蛋白质组学

蛋白质组学Tag内容描述：<p>1、蛋白质组学 Proteomics,硕士生学位课程：,总学时数：36 教学目的和要求 1. 掌握蛋白质组与蛋白质组学的基本概念，基本理论与基本方法。 2. 熟悉蛋白质组研究的关键技术。 3. 熟悉利用蛋白质组研究策略设计研究课题的基本思路。 4. 培养开展临床蛋白质组学与疾病蛋白质组学研究的基础能力。,按照课程的总体要求，将课程分为12个专题进行讲授：,1、蛋白质组与蛋白质组学 2、蛋白质组学研究中的样品制备与分离技术 3、生物质谱 4、蛋白质研究的其它方法（1） 5、蛋白质研究的其它方法（2） 6、临床蛋白质组学与疾病蛋白组学 7、药物蛋白质组。</p><p>2、系统生物学与蛋白质组学 Introduction to systematic biology & proteomics,系统生物学,系统生物学,基因组学与人类基因组计划,1984年，由美国能源部发起$530万 1988年，NIH，詹姆斯沃森，1992年，柯林斯 1990年，美国能源部、NIH$30亿 1998年，Celera GenomicsJ. Craig Venter，陈奕雄 1999年，中国加入1%，第3号染色体上3000万个碱基对 2000年6月26日，工作草图完成,转录组与基因芯片,广义：一个细胞、组织或生物体中出现的所有RNA的总和，包括mRNA、rRNA、tRNA及非编码RNA； 狭义：mRNA 1991年Fodor第一张芯片 1994年Affymetrix第一张商。</p><p>3、第三章 蛋白质组与蛋白质组学,第一节 蛋白质组与蛋白质组学的定义,蛋白质组 protein + genome proteome 一种基因组所表达的全部蛋白质 一个细胞或一个机体的基因所表达的全部蛋白质,蛋白质组学 阐明生物体全部蛋白质的表达模式与功能模式 从整体的角度分析、鉴定细胞内动态变化的蛋白质的组成、结构、性质、表达水平与修饰状态 了解蛋白质之间、蛋白质与大分子之间的相互作用与联系,揭示蛋白质的功能与细胞生命活动的规律,一、蛋白质组与蛋白质组学的定义,蛋白质组学研究意义和背景,目前功能基因组中所采用的策略，如基因芯片、基因表达序。</p><p>4、引言,随着被誉为解读人类生命“天书”的人类基因组计划的成功实施，人类已初步掌握了自身的遗传信息。为了真正破译、读懂这部“天书”，各国科学家随即将生命科学的战略重点转到以阐明人类基因组整体功能为目标的功能基因组学上。蛋白质作为生命活动的“执行者”，自然成为新的研究焦点。以研究一种细胞、组织或完整生物体所拥有的全套蛋白质为特征的蛋白质组学自然就成为功能基因组学中的“中流砥柱”，构成了功能基因组学研究的战略制高点。 与此同时，实施蛋白质组学研究的关键技术平台也已经成熟。近年来诺贝尔化学奖分别授予了发明生。</p><p>5、Proteomics and Mass Spectroscopy,Proteomics,The dream of having genomes completely sequenced is now a reality. The complete sequence of many genomes including the human one is known. However, the understanding of probably half a million human proteins encoded by less than 30,000 genes is still a long way away and the hard work to unravel the complexity of biological systems is yet to come. A new fundamental concept called proteome (PROTEin complement to a genOME) has recently emerged.,Proteomics。</p><p>6、第九章 蛋白质组学 (Proteomics),第一节 概述 蛋白质组的概念及发展简史,20世纪生命科学的辉煌成就： 20世纪上半叶，以遗传学为代表， 以DNA双螺旋结构的提出而告捷； 20世纪下半叶，以分子生物学为代表， 以“中心法则”的问世而集大成； 20世纪90年代， “人类基因组计划（HGP） ”,基因与其编码产物蛋白的非线性关系,遗传信息从DNAmRNA结构蛋白质和功能蛋白质，构成一种有机体，完成生命的功能。 基因 mRNA蛋白质，三位一体，构成了遗传信息的流程图，这即是传统的中心法则。,基因组计划的局限 无法解决“基因精细调控”问题 大规模基。