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(药物化学专业论文)固相有机合成与裂解反应动力学研究.pdf.pdf 免费下载
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山东人学硕士学位论文 6 d c m d e a d d i a d f t i r h p l c m s h r l o g p m c t r a i n p h 3 p s n 2 s p o s t e a t f a t l c t y r 符号表示 二氯甲烷 偶氮二碳酸二乙酯 偶氮二碳酸二异丙酯 傅立叶变换红外光谱 高效液相色谱质谱 小时 亲水亲油平衡值 汞铬碲检测器 分钟 三苯基磷 亲核取代 固相有机合成 三乙胺 三氟乙酸 薄层色谱 酪氨酸 原创性声明 本人郑重声明:所呈交的学位论文,是本人在导师的指导 下,独立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容 外,本论文不包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的科 研成果。对本文的研究作出重要贡献的个人和集体,均已在文 中以明确方式标明。本声明的法律责任由本人承担。 论文作者签名:堡龇 日期: 垫:生:q 关于学位论文使用授权的声明 本人同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的印 刷件和电子版,允许论文被查阅和借阅;本人授权山东大学可 以将本学位论文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索, 可以采用影印、缩印或其他复制手段保存论文和汇编本学位论 文。 ( 保密论文在解密后应遵守此规定) 论文作者签名: 酣冉冉 新签名:闺良日期:2 时哔2 0 山东大学硕士学位论文 固相有机合成与裂解动力学研究 中文摘要 组合化学是根据组合原理在短时间内将不同构建模块以共价 键系统地、反复地进行连接,从而产生大批的分子多样性群体,形 成化合物库( c o m p o u n dl i b r a r y ) ;然后,运用组合原理,以巧妙的 手段对化合物库进行筛选、优化,得到可能的有目标性能的化合物 结构的科学,是一门将化学合成、组合理论、计算机辅助设计及机 器人结合为一体的技术。 就合成技术而言,组合合成的方法包括固相合成和液相合成两 种。就合成方法来说,组合合成分为混合均分法、平行合成法以及 混合试剂合成法等。 固相载体上合成多种小分子有机化合物库在组合化学研究领 域已成为非常重要的一项技术。其关键组成部分,固相载体与化合 物的连接分子l i n k e r 在固相有机合成( s p o s ) 上起着非常重要的 作用。在从酸敏感l i n k e r 上裂解化合物的时候,一般常用的裂解试 剂是三氟乙酸( t f a ) 溶液。然而三氟乙酸在使用蒸发方法将其从 最终产物中除去时是难以实现完全消除的。残留的t f a 存留在产 物中,经过贮存过程以及溶剂的挥发,使之浓度升高,这种高浓度 的酸可能会使产品分解变质。还有研究发现,1o 10 0 n m 浓度的t f a 作用于胎鼠的造骨细胞,在2 4 h 后能抑制细胞增殖以及减少胸腺嘧 啶脱氧核苷的生成。在对关节软骨细胞和幼鼠头盖骨成骨细胞的培 养过程中也发现了类似的结果,表明t f a 并不只对一种细胞有毒 性。所有这些发现表明在高通量筛选中,残留的微量t f a 能引起 严重的假阳性或假阴性的结果,因此必须寻找t f a 的替代物来解 决这一问题。相比之下,作为一种生物兼容性比较好的试剂,h c i 比较容易从产物中除去,利用简单挥发的方法就可实现。即使在产 物中有残留,也不会降解产物或对以后的生物活性筛选产生影响。 山东大学硕士学位论文 因此,如果盐酸溶液可以进行这种酸敏感l i n k e r 的裂解反应以取代 t f a ,将是一个非常好的裂解试剂,对树脂的再生也有重要的意义。 本课题通过监测动力学过程,首次详细研究h c i 作为裂解试剂在固 相有机合成裂解反应中的应用。 官能团的转化在有机合成反应中占有非常重要的地位,它不仅 关系到合成步骤的选择,还直接影响产物的纯度以及产率。 m i t s u n o b u 反应是有机合成中比较常用的用来进行官能团转换的反 应,因为它的反应条件比较温和,使反应较易进行。它是在三苯基 磷( p h 3 p ) 和偶氮二碳酸二乙酯( d e a d ) 或偶氮二碳酸二异丙酯 ( d i a d ) 作用下,伯醇、仲醇与酚发生亲核取代反应,称为 m i t s u n o b u 偶联反应,是生成混合醚的一种重要方法。m i t s u n o b u 反应已经被证明是一个有效形成c o ,c n ,c c ,c x 键的方法。 其优点是:反应条件温和:立体选择性好;适用于带各种官能团的 底物。反应条件温和以及很好的立体选择性使它成为有机合成上非 常重要的合成方法,在组合合成上有很高的利用度。