英语多生物芯片技术

英语多生物芯片技术教学要求掌握：1基因芯片的设计原理和基本方法

2各种芯片的使用及意义了解：1各种芯片的分类特点

2基因芯片的操作及结果分析第2页,共111页，2024年2月25日，星期天FoodtestingLivestockdiagnosticsorgradingAgriculturalbiotechHumandiagnosticsEnvironmentaltestingBasicResearchIdentitytestingPersonalizedmedicineDrivingtheGeneticRevolution第3页,共111页，2024年2月25日，星期天基本概念基因gene基因组genome

生物单体中一套完整的遗传物质,即全部基因结构基因非编码基因,一般不显示功能功能基因编码基因,产生功能蛋白第4页,共111页，2024年2月25日，星期天人类基因组

30亿碱级对组成；共编码约3.5万基因。cDNA

是基因转录过程mRNA的互补DNA，代表了基因的生物学信息。ESTexpressedsequencetag

表达序列标签,是长度为300—500bp的cDNA片段。用于克隆全长基因;制备基因表达谱。SNPsinglenucleotidepolymorphicallele

单核苷酸多态性等位基因。

第5页,共111页，2024年2月25日，星期天芯片的基本概念生物芯片

主要指通过平面微细加工技术，在固体芯片表面构建的微流体分析单元和系统，以实现对细胞、蛋白质、核酸以及其它生物组分的准确、快速、大信息量的检测。基因芯片

技术是通过微阵列技术,将高密度DNA片段阵列通过高速机器人，以一定的顺序或排列方式使其附着在如玻璃片等固相表面，以荧光标记的DNA探针，借助碱基互补杂交原理，进行大量的基因表达及监测等方面研究的最新革命性技术。微阵列技术

微阵列技术巨大优势在于它可以并行地宏量获取生物信息，借助此技术发展的生物芯片，则提供了以核酸杂交为基础的基因水平的表达监控，多态性研究和基因分型。从而使我们对基因表达调控有更深入的了解。

第6页,共111页，2024年2月25日，星期天微阵列芯片（Microarray）微型实验室芯片(Lab-on-a-chip)液体芯片(Liquichip)生物芯片分类基因芯片蛋白芯片组织芯片第7页,共111页，2024年2月25日，星期天什么是组织芯片？定义：将数十个、数百个乃至上千个小的组织片整齐地排列在载体上（通常是载玻片）而成的微缩组织切片,它是一种高通量、多样本的分析工具。第8页,共111页，2024年2月25日，星期天何谓蛋白芯片？蛋白芯片：将多种蛋白质以微阵列的形式固定在固相或液相支持物上，在孵育反应中与样品中靶分子的结合，并用报告分子检测结合信号。抗体芯片：将不同抗体按照类似基因芯片的方法点阵在特定的片基上，通过抗原抗体结合来对检测样品中的蛋白作定性和定量分析。

作用：可以在一次实验中比较生物样品中成百上千的蛋白质的相对丰度第9页,共111页，2024年2月25日，星期天RNA蛋白质转录翻译细胞表型生物表型复制逆转录

(病毒中)Oligo芯片,CpG-岛芯片，CGHcDNA芯片Oligo芯片蛋白芯片组织芯片芯片技术的应用

？ ？ ？ ？1.SNPs2.拷贝数3.DNA修饰1.开/闭2.拷贝数3.剪接分析1.酶分析2.拷贝数3.蛋白修饰1.细胞形态2.细胞功能3.细胞生长PCR-测序SouthernblotFISHNorthernblotRT-PCRRNase保护WesternblotELISA质谱分析组织培养组织学免疫组织学生物学中心法则—

分子生物学的基本原理DNA第10页,共111页，2024年2月25日，星期天基因芯片发展历史Southern&NorthernBlotDotBlotMacroarrayMicroarray第11页,共111页，2024年2月25日，星期天基因芯片分类按功能划分基因组芯片

检测某一基因是否存在，若存在，拷贝数是多少。探针是DNA.

