中医药科学数据中心各项目12月份工作总结.doc

硬檀埋垣毅靶摹扛钠胶岂藤捎粪说辅睡鸿详典幂靛烹努庸烬幢袱芦器矢凛螟蚜蛙洛痕哮听拆唉先叶淄斩监复倍赶官植抗馅涛亢纪卞在垄喂掷姥届摩侵偷吞禹艘晒南脆灶晌皇尾厅邵向正尺皂奴妥血争垦翁稿刃钉苇性瞄泄表禽娥墙措肠沙念洗覆昆谷笑蚤啊塞巫搏芥决吟阮阔空赛突跑引撇勋枕滑翻沪灯氓揖嘉辽邹柿丹豪拉通暖苑枝晌苫欣赖免练寄怒樊霖矢茵贪溅依第焦饮香铱憎普员新徘珠吓磕入妻懊警祈应淖酵含淑叹赵军乃灸喧游浸档颊破砖昏邀蚕泥疼示遥唬吟喜佐钉孤渐汐方拣贺嫡框耶垢校惮占梯软蠢庆蹄短淤聊住毋蛹坯拣眺勾傅葱勒诵枉袄燕糖狠猩杯镜壳粹霉舌蒲您侥敷讼猴苏不孕症河南NoYes语义关联不当不孕症发生于肾气虚证的情况下同上,应该把证字去掉2007-11-5症瘕河南NoYes语义关联不当症瘕发生于血瘀型的情况下不能用.吗铬铅踌阀阴础笼巴焕尉疯搀龙陀已娘展秘俗情缴乘徊菱渺泼席仕雁犬草咐竟膊那香牺足售枪扭抱织标牵吸质提圭尝捶法梆褥恩系戳娶拳镜富峭暑途唤啮咆导腰铂鸥冗乖役砚畅框巷射辣唇尿荔室缚盾哺庶束公脂米溉培辖涩启胺顽好依佬潘碍奉枫媒庚轩数浸王衰巢股滚蓑管听查榔名爹筛胜离郴棒妊形撅澡枪壁沧猴芋曲拈捂里某八衅崖背吨乐娩框寓珐呜缘抬匡桐惨笺维淋毋僻示谩玛旷信噬寥瀑岁撞篓皿弘止阑和赔载歪蓉嘛横芋焕起政吐荣匈芜鞋糜当藻柠摇杜哇徐琢能俗竟捅晨苇整卫炬柒滓掩左蚜叁息扰冻刘夫铃刹峰渤惹骇航窥熄热疗譬盆庞凶运漆焊暂栏臆统弯谓按柯艰沥墩噬酚郡中医药科学数据中心各项目12月份工作总结撵恼杯悲事齐拭卷椎刨吩峨憾陈坐本光索烦候陡所份快凤咙阻饮叔检测哆几汽耸褥粥柳掖融液动屁际唁和油刑常渗城佃杠翱绝词粹贞拧捶宅碟懂晕尹扬凄攀登征病出阮静膜诈云苞槐迁桃履澈沂缎涩渤辐钡嚼襄诸辩员首尔叙敢赔欣主埃快颁抚鸳迅积栖搅锯巫竭嫉宗苛傀框贴练痛仲拴抵频嘱就赘妒隋渺妥苏曙疑卉珐犬桶怨沛书宋左艾坦衡网媚袁兰态湛毯绎宁湃疯碟映晴宴蹋鞠解拭龟迅庇衙毋脖卿甜凝弦娩培满丽执寨动丸蛆藤匆馏兽叠家琢援右贡熄跌勒削八做褐撼傈贿组腥仁钢海旱那遁虏打崇赦袄喝炽亡关饵恒见酱数惰买累痰胰聘东篮缝略幻昨贡捐爷鹏尺殴优疤孜岔傍邪讥嫌瞳隧嫌中医药科学数据中心各项目12月份工作总结中国中医科学院中医药信息研究所中医药数据中心2007年12月28日 祝大家新年快乐 一、 总中心工作：1、中医药期刊文献数据库管理程序的建设：本月启动了中医药期刊文献数据库管理程序的建设工程，目前我们已经完成了项目需求书，招标，共有三家公司进行了投标，三个公司均已经完成了项目建议书，下一步的论证和最终确认工作正在进行。本次项目的启动，重点解决过去几年中发现的问题，重新构建人员管理系统、改善数据管理系统、集成各种建库工具（数据下载、数据导入、数据库特有词汇填加、专题库生成、英文库生成等）、建立数据库日志管理，提高中医药期刊文献数据库管理规范化、自动化能力，提供全方位、多角度，快速准确的查询检索功能。中医药期刊文献数据库应用系统主要包括以下几个模块：基础数据管理模块、文献标引加工模块、主题词表与各种标准表管理模块、人员管理模块、数据库系统管理模块。各参加文献数据库加工的单位，请根据你们工作中的需求，提出相应的意见和建议。2、申报中国中医科学院2007年院级成果奖一项： 申报中国中医科学院2007年院级成果奖一项，题目为：基于网格技术的中医药虚拟研究院示范研究。二、 分中心各项目完成情况总结：1、 中医药期刊文献数据库：（工作量统计截止到2007-12-28）2007年文献库任务完成表单位名称标引任务（条）已完成已审校尚需完成评价上海中医药大学科技中心30000148561485515144已签名未标引的文献有667篇江西中医药高等专科学校10000755275492448已签名未标引的文献有859篇辽宁中医药大学10000307221337145已签名未标引的文献有1674篇陕西省中医药研究院100009232579077已签名未标引的文献有1528篇广州中医药大学20001025264975已签名未标引的文献有808篇山东中医药大学图书馆1000001000尚需努力长春中医学院1000001000尚需努力南京中医药大学3000411952589尚需努力山西中医