尽管如此, m i t s u n o b u 反应也有一些局限,比如通过此反应制得醚类化合物的 反应产率不是很高( 文献报道在6 0 8 0 居多) ,而且纯化的方法 对化合物库的合成不太现实。 傅立叶变换红外光谱( f t i r ) 仪是现代化学试验最常规的分析 仪器之一,广泛用于有机合成的定性及定量分析,近年来f t i r 分 析及其新技术在s p o s 中的应用非常广泛。f t i r 分析可以很方便地 用于固相有机反应研究的各个阶段,包括表征固载化合物、实时跟 踪检测反应进程、固相反应动力学研究等。与t l c 在液相分析中 的作用一样,f t i r 已经成为固相有机化学中最便利、最实用的分 析方法。 关键词:固相有机合成;动力学研究;裂解;m i t s u n o b u 反应 2 山东大学硕士学位论文 a b s t r a c t c o m b i n a t o r i a lc h e m i s t r y ,a sa ne n a b l i n gd i s c o v e r yt e c h n o l o g y ,w a s w i d e l yi m p l e m e n t e di nd r u gd i s c o v e r ya n do t h e rr e s e a r c hd i s c i p l i n e s i nt h e9 0 so fl a s tc e n t u r y s y n t h e s i so fd i v e r s eo r g a n i cc o m p o u n d l i b r a r i e so ns o l i d s u p p o r t s h a sb e e na k e ym e t h o d o l o g y i n c o m b i n a t o r i a lc h e m i s t r ya sa p p l i e df o rd r u gd i s c o v e r y o n ec r u c i a l c o m p o n e n to fs o l i d - p h a s eo r g a n i cs y n t h e s i s ( s p o s ) i st h el i n k e r s t r a t e g y v a r i o u sl i n k e r s ,s u c ha sa c i d - ,b a s e - ,o rp h o t o - c l e a v a b l e l i n k e r s ,h a v eb e e nd e v e l o p e dt oa c c o m m o d a t es y n t h e s i sa n dt h e c l e a v a g er e a c t i o n s a m o n gv a r i o u sl i n k e r sa n dc l e a v a g es t r a t e g i e s , t h e a p p l i c a t i o n o fa c i d l a b i l e l i n k e r st h a ta r ec l e a v e db y t r i f l u o r o a c e t i ca c i d ( t f a ) i sp r o b a b l yt h em o s tp o p u l a ra p p r o a c h h o w e v e r ,t f ai sd i f f i c u l tt or e m o v ec o m p l e t e l yi nt h ef i n a lp r o d u c t s b ya v a i l a b l ee v a p o r a t i o nm e t h o d s t h er e s i d u a la m o u n tt f ai nt h e p r o d u c t c a nb e c o m eh i g h l yc o n c e n t r a t e dw h e nt h ec o m p o u n di s s t o r e da ss t o c ks o l u t i o no rd r i e dc o m p o u n d i nt h ep r e s e n c eo ft f a , c o m p o u n d sw i t ha c i ds e n s i t i v es c a f f o l d sa r ed e g r a d e dw i t h t i m e f u r t h e r m o r e ,t f aa tac o n c e n t r a t i o no f10t o10 0n mr e d u c e de e l l n u m b e r sa n ds o m er e s e a r c hs h o w e dt