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文档简介
胶质瘤患者CSF中分子标记物检测方法与意义,首都医科大学附属北京天坛医院 蒋海辉,分子标记物获取途径,肿瘤标本: 1、最珍贵,最可靠的临床样本; 2、获取难度大,需手术获得; 血清标本: 1、标本易获得; 2、检测阳性率较低,因血脑屏障的存在很大大分子物质在外周血液难以检出; 3、血清杂质多,其他血液细胞存在干扰;,分子标记物获取途径,脑脊液标本: 1、容易获得,通过腰穿即可; 2、颅内肿瘤细胞分泌的物质存在于CSF中; 3、CSF中无杂质(cell-free),杂质蛋白含量仅为0.2-0.8mg/ml,远远低于血清中蛋白含量,masking effect 极小; 4、脑肿瘤分泌相关蛋白为血液中的1000-1500倍;,CSF是最理想的标本,分子标记物临床意义,Diagnostic:分子标记物可为胶质瘤的个体化诊断理论依据,如1p/19q、IDH Prognostic:分子标记物可以协助判断胶质瘤患者预后,如1p/19q、IDH Therapeutic:部分分子标记物可以为患者个体化治疗提供理论依据,甚至设计靶向药物,如MGMT、VEGF、EGFR vIII,实例:micro-RNA,方法:收集胶质瘤患者CSF样本10份(实验组),神经功能紊乱患者CSF样本10份、PCNSL患者CSF样本23份、脑转移瘤患者CSF样本7份(对照组); micro-RNA检测方法:RNA提取、反转录、qRT-PCR;,实例:micro-RNA,结果:胶质瘤患者CSF样本中miR-15b、miR-21表达量明显低于对照组。,筛选指标:通过检测患者CSF中micro-RNA表达量筛选出胶质瘤特异性指标,实例:micro-RNA,结果:胶质瘤患者CSF中miR-15b、miR-21的相对表达量(Relative expression levels )均显著低于Control组,反向验证:通过检测CSF中miR-15b、miR-21表达量来诊断胶质瘤,实例:micro-RNA,反向验证:针对miR-15b指标ROC分析,结果: miR-15b指标曲线下面积AUC=0.96; miR-15b指标REL=0.4作为cut-off值,其敏感性为90%,特异性为94.9% 联合miR-15b、miR-21两指标,诊断准确性更优,实例:micro-RNA,文章NEW FINDINGS: miR-15b富含于胶质瘤患者CSF中,是神经功能紊乱患者组的25倍,PCNSL组的5倍,转移瘤组的17倍,为此,它可作为可靠的胶质瘤诊断指标; miR-15b通过调节细胞周期,参与胶质瘤的发生过程。它可能是一个抑癌基因,在细胞周期G1期作用于Cyclin E1(CCNE1); miR-21同样高表达于胶质瘤患者CSF中,它是一个肿瘤基因,可以抑制肿瘤细胞凋亡;它可以靶向作用于一些抑癌基因,如PTEN、PDCD4等;它可以直接下调TIMP3,增加肿瘤细胞侵袭性;,实例:Proteins,方法:从PubMed MEDLINE上文献检索相关研究蛋白; 标本:收集29例胶质瘤患者23份CSF样本,3份肿瘤囊液; Proteins检测方法:ELISA;,实例:Proteins,研究相关实用网址: 寻找基因相关信息:NCBI GENE databases (http:/www.ncbi. /gene/); 基因相关蛋白表达谱查询:Human Protein Atlas (HPA: / ); 查询蛋白间相互作用:Protein Analysis Through Evolutionary Relationships (PANTHER) website (); 蛋白作用信号通路:Ingenuity Pathway Analysis (IPA: Ingenuity Systems, Mountain View, CA, USA, http:/ );,实例:Proteins,14.7% were signaling molecule, 8.8% were cell adhesion molecule, and 8.8% were lyase);,实例:Proteins,40.7% binding, 25.9% catalytic activity, and 14.8% structural molecule activity), and 7 molecular function groups;,实例:Proteins,16.7 % cellular process, 14.8 % developmental process, and 14.8 % metabolic process, 12 biological process groups;,实例:Proteins,It is not surprising to find that most proteins were located at the extracellular space (52 %) ;,实例:Proteins,GBM囊液中蛋白含量显著高于其他胶质瘤CSF中蛋白含量; LGG中CSF蛋白含量低于对照组、AA/AO组、GBM组;,实例:Proteins,GBM囊液中GAL蛋白含量显著低于对照组、LGG组、AA/AO组、GBM组的CSF中的含量,但LGG组、AA/AO组、GBM组间无显著差异;,实例:Proteins,GBM囊液中WNT4蛋白含量显著低于对照组、LGG组、AA/AO组、GBM组的CSF中的含量,但LGG组、AA/AO组、GBM组间无显著差异;,实例:Proteins,GBM囊液中HSPA5蛋白含量显著低于对照组、LGG组、AA/AO组、GBM组的CSF中的含量,但LGG组、AA/AO组、GBM组间无显著差异;,实例:Proteins,GBM囊液中IL-6蛋白含量显著高于于对照组、LGG组、AA/AO组、GBM组的CSF中的含量; 在CSF中IL-6含量随胶质瘤级别增高,含量增加;,实例:Proteins,文章NEW FINDINGS: IL-6可能是GBM患者CSF中特异性分子标记物; IL-6参与免疫应答、急性炎症反应、造血等过程,它可能在机体防御过程中起重要作用; 有证据表明IL-6是致瘤性活动中重要的炎症介质; IL-6通过炎症信号通路,如JAK2-STAT3 and Jagged-Notch等,可增加GBM肿瘤细胞侵袭、增殖能力,并减少GBM肿瘤细胞的凋亡;为此,IL-6或许可以成为潜在的药物设计靶点;,胶质瘤CSF中相关biomarkers,胶质瘤相关的核酸类、CTCs等分子标记物,胶质瘤CSF中相关biomarkers,胶质瘤相关的核酸类、CTCs等分子标记物,胶质瘤CSF中相关biomarkers,血清、血浆、CSF中与胶质瘤相关的蛋白类分子标记物,胶质瘤CSF中相关biomarkers,血清、血浆、CSF中与胶质瘤相关的蛋白类分子标记物,谢谢!,后面内容直接删除就行 资料可以编辑修改使用 资料可以编辑修改使用,主要经营:网络软件设计、图文设计制作、发布广告等 公司秉着以优质的服务对待每一位客户,做到让客户满意!,致力于数据挖掘,合同简历、论文写作、PPT设计、计划书、策划案、学习课件
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