课件：医学科研与文献检索.ppt

仇 晓 春,上海交通大学医学院信息资源中心 2012.10.26 太原,医学科研与文献检索,提 纲,医学科研与文献检索 医学信息资源的类型与利用 全文型、文摘型、事实(循证)型 医学信息资源的评价 医学文献的管理,医学科研与文献的关系,涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则，应对科学文献和相关资料全面了解，并有充分的实验和动物试验（如有必要）的基础上进行。 -世界医学协会赫尔辛基宣言 11/30,文献检索贯穿医学科研全过程,课题设计,选题、查新,科研实施,论文发表,关键技术,成果申报,医学科研与文献检索,科学性：论文的灵魂与生命 科学的态度、科学的方法 创造性：衡量和评价论文质量的重要标准 实用性：理论联系实际， 解决疾病防治的实际问题 规范性：温哥华格式 可读性：术语规范、表达准确,医学科研论文的基本要求,把握科研课题的现状与动态，启发选 题灵感 评价课题的创新性、可行性、实用性 启发和充实自己的研究思路与方法 获得相关理论依据 收集循证研究原始材料,文献回顾的作用,医学文献检索与科研选题,Look for clues unexplained findings, controversies,Attend international meetings,Read the literature, including related fields Attend international meetings ,医学文献的种类,全文型数据库(一次文献) Elsevier、BMJ、EBSCO host、Springer、Wiley、 BMC、PLoS CHKD、万方数据、维普 文摘型数据库(二次文献) Medline(Pubmed)、Embase、Lilacs、SCI Sinomed、CBA 事实型数据库(三次文献) Cochrane 、 Clinical Evidence、EBMR、 Uptodate,常用医学文献数据库的类型,Pubmed,PubMed是美国国家医学图书馆(NLM)下属的国家生物技术信息中心(NCBI)开发的、基于WWW的医学数据库查询系统。 网址： http:/www. /pubmed,PubMed基本检索,自由词检索 renal stone 主题词检索 kidney calculi 布尔逻辑检索 and, or, not 字段限制检索 in Ti ,.Ti 著者检索 刊名检索 日期或日期范围检索 截词检索 renal* 强制检索 “singal cell”,拖曳网自然语言搜索引擎,智能信息资源整合系统,对于自然医学语汇中同义词、近义词学名与俗名的处理 例： Cancer，Tumor * Neoplasms (近义词) German Measles * Rubella (同义词) Vitamin C * Ascorbic Acid (学、俗名) Apoplexy * Cerebrovascular Disorders(同义词) Deoxyribonucleic Acid * DNA (繁、简称) 非典 *严重急性呼吸道综合症 乙酰水杨酸，阿斯匹林 *阿司匹林,MeSH作用1：规范自由词,MeSH作用2，扩展下位词（范畴表）,等级关系: Diseases C Neoplasms C4 Neoplasms by Site (NON MeSH) C4.588 Digestive System Neoplasms C4.588.274 Gastrointestinal Neoplasms C4.588.274.476 Intestinal Neoplasms. C4.588.274.476.411 Colonic Neoplasms C4.588.274.476.411.306 Colorectal Neoplasms C4.588.274.476.411.306.416 HereditaryNonpolyposis .C4.588.274.476.411.306.416.250,C6.240.476,按照学科性质，词义范围的上下类属和派生关系，将字顺表中的主题词分别划分为15个大类，依次用A-N及Z代表。,代表疾病类Diseases,肿瘤,消化系统疾病,检索限定选择,款目词,主题词树状结构,副主题词,Ovary cancer,例: 卵巢癌放疗文献的主题词检索,主题词的转换与副主题词的选择,MeSH树形结构表,检索策略修正,“Ovarian Neoplasms/radiography“Mesh,检索结果与过滤(Limit),文献过滤器,检索结果,高级检索: 布尔逻辑运算,#22 and #18,例: 环磷酰胺联合放射治疗卵巢癌,GoPubM,GoPubMed统计分析功能具有对所有检索结果或单独对分类类目中的术语在PubMed中检索得到的文献进行的统计分析，包括对检索到文献从年代、主题、核心著者、核心期刊、地区分布可视化地图。,What,Who,Where,When,GoPubM,Induced Pluripotent Stem Cells (IPs cells),E (),Lilacs （/en/）,中国生物医学文摘数据库（Sinomed）,,BiosisPreview 简介,Biological Abstracts,BA美国生物学文摘 创刊于1926年,是世界最主要生物学文摘期刊之一。 BIOSIS Previews(BP) 是世界上最全面的生命科学研究参考文献数据库。它涵盖了传统生物学和生物医学领域的原始研究报告和综述。还包含了有关重大的生物学研究、医学研究发现和新生物体发现的主要期刊文献的参考文献。 BP包括：Biological Abstracts,BA和姐妹刊Biological Abstracts/RRM(Reports,Review,Meetings),实验室指南(Protocols),SpringerP 是全球最大的经同行评议的在线实验室指南库，同时它也是全球引用量最高的在线实验室指南库。该数据库包含超过18,000 条分子生物学及生物医学的可在线检索的实验室指南。Springer Protocols 数据库收集大量原创、可靠、标准化的实验室指南，拥有165,000 余页的内容，可供用户检索、阅览和下载，其杰出的实用性和省时性优势，让科研人员大大受益。