h a tt h et o x i ce f f e c to ft f ai sn o t s p e c i f i ct o o n ec e l l t y p e o rt oo n es p e c i e so fo r i g i n w h e nt h e a c t i v i t i e so ft h et f aa n dh c lw e r ec o m p a r e di no s t e o b l a s t s ,c e l l p r o l i f e r a t i o nw a sc o n s i s t e n t l yl e s sw i t ht f a ,r e s u l t i n gi nf a i l u r et o d e t e c t a p r o l i f e r a t i v e e f f e c to r w r o n g l y a t t r i b u t i n g a n a n t i p r o l i f e r a t i v ee f f e c t t h i sf i n d i n gi n d i c a t e dt h a tt f am a yc a u s e s e r i o u sf a l s e p o s i t i v e o rf a l s e n e g a t i v ep r o b l e m s i nc e l l b a s e d 山东大学硕士学位论文 h i g h t h r o u g h p u ts c r e e n i n g a n dh c i ,o nt h eo t h e rh a n d ,i sa b i o l o g i c a l l yc o m p a t i b l er e a g e n t i n t h i sw o r k ,w ec h o s e18s o l i dp h a s ec o m p o u n d st oe x p l o r et h e f e a s i b i l i t yo fu s i n gh c la sa na l t e r n a t i v ei na c i dc l e a v a g er e a c t i o n s h c ii sv e r y e a s yt or e m o v ec o m p l e t e l yf r o ms a m p l e sa n di td o e sn o t c a u s et o x i ce f f e c ti nc e l la s s a y s i nt h i si n v e s t i g a t i o n ,w es t u d i e dt h e c l e a v a g er e a c t i o nk i n e t i c s o fa na r r a yo fd i v e r s ec o m p o u n d su s i n g s i n g l eb e a df t i rm i c r o s p e c t r o s c o p y t h e s ec o m p o u n d sw e r el i n k e d t o2 p s d v br e s i n st h r o u g ht h r e ec o m m o n l yu s e d l i n k e r sa t d i f f e r e n th c ic o n c e n t r a t i o n s m o s tc o m p o u n d ss t u d i e di nt h i sw o r k c a nb ee a s i l yc l e a v e du s i n gl o wc o n c e n t r a t i o no fh c i ( 0 9 2 3 ) a n d l e s st i m e ( 6 0 - 9 0m i n ) t h e r e f o r e ,o u rk i n e t i c ss t u d i e s e s t a b l i s h e d h c la sab i o c o m p a t i b l e ,r e m o v a b l ea n de f f e c t i v es u b s t i t u t ef o rt f a w h e nf i n a lc o m p o u n d sa r eu s e df o rb i o l o g i c a ls c r e e n i n ga n dd r u g d i s c o v e r y t r a n s f o r mo ff u n c t i o n a lg r o u p sp l a y sa ni m p o r t a n tr o l ei no r g a n i c c h e m i s t r yw h i c