蛋白质序列分析

蛋白质序列分析Tag内容描述：<p>1、从一级序列预测蛋白质分子的三级结构并 进一步预测其功能，是极富挑战性的工作。 研究蛋白质折叠，尤其是折叠早期过程， 即新生肽段的折叠过程是全面的最终阐明 中心法则的一个根本问题，在这一领域中， 近年来的新发现对新生肽段能够自发进行 折叠的传统概念做了根本的修正。这其中， X 射线晶体衍射和各种波谱技术以及电子 显微镜技术等发挥了极其重要的作用。第 十三届国际生物物理大会上，Nobel 奖获得 者 Ernst 在报告中强调指出，NMR 用于研 究蛋白质的一个主要优点在于它能极为详 细的研究蛋白质分子的动力学，即动态的 结构或结构。</p><p>2、蛋白质序列分析 王兴平 n3 .1 蛋白质数据库介绍 n3 .2 蛋白质序列分析 n3 .3 蛋白质序列分析及结构预测策略 n3 .4 一级结构的预测 n3 .5 二级结构预测方法 n3 .6 其他序列分析工具 n3 .7 三级结构预测 n3 .8 蛋白质家族分析 内 容 3 .1 蛋白质数据库介绍 n蛋白质的结构主要分为四级, 一级结构、二级结构、三级结 构以及四级结构。依据这种结构层次, 将蛋白质数据库分为 : 蛋白质序列数据库：蛋白质序列数据库：如PIR、SWISS-PROT、NCBI , 这些 数据库的数据主要以蛋白质的序列为主, 并赋予相应的注释 ; 蛋白质模体及结构域数据库：蛋白质。</p><p>3、蛋白质序列分析 王兴平 n3 .1 蛋白质数据库介绍 n3 .2 蛋白质序列分析 n3 .3 蛋白质序列分析及结构预测策略 n3 .4 一级结构的预测 n3 .5 二级结构预测方法 n3 .6 其他序列分析工具 n3 .7 三级结构预测 n3 .8 蛋白质家族分析 内 容 3 .1 蛋白质数据库介绍 n蛋白质的结构主要分为四级, 一级结构、二级结构、三级结 构以及四级结构。依据这种结构层次, 将蛋白质数据库分为 : 蛋白质序列数据库：蛋白质序列数据库：如PIR、SWISS-PROT、NCBI , 这些 数据库的数据主要以蛋白质的序列为主, 并赋予相应的注释 ; 蛋白质模体及结构域数据库：蛋白质。</p><p>4、第九章蛋白质序列分析与结构预测一种生物体的基因组规定了所有构成该生物体的蛋白质，基因规定了组成蛋白质的氨基酸序列。虽然蛋白质由氨基酸的线性序列组成，但是，它们只有折叠成特定的空间构象才能具有相应的活性和相应的生物学功能。了解蛋白质的空间结构不仅有利于认识蛋白质的功能，也有利于认识蛋白质是如何执行其功能的。确定蛋白质的结构对于生物学研究是非常重要的。目前，蛋白质序列数据库的数据积累的速度非常快，但是，已知结构的蛋白质相对比较少。尽管蛋白质结构测定技术有了较为显著的进展，但是，通过实验方法确定蛋白质。</p><p>5、蛋白质序列分析,胡松年2005基因表达序列标签（EST）数据分析手册第八章吴祖建等2011生物信息学分析实践第五章,蛋白质序列结构信息蛋白质序列的基本性质分析结构域分析及motif搜索蛋白质二级结构蛋白质三级结构,蛋白质序列分析,一、蛋白质序列的基本性质分析,理化性质分析疏水性分析跨膜区分析信号肽预测Coil区分析亚细胞定位,蛋白质序列分析,蛋白质理化性质分析,Protparam工具htt。</p><p>6、第七章 分子进化与系统发育树,主讲人：胡银岗,西北农林科技大学农学院遗传教研组,分子系统学、古分子系统学 古生物遗体、化石保存的三种信息： 形态学信息 化学信息（生物的代谢产物和一般的生物化学分子） 遗传信息(保存的一级结构生物大分子,即基因产物或基因片段) 分子系统学（Molecular Systematics）：从生物大分子（氨基酸、核苷酸）的遗传信息推断生物进化的历史，并以系统树（谱系）的形式表达出来。 古分子系统学：利用古代DNA保留的遗传信息进行分子系统学研究,Darwin, Charles (1809-1882),The Origin of Species （1859）,7.1。</p><p>7、德州学院 物电学院 2014届 应用物理学专业 毕业论文基于序列特征的固有无序蛋白结合位点的统计分析xxx（物理与电子信息学院，山东德州253023）摘 要 本文以Disprot和BSDP数据库中的固有无序蛋白的结合位点为研究对象，构建9种结合位点数据集，利用MATLAB进行统计结合位点各种氨基酸的频率，结果发现，蛋白质与蛋白质相互作用的结合位点最多，蛋白质与ATP/GTP相互作用的结合位点最少，而且还可以得知各种类型结合位点的氨基酸具有明显的偏好性。该研究有助于认识固有无序蛋白质与其它成份的相互作用特征、为进一步挖掘固有无序蛋白质的序列。</p><p>8、第六章蛋白质序列分析,西北农林科技大学农学院遗传组,主讲人：胡银岗,第一节蛋白质数据库,1.数据库的分类蛋白质的功能主要是由它的结构所决定的，蛋白质的结构主要分为四级，依据这种结构层次，将蛋白质数据库分为：蛋白质序列数据库以蛋白质的序列为主，并赋予相应的注释；如PIRPSD、SWISS-PROT/TrEMBL,NCBI等蛋白质模体及结构域数据库收集了蛋白质的保守结构域和功能域的特征序列；如PRO。</p><p>9、生物信息学bioinformatics,生物科学学院生物工程教研室,蛋白质序列分析Analysisofproteinsequence,生物工程教研室孙继政,1,高等课件,通过预测蛋白质的结构、功能特征分析，可为我们的研究提供指导信息,2,高等课件,8.1温故而知新,Single-&three-letteraminoacidcodesGGlycineGlyPProlineProAAlanin。</p><p>10、实验九、蛋白质序列分析（3学时）目的：了解针对于蛋白质序列的分析内容与方法。熟悉蛋白质的网上分析服务器。内容：预测蛋白质序列的物化特性；预测蛋白酶消化模式；预测跨膜结构以及卷曲螺旋（coiled coil）结构；预测蛋白质的翻译后修饰；发现蛋白质中的功能结构域；蛋白质结构域分析常用网站。When youre studying a protein, you turn yourself。</p>