康孕tm-染色体检测.pptx

,孕前产品线 路义霞 2014.8,康孕tm-染色体检测产品介绍,生育健康问题令人担忧！,出生缺陷率,5.6%,早期流产、畸形、死胎、围产儿死亡、婴幼儿死亡、先天残疾,监测期：孕满28周至出生后7天,出生7天后不在检测系统内,344万,*katz vl. spontaneous and recurrent miscarriage: etiology, diagnosis, treatment. in: katz vl, lentz gm, lobo ra, gershenson dm, eds. comprehensive gynecology. 6th ed. philadelphia, pa: elsevier mosby; 2012:chap 16. *himmel, w.; ittner, e; kochen, mm; michelmann, hw; hinney, b; reuter, m; kallerhoff, m; ringert, rh (1997). “voluntary childlessness and being childfree“. british journal of general practice 47 (415): 1118.,生育问题发生率,引起生育问题的因素,流产发生率及原因,自然流产占全部妊娠的15%20%，其中孕早期流产约占自然流产的62%,5,1. family beginnings, pc. recurrent pregnancy loss. (/education/recurrent-pregnancy-loss.html#geneticfactors) 2. the miscarriage clinic. cause 29 suppl b:126-8.,贡献率约50-60%,导致流产的原因,染色体异常,6,染色体异常，反映为一条或多条染色体上存在的数目或结构异常。 机制：细胞有丝分裂和减数分裂的分化过程中出错。,约90%,染色体异常类型示意图,1. nature reviews genetics 13, 493-504 (july 2012). 2. uma m. reddy,et al.the role of dna microarrays in the evaluation of fetal death. tprenatal diag (apr,2012).,非整倍体,缺失/重复,易位,倒位,环状染色体,等臂染色体,康孕tm染色体检测系列,康孕tm -染色体检测-5m 康孕tm -染色体检测-100k 康孕tm -染色体检测-ti 康孕 tm -染色体检测-chry,新旧产品名称对比,康孕tm染色体检测,产品决策树,流产组织 孕周12w,流产组织 孕周12w,引产组织 死胎、胎儿畸形、b超异常,新生儿外周血 多发畸形,5m,100k,ti,父母外周血 查父母是否为异位携带者,查找其他免疫、感染、基因突变等其他原因,康孕tm-染色体检测,产品比较-针对流产家庭（检测流产组织）,康孕tm-染色体检测,产品比较检测反复流产、多发畸形、有出生缺陷生育史，胎儿b超异常，不孕不育的夫妇,产品选择表,康孕tm-染色体检测,因康孕tm-染色体检测-chry仅覆盖95%的azf区缺失，康孕tm-染色体检测-ti覆盖所有染色体区域，针对无精或少精症男性患者，可选择chy或ti产品之一，但是ti检出率更高。,方法学比较案例1,核型分析结果,芯片检测,一条chr 5上有8.8mb大片段缺失，缺失区域拷贝数(102,673,826-111,508,249),c a b,a b,chr8,chr8,chr5,chr5,方法学比较案例1,为什么要进行染色体平衡易位检测?,5-10% of 反复流产因携带平衡易位而导致,特点：携带者正常 子代存在流产、出生缺陷的风险（由非平衡易位导致）,理论非平衡易位发生率: 16/18 实际非平衡易位发生率: 12-20%,常见与平衡易位相关的综合征,edwards syndrome : 大部分为18三体 小部分为 chr18 (q) 平衡易位 wolfhirsch-horn syndrome : del( 4p16.3) 90% de novo, 10%遗传自携带平衡易位的双亲或双亲之一,罗氏易位 近着丝粒、端粒区域的染色体异常 多倍体 单亲二倍体 低比例及复杂嵌合,检测局限,刘女士，28岁，孕9w发现胚胎停育，流产绒毛检测，结果显示为t6,阳性案例,康孕tm-染色体检测-5m,孕周：5w,2013年12月19日首次b超，2014年1月2日b超与首次b超大小一致，停止发育,康孕tm-染色体检测-5m,检测结果：dup(12q11q12,1.06m),t16,阳性案例,孕周：8周，宫内孕8周未见胎心搏动，胎停3次,康孕tm-染色体检测-5m,检测结果：del(6q24.1q27,28.91m),dup(11q22.3q25,28.38m),del(22q11.21,1.13m),注：del(22q11.21,1.13m 该结果不在报告范围内，因此在电子核型图上不显示。,阳性案例,康孕tm-染色体检测-100k,女 ，2岁3月15天，身材短小1年余，头围43cm，无特殊面容。 体征：ht78.5cm（小于3rd）(fh168cm，mh151cm）； 骨龄1岁6月，血脂hdl0.73mm/l，apoal：u79g/l,检测结果：46，xn，del(7)(q31.1),del(10)(q21.1),del(15)(q26.2,q26.3),综合征：chromosome 15q26-qter deletion syndrome 重要基因：igf1r 患者主要表现为生长发育迟缓。