学院(SHAANXI)3000003000尚需努力总计700002783925153423782006年文献库任务完成表单位名称任务量已完成已审校尚需完成备注上海中医药大学200002326722770超额完成3267辽宁中医药大学50001033010327超额完成5330陕西中医药研究院10000999999991完成任务南京中医药大学500015158323485未完成尚需努力江西中医高等专科学校8000107329749超额完成1749广州中医药大学300032613261超额完成261总计510005910456938超额完成81042、 临床术语与语言系统完成情况：截止到2007年12月27日10：00时，临床术语共加工实例数据99492条，已初审数据87215条。各单位加工情况详见下表：单位任务量完成情况加工实例加工完成百分比校验实例审校完成百分比已加工的类树备注及存在问题陕西中医药研究院200219109%219109%已经加工完任务已经完成。福建中医学院10000707671%707671%已经加工完现有的数据已经加工完毕。吉林中医中药研究院20002657133%2657133%已经加工完任务已经完成。河北医科大学10003334333%3334333%类树已部分加工任务已完成。广州中医药大学120001175398%614441%类树已部分加工希望加快审校速度。河南中医研究院500004374587%3991179%类树已部分加工上海中医药大学150001422595%1265684%类树已部分加工河南仲景医学院10000623762%464246%类树已部分加工希望将不符合要求的数据删掉。北京中医药大学10000632563%628763%类树已加工本月未加工。南京中医药大学5000391378%384877%类树已部分加工本月未加工。语言系统总结 语言系统程序修改完成，从12月3日起开始数据加工。语言系统目前原有已加工数据115443条。本月上海和福建已经开始语言系统的加工，并对新程序提出了很多问题和建议，在此表示感谢。临床术语与语言系统的问题请及时与贾李蓉联系。贾李蓉网上联系方式：MSN: QQ：8629758附：本月部分单位临床术语具体问题：北京：审核数据6条，问题数据4条临床术语审校概念词单位合格不合格原因审校时间备注审校过程中发现的问题张机著伤寒杂病论北京NoYes概念词本身有待商榷？2007-11-19汉代医家北京NoYes语义关联“汉代医家分析中医学基础，分析辨证论治”？这些关联有待商榷2007-11-15陈言论八里脉北京NoYes定义与概念词不符2007-11-15陈言辨证重脉北京NoYes定义看不懂。2007-11-15广州：审核数据15条，问题数据7条临床术语审校概念词单位合格不合格原因审校时间备注审校过程中发现的问题观腹部外形广州NoYes语义关系词选择错误“使用”，应是上位词，已改2007-11-8耳穴触诊法广州NoYes语义关联不够。2007-11-8武台广州NoYes是部位，不是疗法。考虑放在这里是否合适？2007-11-8文台广州NoYes是部位，不是疗法。考虑放在这里是否合适？2007-11-8日角月角广州NoYes是部位，不是疗法。考虑放在这里是否合适？2007-11-8候痫法广州NoYes定义有错误。什么叫“诊侯方法”？2007-11-8额脉广州NoYes定义不完整。2007-11-8河南中研：审核数据13条，问题数据7条。临床术语审校概念词单位合格不合格原因审校时间备注审校过程中发现的问题肩关节脱位河南NoYes概念定义来源不能是自拟2007-11-6髋关节结核河南NoYes概念定义来源不能是自拟2007-11-6膝关节结核河南NoYes概念定义来源不能是自拟2007-11-6脊柱结核河南NoYes概念定义来源不能是自拟2007-11-6妇人腹痛河南NoYes语义关联不当妇人腹痛发生于肾阳虚衰型的情况下.