hw eo f t e nu s ei ns y n t h e t i cp r o c e s s t h em i t s u n o b u r e a c t i o n i s e x t e n s i v e l y u s e di n o r g a n i cs y n t h e s i s u n d e rm i l d c o n d i t i o n sf o rt h ef u n c t i o n a l i z a t i o no f a l c o h o l sa n dr e l a t e d c o m p o u n d s i ti se a s y t op u r i f yt h ep r o d u c t st h a nt h es o l u t i o n 。p h a s e r e a c t i o n sb e c a u s et h ep h o s p h i d ec a nb er e m o v e db yf i l t r a t i o nf r o m t h ep o l y m e r b o u n dp r o d u c t s s o l i dp h a s em i t s u n o b ue t h e rf o r m a t i o n c a nb eu s e di nt h ed e s i g na n ds y n t h e s i so fc o m b i n a t o r i a ll i b r a r i e si n m a n y d i f f e r e n tw a y s h o w e v e r ,e t h e rf o r m a t i o n v i am i t s u n o b u r e a c t i o nw a s c o m p l i c a t e db y l o w y i e l d s ,t h e n e e d f o r c h r o m a t o g r a p h i cp u r i f i c a t i o nm a d et h i sr o u t ei m p r a c t i c a lf o rl i b r a r y g e n e r a t i o n b e s i d e st h ec o n d i t i o n st h e y u s e da r ev a r i e d ,i ti sn o t s u r p r i s i n gt h a ta l m o s ta l lo ft h es o l i d - p h a s ee x p e r i m e n t a lp r o t o c o l s 4 山东大学硕士学位论文 d e s c r i b e dt od a t ea d v o c a t ed i f f e r e n to p t i m a lr e a c t i o nc o n d i t i o n s h e r ew es t u d i e dt h eo p t i m i z e dp r o c e s sb e t w e e nw a n gr e s i na n da p h e n o lt h r o u g hi t sy i e l d sa n dk i n e t i ci n v e s t i g a t i o n ,a l s ow ea p p l i e di t t oas e to fp h e n o l s f i n a l l yw ef o u n dt h a tm o s tp h e n o l sc o u l dr e a c t w i t hw a n gr e s i ne x c e p to n ew h o s el o g pi sv e r yb i g m o r e o v e rw e f o u n dt h a ts p a t i a lh i n d r a n c eo np h e n o l sh a sn oe f f e c t f t i rm i c r o s p e c t r s c o p yt e c h n o l o g yh a sb e e nu s e di n m o n i t o r i n g s o l i dp h a s eo r g a n i cs y n t h e s i s ( s p o s ) ,i ti sv e r yp o p u l a rb e c a u s ei t i s v e r yc o n v e n i e n t ,f a s ta n ds i m p l e i tc a nb eu s e dt od e t e r m i n a t i o no f t h ep r e s e n c ea n dt h el o a d i n g so ff u n c t i o n