在顶级科学杂志上发表论文的技巧.doc

第2章.如何在顶级科学杂志上发表论文 本文由同城交友异性聊天室提供第一，Major advance in a classic field,假如说是一个非常经典的学科如组织胚胎学（读医学院的人，都要学），它已经不能再有很大进展时,突然你有一个重大的突破，这样的工作，应该是相当不错的。第二，New techniques and methods that can be widely used,我们在做研究工作中经常会发现新的方法和技术。一个技术和方法要被非常广泛地使用,那就是一个很好的工作，甚至可以得诺贝尔奖。第三，Discoveries with obvious practical implications，过去在NIH有一中国人发表了一篇文章，发现了AIDS virus的受体。那不得了，艾滋病毒可以进入人类免疫系统的细胞里，找到了受体，显而易见就可以想办法阻止它进入人类的免疫系统细胞,根本不用去想，应用的前景显而易见。第四，Conceptual breakthrough,完全一个新的概念，过去人家不是这样认为的一个概念上的突破。第五，Challenge to traditional views, break dogma，dogma是教课书已经建立一个理论体系，你要能够打破它，证明是错的，就很了不起。 这与上面讲的是对应的，一个是能提出一个新的概念，另外是打破一个旧的观念，就是说我要提出反对意见，原来的概念有问题，对它提出挑战，提出这样的问题，也是一个很好的工作。第六，opening up new area,开创了一个崭新的领域，也是从一个小事情做起，举一个例子细胞凋亡现象的发现，细胞凋亡这是个很大的领域，发现这现象的几位科学家在今后哪一年给他们诺贝尔奖是肯定的。在讲完什么样的工作是好的工作后，再讲讲什么样的工作是不好的工作。第一，Horizontal growth，叫做横向长。第二，Filling gaps，有人发现了A，猜想A会到B，有人发现了C，你就在中间证实一下A是通过B到C的。这样的发现，也不是说不可以发表文章，但这种文章不会在很出色的杂志上发表，因为杂志的编委一看这种文章就认为是一种Filling gaps。第三，Working out details，有人把大的框架已经搞出来了，你把细节再搞清楚的文章，一般不会是特别好的文章。第四，Support existing idea,“me too”，这类文章很多，有些人文献看得很多，而且手脚特别快，等你的文章在Science、Nature上一发表，他马上跟上一篇“me too”，你会，他也会。第五，Follow up，有人在前面已经发表了，我在后面跟上。第六，Incomplete study, preliminary， 这类文章最令人讨厌，国内这样的文章很多，欧洲也多，还有日本。做了二个图或四个图，有这么一点点的现象，故事还没有讲完，马上就送去发表。这类文章在二 三流杂志也不会拒绝，总归是一个发现。这种把故事讲了一半，你把现象搞掉了，使得人家也不能去做一个完整的工作。我觉得这种文章是阻碍了科学的发展，就象 写小说一样，你写了第一节，让别人去写第二、第三节，人家不会愿意去做。会读Paper是你一辈子受用的事情写文章的人就是要牵着你的鼻子看他的文章，让你去相信他写的东西，但你先不要去相信他，拿到文章后，先看题目、摘要，然后就去看图1，因为结果都在图里，不要借助任何帮助的情况下，先给图1下一个你自己的结论，然后再看图2， 也下个结论，等到你把几个图都看完以后，再下个结论，然后去看文章，结果会发现你的结论经常与作者的结论不一样，二个不一样的结论，那总有一个是错的，这 时再去看文章，是你的错，还是他的错，也许你没有看清楚那是你的错，也许是他的解释错，这样的话，你的收获是很大的，而且速度也很快，不会被他牵着鼻子走。看Paper，首先了解他要探讨怎样一个问题，这是一个大框架，以及问题的重要性，假如是个吹毛求痴的小问题，who cares。 然后用的实验方法是否能够回答这个问题，如一个分子在细胞里面是怎么动的，用光学显微镜是没法看的，这肯定是胡说八道。一篇文章一定要有它的闪光的思想， 如在一篇文章中有出人意料的新观点，而且新的观点是否有实验结果来支持，如果实验结果没有支持新的观点，那样的文章要被拒绝。但是很多这样的文章也照样发 表，所以你自己不一定要相信作者的观点，自己要有自己的想法。养成这样一个习惯每周阅读CNS，CNS是Cell、Nature、Science, CNS每周出一期，要养成一个习惯浏览一下文章的目录。我经常会问自己，为什么这篇文章会发表在CNS杂志上，如果能坚持一个学期下来，你必定会有很大的收益。当然很多东西你不懂，偶尔有一个东西你懂，你就会问为什么它可以发表在Nature、Science上，久而久之，你就养成两个习惯，一个是批判精神，很多已经发表在Nature、Science上的文章，都有漏洞，所以要学会批判。