表达谱芯片

确定基因表达的途径与表达产物。探针是RNA或cDNA。测序芯片

通过探针与微阵列的配对分析获得探针的序列结果。按探针类型划分cDNA芯片：几百到上千个碱基Oligo芯片:25mer(affymetrix)；70mer(Operon)；80mer（Clontech）

第12页,共111页，2024年2月25日，星期天用GeneChip作为主要研究手段

发表在国际杂志的研究论文第13页,共111页，2024年2月25日，星期天基因芯片研究的总体方案图象扫描/结果分析杂交/洗涤芯片标记好的样品点样（针点或喷点）探针标准化Oligo探针合成Oligo探针序列确定基因组序列分析组织样品目的细胞总RNA提取cDNAmRNA基因文库构建目的基因扩增PCR产物纯化第14页,共111页，2024年2月25日，星期天TheProcessCellsPoly-ARNAAAAAcDNALLLLIVT10%Biotin-labeledUracilAntisensecRNALFragment(heat,Mg2+)LabeledfragmentsHybridizeWash/stainScanL第15页,共111页，2024年2月25日，星期天GenechipsforgenesexpressionanalysisStandardeukaryoticgeneexpressionassay.ThebasicconceptbehindtheuseofGeneChiparraysforgeneexpressionissimple:labeledcDNAorcRNAtargetsderivedfromthemRNAofanexperimentalsamplearehybridizedtonucleicacidprobesattachedtothesolidsupport.BymonitoringtheamountoflabelassociatedwitheachDNAlocation,itispossibletoinfertheabundanceofeachmRNAspeciesrepresented.Althoughhybridizationhasbeenusedfordecadestodetectandquantifynucleicacids,thecombinationoftheminiaturizationofthetechnologyandthelargeandgrowingamountsofsequenceinformation,haveenormouslyexpandedthescaleatwhichgeneexpressioncanbestudied.Formoredetailedinformation,reviewtheGeneChipExpressionAnalysisTechnicalManual.

第16页,共111页，2024年2月25日，星期天TheResultAlightsourcescansthearray,causingthedyestofluoresceTheglowispickedupbyasensorandisusedtodeterminetherelativeabundanceoftheRNAThisinformationmustbeprocessedtodeterminethelevelofactivityforeachexpressedgene第17页,共111页，2024年2月25日，星期天（一）探针设计与合成探针标准化Oligo探针合成Oligo探针序列确定基因组序列分析基因文库构建目的基因扩增PCR产物纯化cDNA探针Oligo探针第18页,共111页，2024年2月25日，星期天探针设计的要求高度特异性较高灵敏度第19页,共111页，2024年2月25日，星期天cDNA探针的缺点由于不同的基因长短不同，Tm值各异，成千上万的基因在同一张芯片上杂交，使得杂交条件很难同一。同一个体中总是存在一些基因家族的同源序列，加上有的物种存在基因重叠序列的相互干扰，使得传统的cDNA芯片的分辨能力受到限制，结果的准确性也受到影响。有些组织中在DNA双链中的无意义链中存在重叠的基因；而且不同RNA的剪切方式等基因表达方式很难用cDNA芯片来区分。PCR产物是结合稳定的DNA双链，加入探针后在杂交中必然存在竞争性抑制，影响探针和模板的结合能力和稳定性，进一步影响cDNA芯片的分辨能力和结果的可信度，这对于低丰度的基因影响尤为明显。PCR产物浓度不均一也可能导致错误的结论。

第20页,共111页，2024年2月25日，星期天cDNA探针无法区别同源基因基因1基因2基因3基因1cDNA探针基因2cDNA探针基因3cDNA探针第21页,共111页，2024年2月25日，星期天cDNA探针空间结构影响杂交效率SignalIntensity021QuantitativeNoReproducibleNo第22页,共111页，2024年2月25日，星期天寡核苷酸探针比cDNA探针的优点探针序列经过系统优化，减少非特异杂交，能有效区分有同源序列的基因；减少二级结构及其对杂交结果的影响