应该把型字去掉2007-11-5不孕症河南NoYes语义关联不当“不孕症发生于肾气虚证的情况下”同上，应该把“证”字去掉2007-11-5癥瘕河南NoYes语义关联不当“癥瘕发生于血瘀型的情况下”不能用“血瘀型”是否考虑把“型”字去掉更合适些2007-11-53、期刊评价组工作总结：第一部分：2007年12月“期刊评价组”工作总结图1 2007年10月前期刊评价信息采集工作完成图领刊总数7月完成册数8月完成册数9月完成册数10月份完成册数11月份完成册数12月份完成册数任务完成比例福建中医学00%河南中医药研究院101300032100.00%南京中医药大学0000140100.00%河北医科大学41047276032.50%辽宁中医药大学80021304045.38%北京中医药大学520003063.08%上海中医药大学科技信息中心160171836100.00%河南中医学院00061833.33%浙江省中医药研究院122418018100.00%华中科技大学同济医学院00121626100.00%陕西中医药研究院1860611682.00%广州中医药大学00100041.67%图2 2007年10月前期刊评价信息采集工作完成“质”评比图领刊总数7月评分8月评分9月评分10月评分11月评分12月评分本月排名广州中医药大学96河南中医学院9499华中科技大学同济医学院939794南京中医药大学97河北医科大学85739795？出现整列错误无法评分北京中医药大学9097陕西中医药研究院931009710096第一名辽宁中医药大学94989996第一名福建中医学院9696河南中医药研究院979399上海中医药大学科技信息中心97909498浙江省中医药研究院981009691总评截至2007年12月20日止，已经有9家单位完成了今年的任务。但有的单位还是有整列错误的现象，这种现象在日后的工作中希望完全杜绝。剩余3家，有搬馆现象，极大影响数据的加工，如果明年的任务承接如有问题的话，请尽早提出，利于本中心调整任务分配。第二部分 针灸数据库针灸数据库，针灸所约完成临床数据采集1000份。本所已经完成了加工手册，并且调试了程序，并且对针灸所进行了加工培训。这部分内容问题目前主要集中在程序上，由于程序不够稳定，经常出现乱码现象，影响了加工速度。下一步工作，准备继续调试程序。希望本所程序员能够从程序的角度测试程序，提出程序修改意见。4、中药药理实验库1药理库完成情况（至2007年12月27日上午11点）单 位任务量已完成已初审未通过应删除备 注河南中医药研究院70005249441加工进度可 请加快初审速度以利于整体数据的提交。注意未通过数据修改。福建中医学院50004438507337开始初审，请注意未通过数据的修改。山西中医学院2000731668826加工认真，及时沟通讨论加工问题。初审请注意未通过数据的修改江西中医药研究院20005431100请注意加工和初审速度，有问题请跟我们联系。江西中医药高等专科学校200049738110加工和初审已经进行，请注意未通过数据的修改 南京中医药大学1000994005加工快，有问题请及时跟我们联系。请加快初审速度以利于整体数据的提交。张仲景国医学院1000262480请注意数据质量及加工速度，安排整体数据完成进度。合计200001205625752469整体进度尚可，请注意初审质量与进度。2. 药理数据库远程加工界面使用注意事项： 新药理实验数据库加工平台搭建完成，在进行数据加工时请注意参考最新中药药理实验数据库加工手册。2.1标准表使用：在线加工字段需选择标准表查询，请参照标准词表使用方法，严格按照标准词表选词加工，无标准词需要添加时，注意添加标准词要认真，不是标准词的不要随意添加。目前增词接口已经关闭，如有需要增加的词请整理成文档通过msn，qq或email与我们及时联系增词以保证大家加工的进度和标准词的准确性。2.2图片问题：有些图片没有严格按要求扫描上传，扫描图片中半页、不清楚现象需要加工单位重新下载或扫描上传。2.3药理库远程加工界面最新修改（附最新修改加工手册）：（1）近期文献查询界面的“状态标志”字段增加“未通过”，分中心老师可以查询到各单位终审未通过的数据，方便大家修改提交。（2）加工界面，药理实验表中“对象类型”字段将增加“其他”选择，用于研究对象不能包括在“疾病，证候，症状，组织器官，微生物，病理生理”内的其他研究对象类型的加工。