另一种你要养成欣赏别人做得好的工作，如到音乐厅去听音乐或到展览馆去欣赏艺术品一样。其实做科学家是很有趣的，政府给你出钱，让你玩，你如同每天在听音乐，每天在看电影一样，那有什么不开心的。怎样的科学工作是好的科学工作其一，必须被公众认为是一个非常重要的科学问题，你一说出来大家都点头这是重要的问题。其二，要有创新的概念，DNA的合成过程大家都知道是重要的，问题是怎样在你的工作中体现出来。在蒲先生的实验室里你写实验设计，蒲先生经常会问你两个问题，第一，你想到的问题，你的竞争对手有没有想到，如果他已经想到，那么就扔垃圾筒。第二，他没有想到，是你想到的问题，但能发表在Nature、Science杂志上吗？其三，如有一个非常重要的问题，而且别人想不到的，但能否过得了关，要看结果是不是可靠，结果是否被人信得过。张香桐先生一个观点，会从三至五个不同的方面来证明。文章一到手第一反应是拒绝，然后再到文章中去找，找到足够的证据来改变我的拒绝，我才考虑去接受，所以你的实验结果一定要用多种方法、从多种角度，反反复复 来证明。这是对得起别人，也对得起你自己。不要过二天人家认为你的文章是错的，你会没面子的，所以结果一定要非常可靠。第四点，你做的工作要unique and unusual,就是要独特非凡。你的科研工作一定要有自己的特色，你要能做出来的东西，人家做不来，而且是unusual的科研工作。后来我与蒲先生谈了这个事情，我说为什么你要选这样题目，而不选辛辛苦苦地去做总会有结果的题目，他说做科学有二种人，一种叫纽约马拉松，纽约马拉松是全世界有名的，一年一次，你要赢这个马拉松比赛，你要very good，要work very hard，拼命练习，肌肉很发达，还要起跑快，每个地方都不能失误。这种科学家叫纽约马拉松式的，本身条件好，又work very hard， 而且起步快。第二种叫做纽约导游，导游在纽约或上海都有，一帮人后面跟着，他拿着一面小旗子，他指向哪儿，一帮人就跟到那儿。他认为这方向走错了，再朝另 一个方向走，大家跟着他走，他不用跑得很快。这种叫做纽约导游，要做一个领路人，要开创新的，不用跑得很快。最后我引用一句杜甫的诗句：语不惊人誓不休。 他每个句子都让人拍案叫绝，句句非常精彩。他不是随随便便就写，也不是天才，但他每次想句子就想跟人家不一样。论文写作不但开始于在思考创新性idea论文写作不但开始于在思考创新性idea，而且贯穿于整个实验过程、论文写作和发表的全过程。在思考创新性idea的过程中，应该已经勾勒出了论文的大致框架，在实验过程中，就是也将此框架进一步细化的过程。我自己的经验是：）做实验前，尤其是新实验（哪怕是实验室其他人已经做了遍的实验）先尽可能的写清楚实验步骤(protocol),这个protocol最好用英文写，并且做成电子版，存在自己的电脑中，打印一份贴在自己的笔记本中，以后再用该protocol,只需写明：参见xx页(refer Pxx。这样到时候写论文时，就很方便了；）新的实验结果一旦得到，要将数据尽快整理成图表，用Powerpoint做成PPT格式，质量和格式就和准备发表一样，哪怕是阴性结果，并且将实验的相关信息和参数尽量详细列出，这样以后无论是开会做presentation还是撰写论文都会方便很多；c)如果是阴性结果，和预测的不同，分析问题的可能原因，有无别的替代方法？是否要修改原来实验方案乃至整个实验设计？; d)同样重要的是，在实验过程中，要经常（我一般一周至少一次）查Pubmed（生物医学最著名的、最重要的摘要数据库）,看相关领域是否有新的论文发表，如果相同思路的结果已经发表，就要及时调整实验方向。当然，看到好的相关文献要及时加到Endnote等文献管理软件中。另外这一过程也是熟悉本领域最新发展的过程，届时写论文时就会有胸中有丘壑的感觉，写起来就可以得心应手。所以在做实验的过程中，也同样可以在两方面准备你的论文手稿：1）及时整理数据；2）跟踪、更新、阅读相关文献。两手都要抓，两手都要硬！学生阶段该学习和掌握的，一定要自己主动去学习和掌握。1） 勤奋。这是取得成绩的必要条件。2） 扎实的理论功底。3） 科学的悟性。4） 多问几个为什么还可以提高自己的预见力。5） 有时候问一个问什么是不够的，必须多问几个为什么，否则对事物的认识就会肤浅。6） 困难，就是迫使我们努力的必要条件，与困难斗，其乐无穷！7） 困难还给了我们脱颖而出的机会。8） 困难是进步的阶梯。9） 在正确的地方使用正确的工具和正确的方法寻找正确的内容10） 一定要记住最重要的东西，要把我们学到的原则应用到日常生活中去。11） 我们不能完全确信任何科学问题。我对你们的回答非常满意。是的，在科学上，一切皆有可能。12） 同我们上课做过的实验相比，日常生活中的实验非常的不完美：它缺乏对照，常常没有重复，更无法做统计分析。怎样使思想和智慧呈指数增长1 以偏概全。不仅要从自己的失败中总结教训，也要从别人的失败