部分患者还有小头畸形，小颌畸形，低耳位，鼻梁低，睑裂，内眦皱襞，斜视，先天性心脏畸形，肺发育不良，肾脏畸形，复发性低血糖，听力损失，头皮毛发多的表征。 omim ：612626,阳性案例,dup(7p14.1,159kbp),del(12q13.3,399kbp),dup(15q11.2,164kbp),dup(xq21.33p22.33,107kbp),检测结果：15号染色体的长臂部分（24503926-24668785）位置存在164 kbp的片段重复。 该区域完全包含于已知疾病chromosome 15q11-q13 duplication syndrome的重复片段中。 疾病症状：功能自闭症，智力低下，共济失调，癫痫发作。 omim： 608636,康孕tm-染色体检测-100k,男，4岁，智力低下，有自闭症倾向，偶见癫痫发作,阳性案例,28岁女性，第一胎孕中期b超发现发育异常后引产处理，孕第二胎24w时b超发现胎儿发育异常，引产处理。 核型结果： 女性：t(8;18)，但无法确定片段大小及具体位置。 第二胎引产组织：结果模糊，难以准确判断。,康孕tm-染色体检测系列-ti结果： 女性（外周血）：46 , xn, t(8, 18)(q24.13, p11.22), dup(7q36.2) 胎儿（组织）：46 xn, t(8;18) (q24.13q24.3;p11.32p11.22), dup(8)(q24.13q24.3), del(18)(p11.32p11.22), del(5)(p14.3), dup(7)(q36.1), dup(7)(q36.2), dup(2)(q13),胎儿样品电子核型图,880k 192k 10.75m,8.79m 20.77m 8.66m 350k 283k 193k 130k,康孕tm-染色体检测-ti,阳性案例,1,检测结果：seqgrch37/hg19 der(6)t(6;10)( q27; q26.3) 6q27 (167856498170879606)1, 10q26.3 (131879650135404771)3 解释：染色体6q27区段有长约3.02mbp的片段缺失，该区段内含有与牙质发育不全及小牙畸形相关的smoc2基因；与室周小节异位相关的ermard基因；与脊髓小脑性共济失调17相关的tbp基因，等。 同时，染色体10q26.3区段有长约3.53mbp片段重复，该区段内暂未发现明确致病基因,其母亲检测结果；,seqgrch37/hg19 t(6;10)(q27(167879969 167888242);q26.3(131937410 131946734) 解释：6号染色体的167,879,969-167,888,242（对应区带：q27）远端片段与10号染色体的131937410-131946734（对应区带：q26.3）远端片段发生平衡易位。,康孕tm-染色体检测-ti,男孩，5岁，小牙畸形，发育迟缓，智力迟缓。,推测：孩子染色体异常遗传自母亲、,阳性案例,产品选择表,因康孕tm-染色体检测-chry仅覆盖95%的azf区缺失，康孕tm-染色体检测-ti覆盖所有染色体区域，针对无精或少精症男性患者，可选择chy或ti产品之一，但是ti检出率更高。,样本类型及工作周期,送样注意事项,华东样本降解情况,1. 送检单填写完整（患者信息、送检单位、样本类型、检测项目等） 2. 采样及运输注意事项 量足：至少含100mg的胚胎、胎儿组织或绒毛（蚕豆大小） 干净：用pbs或生理盐水冲洗至澄清（无明显血色）后置于无菌痰液杯。勿进行培养、固定及包埋处理。 参照用血：需同时提供至少2ml父亲和母亲外周血（edta抗凝）作为参照。 禁止将样本在室温状态下放置；忌反复冻融。 低温运输：足量超低温冰袋（8-10个/次）或干冰（3公斤/快递天）；超低温冰袋/干冰（夏季需使用干冰）塞满泡沫盒，72h内可用冰袋运输，超过72h干冰运输，确保样品送达至华大时温度低于4。,不规范的送样容器： 塑料袋,规范的送样容器,送样注意事项,规范的样本包装状态,40ml痰液杯,推荐厂家： 浙江黄岩埃迪塑料厂,部分文章与专利,33,流产组织染色体异常（非整倍体）检测：已完成所有（除1号、19号染色体三体）染色体非整倍体阳性样本验证。 发表文章：ww xie, et al. rapid detection of aneuploidies on a benchtop sequencing platform. prenatal diagnosis（华大基因与中南大学生殖与干细胞工程研究所、中信湘雅生殖与遗传专科医院合作） 染色体片段微缺失/重复检测：已检测已知acgh结果的全部16种微缺失/微重复综合征的阳性样本，检出率为99.9%，发现新的染色体1mb以上缺失/重复突变15个。 发表文章：dan s, chen f, choy kw, jiang f, lin j, et al. (2012) prenatal detection of aneuploidy and imbalanced chromosomal arrangements by massively parallel sequencing. plos one. 华大基因与北京妇产医院、香港威尔斯亲王医院合作发表 染色体平衡易位检测： dong z, jiang l, yang c, et al. a r