a lg r o u p sa n dc o n f i r mt h e o c c u r r e n c ea n dc o m p le t i o no fr e a c t i o n so nr e s i n s i tc a ns u p p o r ti n s h o r t e n i n gt h es o l i d - p h a s es y n t h e s i so p t i m i z a t i o nt i m ec o n s u m i n gi n c o m b i n a t o r i a lc h e m i s t r y t h i st e c h n i q u ea l l o w st h ed i f f e r e n t i a t i o no f f u n c t i o n a lg r o u p so fr e s i n - b o u n dc o m p o u n d sw i t hm i n o rs t r u c t u r a l d i f f e r e n c e s i nt h i ss t u d y ,w eh a v ea p p l i e dt h i s t e c h n i q u et ot h e d e t e r m i n a t i o no fp r o d u c ti d e n t i t ya n dr e a c t i o nt i m ec o u r s eo ns o l i d s u p p o r t sb ya n a l y z i n gas i n g l er e s i nb e a d k e y w o r d s :s o l i dp h a s es y n t h e s i s ;k i n e t i cs t u d y ;c l e a v e ;m i t s u n o b u r e a c t i o n 山东大学硕士学位论文 第1 章引言 组合化学( c o m b i n a t o r i a lc h e m i s t r y ) 是近几十年逐渐发展并 成熟的一门学科,其概念和技术己被广泛接受,并应用于许多科学 研究领域。化学家们称之为21 世纪的化学合成,并将其列为科学 研究领域的九大突破之一。 组合化学的定义可以概括为:一门将化学合成、组合理论、计 算机辅助设计及机器人结合为一体的技术。它根据组合原理在短时 间内将不同构建模块以共价键系统地、反复地进行连接,从而产生 大批的分子多样性群体,形成化合物库( c o m p o u n d l i b r a r y ) ;然后, 运用组合原理,以巧妙的手段对化合物库进行筛选、优化,得到可 能的有目标性能的化合物结构的科学。组合化学的创立与发展始于 新药研究的需要。上世纪6 0 年代初期,m e r r i f i e l d 1 】建立的固相多 肽合成法为组合化学方法的建立奠定了基础,而多肽合成仪的出 现,使该方法成为一种常规手段。上世纪8 0 年代中期,g e y s e n l 2 】 用9 6 孔板在高分子链上首次合成多肽成功,标志着组合合成的开 始。随着分子生物学研究的突破一一高通量筛选技术的发展,新药 开发所需要的新分子实体的数目越来越多,科学家们把注意力从寻 找天然产物转入合成大数目的化合物群一一化合物库。化学库是由 诸多具有不同属性的有机化合物组成的,组合化学就是一种合成化 合物库的技术。运用这项技术,不同系列的合成砌块一一反应成分 有序地排列起来以组成大系列的多样化分子实体群。 组合化学是建立在高效平行的合成之上,这种合成方法步骤有 限但生成的化合物库内包含大量的化合物。组合合成的本质是快速 产生大量化合物。组合合成速度的实现在于摒弃了在有机合成中被 固守的规则,即把所有的化合物和中间体完全纯化与表征的规则, 取而代之的是使用可靠的化学反应以及简单而有效的纯化方法 【3 - 6 1 。 山东大学硕士学位论文 1 1 发展历史 组合化学起源于药物合成,继而发展到有机小分子合成、分子 构造分析和分子识别研究等领域。以往有些化学家一次只生产一种 化合物,一次只发生一个反应。例如化合物a 和化合物b 反应得到 化合物a b ,在随后的反应后处理中将通过重结晶、蒸馏或其它方法 进行分离纯化。与此相反,组合化学能够对化合物a l 到a n 与化合 物bl 到b n 的每一种组合提供结合的可能。组合合成的范围非常广 泛,可以使用液相或固相技术以平行方式或混合物方式来独立地生 成这些产物。 组合化学是在固相合成多肽基础上发展起来的一项快速合成新 技术。传统的药物研制方法是根据天然先导化合物,逐个地进行合 成、纯化,然后进行结构鉴定、生物活性测定等,一般每推出一个 新药约需6 10 年的时间,耗资也相当大,而且周期长、成本高。 随着酶和受体作为药物治疗靶点的不断阐明,药物自动化快速筛选 方法的不断出现,筛选的效率已非常高,但样品的来源却远远跟不 上,科学家们便把注意力转入合成大数目的化合物群,即化合物库。 