,SpringerP 内容来自以下著名丛书： Methods in Molecular Biology 分子生物学方法 Methods in Molecular Medicine 分子医学方法 Methods in Biotechnology 生物技术方法 Methods in Pharmacology and Toxicology 药理学与毒物学方法 Neuromethods 神经方法,Springer P,TAYLOR & FRANCIS,SPRINGER,WILEY,ELSEVIER,CABi,Annual Reviews,LAWRENCE ERLBAUM,SIAM,NATURE,PALGRAVE,Karger,THIEME,ACS; RSC,KLUWER,BLACKWELL,AIP; APS IOP,IEEE CS,IEEE; ASCE; ASME; PEP,AAAS,SPIE,MIT,CORNELL (EUCLID),ROCKEFELLER,OUP,PROJECT MUSE,BIG FIVE,Mediums,University Press,Societies,FASEB,SWETS,OViD,EBSCO,ProQuest,Databases,西文全文型数据库：,检索结果与全文库的链结,IPs cellstitle,Publisher,Manuscript,Only those who can afford expensive subscriptions or licences have access,Result:,传统期刊的出版模式,Publisher,Everyone has access All use is fair use,Result:,Manuscript,开放存取期刊的出版模式,OA Journal Successes: PLoS Biology,features works of exceptional significance in all areas of biological science, from molecules to ecosystems, including works at the interface with other disciplines, such as chemistry, medicine, and mathematics Public Library of Science impact factor: 14.7,网上免费医学全文 ,BioMed Central(BMC),中文全文型检索工具,中国医院知识仓库（CHKD） 万方全文期刊数据库 维普全文期刊数据库,本位词检索：不包括下位词的检索主题词,循证医学与医学文献,有益处,可能有益处,利弊相当,可能无益处,未知有效性,可能无效或有害,循证文献,按资源内容分：Studies、Syntheses、Synopses、Systems,Cochrane系统评价：,Cochrane系统评价是以某一具体临床问题（如疾病的治疗、诊断）为基础，系统、全面地收集全世界所有已发表或未发表的临床研究结果，采用临床流行病学严格评价文献的原则和方法，筛选出符合质量标准的文献，进行定性或定量合成（Meta-analysis），去粗取精，去伪存真，得出综合可靠的结论。 Cochrane系统评价是对多个同类独立研究的结果（采用同一种设计、针对同一个问题所得到的研究结果）进行汇总和合并分析，以达到增大样本含量，减少了各种偏倚和随机误差，提高检验效能，得出真实可靠的结论。,Cochrane library,(),Cochrane图书馆由六个主数据库组成。 包括：,Cochrane系统评价数据库 (CDSR) Cochrane疗效评价数据库 (DARE) Cochrane临床对照实验登记数据库 (CENTRAL) Cochrane 系统评价方法综述数据库 (CDMR) 卫生技术评估信息数据库 (HTA) 英国国家卫生服务系统经济评价数据库。(NHS EED),(),Cochrane library,Cochrane library (),UpToDate (),DynaMed,MD Consult (First Consult),电子病历与循证文献系统,医学文献资源的评价 （SCI 、F1000),2004,Cited References,2000,1998,2001,1993,2003,Times Cited,Related Records,2003,2004,1999,2002,1994,2004, Citing ,从一篇高质量的文献出发 沿着科学研究的发展道路, Cited References 越查越旧 Times Cited 越查越新 Related Records 越查越深,2002,期刊影响因子,期刊影响因子（Impact Factor, IF）指期刊近两年的平均被引用率，最早是由美国情报学家SCI创始人尤金加菲尔德(Eugene Garfield)博士在1972年提出来的。 IF=(C2+C3)/(A2+A3) 以1996年Science杂志为例： A21995年出版的文献数1037（篇）， A31994年出版的文献数1054(篇)， C21995年出版的文献在1996年被引用的次数24189(次)， C31994年出版的文献在1996年被引用的次数25170(次)。 IF23.605(次篇)。,Web of Science 检索,IPs Cells,Web of Science 检索,F1000:医学科研中新的学术评价指标,包括两个数据库，“Faculty of 1000 Biology”和“Faculty of 1000 Medicine” F1000B：根据1400 多位专家学者的建议，提供目前世界上最重要的生物学论文信息及研究趋势 F1000M（2006年推出）：由来自全球的（包括美国哈佛大学和英国剑桥大学等著名学府）约2500名顶级医学专家组成顾问团，每日将最近1个月可能改变医学实践的极少数优秀论文,F1000推荐等级与评分: “推荐”: 3 分，指论文本身专业性比较强，可能仅对某一学科或主题感兴趣的研究者有用； “必须阅读”: 6分，是对一般读者均有益的论文 “杰出”: 9 分，指里程碑性质的论文 两个以上推荐人推荐的论文，F1000因子是两个最高评分的均值加上所有评分之和除以30后得的商,F1000M评价委员会 每一主题又划分为不同的部分，由23 人负责，成员包括来自全球的630名研究人员或医生，成员必须在该领域发表过相当数量的论文，得到同行的尊重和认可，同时应兼顾不同国家