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文档简介

细菌的分类和鉴定 一、微生物的分类 根据微生物的大小、结构、组成等分三类 原核细细 胞型 如:细细菌、放线菌、螺旋体、支原体 、衣原体、立克次体。(也称广义的细 菌) 真核细细 胞型 如:真菌、原虫 非细细胞 型 如:病毒、亚病毒、朊粒 二、细菌的分类方法 根据每种细菌各自特征,并按照它们的 亲缘关系分类,分类方法有两类 1.生理学与生化学分类法(传统方法) 2.遗传学分类法 (一)生理学与生化学分类法 主要以细菌的形态、染色以及细菌的特 殊结构为最基本的分类依据,其它依据还包 括细菌生长条件等等。 主要有两种方法 1、传统分类法 2、数值分类法 1、传统分类法 主要以细菌的形态、生理特征为分类基 础,选择一些较稳定的生物学性状如细菌的 形态结构、染色性、培养特性、生化反应、 抗原性等作为依据,然后按主次顺序逐级区 分。 2、数值分类法 对细菌各种生物学性状按“等重要原则” 进行分类,选用多项生理、生化指标逐一进 行比较,通过查表或计算机分析各菌间相似 度,完成细菌分类。 (二)遗传学分类法 以细菌的核酸、蛋白质等在组成的同源 性程度分类。 主要有三种方法 1、DNA G+C mol%测定 2、核酸同源值测定 3、核蛋白体RNA碱基序列测定 1、DNA G+C mol%测定 DNA分子两条链上4种碱基的总分子量 为100,测定其中G+C或A+T摩尔百分比, 能反应出细菌间DNA分子的同源程度,习惯 上以G+C 作为细菌的分类标记。 不同菌属间的G+C mol%范围很大,在 25%75%之间,但同一种细菌G+C mol% 相当稳定,不受菌龄、培养条件和其它外界 因素影响,亲缘关系越近的细菌,它们G+C mol%越接近(但并非G+C mol%越接近, 亲缘关系就越近?)。 2、核酸同源值测定 为什么不能说G+C mol%越接近,亲缘 关系就越近? 因为G+C mol%只能反映细菌的碱基总 数而不能反映碱基序列! 而利用DNA分子杂交的技术就可以精确 测定DNA分子的碱基序列。这就是核酸同源 值测定。 3、核蛋白体RNA碱基序列测定 核蛋白体RNA碱基序列测定属于核酸范 畴。 由于核蛋白体RNA(rRNA)序列比较保 守,其变化十分缓慢。其中,16s rRNA具 有高度的保守性和特异性以及该基因序列足 够长,因此,被作为细菌鉴定的快速、准确 方法,素有“细菌化石之称”。 (三)两类分类法的优点和意义 方 法优优 点意 义义 生理学与生化学 分类类法 方便、简单、廉 价 主要用于鉴定 遗传遗传 学分类类法 准确、可靠; 有利于了解细菌 的进化和原始亲 缘关系 主要用于分类 三、原核微生物(广义细菌)分类系统 伯杰鉴定细菌手册 (Bergeys Manual of Determinative Bacteriology) 伯杰氏手册:是目前进行细菌分类、鉴定的 最重要参考书,其特点是描述非常详细,包括 对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实 验的具体方法。 四、细菌的分类等级 界 (Kingdom) 门 (Phylum) 纲(Class) 目(Order) 科(Family) 属(Genus) 种(Species) 五、细菌的命名(一) 细菌的命名依据“国际细菌命名法规” 的规定 ,学名用拉丁文,遵循“双名法”。即每一种细菌 的拉丁文名称由属名和种名两部分构成,属名第 一个字母必须大写,其余均应小写(即使种名以 人名或地名命名)。整个属名及种名在出版物中 应排成斜体。 如:Escherichia coli 属名+种名 n属名重复出现,可缩写 如:E.coli (大肠杆菌); n只确定属名,未确定种名的某一株细菌 Salmonella sp. (沙门菌属); n只确定属名,未确定种名的若干菌 Salmonella spp. n亚种用subsp.(正体)表示 Pasteurella multocida subsp. septica 几种不同的书写情况 五、细菌的命名(二) 六、微生物分类鉴定的依据 根据微生物分类学中使用的技术和方法,可 把它们分成四个不同的水平: n细胞形态和行为水平; n细胞组分水平; n蛋白质水平; n基因组水平。 在微生物分类学发展的早期,主要的分类鉴 定指标是以在细胞形态和习性为主,可称为经典 的分类鉴定法 七、细菌的分类方法 n生物分类的传统指标 n分子生物学指标 n微型、简便、快速或自动化鉴定技术 n细菌的数值分类 形态学特征 生理、生化学特征 从不同层次,用不同学科的技术方法来研究和比较 不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物,从中发现反 映微生物类群特征的资料。 八、生物分类的传统指标 (一)形态学特征 包括培养特征、细胞形态及其染色特性、 特殊的细胞结构、运动性等等。 形态学特征指标特点: n易于观察和比较,尤其是真核微生物和具有 特 殊形态结构的细菌; n许多形态学特征依赖于多基因的表达,具有 相 对的稳定性; (二)生理生化特征 包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应 性、碳水化合物的代谢试验、蛋白质和氨基酸的 代谢试验及的碳源和氮源利用试验、各种酶类试 验、抑菌试验等等。 生理生化特征特点: n对微生物生理生化特征的比较也是对微生物 基因组的间接比较; n测定生理生化特征比直接分析基因组要容易; (二)生理生化特征 包括营养类型、与氧的关系、对温度的适应

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