生物信息学试题

生物信息学试题Tag内容描述：<p>1、名词解释1.生物信息学 : 是研究生物信息的采集、处理、存储、传播，分析和解释等各方面的学科，也是随着生命科学和计算机科学的迅猛发展，生命科学和计算机科学相结合形成的一门新学科。 2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。3.FASTA序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。4.genbank序列格式：是GenBank 数据库的基本信息单位，是最为广泛的生物信息学序列格。</p><p>2、生物信息学复习题名词解释1. Homology (同源):来源于共同祖先的序列相似的序列及同源序列。序列相似序列并不一定是同源序列。2.Orthologs（直系同源）：指由于物种形成的特殊事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，它们具有相似的功能。3.Paralogs（旁系（并系）同源）：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因复制产生的一组基因，这些基因在功能上的可能发生了改变。基因复制事件是促进新基因进化的重要推动力。4.Xenologs (异同源)：通过横向转移，来源于共生或病毒侵染而产生的相似的序列，为异同源。5.Identity Score：The sum。</p><p>3、生物信息学复习题名词解释1. Homology (同源):来源于共同祖先的序列相似的序列及同源序列。序列相似序列并不一定是同源序列。2.Orthologs（直系同源）：指由于物种形成的特殊事件来自一个共同祖先的不同物种中的同源序列，它们具有相似的功能。3.Paralogs（旁系（并系）同源）：指同一个物种中具有共同祖先，通过基因复制产生的一组基因，这些基因在功能上的可能发生了改变。基因复制事件是促进新基因进化的重要推动力。4.Xenologs (异同源)：通过横向转移，来源于共生或病毒侵染而产生的相似的序列，为异同源。5.Identity Score：The sum。</p><p>4、一、名词解释：1.生物信息学： 研究大量生物数据复杂关系的学科，其特征是多学科交叉，以互联网为媒介，数据库为载体。利用数学知识建立各种数学模型; 利用计算机为工具对实验所得大量生物学数据进行储存、检索、处理及分析，并以生物学知识对结果进行解释。2.二级数据库：在一级数据库、实验数据和理论分析的基础上针对特定目标衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步的整理。3.FASTA序列格式：是将DNA或者蛋白质序列表示为一个带有一些标记的核苷酸或者氨基酸字符串，大于号（）表示一个新文件的开始，其他无特殊要求。4.genbank序列格。</p><p>5、1 上海师范大学生物信息学标准试 题 20152016 学年 第一学期 考试日期 2015 年 12 月 专业 年级 姓名 学号 1, 有四条序列如下（8 分）： 1)TCTTAGTAGGACTAGCAAAAGGTA 2)CGTATACGTTAGTTCATCGTAATGAG 3)GGGTAGAGTAGCGTATCATGCCCGTATAC 4） AATGCACGGGGTAGGACTAATTGGA 使用软件 Clustal 对这些序列进行全序列分析和分子进化分析，并用软件 TreeView 画进化树， 将得到的 Alignment 和进化树呈现在答卷上。 2, 请举例说明两条序列分别在 ungapped 和 gapped 的情况下形成 alignment 的差异， 并比较它们的同源性（10 分） 。 3, 用软件 RNA ST。</p><p>6、课程作业从下面三个题目中任选一个，运用所学的生物信息学知识，结合本研究领域，进行分析。要求：1）一定要结合本研究领域，写一个1万字左右的研究报告，包括插图、表格和文字等。2）分析中使用的软件要写明版本号。3）报告内容：包括摘要、研究背景及意义、材料与方法以及结果与讨论等部分，格式要规范。4）报告上应注明：学号、姓名、所属学院以及研究专业。5）提交时间：报告最后生成pdf格式文件，于1015年12月31日前将报告同时发给以下邮箱：longkeranaliyun.comtottyhy163.com412617230qq.com一、请利用核酸和蛋白质数据库下载“Hom。</p><p>7、Primary database：数据直接来源于实验获得的原始数据，只是经过简单的归类、整理和注释Second database：由一级数据衍生而来，是对生物学知识和信息的进一步整理Genbank：一个来源于有7万种生物的核苷酸序列数据库Swiss-prot：经过注释的蛋白质序列数据库，提供序列查找以及相似蛋白质序列搜索SRS：序列搜索系统，是一种数据库搜索工具，它开放源代码软件，可以在本地计算机网络中安装和运行Entrez：是NCBI开发的核心检索系统，集成了NCBI的各种数据库，具有链接的数据库、使用方便、能够进行交叉检索等特点Bioinformatics：生物与信息技。</p><p>8、窗体顶端 单选题共 50 题 总计 50 分 1 顶部 基本局部比对搜素工具是 A Mega B ClustalW C BLAST D GCG analogy的含义是 A 登录号 B 算法 C 比对 D 类推 提交序列到GenBank中 使用的程序可以是 A Entrez B SRS C Med。</p>