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(a) ATCC: American Type Culture Collection(美國菌種保存中心); (b) NRRL: Agricultural Research Service Culture Collection(農業研究服務菌種) ; (c) JFCC: Japan Federation of Culture Collection(日本微生物株保存連盟) ; (d) CCRC: Culture Collection and Research Center(菌種保存中心),現已改稱Bioresource Collection and Research Center (生物資源保存中心,簡稱 BCRC)。詳見42頁。6. 微生物之命名依據包括形態、生理性質、來源、色素生成、病原性、發現者等。詳見63頁。7. 細菌依性狀不同,可分為球菌、桿菌、螺旋形細菌。8. (a) 麴黴:例如Aspergillus oryzae;(b) 酒精酵母:Saccharomyces cerevisiae;(c)枯草菌:Bacillus subtilis;(d) 乳酸菌:例如Lactobacillus bulgaricus;(e) 醋酸菌:例如Acetobacter aceti;(f) 大腸菌:Escherichia coli。9. 好氣菌(aerobes;又稱好氧菌、嗜氧菌、喜氧菌)、厭氣菌(anaerobes,又稱厭氧菌)、兼性厭氣菌(facultative anaerobes,又稱兼性厭氧菌)。10.革蘭氏陽性菌與陰性菌之細胞表層構造差異,例如(1)陽性菌最外層為胜糖層,而陰性菌最外層則係外膜然後才係胜糖層;(2)陽性菌之胜糖層較陰性菌的厚;(3)陽性菌細胞壁含有台口酸,而陰性菌則無。詳見82頁。11.單球菌(例如Micrococcus lysodeikticus)、雙聯球菌(例如Diplococcus pneumoniae)、四聯球菌(例如Pediococcus cerevisiae)、八聯球菌(例如Sarcina ventriculi)、鏈球菌(例如Streptococcus faecalis)、葡萄球菌(例如Staphylococcus aureus)。詳見71頁。12.Bacillus 屬、Clostridium屬。詳見73頁。13.無鞭毛(atrichous)、一端有單鞭毛(monotrichous)、一端有束鞭毛(lophotrichous)、二端有鞭毛(amphitrichous)、周身有鞭毛(peritrichous)。詳見76頁。14.糖類經由乳酸菌發酵生成乳酸,可分為正常乳酸發酵、異型乳酸發酵。詳見96頁。15.酒精經由醋酸菌發酵而氧化成醋酸。詳見99頁。16.例如大腸桿菌(E. coli)可用來作為水質判定之依據。詳見100頁。17.細菌莢膜之組成,例如Bacillus anthraxis的為聚胜月太;Leuconostoc mesenteroides的為聚葡萄糖;Streptococcus pneumoniae的為複合多糖。詳見91頁。18.例如性線毛較一般線毛長且粗,性線毛僅存於雄性細菌(F+),不會超過10條。詳見93頁。19.革蘭氏陽性菌:Bacillus subtilis; Clostridium tetani; Micrococcus lysodeikticus; Staphylococcus aureus。革蘭氏陰性菌:Escherichia coli; Pseudomonas aeruginosa; Salmonella typhi; Serratia marcescens。20.軸絲(filament)、彎鉤(hook)、基體(basal body)。21.無橫隔(nonseptate)或稱無橫隔多核細胞(coenocytic)、具有橫隔之單核細胞(septate with uninucleate cells)、具有橫隔之多核細胞(septate with multinucleate cells)。詳見104頁。22.營養菌絲(vegetative hyphae)或稱基中菌絲(submerged hyphae)、生殖菌絲(reproductive hyphae)或稱氣生菌絲(aerial hyphae)。詳見105頁。23.子囊孢子(ascospores)、擔子孢子(basidiospores)、接合孢子(zygospores)、卵孢子(oospores)。詳見105頁。24.