杂交温度均一，提高杂交效率

；合成产物浓度均一，避免因样品浓度差异而造成点样量差异；可以设计检测不同剪切方式的基因；

无需扩增，防止扩增失败影响实验。第23页,共111页，2024年2月25日，星期天单个长片段Oligo探针全长基因序列Oligo探针5´3´单点或重复第24页,共111页，2024年2月25日，星期天GeneChip表达谱探针设计原理全长基因序列多段探针完全匹配不完全匹配5´3´第25页,共111页，2024年2月25日，星期天多段寡核苷酸探针基因1基因2基因3基因2多段OLIGO探针基因3多段OLIGO探针基因1多段OLIGO探针第26页,共111页，2024年2月25日，星期天探针长度与特异性和灵敏度第27页,共111页，2024年2月25日，星期天PerfectMatchPMMMMismatchPM-MM探针设计Oligo探针第28页,共111页，2024年2月25日，星期天ExcellentDiscriminationofMismatchBaseSequenceATCGGTAGCCATGCATGAGTTACTAATCGGTAGCCATCCATGAGTTACTA13MisMatchBase第29页,共111页，2024年2月25日，星期天PM-MM设计作用

---有效的扣除掉芯片上面的背景其他的基因芯片只是用片基上空白处的杂交信号作为背景扣除，空白背景‡水背景‡核苷酸背景与这条MM探针结合的信号里面有一部分就是背景信号，在实际计算每一点的实际的信号值时，这些信号将被去除，最终获得准确的数据并有利于在低丰度基因表达的准确定量。第30页,共111页，2024年2月25日，星期天PM-MMProbePairsOfferHighSensitivityDiscriminateagainstbackgroundsignalsIncreasingsensitivityatlowtargetconcentrations第31页,共111页，2024年2月25日，星期天探针特点总结cDNA探针特异性最差；检出限最低，但并非真实灵敏度单个长的Oligo探针保证较好的特异性和灵敏度，是不得已的折中路线；多个Oligo探针：

25bp探针保证最高特异性多段探针保证最高的灵敏度

PM-MM探针设计有效扣除假阳性第32页,共111页，2024年2月25日，星期天（二）样品制备与标记标记好的样品组织样品目的细胞总RNA提取cDNAmRNA标记物标记方法荧光素放射性同位素金属粒子反转录标记PCR标记随机引物标记第33页,共111页，2024年2月25日，星期天样品制备与标记的质控TEST芯片监控RNA提取及反转录的完整性监控RNA提取及反转录的灵敏度监控系统操作的灵敏度第34页,共111页，2024年2月25日，星期天标记方法的区别双色标记：Cy3,Cy5标记效率不同，相同的杂交探针不同的荧光信号，不能进行直接比较，必须进行反标记校正。单色标记：标记效率相同，信号值可直接进行比较。第35页,共111页，2024年2月25日，星期天（三）生物芯片制作技术第36页,共111页，2024年2月25日，星期天生物芯片制作方法分类探针固定方式片基特点原位合成（in-situsynthesis）刚性片基，如玻璃片、半导体硅片等高密度，探针合成均一；可制作全基因组芯片，并允许进行复杂的探针设计合成后点样(off-chipsynthesis)刚性片基，如玻璃片、半导体硅片等薄膜片基，如NC膜、Nylon膜等低密度，CV值高；芯片基因数目少，不允许进行复杂的探针设计，直接导致假阳性率高第37页,共111页，2024年2月25日，星期天原位合成(InSituSynthesis)压电打印原位合成分子印章原位合成原位光刻合成第38页,共111页，2024年2月25日，星期天FabricationFabricationviaPrintingDNAsequencestucktoglasssubstrateDNAsolutionpre-synthesizedinthelabFabricationInSitu

