论文撰写-曲成毅(博2013重点).ppt

2019/11/24,1,医学科研论文撰写,山西医科大学流行病学教授中华流行病学杂志副主编曲成毅quchengyi0012,2019/11/24,2,科学研究的基本程序,选题与立项文献检索与撰写综述研究设计收集资料统计分析归纳与推理撰写论文,2019/11/24,3,论文的价值,科研论文是以文字形式对所做科研工作的总结和表达，是提供新的科学信息和科学证据及推广和交流科研成果的主要方式。科研论文是对研究者科研水平和科研贡献进行评估的重要指标。科研论文的质量反应作者所在单位、地区、国家相关学术地位的重要基础。,2019/11/24,4,学术论文的分类,学术论文（发表于期刊杂志）研究报告（科研论文）：档案与文案、调查报告、观察描述、实验研究、研究简报、研究快报等；综述：专题综述、会议综述、专题述评等；议论文：一般议论、评论、杂文等；学年论文毕业论文学位论文,学位论文（国家学位条例第四、五、六条）,学士学位论文：较好地掌握本学科的基础理论、专门知识和基本技能；具有从事科学研究工作或负担专门技术工作的初步能力，一般1万字左右。硕士学位论文：在本学科领域内掌握坚实的基础理论和系统的专门知识；具有从事科学研究工作或独立负担专门技术工作的能力，一般3万5万字。博士学位论文：在科学或专门技术上做出创造性的成果，从论文的写作中反映出作者具有渊博的理论知识和熟练的科学研究能力；能够开辟新的领域和对所研究的学科发展起推动作用，一般5万15万字。,2019/11/24,6,撰写综述,文献综述是在阅读有关问题的大量文献后，将各种信息、观点进行分析和评价，经过综合、归纳、条理化整理后写成的文章。这是积累、理解和传播信息，使自己和大家了解有关问题的发展历史及现状，培养自己组织资料和表达思想的好形式。撰写文献综述的程序一般是：,选题,收集文献,阅读和评价,撰写,2019/11/24,7,综述的特点,对大量信息的综合：既有纵向的回顾和展望，又有横向的对比；内容专深但述而不评：不作评论，但能理解作者的立场和见解；回顾性对比分析是主要写作方法：通过不同时间、不同单位或地点的数据、资料对比示明差距和动向。,2019/11/24,8,综述的内容,文题：包括涉及的对象和说明语摘要：目的资料来源选用标准和方法综合的方法结论前言：写作缘由、目的意义、编写过程和引用参考资料范围正文：客观、公正、如实反映原作者的论据及论点，内容包括：提出问题；历史发展；现状分析；未来展望结语：概括本文主要结论参考文献表（Vancovour式）:书籍:作者.书名.卷次.版次.出版地:出版者,出版年:起-止页.期刊:作者.文题.刊名,出版年,卷(期):起-止页.,2019/11/24,9,撰写综述的方法,枚举法：将主题包含的几件事物分别列举，加以介绍说明，最后进行分析和比较；阶段法：按事物发展的不同历史阶段阐述其发展和变化，适合于综述某一技术的发生过程、发展道路和发展趋势；综合法：,2019/11/24,10,综述的类型(1),叙述性综述（descriptivereview）性质：定性综合评价原则：是否收集了所有相关文献；收集文献时是否有偏倚；是否进行了科学评价；是否进行了科学的分析和总结,2019/11/24,11,在医学研究中，传统的文献综述在处理同一问题的多个结果报道时，通常是平等（等权重方法）对待每个研究结果而得出结论。这种文献综述一般不进行文献评价，也不考虑文献的质量，主要是以某类结果文献数量的多少得出结论。,传统文献综述的特点,2019/11/24,12,综述的类型(2),系统综述（systematicreview）性质：定量综合方法：Meta分析：采用统计学方法对已发表和未发表资料进行的综合分析，基本程序是：确定目的；收集文献；质量评定；资料摘要；资料合并；敏感性分析,2019/11/24,13,Meta分析的应用系统评价的步骤：(1)提出问题(2)文献检索(3)文献评价(4)统计分析(5)结论,Meta分析的主要内容单个研究效应量计算异质性分析与检验多个研究效应量的合并固定效应模型随机效应模型合并效应量的假设检验合并效应量的可信区间图示分析敏感性分析,2019/11/24,14,学术论文的特点,科学性：揭示事物发展客观规律，探求客观真理；创新性：选题新、方法新、资料新、观点新；逻辑性：论文所反映的不是一般的现象和过程，也不是浅显的经验和法则，而是作者对事物本质和规律的深刻认识，是抽象和生动的科学理论。