组合化学技术由此应运而生。 上世纪6 0 年代初期,m e r r i f i e l d l 2 】建立的固相多肽合成法为组 合化学方法的建立奠定了基础,而多肽合成仪的出现,使该方法成 为一种常规手段。上世纪8 0 年代中期,g e y s e n 1 】用9 6 j f l 板在高分子 链上首次合成多肽成功,标志着组合合成的开始。19 91 年,混合裂 分合成法【7 1 的提出标志着组合化学的研究进入了一个飞速发展的 阶段。为了确定混合物的成分,合成物密码标记和解密技术以及产 物追踪技术也逐渐地发展起来。至上世纪9 0 年代初,以合成小分 子为主的平行单分子合成技术有了很大的发展,并成为组合合成 的主要技术。 组合化学的创立与发展,始于新药研究的需要。上世纪8 0 年代 末,组合化学合成开始应用于新药开发领域。随着分子生物学研究 山东大学硕士学位论文 的突破,即高通量筛选技术的发展,新药开发所需要的新分子实体 的数目越来越多,科学家们把注意力从寻找天然产物转入合成大数 目的化合物群,即化学库。组合化学就是种合成化学库的技术, 运用这项技术,不同系列的合成砌块一一反应成分可有序地排列起 来,从而组成大系列的多样化分子实体群。至9 0 年代后期,组合 化学技术被进一步推广应用于新材料和新型催化剂的研究。 组合化学是一门交叉性科学,它以有机化学为基础,与生物化 学、药物化学密不可分,并涉及到数学、物理学、计算机等多门学 科,是这些学科与合成化学的完美结合。目前,分子生物学、分子 图形学以及计算机科学等学科、人类基因组计划,都为药物设计提 供了大量的有用工具和高选择性新分子靶标;应用电子信息技术生 成和贮存的虚拟组合库,使得库内化合物具有了尽可能大的化学多 样性,增加了组合库的命中率。组合化学作为合成药物的一种全新 思路和可行方法,今后更深入的发展方向是:除构建分子多样性化 合物库外,还应提高生物检测效率和水平,发展直接测定结构的技 术,实行合成和筛选一体化,组合化学与计算机一体化,改革、发 展现代生物筛选技术并进行标准化等。 组合和平行合成方法的发展推动了用于医药工业中先导化合物 的发现和高通量药物化学的化合物库的制备。仅仅经历短短十多年 的发展,组合化学技术已经取得了令人瞩目的进展;虽然作为一个 科学研究新领域,它还存在着一些有待完善的问题。例如,化合物 库结构设计智能化、组合合成自动化、结构分析过程同步化、超微 量活性化合物的快速检出等。然而,科学家在这个新的研究领域里 已经取得的成绩让人们乐观的相信,组合化学技术将在更广阔的科 学领域中发挥更大的作用。 1 2 组合合成技术 组合合成是组合化学的基础,也是它的第一个环节。所有的组 合合成都包括化合物库的制备、库成份的检测及目标化合物的筛选 9 山东大学硕士学位论文 三个步骤。在过去十多年,在药物发现与其它研究领域,组合化学 技术一直是一个最重要的技术。就合成技术而言,化合物库的制备 既可以通过液相也可以通过固相来完成,因此,组合合成的方法包 括固相合成和液相合成两种。 1 2 1 固相合成 到目前为止,组合化学领域中大部分重要成果还是由固相技术 来完成的 8 - 12 】。固相反应中,由于反应中间体是键连在载体上的, 所以可不经萃取、浓缩和纯化就能快速地从混合物中分离出来。因 此,固相合成在多步重复合成反应方面有着特殊的优势。相对于液 相合成,固相合成所得产物较易纯化( 直接过滤即可) 、收率较高 ( 通过使用过量的溶剂来实现) 、较易实现自动化,如果使用混分 法可得到等分化合物。 固相合成是m e r r i f i e l d 【2 】利用树脂作为载体合成多肽的基础上 发展起来的。固相有机合成( s p o s ) 涉及多步有机反应,其中包 括将反应物键合于高分子载体上的反应和选择适当溶剂从树脂上 裂解产物,其原理如下图所示,其中a 为通过适当连接桥( 1 i n k e r ) 键连在树脂上的反应物组分,b 、c 为可溶性反应物,分别与a 和固 载化中间体a b 反应形成键合于载体上的产物a b c ,然后用适当 裂解试剂裂解即可得到产物( 图1 1 ) 。 争z - 唰。8 l 1 丁 令f 。8 一型,胁c 3 4 图1 1 固相有机合成一般路线 固相有机合成( s p o s ) 具有以下特征【13 】:1 ) 大大简化反应后 处理操作,反应完毕,只需简单过滤,用溶剂冲洗过量的试剂和未 1 0 山东大学硕士学位论文 反应原料,从而省略了费时、麻烦的分离纯化操作;2 ) 可充分利 用热力学和动力学因素促进反应,形同条件下,固相反应不如液相 反应完全,且反应条件不宜苛刻( 如高温) ,但可增加廉价反应试 剂促使反应完全,过量的试剂可简单地用溶剂冲洗,过滤清除;3 ) 稀释原理的应用,交联度高而负载低的树脂( 衍生化官能团 o 8 m m o l g ) 中,反应位置相对分离,相当于在浓度较低的体系中 进行反应,可抑制一些副反应,如固载化的产物分子间相互隔离, 从而避免了自身相互作用,这对于合成某些易聚合的产物是十分有 益的;4 ) 易于实现自动化,多中心同步合成( m u l t i p l ep a r a l l e l s y n t h e s i s ) 与组合库的建立都离不开合成方法自动化;5 ) 有毒反 应物键合于固相载体上可以减少或消除其毒性;6 ) 树脂再生:如 果选择适当连接桥( 1 i n k e r ) 的裂解条件,高分子树脂可再生重复 使用。 