已阅读5页,还剩29页未读, 继续免费阅读
版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
甲基化芯片数据分析应用,DNA甲基化,研究DNA甲基化的意义,DNA甲基化与肿瘤发生,高效液相色谱重亚硫酸盐测序甲基化特异性PCR焦磷酸测序甲基化DNA免疫共沉淀,常用的检测手段,AFFYMETRIX甲基化芯片实验,HumanPromoter1.0RHumanTiling1.0R/2.0R,甲基化实验流程,利用甲醛对样品进行固定,使蛋白与染色质进行交联,样品交联,超声波打断染色质,染色质片段化,特异性MBD2抗体结合,免疫共沉淀-CHIP,对CHIP染色体进行进行纯化,并对DNA进行琼脂糖凝胶电泳检测CHIP效率,洗涤纯化,利用随机引物扩增CHIP和对照组DNA片段,PCR扩增,使用DNA末端标记试剂盒将PCR扩增产物打断成碎片DNA,并进行标记,片段化&标记,杂交洗脱扫描,甲基化芯片数据分析及应用,甲基化芯片数据类型,单通道甲基化芯片数据分析,数据解析,数据质控信号分布,数据质控MA图,散点图,GC含量及ATCG位置信号分布,标准化,标准化,标准化,双通道甲基化芯片数据分析,每个样本的信号值和Input信号值的比值,原始数据,AMS(绝对甲基化水平)染色体区域范围内探针所代表的甲基化水平RMS(相对甲基化水平)探针所代表的相同数量CpG的甲基化水平,RMS/AMS计算MEDME,MEDME对smoothedlog-Ratio进行处理,使用全甲基化数据构建出log-Ratio对AMS的模型。再代入待测样本的log-Ratio数据计算出RMS。,探针filter完全相同值的探针Peakfilter没有peak的区域,FILTER,差异甲基化探针筛选,差异甲基化基因注释,全基因组展示,差异甲基化聚类,ThankYouForYourAttention,施沫全国统一服务电话:40030-40060公司电话:021
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 营养体重管理课件
- 医学免疫学常见症状及护理手段
- 多动症病状辨认及护理指导
- 2025年改则县教师招聘考试参考题库及答案解析
- 2025年珠海市香洲区教师招聘考试参考题库及答案解析
- 2025年虚拟数字人制作协议
- 2025年虚拟数字人形象营销合作协议
- 2025年秋北师大版生物七年级上册第4章 绿色开花植物的生活方式 第1节 光合作用第1课时课件
- 山东省枣庄、滕州市2025-2026学年高一数学第一学期期末质量检测模拟试题含解析
- 2025年中职(专业技能类-医学影像技术)教师资格证考试专业知识模拟卷后附答案
- 机械制图-同济版习题答案
- 解读慢性阻塞性肺病(GOLD)指南(2026)更新要点课件
- 比亚迪员工级别晋升表
- 2025北京中邮资产管理有限公司招聘1人笔试历年常考点试题专练附带答案详解试卷2套
- 【七年级秋季上】期中家长会:初梦扬帆乘风起一心携手育英才【课件】
- 小班健康课件《人们怎样过冬》
- 农村房卖买合同范本
- 钢结构施工安全协议书
- 陶粒的施工方案
- 票务及AFC考试试题及答案
- 2025年水利报社笔试面试题及答案
评论
0/150
提交评论