Sequence“built”Photolithographictechniquesuselighttoreleasecappingchemicals365nmlightallows20-mresolution第39页,共111页，2024年2月25日，星期天原位光刻合成

美国著名的Affymetrix公司率先开发的寡聚核苷酸原位光刻专利技术，是生产高密度寡核苷酸基因芯片的核心关键技术。

优点：合成效率高，点阵密度高缺点：设备昂贵，技术复杂第40页,共111页，2024年2月25日，星期天

原位光刻合成原理Lightdirectedoligonucleotidesynthesis.Asolidsupportisderivatizedwithacovalentlinkermoleculeterminatedwithaphotolabileprotectinggroup.Lightisdirectedthroughamasktodeprotectandactivateselectedsites,andprotectednucleotidescoupletotheactivatedsites.Theprocessisrepeated,activatingdifferentsetsofsitesandcouplingdifferentbasesallowingarbitraryDNAprobestobeconstructedateachsite.第41页,共111页，2024年2月25日，星期天 AffymetrixusesauniquecombinationofphotolithographyandcombinatorialchemistrytomanufactureGeneChip®Arrays.

第42页,共111页，2024年2月25日，星期天GeneChipsProbeArrays***************QuantitativeYesReproducibleYes

第43页,共111页，2024年2月25日，星期天（四）、杂交/洗涤技术杂交技术的关键在于使杂交洗涤条件的标准化、均一化方法盖玻片杂交盒全自动杂交洗涤工作站第44页,共111页，2024年2月25日，星期天（五）基因芯片检测技术非共聚焦激光扫描仪激光共聚焦扫描仪第45页,共111页，2024年2月25日，星期天基因组芯片

在临床研究领域的应用第46页,共111页，2024年2月25日，星期天

EukaryoticCellDNARNAGenotypingandGeneExpressionMonitoringGenotyping:IsitAorB?GeneExpression:Whichgenes?Howmuch?第47页,共111页，2024年2月25日，星期天（一）人类全基因组分析第48页,共111页，2024年2月25日，星期天第49页,共111页，2024年2月25日，星期天HuSNPApplicationsLinkageStudies(确定疾病相关基因在染色体的位置)humanfamiliallinkagestudiestomapdisease-associatedgenestospecificchromosomallocationsLOH(LossofHeterozygosity,杂合子缺失研究以确定癌细胞中染色体缺失的位置和程度)comparethequantitativerepresentationofallelesforsamplesobtainedfromnormaltissuetothoseobtainedfromtumortissuetodeterminethelocationandextentofchromosomallossintumorcells揭示个体间差异的遗传基础第50页,共111页，2024年2月25日，星期天美国、加拿大、英国和欧洲其他国家超过50个研究中心组成科学研究小组170多位专家，利用Affymetrix研发SNP新技术，扫描1500个有自闭症孩子家庭基因与自闭症之间可能存在的联系overfifteenpublicationsinlessthantheyearsinceitslaunch，MappingArraysforapplicationsincludinglinkageanalysis,populationgenetics,andchromosomalcopynumberchangesduringcancerprogression第51页,共111页，2024年2月25日，星期天SNPGenotypingUsingMolecularInversionProbesTheSNPgenotypingprocessusingmolecularinversionprobesisoutlineddiagrammaticallyinbelow.10,000multiplexMIPassaydetectedonTagMicroarray

第52页,共111页，2024年2月25日，星期天Allelicimbalanceanalysisbyhigh-densitysinglenucleotidepolymorphicallele(SNP)arraywithwholegenomeamplifiedDNAosteosarcomatissuesvspatient-matchedbloodNucleicAcidsResearch,Vol.32No.9