分生孢子(conidiospores 或稱conidia)、孢子囊孢子(sporangiospores)、關節孢子(oidia或稱arthrospores)、厚膜孢子(chlamydospores)、游動孢子(zoospores)。詳見105頁。25.卵菌類(oomycetes)、接合菌類(zygomycetes)、子囊菌類(ascomycetes)、擔子菌類(basidiomycetes)、不完全菌類(deuteromycetes或稱imperfect fungi)。前兩類(卵菌類、接合菌類)屬於藻狀菌類(phycomycetes)。26.(a)根黴屬(Rhizopus):Rhizopus japonicus(釀酒)、Rhizopus nigricans(生產反丁烯二酸);(b)毛黴屬(Mucor):Mucor mucedo(製造豆腐乳或生產凝乳酉每)、Mucor pusillus(生產凝乳酉每);(c)麴菌屬(Aspergillus):Aspergillus niger(生產有機酸或酵素)、Aspergillus oryzae(製造醬油、味噌);(d)青黴菌屬(Penicillium):Penicillium camemberti(製造乳酪)、Penicillium chrysogenum(生產青黴素)。27.amylo process:阿米諾法;amylo mold:阿米諾菌。詳見116頁。28.所謂產膜酵母(film forming yeast, film yeast, pellicle formation yeast)係指於進行液態培養時,會形成一層盤登於培養器壁面之乾薄膜。例如Saccharomyces rouxii var. halomenbranis, Pichia membranaefaciens, Hasenula anomala 等。29.充當水域食物鏈之初級生產者;平衡生態與淨化環境;水質污染度之指標。詳見121頁。30.充當海洋食物鏈之初級製造者;光合作用所產氧氣能有益於環境淨化;穩定及改善土壤物性、作為肥料、磨劑、隔熱物、濾器等。詳見126頁。31.單蟲界(monera)、原生生物界(protista)、真菌界(fungi)、動物界(animalia)、植物界(plantae)。32.原生生物界(protista)、動物界(animalia)、植物界(plantae)。33.例如碘液(iodine solution)於革蘭氏染色之際,可用來幫助染料(結晶紫)固定於菌細胞內。詳見69頁。34.細菌學鑑定手冊。詳見93頁。35.有用黴菌:Monascus purpureus(紅麴色素、降膽固醇藥劑)、Penicillium roqueforti(製造乳酪);有害黴菌:Aspergillus flavus(黃麴毒素生產菌)、Fusarium oxysporum(植物病原菌)。36.有用酵母菌:Saccharomyces cerevisiae(釀酒)、Saccharomyces rouxii(釀造味噌);有害酵母菌:Cryptococcus neoformans(造成隱球菌病)、Candida albicans(造成念珠菌病)。37.lytic phage:溶解性噬菌體,亦稱毒力噬菌體(virulent phage),能讓寄主細菌發生溶解之噬菌體;lysogenic phage:潛溶性噬菌體,亦稱溫和噬菌體(temperate phage)。38.詳見109-112頁。39.例如屬於絕對寄生性微生物;主要成分為核酸及蛋白質等。詳見133頁。40.主要為核酸(核心成分)及蛋白質(外殼成分)。詳見134頁。41.二十面體(icosahedron)或螺旋狀(helical)。詳見137頁。42.附著(attachment)、穿入(penetration)、熟成(maturation)、釋出(release)。詳見144頁。第三章1. 解釋名詞: (a) cardinal temperature: 主要溫度。包括最高、最適、最低溫度。詳見164頁。 (b) stenothermal: 狹溫域菌。係指生長溫度範圍較窄之微生物。詳見166頁。 (c) eurythermal: 廣溫域性菌。係指生長溫度範圍較廣之微生物。詳見166頁。 (d) psychrotroph: 低溫菌。亦稱psychrotrophic microorganism或psychrophiles。詳見167頁。 (e) mesophile: 中溫菌。詳見168頁。 (f) thermophile: 高溫菌。詳見168頁。 (g) halophile: 好鹽菌。詳見174頁。 (h) barophile: 好壓菌。