固相有机反应的发展拓展了组合化学的应用范围,它已成功用 于小分子有机合成,该技术目前仍处于快速发展阶段,越来越多的 经典有机反应已可以从溶液相转移到固相。固相化学的难度在于寻 找简便、高效的反应。成功的固相合成不仅仅包括路线本身,还需 要合适的固相载体、连接分子、反应监视、纯化和自动化工具等。 随着组合化学的不断发展,作为绿色化学合成技术的固相有机 合成研究,必将对化学、化工、医药、生命科学和材料化学产生巨 大影响,而成为研究和开发的核心技术之一。 1 2 2 液相合成 所谓的液相技术,顾名思义,所有的反应物在液相中进行,根 据体系的不同性质选择不同的检测与筛选手段,以达到寻找目标产 物的目的。 液相合成不需开发制备化合物库的新化学反应,对反应试剂或 反应条件的要求并不苛刻。即使是高反应性和高腐蚀性的化合物或 特高温反应,在液相合成中同样可以进行,只是这些反应在纯化时 山东大学硕士学位论文 比较困难。在液相中的组合合成例子并不多【1 4 6 1 ,而且大多数是 一步或两步的单个化合物的平行合成或是混合化合物的混合试剂 合成。较为成熟的是酯类、酰胺以及氨基甲酸酯等二聚体的合成, 且不需进一步纯化。有一类反应特别适用于在溶液中进行组合合 成,即多组分反应。与固相组合合成相比,液相组合合成的优点是: ( 1 ) 不受反应类型限制,已有的反应均可用于液相组合合成;( 2 ) 不需 要设计和合成连接分子;( 3 ) 对反应过程容易实现跟踪和检测;( 4 ) 大多数反应,不需切割可以直接得到产物;( 5 ) 容易实现大量合成。 液相组合合成,虽没有固相组合化学成熟,但由于它有别于固相技 术的优势,且合成步骤较少的小分子化合物的合成更适宜于在液相 中进行,故在人们将视线逐渐转向具有药理活性的有机小分子合成 的同时,液相组合化学也得到了快速发展。 固、液相技术各有优缺点,但总的说来,固相技术的优点多于 液相技术,特别是液相技术难以实现自动化限制了其发展。到目前 为止,大多数库的合成都是通过固相技术实现的。 1 3 组合合成策略 组合合成库的合成策略主要有混合裂分法l 16 18 1 和平行合成 法。混合裂分法是合成大量化合物的最常见方法,而且已经有多种 方法可以对混合化合物库中有活性的化合物进行结构鉴定,不过它 只能用于固相合成。平行合成法也可以采用不同的固相载体或专门 设计的反应器皿,单个化合物的合成产量可以从纳摩尔到毫摩尔不 等。另外,平行合成法在固相和液相中都可能进行。而混合试剂合 成法可适用于固相合成,也可用于液相合成。 1 3 1 混合裂分( s pl ita n dp o o1 ) 法 19 91 年,混合裂分合成法【3 】的提出标志着组合化学研究进入了 个飞速发展的阶段。通过混合裂分法,首先合成了多肽化合物库。 用传统化学方法合成l 万个化合物通常需要1 万个反应容器,如果经 1 2 山东大学顾士学位论文 三步反应制备产物三联体,则至少需要3 万个单独的化学反应容器, 这是制备该数目化合物的先决条件。而混合裂分法效率则要高很 多。只要把反应条件相同的不同底物合并到同一个反应容器中进行 相同的反应,同样制备1 万个三联体化合物,工作量可降低到1 万的 立方根的程度,即大约仅需2 2 个反应容器。组合化学己通过机器实 现了自动化合成,采用混合裂分法理论上一台自动合成仪几天内可 以合成上百万个化合物。据统计,19 9 0 年以来用组合技术得到的各 类化合物总和已超过人类有史以来所发现的全部化合物总和。人们 将这种快速获取多样性分子、大范围获取结构与活性信息、大大提 高研制新药效率而又借助于信息高速公路的组合技术称为“新药发 现的高速公路”。组合化学的研究方法主要包括三个阶段:化合 物库合成、群集筛选( 活性检测) 和活性结构测定等。 缸。r 金 i p 触岔b a 阻i争a b 争b b 分c b iq 图i 2 混合裂分法图示 1 3 2 平行合成( p ar8i iei s y n t h e s is ) 法 平行合成法【2 1 ,即平行制备数十到数百个生物活性化合物的类 似物,可通过手工或自动方法,经可靠的偶联反应和官能团间的转 化来实现,在除去溶剂和挥发性副产物后,直接用于筛选。 山东大学硕士学位论文 传统合成通常经历多步过程,如从反应物a 到终产物d ,一般 在筛选之前进行结构确定。以一个化合物的生物活性为依据,设计 合成下一个化合物,然后再筛选。通过优化活性和选择性来重复这 一过程。相反,平行类似物合成包括一个底物s 与多个反应物r l , r 2 ,r 3 r n 反应,产生一个含有n 个单个产物s r l ,s r 2 ,s r 3 , s r n 的化合物库。该化合物库通常不需纯化,只做简单的结构确证 就可以用高通量筛选技术进行筛选。如果发现了活性化合物,可选 择重新合成、纯化、结构确证和筛选。