,2019/11/24,15,逻辑性,学术论文不是资料或数据的简单堆砌，是作者深刻领悟了素材，通过归纳、推理等一系列逻辑思维的过程才得出最后结论；描述要求文字精炼、语言通顺、用词准确，写作应当层次分明、条理清楚，包括图表清晰、规范、容易理解，这些都体现了作者的文字功底和写作的水平。,2019/11/24,16,医学论文撰写的基本思维方式,假设演绎法hypotheticdeductivemethod假设是在为数不多的经验事实以及已有理论的基础上，通过逻辑推理或创造性想象（猜测）等而形成的；得到假设后，描述性研究通过假设演绎法同检验假设的分析性研究和实验性研究相衔接。,2019/11/24,17,假设演绎法(1)因为假设H,所以推出证据E(演绎推理)(2)因为获得证据E,所以反推假设H成立(归纳推理)假设演绎法的整个推论过程为：从假设演绎地推出具体的证据，然后用观察或实验检验这个证据，如果证据成立，则假设亦成立。从逻辑学上看，反推是归纳的。从一个假设可推出多个具体证据，多个具体证据的经验证实，则可使归纳支持该假设的概率增加。,2019/11/24,18,医学科研论文的质量基础（1）学术水平,立题依据充分（理论意义和实用价值）；严谨的科研设计；准确可靠的资料；正确合理的统计分析；实事求是的评价；符合伦理要求,2019/11/24,19,医学科研论文的质量基础（2）写作水平,逻辑性（层次分明、条理清楚）；简洁流畅（文字精炼、语言通顺、用词准确）；图表清晰（规范、容易理解）,统计关联到因果关联,在排除或控制了各类偏倚的干扰后，如果还有统计学关联，或者统计学关联虽然有所改变（增强或减弱）但仍存在，就说明存在真实的关联，可以用因果判定标准进行综合评价，判断有无因果关系或存在因果关系的可能性。判断进程如下：暴露与疾病统计关联?偏倚?时间先后?(提出假设)(排除偶然)(排除虚假)(前因后果),2019/11/24,21,因果推断标准（1964）美国“吸烟与健康报告”委员会(1)关联的时间顺序；(2)关联的强度；(3)关联的特异性；(4)关联的一致性或可重复性；(5)关联的连贯性或合理性。,2019/11/24,22,变异：同质观察单位（个体）间观察指标（生物学指标）存在差异，因生物体内外多种因素综合影响造成，反映事物本身固有特征,影响结果真实性的误差：,抽样误差随机误差系统误差,2019/11/24,23,偏倚及分类,信息偏倚收集资料过程中的系统误差,偏倚：所获结论系统地偏离真实,选择偏倚选择研究对象的条件受限或方法不对,混杂偏倚由混杂因子产生的歪曲作用,2019/11/24,24,质量控制偏倚来源,实验者（设计，操作，观察，分析等）选择研究对象：入院偏倚、检出症侯偏倚、患病发病偏倚、诊断怀疑偏倚等；现场调查或实验室操作：暴露怀疑偏倚、期待效应、光环效应、严格和宽容、参照标准不一等；统计分析：计算机输录错误、推论不符合因果推断原则等,2019/11/24,25,质量控制偏倚来源,测量工具效度（灵敏度及特异度）信度（一致性）调查表设计、提问方式、调查程序测验仪器、试剂诊断标准（归类错误偏倚）时间效应,2019/11/24,26,质量控制偏倚来源,被试者回忆偏倚recallbias遵从:屈服于群体压力集中趋势；依从：屈服于权威压力；报告偏倚reportingbias测验焦虑；他评者的偏见；无应答：失访，不依从等。