OxfordUniversityPress2004;应用实例1第53页,共111页，2024年2月25日，星期天CopynumberofindividualSNPsinchromosome6detectedfromcaseOST1976q12--13have5-to20-foldamplificationbyreferencedataconsistentwithCGHresult第54页,共111页，2024年2月25日，星期天Significancegraphofdetectingcopynumberchanges.Anexampleforchromosome6ofOST197lossof6q14-q27gainat6q12—13confirmedbyCGH第55页,共111页，2024年2月25日，星期天SNPlociat6q12-13arewithinaregionofLOHbutalsohavesignificantincreaseincopynumber.TheincreaseincopynumberinaLOHregionmaysuggestthelossofanallelefollowedbyamplificationoftheremainingallele.---TheabilitytomakesuchaninferenceisoneoftheadvantagesofSNParrayoverothermicroarray-basedmethodssuchastheuseofcDNAandBACforallelicimbalanceanalysis.SNPArrayAdvantage第56页,共111页，2024年2月25日，星期天第57页,共111页，2024年2月25日，星期天TraditionalMethodinLOHDetectionRestrictionFragmentLengthPolymorphism(RFLP)Microsatellitemarkers第58页,共111页，2024年2月25日，星期天第59页,共111页，2024年2月25日，星期天（二）表达谱芯片在临床研究中的应用第60页,共111页，2024年2月25日，星期天表达谱基因芯片

表达谱基因芯片通俗地讲是指用于基因功能研究的一种基因芯片。研究基因在不同组织或细胞、不同发育阶段中基因表达的改变，进而阐明基因的功能。第61页,共111页，2024年2月25日，星期天应用表达谱芯片的意义表达谱基因芯片可以快速、有效地帮你寻找到与您研究领域相关的靶基因。在人类10万种基因中，目前已研究过的基因仅2000-3000种，绝大部分基因尚处于待研究阶段，通过基因芯片您可以获得最多待研究基因。通过对大量未知基因的研究，您可以获得更多的基因功能专利，而专利就是财富。第62页,共111页，2024年2月25日，星期天表达基因芯片检测示意图第63页,共111页，2024年2月25日，星期天GeneLogicGeneExpress™databasesuite•BioExpress™研究人和动物正常组织和病变组织基因表达规律,揭示疾病发生分子机制,包括了解生理病理过程涉及的分子的相互关系•ToxExpress™研究各种毒素引发的基因表达规律,筛选合适的毒理标志分子,评估药物毒理作用,比经典的临床前安全测试方法(临床化学和组织病理学等)更有效•PharmExpress™研究典型药物药理作用的分子机制第64页,共111页，2024年2月25日，星期天表达谱基因芯片检测原理用不同的荧光染料通过逆转录反应将不同组织或细胞的mRNA分别标记成不同的探针，将探针混合后与芯片上的基因进行杂交、洗涤，用特有的荧光波长扫描芯片，得到这些基因在不同组织或细胞中的表达谱图片，再通过计算机分析出这些基因在不同组织中表达差异的重要信息。第65页,共111页，2024年2月25日，星期天ClinicalTrialsProcessFlow-Expression第66页,共111页，2024年2月25日，星期天基因芯片技术在药物筛选中的应用第67页,共111页，2024年2月25日，星期天TargetIdentificationPharmaceuticalChallengeSolvecomplex,multifactorialdiseasessuchascardiovascular,neurodegenerative,andcancerFindnoveltargetsforhigh-valuetherapeuticproductsGeneChipSolutionGlobaltranscriptomeanalysisispossiblythebestwaytounravelcomplexdiseaseGenome-wide,high-densityassociationstudieswillallowthedeterminationofgeneticbasisofdiseasesusceptibilityTargetIDTargetValidationCompoundScreeningLeadOptimizationClinicalTrialsPreclinicalTrials第68页,共111页，2024年2月25日，星期天CompoundScreeningPharmaceuticalChallengeDeterminethenumeratoranddenominatorofthetherapeuticindexatanearlierpointinthediscoveryprocessPrioritizecompoundssoonerinthescreeningprocessGeneChipSolutionBuildrobustdatabasestocharacterizeindexesofgenesthatcanbecorrelatedwithefficacyandtoxicityPerforminformation-richscreeningusingautomated,