詳見175頁。 (i) prototroph: 原營菌。係屬一種變種,重獲生長於原先不含生長因素培養基之能力。auxotroph(營養變異菌)乃其相對語。 (j) auxotroph: 營養變異菌。原營菌(prototroph)若因發生變異而失去合成某種生長因素之能力則成營養變異菌。基於此故,於培養營養變異菌時,須添加其所無法合成之因素於培養基。 (k) osmotolerant: 耐滲透菌。詳見173頁。 (l) heterotroph: 有機營養微生物(亦稱異營性細菌)。通常無法利用二氧化碳作為唯一碳源,而係須由有機化合物獲取碳元素之微生物稱之。autotroph(無機營養微生物,亦稱自營菌)乃其相對語。2. 可分為誘導期(lag phase)、對數增殖期(log phase或exponential phase)、定常期(stationary phase)、死滅期(death phase或decline phase)。詳見155頁。3. 物理性環境因素:溫度、壓力、光線、放射線等;化學性環境因素:氧氣、水分、氫離子濃度、營養物質、抗微生物性物質等;生物性環境因素:共生、偏利共生、拮抗等。詳見156頁。4. 光自營菌(photoautotroph)、光異營菌(photoheterotroph)、化學自營菌(chemoautotroph)、化學異營菌(chemoheterotroph)。詳見179頁。5. 細菌主要以分裂法;酵母菌主要以出芽法;放線菌主要以分裂法或菌絲伸長;黴菌以分裂法或菌絲伸長。詳見149頁。6. 總菌計數法、活菌計數法、分光學法、菌體重量法。詳見151頁。7. 厭氣操作箱、厭氣培養瓶。8. acidophile:好酸菌,亦稱嗜酸菌;neutrophile:好中菌,亦稱嗜中菌;alkalophile:好鹼菌,亦稱嗜鹼菌。詳見頁。9. 黴菌:微酸性(pH 4 - 6);酵母菌:中性 微酸性(pH 5 - 7);細菌:中性 微鹼性(pH 7 - 8)。10.minimal medium:最小培養基;synthetic medium:合成培養基;complex medium:複合培養基;selective medium:選擇培養基;differential medium:鑑別培養基。11.synchronous culture:同步培養。12.aerobe:好氣菌;anaerobe:厭氣菌;facultative anaerobe:兼性厭氣菌;obligate aerobe:絕對好氣菌。詳見157頁。13.pure culture:純培養;streak culture:劃線培養;pour culture:傾注培養;slant culture:斜面培養。14.parasitism:寄生;saprophytism:腐生。15.洋菜膠斜面(或平板)培養保存、孢子懸浮液保存、液態氮保存。16.於影響生長的所謂溫度效應裡,酵素催化反應被認為係屬最重要之因素。詳見163頁。17.osmotic effect:滲透效應。詳見172頁。18.因UV會造成DNA裡的胸腺口密口定(thymine)形成二聚物。詳見176頁。19.去氧核糖核酸:deoxyribonucleic acid,簡稱DNA;去氧核糖核甘:deoxyribonucleoside;去氧核糖:deoxyribose。詳見181頁。20.詳見181 182頁。第四章1. 解釋名詞: (1) sterilization: 滅菌。殺死或除去所有微生物之繁殖體與芽孢,使物體或溶液內外皆呈無菌狀態。 (2) disinfection: 消毒。使病原菌數減少至不會有造成疾病之威脅的程度。 (3) tyndallization: 間歇滅菌法。(4) lyophilization: 冷凍乾燥。(5) autoclave: 高壓蒸氣滅菌器。(6) chemotherapeutic agents: 化學療劑。(7) plasmolysis:質壁分離。詳見頁。 (8) cold sterilization: 冷滅菌。利用輻射滅菌。(9) phenol coefficient: 酚係數。詳見頁。(10)mycotoxin: 黴菌毒素。2. 作用於蛋白質之反應;作用於細胞膜之反應;作用於其他細胞成分之反應;作用於病毒之反應。3. 對微生物具毒性;對人及其他家畜動物無毒性;安定性;溶解性;均質性;透過力;殺菌力不因有機物的存在而受影響;於室溫就具殺菌力;無腐蝕性、無著色性、無臭味、不損壞包裝容器等;無令人不舒服之味道;去污力;可用性。4. 酚(phenols)、醇類(alcohols)、鹵素(halogens)、重金屬(heavy metals)。