杂化双链解链,RNA释放出来。2.不依赖ρ因子的转录停止内源性终止子有两个明显结构特点:一个二级结构的发夹,和转录单位最末端的连续6个U残基的区段,这两个特点都是终止所必须的。

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