high-throughputgeneexpressionanalysissystemTargetIDTargetValidationCompoundScreeningLeadOptimizationClinicalTrialsPreclinicalTrials第69页,共111页，2024年2月25日，星期天PreclinicalandClinicalTrialsPharmaceuticalChallengeFaster,moreeffectivetrialsthataremorepredictiveofhumantrials(preclinical)andclinicaloutcomes(clinical)GeneticandgenomicinformationthatmeetsregulatoryrequirementsGeneChipSolutionHighestqualityproductsthatdeliverreproducibleresultsCustomdesigncapabilitiesallowselectionandcost-effectivescreeningofspecificgenesofinterestCommitmenttounderstandingandmeetingregulatoryrequirementsTargetIDTargetValidationCompoundScreeningLeadOptimizationClinicalTrialsPreclinicalTrials第70页,共111页，2024年2月25日，星期天

寡核苷酸微阵列对正常结肠、结肠腺瘤、结肠腺癌的基因表达谱分析实例2第71页,共111页，2024年2月25日，星期天第72页,共111页，2024年2月25日，星期天用基因表达和聚类分析的方法能否鉴别良性和恶性肿瘤进一步研究正常组织病变成腺癌的过程中基因表达

研究目的第73页,共111页，2024年2月25日，星期天实验设计

肿瘤组织腺瘤或腺癌患者正常组织切片腺瘤或腺癌组织切片正常组织第74页,共111页，2024年2月25日，星期天疾病发展过程

正常

结肠腺瘤

结肠腺癌表达谱比较正常22腺瘤4腺癌18第75页,共111页，2024年2月25日，星期天芯片统计分析统计分析统计学软件Statistica（Stat-Soft.Tulsa.OK）聚类分析Cluster20.2进行聚类Treeview1.45浏览分析结果图第76页,共111页，2024年2月25日，星期天第77页,共111页，2024年2月25日，星期天第78页,共111页，2024年2月25日，星期天一些基因的表达经半定量RT-PCR进一步证实epithelialtissuewasgrosslydissectedfreeofunderlyingstromalandmuscularelements

第79页,共111页，2024年2月25日，星期天在腺瘤与腺癌中均过量表达的产物Mr100,000coactivator(by11-fold)BIGH3(8.9-fold)ckshs2(2.7-fold)MGSA(2.1-fold)matrilysin(3.0-fold).

在腺瘤与腺癌中均下调表达的产物:Thecolonicepithelialcellproduct,guanylin(111-fold),down-regulatedinadenocarcinoma(40-fold)hevin(7.2-fold).结肠腺瘤与结肠腺癌相比第80页,共111页，2024年2月25日，星期天正常组织结肠腺癌结肠腺瘤聚类分析第81页,共111页，2024年2月25日，星期天腺癌与正常组织或腺瘤相比正常组织与腺癌或腺瘤相比腺瘤与正常组织或腺癌相比正常组织结肠腺癌结肠腺瘤第82页,共111页，2024年2月25日，星期天聚类分析结果

这组基因在腺瘤组织中高水平表达，比腺癌或正常组织中的表达都更活跃。包括几个转录因子（其中一些可能为癌基因,XBP-1、SSRP1、ETS-2、SOX9）、核糖体蛋白（S29和S9）、一个凋亡诱导因子（NBK）和一个剪切因子（SRp30c）推测这些基因很可能在腺瘤向腺癌转化的早期起一定的作用。基因簇1－第83页,共111页，2024年2月25日，星期天这个基因簇在腺癌中特定高水平表达包括许多在结肠瘤(colorectalneoplasia)中高表达的已知基因产物，如Ckshs2、MGSA、matrilysin和一些与代谢率和繁殖相关的基因。基因簇2－第84页,共111页，2024年2月25日，星期天这组基因在正常组织中高水平表达，这些基因(guanylin,colonmucosaantigen)，在结肠瘤组织(colorectalneoplasms)中的表达是抑制的。这些基因还包括平滑肌和结缔组织相关基因。基因簇3－第85页,共111页，2024年2月25日，星期天用寡核苷酸微阵列技术可鉴定出在腺瘤向腺癌转化过程中起一定作用的基因进一步确认已知表达发生变化的基因，在肿瘤转移过程中表达发生改变证明用基因表达谱可区分正常组织表型上十分相似的结肠腺瘤和腺癌结论第86页,共111页，2024年2月25日，星期天Clusterdiagramofgeneexpressionprofilesof29pediatricALLsamplesBonemarrowaspiratesfrompediatricpatientswithacutelymphoblasticleukemia