5. 滅菌時間須依滅菌物之性質、容量等因素來考量,不適於諸如油脂或試管之類的物質之滅菌。6. 物理法:低溫處理(冷藏、冰藏、凍藏)、加熱處理(低溫加熱處理、高溫殺菌)、降低水活性(乾燥、鹽漬、糖漬)、除氧(真空包裝、更換氣體包裝、添加脫氧劑);生物法:可食菌發酵;化學法:燻煙法、食品添加物(保存劑、殺菌劑)。詳見頁。7. 免疫(immunity):可分為先天免疫(innate immunity)及後天免疫(acquired immunity);抗體(antibody):動物受抗原刺激所產生之一種特異性物質;疫苗(vaccines):致死或弱毒化或無毒之微生物或其產物之一種製劑,用來產生自動免疫。詳見-206頁。第五章1. 解釋名詞: (a) zymases: 多種酵素混合在一起的複合發酵酵素之總稱。詳見220頁。 (b)-amylase: 液化澱粉分解酉每,屬於內切型澱粉分解酉每(endo-type amylase)。詳見229頁。 (c) debrancing amylase: 切枝型澱粉分解酉每。glucoamylase、pullulanase即屬之。 (d) constitutive enzyme: 體質酉每,亦稱構成性酵素。詳見頁。 (e) inducible enzyme: 誘導酉每,亦稱適應酉每(adaptive enzyme)。詳見頁。 (f)-amylase: 糖化澱粉分解酉每,屬於外切型澱粉分解酉每(exo-type amylase)。詳見頁。(g) extracellular enzyme: 細胞外酵素,或稱外酵素(exo-enzyme)。詳見230頁。 (h) intracellular enzyme: 細胞內酵素,或稱內酵素(endo-enzyme)。詳見230頁。(i) substrate specificity: 基質特異性,或稱受質特異性、基質專一性、受質專一性。詳見頁。(j) apoenzyme、holoenzyme:單純蛋白質型酵素、複合蛋白質型酵素。詳見238頁。 (k) operon theory: 操縱子學說。詳見244-246頁。 (l) chymogen: 潛在酵素,或稱前驅體酵素(precursor enzyme)。詳見249頁。2. 反應條件溫和、強的催化作用、所需反應時間短、受質特異性等。3. bromelain(鳳梨酵素)、papain(木瓜酵素)、cathepsin(組織蛋白酉每)、pepsin(胃蛋白酉每)、rennin(凝乳酉每);amylase(澱粉分解酉每)、cellulase(纖維素分解酉每)、chitinase(幾丁質分解酉每)、pectinase(果膠分解酉每)、蛋白質分解酉每(proteinase)。詳見225頁。4. 氧化還原酉每(oxidoreductase)、轉移酉每(transferase)、水解酉每(hydrolase)、脫離酉每(lyases)、異構酉每(isomerase)、結合酉每(ligase)。詳見227頁。5. 酵素濃度、基質濃度、溫度、酸鹼值、活化劑、抑制劑。詳見234頁。6. prothetic group:補助基。與輔酉每同屬輔因子,為其結合力較輔酉每的緊。詳見239頁。7. feedback inhibition: 回饋抑制。詳見246頁。8. allosteric enzyme: 異化酉每。除了具有活性位置(active site)之外,尚具異化位置(allosteric site)。詳見247頁。9. 擔體鍵結法(carrier binding method)、交聯法(cross-linking method)、包埋法(entrapping method)。詳見251-252頁。10.例如反應可連續進行、反應時間可縮短、反應條件較易控制等。詳見253頁。11.例如酵素活性之固定化率、酵素活性之安定性、雜菌汙染之防止、附著物之去除等。12.蛋白質分解酉每、澱粉加工相關酵素、凝乳酉每。詳見255頁。13.active site: 活性位置;allosteric site: 異化位置。詳見235-236頁。14.competitive inhibitor: 競爭型抑制劑;noncompetitive inhibitor: 菲競爭型抑制劑。詳見235-236頁。15.catabolite repression: 異化代謝產物抑制。詳見246頁。第六章1. UV法、Folin法、Biuret法、Lowry法、Kjeldahl法。詳見261-263頁。2. 化學法:溶菌酉每、界面活性劑;物理法:音波、均質、玻璃珠磨碎。