蛋白质的基本单位.ppt

胺基(Aminogroup),羧基(Carboxylicacid),氫原子,Aminoacid,Protein,Enzyme,Coenzyme,張憲彰96/10/02,胺基酸(Aminoacid),為蛋白質的基本單位。有20種不同的胺基酸。每個胺基酸之間以胜肽(peptidebond)連結。胜肽鍵是由兩個胺基酸分別提供羧基和胺基，兩者之間經脫水反應(失去H2O)後所生成的。,胺基酸的分類,1.非極性或疏水性的R基群(Non-polarorhydrophobicRgroups)2.不帶電荷或親水性的R基群(UnchargedorhydrophilicRgroups)3.帶負電荷的R基群(NegativelychargedRgroups)4.帶正電荷的R基群(PositivelychargedRgroups),胺基酸的種類,非極性或疏水性的R基群,胺基酸的種類,非極性或疏水性的R基群,不帶電荷或親水性的R基群,胺基酸的種類,不帶電荷或親水性的R基群,胺基酸的種類,帶負電荷的R基群,帶正電荷的R基群,蛋白質的四級結構,一級結構：,二級結構：因兩碳上的R基團與前後相鄰基團的吸引力或排斥力，使得兩相鄰胜肽鍵平面間的轉動限制在一定角度範圍，而造成規律的兩種主要構形為螺旋(helix)和長帶(sheet)，其主要構成力量都是氫鍵。,三級結構：分子內各部分的二級結構再相互組合，構成完整的球形。,四級結構：數個相同或不同的三級結構分子再結合成一較大的複合體，才能進行完整的活性功能，構成四級結構的每單位分子，稱為次體(subunit)。,一級結構,二級結構,三級結構,四級結構,KKGGLVAH,蛋白質的一級結構,四級結構(QuateruaryStructure)：一些蛋白質由二個以上的peptide鏈(次單位)組成，代表蛋白質的整體結構。,三位一體密碼(Thetripletcode)-mRNA與蛋白質的關係,傳訊RNA(mRNA)(messengerRNA)2.核醣RNA(rRNA)(ribosomalRNA)3.轉運RNA(tRNA)(transferRNA),三種RNA各有所司,1.信使RNA(mRNA,messengerRNA)用來傳遞DNA的遺傳訊息並作為蛋白質合的模板，佔RNA總量5%。2.核醣RNA(rRNA,ribosomalRNA)用來將mRNA所攜帶的蛋白質胺基酸訊息序列，轉譯成相對應的胺基酸，佔RNA總量的15%。3.轉運RNA(tRNA,transferRNA)核糖體RNA，是組成核糖核蛋白的主要成份。,rRNA是構成核糖體的成份，且具有酵素活性，一些蛋白質會經過核孔進入細胞核，在核仁附近與rRNA結合成兩種次單元（大單元及小單元，若是真核生物其大單元為60S，小單元為40S），這兩個次單元會再次經過核孔離開細胞核，到達細胞質中並組合成為mRNA-核醣體複體(mRNA-ribosomalcomplex)。,rRNA的結構和功能,RibosomalRNA(rRNA)isacomponentoftheribosomes,theproteinsyntheticfactoriesinthecell.EukaryoticribosomescontainfourdifferentrRNAmolecules:18s,5.8s,28s,and5srRNA.ThreeoftherRNAmoleculesaresynthesizedinthenucleolus,andoneissynthesizedelsewhere.rRNAmoleculesareextremelyabundant.Theymakeupatleast80%oftheRNAmoleculesfoundinatypicaleukaryoticcell.,http:/www.biochem.uwo.ca/meds/medna/rRNA.html,tRNA的結構和功能,攜帶胺基酸來完成蛋白質合成：tRNA為單股RNA，折疊成苜蓿葉型(十字形)，它包含一個補密碼及攜帶一個對應的胺基酸，當一連串不同tRNA上面的這些補密碼與mRNA上的一連串密碼子互相配對時，其所攜帶的胺基酸就會連接在一起(這個過程皆發生在核糖體上，如同上面所提到的rRNA具有酵素活性,它可以協助胺基酸的連接),mRNA與蛋白質的合成,mRNA是攜帶DNA訊息，經過轉譯作用合成功能性的蛋白質。DNA會經過轉錄作用,將其遺傳密碼經過mRNA送到細胞質中轉譯出蛋白質,來表現遺傳性狀，mRNA中每三個鹼基序列稱為密碼子（如GGA,CUA,）。（這麼做可確保原始遺傳訊息不會被破壞;且因為RNA是單股，容易被分解，故在mRNA進行轉譯後,可確保細胞質不會有過量的RNA且不會過度轉譯太多蛋白質）mRNA是以DNA為模板轉錄的單鏈多聚核苷酸，每三個鹼基代表一個氨基酸訊息，稱三聯體密碼。起始密碼子(AUGorGUG)與tRNA作用後便可進行蛋白質的轉譯。,DNA-mRNA-Protein,（轉錄）（轉譯）,一種新的胺基酸，命名為對氨基苯丙氨酸（p-aminophenylalanine，簡稱pAF),前加州LaJolla,Scripps研究中心，目前任職賓州Lancaster,Franklin單位:M或mg/ml等)。(2)所用石英管(cuvette)的寬度(l;單位:cm)。(3)化學物質在波長的吸光值(A;absorbance)定義為A=log(I0/I)。吸光值另稱為opticaldensity(OD)，分光光度儀(spectrophotometer)測定吸光值。此正比關係稱為Beerslaw(或Beer-Lambertslaw):即A=cl,H2O2在波長240nm的240nm=0.0395mM-1cm-1NADH在波長340nm的240nm=6220mM-1cm-1NADH於酸中不安定,酵素的活性單位,(1)抽出液中含有多種蛋白質，這當中有些則具有某些酵素活性。如，種子抽出液中，含有多種酵素，其中有一種即為a-amylase。常用的單位有兩種:(a)units/ml:即1ml的抽出液中含多少unit(單位)的該種酵素活性。(b)unit/mg:即抽出液中，每1mg的蛋白質含有多少unit(單位)的該種酵素活性，此法稱為抽出液中所含有該酵素的比活性(specificactivity)。比活性愈高，則抽出液含有該酵素的純度愈高。(2)酵素活性單位(unit)，指在單位時間(通常為分鐘)內，酵素使受質減少(或產物增加)的量。受質減少(或產物增加)的量，可視實驗的需求或方便性，以m