Theresearchersdevelopednewalgorithmstoanalyzethegeneexpressiondataandclassifypatientsdependingontheirriskforfailingtherapy.Thenumberofgenesrequiredforclassifyingpatientsvariedamongthesubtypes.Asinglegenewassufficienttoachieve100percentaccuracyfortwoALLsubtypes.第87页,共111页，2024年2月25日，星期天MovingtotheClinicClassifyingAML,ALLandMLL

LungCancerClassificationColonCancerClassificationsPrognosisforPediatricALLArmstrong,S.A.,etal.NatureGenetics30:41-47,2002Affymetrix,Inc.–nonpublisheddataBhattacharjeeetal.PNAS

98(24),

13790-5,

2001Ross,M.E.etal.Blood

102,

2951-9,

2003

第88页,共111页，2024年2月25日，星期天（三）组织芯片

在临床研究领域的应用表达谱分析结果的快速高通量后续验证第89页,共111页，2024年2月25日，星期天

蛋白AAAAARNA抗体DNA基因组水平表达水平蛋白质水平组织芯片－灵活的研究工具第90页,共111页，2024年2月25日，星期天组织芯片的优点可提高实验效率，减少实验误差高效、快速、低消耗、自身内对照和可比性强应用范围广形态学观察，免疫组织化学染色、原位杂交(FISH)、原位PCR(MSP-ISH)和各种原位组织、细胞学的观察和研究第91页,共111页，2024年2月25日，星期天组织芯片的研究意义1.实现高通量的组织样本研究第92页,共111页，2024年2月25日，星期天HumanMolecularGenetics,2001,Vol.10,No.7组织芯片的研究意义检测特定基因或蛋白在不同组织中的表达变化第93页,共111页，2024年2月25日，星期天基因芯片肾癌细胞系5184种cDNA89种差异表达的基因编码Vimentin基因组织芯片和基因芯片技术结合在肿瘤生物学的研究应用实例组织芯片技术和免疫组化532例肾癌组织中Vimentin的表达51％透明细胞癌61％乳头状癌出现阳性表达仅在4％的肾脏嫌色细胞癌和12％的嗜酸细胞癌中出现阳性表达Vimentin与患者预后密切相关，而与肿瘤的分期、分级无关MochH.etal..AmJPathology,1999,154:981-986.第94页,共111页，2024年2月25日，星期天BubendorfLetal.,1999,CancerResMar15;59(6):1388组织芯片和FISH技术结合在肿瘤生物学的研究应用实例第95页,共111页，2024年2月25日，星期天（四）蛋白质芯片

在临床研究领域的应用功能验证及临床应用第96页,共111页，2024年2月25日，星期天临床应用的芯片分类按照反应类型：

抗原-抗体芯片受体-配基芯片酶-底物芯片按照芯片的用途

蛋白质组芯片临床检测芯片药物筛选芯片代谢工程芯片第97页,共111页，2024年2月25日，星期天蛋白质芯片（ProteinChip）蛋白分析技术高通量微型化自动化多样化第98页,共111页，2024年2月25日，星期天蛋白功能芯片蛋白检测芯片蛋白质芯片的类型第99页,共111页，2024年2月25日，星期天蛋白质芯片的类型

蛋白质微阵列三维凝胶块芯片微孔板蛋白质芯片第100页,共111页，2024年2月25日，星期天蛋白