詳見266-267頁。3. 繁殖速度快、繁殖條件容易控制、供給量容易控制、可依菌種不同而選擇能大量生產所要酵素之菌種、可經人為變異提升菌種之酵素生產能。詳見268-269頁。4. 生長速度快(培養時間短)、培養基便宜、酵素生產量高、容易回收(純化分離)目標酵素、具安定性、具安全性、所生廢液容易處理。詳見272頁。5. 希望能藉由人工變異而篩選到生產率較高之突變菌;希望能藉由減少其他不必要之酵素或代謝物的產生,而有利於後續之目標物質的純化分離。詳見273頁。6. meat extract: 肉萃取物;pepton (peptone, polypeptone): 蛋白月東;casamino acids: 酪蛋白酸解物;vitamin deficient casamino acids: 缺維生素酪蛋白酸解物。詳見277頁。7. corn steep liquor (CSL): 玉米萃取物。詳見278頁。8. 依序加入培養基之組成物;避免因受熱而發生沉澱反應等。詳見278頁。9. 例如沉澱法、乾燥法、蒸發法、超過率與逆滲透法。詳見279-281頁。10.沉澱法、層析法。詳見281-291頁。11.salting in: 鹽溶作用;salting out: 鹽析作用。詳見283-284頁。12.精蛋白、鏈黴素、聚乙烯醯胺、錳離子、核酸分解酉每。詳見283頁。13.(1)利用蛋白質分子本身的荷電性質差異來達成分離之目的;(2)若目的蛋白質之等電點高於pH 7,原則上係選用陽離子交換樹脂(例如CM-Sephadex),若係等電點低於pH 7,則係選用陰離子交換樹脂(例如DEAE-Sephadex)。詳見288-290頁。14.affinity chromatography: 親合性層析法。詳見290頁。15. 酵素之specific activity(比活性)係由酵素活性單位(U)除以酵素重量(例如g)所得數值,於純化過程當中,比活性之數值通常都會愈來愈高,亦即,所得酵素愈來愈純(所含非目的之蛋白質愈來愈少)。第七章1. anabolism: 合成性代謝,亦稱同化反應(assimilation);catabolism(分解性代謝),亦稱異化反應(dissimilation)。詳見293-294頁。2. 好氣性脫氫反應(aerobic dehydrogenation);厭氣性脫氫反應(anaerobic dehydrogenation)、發酵(fermentation)。詳見294頁。3. 於進行分解時,有氧參與的反應稱之為呼吸(respiration),若係僅有酵素作用而無氧氣參與的反應則稱發酵(fermentation)。詳見296頁。4. TCA循環(TCA cycle)。詳見298頁。第八章1. transcription: 轉錄;translation: 轉譯。詳見304-305頁。2.central dogma: 中心信息。詳見305頁。3. coding strand: 指令鏈;noncoding strand: 非指令鏈。詳見305頁。4. retrovirus: 逆轉錄病毒。詳見307頁。5. polycistronic mRNA: 複遺傳單位mRNA。詳見309頁。6. intron: 間隔區;exon: 表現區。詳見313頁。7. site mutation: 點變異。詳見315頁。8. splicing: 接合。詳見313頁。9. restriction enzyme: 限制酵素。詳見316頁。10.recombinant DNA: 重組DNA。詳見316頁。第九章1. 單發酵(single frementation):直接利用糖分進行酒精發酵者;單行式複發酵(single step complex fermentation):糖化(saccharification)與發酵(fermentation)個別進行;並行式複發酵(parallel step complex fermentation):糖化(saccharification)與發酵(fermentation)於同一容器內同時進行。詳見326頁。2. 菌種好壞影響所釀酒類品質甚鉅,因而所擬改良之性質包括糖化酵素強、耐機械剪力(以利發酵槽發酵)、提高酒精生產能、減低危險成分之生產等。詳見331頁。3. 利用微生物(例如Bacillus stearothermophilus)所生產乳糖分解酉每(lactase,或稱-galactosidase)分解牛乳所含乳糖。詳見335頁。4. 