,2019/11/24,27,效应修饰（效应变异effectvariation）,效应修饰是指一种效应的测量值随第三个变量而改变混杂是偏倚，是研究者希望避免的，或在必要时希望从资料中消除，效应修饰是对效应本身的详细描述，是需要报告的发现，研究者应当消除混杂，发现和描述效应修饰,2019/11/24,28,交互作用的处理,分层分析多因素回归模型分析（适合于相乘模型）交互作用指标（适合于相加模型）,2019/11/24,29,正确使用统计学方法-多因素统计分析,多元线性回归分析逐步回归分析Logistic回归分析Cox回归分析聚类分析协方差分析主成分分析及因子分析判别分析典型相关分析,2019/11/24,30,医学科技论文主要内容,文题Title,heading署名Signatureanddepartment摘要Summary,Abstract关键词Keywords前言Introduction材料(对象)与方法Materials(Subjects)andmethods结果与分析Resultsandanalysis讨论Discussion致谢Acknowledgements参考文献References,2019/11/24,31,(一)文题(heading,title),是论文主要内容和中心思想的高度概括，应简明、清晰、能说明研究的本质，便于编目与检索，具体要求：醒目确切地反映全文的特定内容，不抽象，不笼统，使读者阅后就明了本科研的目的和意义。有特色和新意准确得体文题应准确地表达论文的特定内容，事实求是地反映研究的范围和深度，防止小题大作或小内容冠以大标题，避免使用“论”“谈”等过大的词。简短一般不超过20字，最多30字，英文不超过10个实词，避免使用“初探”“的观察”等非特定词。其中名词、术语尽量做到可以检索。,2019/11/24,32,(二)署名(signature)和单位(department),作者署名表明文责自负和作者拥有的著作权。署名的作者应是参与论文内容的创意、实践和撰写文稿的人。署单位或集体名称者，执笔人姓名列于文末，加圆括号。第一作者是选定课题、提出研究方案，组织、参加或指导科研工作和撰写论文的人，对论文负全部责任。论文作者应同时具备以下条件：参与选题、设计或资料的分析和解释；起草或修改论文中关键性的重要理论内容；最终同意论文发表者。,2019/11/24,33,(二)署名signature和单位department,中华流行病学杂志要求在论文首页下方注明基金项目及编号：作者单位：邮编城市，单位（作者名）；,2019/11/24,34,（三）结构式摘要,ObjectiveMethodsResultsConclusions,文字可以不以句子出现，而用短语，方法、结果部分用过去时，结论部分用一般时，字数350字左右。,2019/11/24,35,Abstract,Summary(AnnalsofInternalMedicine)内科学记事,Objective(purpose)Design(materialsandmethods)SettingSubjectInterventionsMainoutcomemeasuresResultsConclusions,2019/11/24,36,(四)关键词(keywords),是文稿中最能反映中心内容的名词或词组，可为编制索引和检索系统使用。每篇论文选个关键词列于摘要之下，各关键词间不加标点，外文字符专用名词首字大写；中国科协规定，第一个关键词为研究领域，第二个为研究方法，第三为研究对象，以后作者自行决定；关键词的选用应参考汉语主题词表（中国科技情报研究所和北京图书馆主编）及MedicalSubjectHeadings,McSH（IndexMedicus）,2019/11/24,37,STROBE声明,Strengtheningthereportingofobservationalstudiesinepidemiology强化流行病学观察性研究报道质量2004年11月，33位来自欧洲及北美的流行病学、方法学、生物统计学专家及医学期刊编辑在英国布里斯托起草了第1版STROBE声明，2005，2007年对声明进行了3次修订，目前已成为国际著名医学杂志审稿评议观察性研究论文质量的核心依据。