</p><p>7、第三章 基因组和基因组学,Genome and Genomics,基因（Gene）的概念,定义：基因是决定一定功能产物的DNA序列（片断），是遗传的结构和功能单位。 功能产物：RNA和蛋白质,染色体组 （Chromosome set ）,每个生殖细胞中的全部染色体称为一个染色体组。人体体细胞内含两个染色体组。,基因组（Genome）,每个染色体组的DNA构成一个基因组。广义的基因组包括细胞核染色体基因组和细胞质中的线粒体基因组。 是一个细胞或一种生物体的整套遗传物质,基因组学（Genomics）,是指对所有基因进行基因组作图，核苷酸序列分析，基因定位和基因功能分析。,。</p><p>8、第二讲 蛋白质组学基本技术 简介（）,二维电泳和生物质谱技术,第一节 双向凝胶电泳 （Two-dimensional electrophoresis，2-DE）,Oldest method for large scale protein separation (since 1975) Still most popular method for protein display and quantification Permits simultaneous detection, display, purification, identification, quantification Robust, increasingly reproducible, simple, cost effective, scalable & parallelizable Provides pI, MW, quantity,2-D electrophoresis (separation) Major technique in prot。</p><p>9、蛋白质组学,背景,基因数量有限性和基因结构的相对稳定性VS生命现象的复杂性和多变性,从genomic到proteome,对蛋白质的数量、结构、性质、相互关系和生物学功能进行全面深入的研究已成为生命科学研究的迫切需要和重要任务。,Theeraofomics-basedscienceGenomics（基因组学）Post-genomicscience（后基因组时代）Functionalgenom。</p><p>10、第4章 蛋白质组学 的研究方法和进展,One Genome different Proteomes,Life is based on proteins and their interactions,前言从基因组学到蛋白质组学,20世纪生命科学的辉煌成就 1953年Watson & Crick，DNA双螺旋结构提出 1957年，“中心法则”的问世 20世纪90年代，人类基因组计划（HGP）,基因组计划的局限 无法解决“基因精细调控”问题 “mRNA” 无法反映蛋白质的质与量。,以往人类对于蛋白质的研究只是针对生命活动中某一种或某几种蛋白质，难以形成一种整体观，难以系统透彻地阐释生命活动的基本机制。,大规模、全方位的蛋白质研究势。</p><p>11、小麦论文 小麦响应赤霉病菌的表达谱分析与禾谷镰刀菌胞外蛋白的研究 中文摘要 小麦赤霉病是主要由禾谷镰刀菌 Fusarium graminearum Schw 在小麦扬花期侵染麦穗所导致的真菌病害 它不仅造成小麦严重减产和品质的下降。</p><p>12、,第五节 化学蛋白质组学,.,人类基因组计划的顺利实施，使生命科学研究的重心逐渐转移到对生物功能的整体研究上。对生物功能的主要体现者或执行者-蛋白质的表达模式和功能模式的研究必然成为生命科学发展的趋势。,.,在20世纪90年代中期，国际上萌发了一门研究细胞内各种蛋白质的组成及其活动规律的新兴学科-蛋白质组学(proteomics)。 蛋白质组(proteome)这一概念是1995年由澳大利亚。</p><p>13、基因组学和蛋白质组学工具,本科08级通信工程1班 况玲,.,主要内容,一、序列组装 二、功能基因组学 三、蛋白质组学,.,一、序列组装,研究内容：,1、怎样将散的序列拼接起来 2、如何去掉序列中重复的部分,.,1、怎样将散的序列拼接起来,我们知道，使用鸟枪法的DNA测序提供了成千上百万个小序列，每一个片段长度有400500个碱基对。 当基因组被提取成限制性片段时，它只是被部分提。</p><p>14、第 五 章,蛋 白 质 组 学 (Proteomics),医学检验系临床生化教研室 周 琳,重点 蛋白质与蛋白质组学的概念 难点 二维凝胶电泳、酵母双杂交等技术的原理与方法 了解 蛋白质组学在医学中的应用,蛋白质组学研究背景,1.基因研究是20世纪生命科学的主线 1953年，DNA双螺旋结构的提出 1954年，“中心法则”的问世 20世纪90年代，全球性基因组计划尤其是人类基因组计 划（HGP。</p>