基因表达的生物信息学研究

翻译 基酸序列 一维肽链 折叠 蛋白质翻 译后修饰 三维结构 活化的蛋白 转录 内容大纲 基因表达与基因芯片 基于基因芯片的 基因表达 分析 基于 基于 2 内容大纲 基因表达与基因芯片 基于基因芯片的 基因表达 分析 基于 基于 3 4 by in a of at 5 NA to of a NA in a be a 6 of a b c of 8 of 1of of is a of A is to NA to on of a x2 cm 6000 NA to 10 on a 1 “of 2 of of on a 3 3 4 5 6 17 18 A is a a is a to to is of NA to be at 19 20 21 张学工等 ,中国计算机学会通讯 , 第 2卷 , 第 3期 , 2006年 5月 () ) ) 22 23 24 a b c d (or in 内容大纲 基因表达与基因芯片 基于基因芯片的 基因表达 分析 基于 基于 25 选择感兴趣的候选基因 数据的聚类分析：分级聚类 小鼠肝脏发育数据，美国昂飞公司 14 个时间点 : 胚胎期 生 0天， 3天， 7天， 14天， 21天，和成熟肝脏。 它们的功能是什么？ 26 27 数据格式 O:0000009 O:0000016 O:0000009 000009 000016 28 功能分析 0000 000 00 00 100 50 of 00 : 100/150 : 100/1000 is in . 29 超几何分布与 m i n ,11 ni m 30 选择感兴趣的候选基因 数据的聚类分析：分级聚类 小鼠肝脏发育数据，美国昂飞公司 14 个时间点 : 胚胎期 生 0天， 3天， 7天， 14天， 21天，和成熟肝脏。 它们受哪些转录因子调控？ 转录因子结合位点的识别流程 32 5- - - - - - - A 3 5- - - - - A 34 前景集 : 待研究集合 背景集 : 随机从基因组中抽取 已知模体 模体 2 模体 1 利用 (et 与特定基因集相关的模体 35 转录因子结合位点的识别流程 36 内容大纲 基因表达与基因芯片 基于基因芯片的 基因表达 分析 基于 基于 37 to to in to in 40 “730 96 1000 1 to up of at ) 454 ) 1G - I - () 4 42 up 50 300M 3 A by by 44 5 3 G T C A G T C A G T C A C A G T C A T C A C C T A G C G T A G T 1 2 3 7 8 9 4 5 6 T G C T A C G A T 1 2 5 :1:13:1622 :1:13:1622 a_aZ ( 64) by in :1:1601:346 :1:1601:346 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 40 6 6548 6580 6_1_496_300 1 + 11480 11512 6_1_1641_453 0 + (at 容大纲 基因表达与基因芯片 基于基因芯片的 基因表达 分析 基于 基于 49 50 张学工等 ,中国计算机学会通讯 , 第 2卷 , 第 3期 , 2006年 5月 1 et 2009 et 2009 of 52 of 3 4 a b c d ( in 109 *(# t