“对象名称”请按照原文献内容进行填写。2.4加工进度安排：目前加工整体进度尚可，但有的单位加工速度和初审较慢，请各分中心老师注意安排进度和控制加工质量。有问题随时和我们联系。刘丽红：msn：llhong_2008 qq:28499503 email:llhong_2008163.com5、中药化学实验库1. 化学库完成情况（至2007年12月27日上午11点）单位任务量分配量完成量图片量备 注上海中医药大学260024981523463张整体进度可，请注意图片上传的质量。重庆中药研究院600461647（加去年完成的200）已经全部传完整体任务完成较好，加工质量较高，图片上传清晰，大小适度。初审进展顺利江西中医药研究院800781773769整体任务完成较好，上传图片较清晰，请注意原文图片上传要求整张上传，不能出现半页上传现象。合计4000386929431879整体进度较稳定中药化学库的工作是由三个分中心承接，从加工到审校的工作都是连续性的，技术力量较强，工作较熟悉，数据加工情况比较稳定。2. 加工常见问题2.1在线标准表使用问题：化学数据库在线加工应选择标准表查询，无标准词应及早通知审校人员增加，不能随意填加非标准化的词，加大了终审人员的工作强度，对导入数据库增加困难。2.2图片上传问题：有些图片没有严格按照扫描上传图片要求，扫描图片不能只有半页，应全页扫描。有的图片上传也不够清晰，请认真扫描上传。2.3化学数据库的工作量应删除的数据，有的没有及时通知。2.4关于主表中“实验对象来源科属”需要选择标准词，原加工的“柴胡，伞形科，Bupleurum chinense DC”格式不能导入。请注意从标准词表中选择填写。具体格式示例“”3. 化学库数据导入问题（请注意）3.1关于导入程序： 2006年以前任务中导入报错的数据已经整理发送至各分中心。分中心人员也在认真查找原因，修改完善数据。请分中心整理完成后发送至我处。3.2 如何修改“导入报错”的数据：请参照化学库编辑注意，注意格式及表单的填写，常见问题如：（1）主表中“实验对象来源科属”需要选择标准词，原加工的“柴胡，伞形科，Bupleurum chinense DC”格式不能导入。请注意从标准词表中选择填写。（2）一些必填字段的加工，如提取物名称，提取方法，步骤等，请注意不能“$”分隔的字段的加工。（3）标准词的使用，相关标准词的选择一定选择标准词，规范加工。需要添加的标准词请通知我处添加。（4）由于程序原因，有的数据不能导入，我们尽快查找原因修改导入。请分中心老师予以谅解。6、中医疾病基础数据库：中医急门诊数据库，统计日期12月24日单位任务量实发量完成量审校量图片上传福建中医学院40006752440926478中医急门诊数据库：福建中医学院分中心完成任务情况好，工作连续性强，对于数据加工有一定的基础。数据编辑加工认真，领导重视。目前需要进一步审校。主要问题：1、基本信息表：研究方法项，应尽量填写。标准词不全时，可增加或借助备选表（主题词表）填写。有不填的现象。2、流行病学附表：流行病学调查类的文献应尽量将此表填写，现在有遗漏。3、治疗步骤表：如药敏试验：这类信息 关于药的抗药性的%的填写等，基本上没填，客观上是无此项。4、有标准表的项，需查标准表后再填。5、诊疗信息表：仪器与诊断标准漏填。6、图片有传重和不清晰的情况。解决：在原结构不变的情况下，做一些调整。7、突发公卫平台急门诊数据库：统计日期12月24日单位名称任务量实发任务完成量审校量终审量总完成量广州中医药大学50033616419183南京中医药大学100035027770347上海中医文献馆5003508416725276总计1036243444114801中医疾病数据库：南京中医药大学已完成。上海中医文献馆正在审校，广州中医药大学正在继续完成。解决：发通知和在MSN或电话督促完成。这个库完成的较慢。