,2019/11/24,38,STREGA声明,Strengtheningthereportingofgeneticassociationstudies强化遗传关联性研究报道质量声明STROBE的扩展，2006年6月由33位相关领域专家在加拿大渥太华制定，对STROBE声明的核对表22个条目中的12个给予补充说明，目的是提高与遗传有关研究报道的完整性和透明度，使读者能够正确解读研究结果。,2019/11/24,39,STROBE-ME声明,Strengtheningthereportingofobservationalstudiesinepidemiology-molecularepidemiology强化分子流行病学观察性研究报道质量STROBE的扩展，2008年由30余位流行病学专家、生物统计学专家、实验技师、医学期刊编辑在英国伦敦组建工作小组，历时3年完成编订，补充STROBE声明中9个条目，增加17个新条目。,2019/11/24,40,署名与摘要审稿要求,采用常规术语在题名或摘要中指明研究设计类型在摘要中概括、总结研究方法及结果（STROBE声明条目1）若研究选用特定生物标志物对结果影响很大，则需要在题目和（或）摘要中体现这些特定生物标志物的名称（STROBE-ME-1）,2019/11/24,41,(五)前言(introduction),前言扼要介绍本项目国内外研究的进展现状，已解决和尚待解决的问题，本科研的目的和起止日期。对“首次报道”“达到国际水平”等提法要慎重。,2019/11/24,42,前言部分审稿要求,背景与合理性阐明研究的科学背景与合理性（STROBE-2）阐明研究的科学背景及从众多生物标志物中遴选出特定生物标志物的方法、原因（STROBE-ME-2）,2019/11/24,43,前言部分审稿要求,目的阐明研究特定目的和既定假设（STROBE-3）指明研究是首次研究、重复性研究或二者兼具（STREGA）验前假设：若以一个或多个生物标志物为间接检测指标，则需事先假定这些生物标志物的预期价值（STROBE-ME-3）,2019/11/24,44,(六)材料和方法(materialsandmethods),材料：实验对象（如为患者，应介绍总例数、病例诊断分型及选择标准、疗效评定标准等）；实验仪器（须介绍名称、产地、制造厂商和国家，牌号、型号、批号，精度和操作方法等）；药品和试剂（应标名名称、成分、规格、纯度、来源、生产单位、出厂日期、型号、批号、给药方法和剂量、使用的浓度和剂量等）。方法：分组原则及方法，实验步骤或流程，给药方法和疗程，观察方法和指标，资料的收集、整理和统计分析手段。,2019/11/24,45,中华医学会系列杂志对来稿中统计学处理的有关要求,研究设计：交代设计的名称和主要做法。如：调查设计（分前瞻性、回顾性及横断面研究）实验设计（应交代具体设计类型，如自身配对设计、成组设计、交叉设计、析因设计、正交设计等）临床试验设计（第几期临床试验、采用何种盲法措施等）围绕四个基本原则（重复、随机、对照、均衡）如何控制偏倚,2019/11/24,46,分子流行病学研究对生物样本的要求,生物样本采集：报道生物样本采集地点、样本量、采集过程、受试者状况、样本采集至出现临床或生理学终点所需时间（STROBE-ME-4.1）生物样本储存：描述样本处理过程（包括离心、时间设定、选用添加剂等）（STROBE-ME-4.2）生物样本处理：描述进行生物标志物分析前样本的处理过程（包括储存、解冻、操控等）（STROBE-ME-4.3）生物标志物生化特性：报道生物标志物的半衰期及理化特性（如可溶性）（STROBE-ME-4.4）,2019/11/24,47,研究方法部分审稿要点,研究机构描述研究地点、机构名称及相关日期（包括招募期、暴露期、随访期、数据收集期）（STROBE-5）,