細菌菌酉元:Streptococcus lactis, Streptococcus cremoris, Lactobacillus bulgaricus, Lactobacillus casei 等;黴菌菌酉元:Penicillium camemberti, Penicillium roqueforti等。詳見338頁。5. 例如利用微生物所生產酵素來分解酵母RNA;利用微生物發酵生產核甘酸。詳見342-345頁。6. 果寡糖(fructooligosaccharides)、巴拉金糖(palatinose)、偶合糖(coupling sugar)。詳見344-348頁。7. fructooligosaccharides:果寡糖、coupling sugars:偶合糖、cyclodextrin:環狀糊精。8. 靈芝:多糖體及三帖類;冬蟲夏草:蟲草酸、蟲草素等。詳見354-358頁。9. 可分為機能性乳酸菌型、素材添加型。詳見358頁。第十章1. 所謂的GMO食品就是由基因改造生物(genetically modified organisms,簡稱GMO)為原料所製造的食品。2. Ti 質體係為又發腫瘤之主體,其T-DNA裡存有指令生產生長激素之基因,遭農桿菌感染之植物細胞因而形成王冠癭瘤。詳見369頁。3.藉由農桿菌將所擬導入之外源基因(有用基因)嵌入其他生物(例如農作物),因而得以育種出能生產有用物質之基因重組生物。詳見370頁。4. 例如加拿大農長青公司利用放線菌Streptomyces viridochromogenes 生產除草劑,並且利用農桿菌(Agrobacterium tumefaciens)將源自Streptomyces viridochromogenes之PAT基因(解藥)送入所擬基因改造之農作物,因而育種出耐該除草劑之農作物。詳見373-375頁。5. 例如耐保存番茄、耐除草劑大豆、抗蟲害玉蜀黍等。詳見367頁。第十一章1. 蛋白質分解酉每(protease)、澱粉分解酉每(amylase)、脂質分解酉每(lipase)、纖維素分解酉每(cellulase)。詳見381頁。2. 耐鹼性、耐界面活性劑等。3. 例如源自Saccharomyces cerevisiae的alcohol dehydrogenase可用來測量乙醇;源自Pseudomonas fluorescens的cholesterol esterase可用來測量膽固醇等。詳見385頁。4. -amylase: 液化澱粉分解酉每,屬於內切型澱粉分解酉每(endo-type amylase);-amylase: 糖化澱粉分解酉每,屬於外切型澱粉分解酉每(exo-type amylase);glucoamylase: 葡萄糖生成型澱粉分解酉每。詳見389頁。5. -amylase(液化澱粉分解酉每);-amylase(糖化澱粉分解酉每);glucoamylase(葡萄糖生成型澱粉分解酉每);pullulanase(茁黴多糖酉每);isoamylase(支鏈澱粉分解酉每)。6. debranching enzyme(切枝酉每):例如debrancing amylase即屬之。詳見389頁。7. naringinase(柚甘分解酉每):柑橘果汁苦味去除;hesperidinase(柑果甘分解酉每):柑橘果汁或罐頭之沉澱去除。詳見392頁。8. glucose oxidase(葡萄糖氧化酉每)可用來除去食品裡之氧氣。詳見393頁。9. 例如glutamic acid可用來生產味精(sodium glutamate)、methionine及lysine添加於飼料以增加飼料之營養價值等。詳見397-398頁。10. optical resolution(光學分割):例如胺基酸之光學分割即係利用固定化酵素於左旋L型及D型胺基酸之分離。詳見399-400頁。11. 幾丁類物質(chitinous materials)包括幾丁質(chitin)、幾丁聚醣(chitosan)等。詳見405-406頁。12. 藉由蛋白質工程(protein engineering)或基因重組(genetic recombination)相關技術,改進源自生物之天然酵素,使其更符合需求目的(例如耐熱、耐界面活性劑等)。詳見384頁。第十二章1. 抗生素(antibiotics)微生物所生產會抑制其他微生物生長之物質。詳見415-417頁。2. -lactam antibiotic(內醯胺抗生素):係指以青黴素(penicillin)為始的那些具有內醯胺(-lactam)構造,且此構造為主要
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