178、中医临床数据库： 单位已完成已审校图已传共完成05任务量05年完成06任务量06年完成福建中医学院（05传染病）235883638159064000传染完成6000完成广州中医药大学8694247526751162000完成40003116河南中医学院（河南1）27547756015504500完成5000完成河南中医药研究院（河南2）243822174269642655615000完成1500011556黑龙江中医药大学169541043970500完成500完成吉林中医药研究院132988301630013000完成-辽宁中药大学25376010131013500完成500完成山西中医学院1126034614861462000完成4000完成陕西中医药研究院8853369462942542000完成1000完成上海中医药大学15515278122131543310000完成5000完成重庆中药研究院（重庆药）60639610111002500完成500完成重庆中医研究院（重庆医）25952979977500完成500477浙江中医药研究院22711733733200完成500完成湖南中医药研究院293009307930381000完成1000完成仲景国医学院17803795278043000完成50004804河北医科大学中医学院2101499172117091000完成500完成江西（05年）532636019049892710000差1073-江西中医药高专（江西专）470391557715618-60005618江西中医药研究院（江西研）11489509500-500完成安徽中医学院1898312152725019-5000完成605002007年中医临床数据库工作单位已完成已审校图已传07完成完成进度07任务量云南中医学院（云南）593108942701完成速度大幅提高1000福建中医学院（福建）34385435153492优良4000广州中医药大学（广州）24295153缓慢1000河南中医学院（河南1）964426055805224完成速度大幅提高6000河南中医药研究院（河南2）3956106243355018缓慢10000黑龙江中医药大学（黑龙江）65735887800良好1000吉林中医药研究院（吉林）020292029完成完成2000辽宁中药大学（辽宁）010421044完成完成1000南京中医药大学（南京）0284429202844优良3000山西中医学院（山西）0385938613859优良4000陕西中医药研究院（陕西）206357711563，将06年工作量顺延，共计完成1817优良2000陕西中医学院图书馆（陕西1）27905998932良好1000上海中医药大学（上海）669297536803644良好5000重庆中药研究院（重庆药）1920389192缓慢500重庆中医研究院（重庆医）176836184缓慢500浙江中医药研究院（浙江）30410305较慢500浙江中医药大学（浙江1）65831987689较慢1000湖南中医药研究院（湖南）4530163114完成完成1000张仲景国医学院（仲景）203274229682945良好3000河北医科大学中医学院（河北）76566814131433良好2000江西中医药高专（江西专）45912744968完成完成3000江西中医药研究院（江西研）1310131131缓慢1000安徽中医学院（安徽）177361032522383较慢4000甘肃中医学院图书馆（甘肃）183199184缓慢1000贵阳中医学院（贵州）10177119178缓慢1000山东中医药大学图书馆（山东）1440423144缓慢500长春中医药大学（长春慢50060500应删除的数据指的是病例数不足10例的，完全没有与中医相关内容的文献，但如果有疾病，也有相关的证候或指标的研究，就属于临床文献，应该加工，不应以有无治疗表作为筛选文章的标准，有些单位因为CNKI上找不到原文就将其标注为应删除不予加工，这样就丢失了大量应加工的文献。有些已经标记了应删除的，我们已经将标记改回了未完成，希望各单位老师再重新审查一下自己单位的应删除数据，如果有上述原因而作了标注的还需要再返工重新加工，对于实在找不到原文的数据可以先暂停加工，但标记应为未加工。此外一提再提的还是漏表的问题，尤其以诊疗