2019/11/24,48,研究方法部分审稿要点,受试者列举从某一大规模研究中筛选部分受试者的标准及方法（STREGA）报道可能影响生物标志物特征或浓度的受试者特点，包括日常习惯、临床状况、生理因素、工作或生活状况（STROBE-ME-4.6）,2019/11/24,49,研究方法部分审稿要点,研究变量明确界定结局指标、暴露因素、预测指标、潜在混杂因素及效应修饰因子，条件许可时可列举诊断标准（STROBE-7）采用通用的命名系统界定遗传暴露因素，找出可能与人群分层相关的变量（STREGA）,2019/11/24,50,研究方法部分审稿要点,资料来源与评估描述实验室检测方法，包括DNA来源及储存、基因分型方法与平台（包括等位基因计算法及版本）、错误率及检出率；列出完成基因工作的实验室名称；设立多个组别时需描述评估方法的可比性，阐明基因型鉴定工作是同期抑或分批完成的。（STREGA）实验室检测：报道实验类型、检测范围、生物样本用量、分离物、时间设定、校验过程或校验标准（STROBE-ME-8）,2019/11/24,51,(七)结果与分析(resultsandanalysis),结果是论文的核心，结论的依据，反映本课题水平的高低及价值。从丰富的实验结果中经过去粗取精、分析归纳，经核对原始数据后作相应的统计学处理。凡在原设计范围之内的数据，都应作数，不能随意取舍。,中华医学会系列杂志对来稿中统计学处理的有关要求资料的表达与描述：,近似服从正态分布的定量资料：s，偏态分布的定量资料：M（QR）；量的符号一律用斜体，如吸光度（光密度）的符号为“A”相对数的分母不小于20，区分比和率。,2019/11/24,53,数字,世纪、年代、年、月、日、时刻和计数、计量均用阿拉伯数字小数点前或后超过3位数字时，每3位数字一节，如1309.4765，序数词和年份、页数、部队番号、仪表型号、标准号不分节血压用mmHg(1mmHg=0.133kPa),2019/11/24,54,统计学符号,样本算数均数及标准差xs标准误sx；中位数Mt检验;F检验；2检验；相关系数r自由度；概率P小数点后保留3位,中华医学会系列杂志对来稿中统计学处理的有关要求统计结果的解释和表达：,当P0.05（或P0.01）时，应说对比组之间的差别具有显著或十分显著统计学意义，不应当说对比组之间具有显著性或非常显著性的差别；应写明所用统计分析方法的具体名称（如成组设计资料的t检验、两因素析因设计资料的方差分析、多个均数之间两两比较的q检验等）。,2019/11/24,56,中华医学会系列杂志对来稿中统计学处理的有关要求统计结果的解释和表达：,应写明统计量的具体值（如：t=3.45，2=4.68，F=6.79等）；应尽可能给出具体的P值（如：P=0.0238）；当涉及到总体参数（如总体均数、总体率等）时，应标明95%置信区间。,2019/11/24,57,遗传流行病学研究对统计学的要求,交代所用软件的版本及选用的统计学方法；阐明是否进行Hardy-Weinberg平衡检验及其方法；描述基因型或单倍体型的推断方法；描述人群分层分析方法；描述重复比较或假阳性的控制解决办法；描述受试者亲缘关系的解决、纠正办法（STREGA）,2019/11/24,58,分子流行病学研究对统计学的要求,阐述如何将生物标志物纳入统计学模型（STROBE-ME-12）检测准确性(accuracy)、可靠性(precision)及内部效度、外部效度（STROBE-ME-12.1）,2019/11/24,59,(七)结果与分析(resultsandanalysis),结果的表达除文字外，可用表、图作为补充。表是简明的、规范化的科学语言，科研论文中最常用的是统计表，统计表设计时应注意规范、准确，目前科研用表一般均用三线表。表的设计注意纵横标目，数据含义；图是形象化的语言，包括统计图和照片图两类。统计图最常用，具体有：线图、条图、构成图等。统计图的类型与资料性质匹配，数轴上刻度值的标法符合数学原