重复率 群体与数量遗传学 教学课件

群体数量遗传学 第8讲 重复力(率) 内容 样本平均数与方差 方差分析(ANOVA) 重复率:概念/估计方法/应用 一、样本平均值与方差 1、定义与计算 为何样本方差用N1为分母？ 自由度=N-1 群体和样本参数的表达方法 在方差分 析中称为 均方 一、样本平均值与方差 1、定义与计算 2、方差的性质 各变量相互独立， 且方差相等时！ 各变量相互独立时 一、样本平均值与方差 1、定义与计算 2、方差的性质 3、样本平均值的标准差(标准误) 样本规模N越大，样 本平均值的标准差越 小，可靠性越高。 二、方差分析(ANOVA) 有s组，每组n个观察值 二、方差分析(ANOVA) 1、观察值离均差平方和的分剖 按第i组内观察数累加 二、方差分析(ANOVA) 将所有s组观察数累加 总离均差平 方和=SST (n倍)组间离均 差平方和=SSB 组内离均差平方 和=SSW 观察值离均差平方和的分剖 二、方差分析(ANOVA) 1、观察值离均差平方和的分剖 2、自由度 总自由度dfT=ns-1 组间自由度dfb=s-1 组内自由度dfw=dfT-dfm= ns-1- (s-1)=s(n-1) 1、观察值离均差平方和的分剖 2、自由度 3、均方 总均方 (n倍)组间均方 组内(误差)均方 方差组分估计 方差组分估计的步骤 当各组观察数不同时 举例 S=4,n=6 观察值组和 平均值 123456 组 别 A9111099126010 B9108876488 C586989457.5 D1216131514178714.5 观察值组和 平均 值 123456 组 别 A9111099126010 B9108876488 C586989457.5 D1216131514178714.5 观察值组和 平均值 123456 组 别 A9111099126010 B9108876488 C586989457.5 D1216131514178714.5 方差组分分析 变异来源 自由度 SS MS 方差组分 总变异 23 232 组间变异 3 183 61= 2.45+69.758 组内变异 20 49 2.45= 2.45 观察值组和 平均值 123456 组 别 A9111099126010 B9108876488 C586989457.5 D1216131514178714.5 三、重复率 1、概念:对于个体可以重复度量的性状,各 次度量值之间的相关称为重复率(力 )(repeatability) 时间上重复 空间上重复 重复率高 重复率低 2、重复率的计算：组内相关系数 母猪不同胎次窝产仔数 123456 个 体 A911109912 B9108876 C586989 D121613151417 三、重复率 1、概念 3、重复率的性质环境方差的剖分 永久环境效应 (特殊环境效应) 临时环境效应 (一般环境效应) 个体两次测定值间的 表型协方差 个体两次测定值间的 表型相关 4、动物生产性状的重复力 奶牛重复力 绵羊重复力 猪重复力 干奶期0.28毛重0.74窝产仔 数 0.15 受胎率0.44羔羊初生 体重 0.32窝产活 仔数 0.10 产奶量0.40断奶体重 0.43断奶窝数 0.13 乳脂率0.80周岁体重 0.73断奶窝重 0.15 re0.3:低重复力；0.3= re0.6:中等重复力； 0.6= re :高重复力 5、重复力的应用 5.1判断遗传力估计是否正确 5、重复力的应用 5.1判断遗传力估计是否正确 5.2确定性状需要度量的次数 个体k次测定均值的表型方差 个体k次测定均值的表型方差 个体k次测定均值的准确度 测定值的准确度与其标准误成反比，可以 用其标准误的倒数来衡量。 测定次数与相对准确度 5、重复力的应用 5.1判断遗传力估计是否正确 5.2确定性状需要度量的次数 5.3估计畜禽终生可能的生产力 k次测量均值的重复率 5.3估计畜禽终身可能的生产力 畜禽终身可能的生产力公式(Lush) 畜禽终生可能的生产力 畜禽k次测定均值 k次测量均值的重复率 群体均值 举例 断奶窝重重复力0.4 全群平均断奶窝重185kg 母猪1已产3窝,平均断奶窝重216kg 母猪2已产2窝,平均断奶窝重221kg 这两头母猪终身可能得到的平均断奶窝重 母猪1 母猪2 5.1判断遗传力估计是否正确 5.2确定性状需要度量的次数 5.3估计畜禽终生可能的生产力 5.4计算多次度量均值的遗传力 小结：个体k次测量均值的遗传参数 作 业 1、根据以下数据估计猪断奶窝重(kg)的重复力 2、计算其中1、2、3、4号母猪断奶窝重的准确 度及终身可能生产力。 母猪号1胎2胎3胎4胎 1959792 29498 395939594 497 598919489 689958886 当各组观察数不同时 ANOVA Source SS dfMS 母猪间 95.58 519.12 母猪内 114.42129.53 Total 210 17 期望均方 个体k次测定均值的准确度 测定值的准确度与其标准误成反比，可以用其标 准误的倒数来衡量。 群体均值=93.3 终身可能生产力 母猪号观察数n 平均值排序 Re(平均值 ) Px排序 13 94.667 3 0.50793794.0093 22 96.000 2 0.4076