如果生物活性得到证实,新 发现的先导化合物和s a r 将用来设计新的底物模板。再用平行类似 物合成方法制备新化合物库。因此,这是一个快速、与传统的先导 化合物优化法非常相似的方法,特点是速度快、化合物数目较大。 图1 3 平行合成法图示 单个化合物的平行液相合成法可快速合成出许多化合物用于 生物活性筛选,对于药物化学家而言,这种方法很有实用价值,因 为单个化合物对于先导化合物优化和s a r 研究特别有价值,当化合 物库中有许多活性化合物时,以混合物方式制备化合物库并不合 适。平行合成法在许多研究机构和制药公司正用于单个化合物的合 成,进行新药开发研究,自动合成和纯化技术的提高将有助于该方 法的进一步发展和应用。 1 3 3 其它方法 1 4 组合化合物库的混合试剂合成法,可适应于固相合成,也可用 佃呦b 一、呲价吖n削吖 1 2 ; n 臣臣 臣 : 卧 山东大学硕士学位论文 于液相合成。其组合合成的每一步反应都是在构建单元混合物的反 应器皿中进行,不管是液相反应还是固相反应。应用混合试剂法必 须对其中所有反应的反应机理和反应动力学有所了解,反应试剂之 间的相对反应速率要相当,并且与连有树脂珠的化合物无关。 19 9 1 年,朗姆( l a i n ) 提出了一珠一肽( o n e b e a d ,o n e p e p t i d e ) 合 成【19 1 ,又将混合一均分法与多肽固相合成法及生物筛选技术有机 地结合在起,从而使组合化学技术更趋成熟。一珠一肽( 即一粒 树脂珠上含有一种肽段) 混合均分合成法的基本思想是利用树脂作 载体,按混合一均分法进行组合合成由于产物与树脂相连,在每 步反应完成后它不溶于溶剂,因而可以十分方便地将杂质、催化 剂及过量的试剂等洗涤干净,所得化合物库( 这里指的是肽库) 经筛 选后检出其中具有活性肽段结构的树脂珠,再经仪器测序,即可确 定具有活性的肽段结构。事实上,朗姆等人用该法合成的五肽库对 抗内啡肽的单克隆抗提供了亲和性研究,并已成功地找到天然抗原 位点肽的六个有效类似物 21 世纪的新药研究与开发将是一项高度复杂的系统工程,是 现代高技术特别是生物技术和信息技术在生命科学研究领域的应 用。它取决于多学科特别是化学、生物学和生物医学发展的整体水 平和综合实力,其关键是如何将现代生物技术、组合化学技术以及 各种有机合成新方法结合起来,减少在合成和筛选方面的时间和投 入,降低风险,提高筛选命中率,以研制出高质量、高效用的新药。 1 4f tir 分析在固相有机合成中的应用 固相有机合成( s p o s ) 具有产物分离纯化简单、可以使用过量试 剂促使反应完全和容易实现合成的自动化等诸多优点而受到重视, 是组合化学及高通量筛选技术中建立分子多样性化合物库最常用 的方法。但是,s p o s 也有自身的缺点,其中之一便是缺乏普遍适 用和稳定可靠的分析检测方法。由于s p o s 的目标产物是连在不溶 性高分子载体上的,一些基于液相合成普遍有效的分析监测技术如 山东大学硕士学位论文 薄层色谱( t l c ) 和高效液相色谱( h p l c ) 等不再适用。因此,化学家 们考虑先把目标化合物从载体上切割下来再对其进行常规分析检 测的方法( c l e a v ea n da n a l y z e ) 1 20 1 。这样的方法要求切断反应非常完 全且不会对目标产物造成污染,而在实际操作中,这一点是很难做 到的。此外,切割以后分析得到的产物收率和纯度不能真实反映连 接在固相载体上的产物收率和纯度。更为重要的是,这样的方法无 法对固相反应进程进行实时监测,不适合对反应进行动力学研究。 随着固相化学分析技术的深入发展,逐渐建立了很多直接对连 在高分子载体上的化合物进行分析检测的方法。质谱( m s ) 可以用来 检测剖析化合物库中的化学结构,例如采用电子喷雾离子化质谱技 术( e s i m s ) 可以对树脂接枝衍生物作无损结构分析f 21 1 。还有人采 用液相色谱质谱( l c m s ) 联用技术以及高效液相色谱核磁共振谱 质谱h p l c n m r m s ) 三谱联用技术f 2 2 1 对化合物库作同步成分分 析和结构解析;魔角旋转核磁共振( m a s n m r ) 技术 2 3 , 2 4 】可以实现 对连在固相载体上的化合物进行表征;固相原位质谱( s p i m s ) 技 术 2 5 - 2 7 1 在分析样品之前也不必除掉树脂载体。这些新技术不但可 以提供固载化合物结构方面的信息,而且实现了对固相反应的原位 检测,可以用于固相反应的动力学研究。但是,这些技术对s p o s 不都是普遍适用的,而且m a s n m r 和s p i m s 的仪器设备价格昂 贵,大多数实验室都不具有这样的设备。 傅立叶变换红外光谱( f t i r ) 仪是现代化学试验最常规的分析 仪器之一,广泛用于有机合成的定性和定量分析 2 8 , 2 9 。在固相有 机合成中,红外分析是检测固相反应最有效的技术。这是因为:首 先,大部分的固相有机反应包括了官能团的转换,通过观察重要吸 收信号的出现与消失,并确定这些吸收峰不会被高分子固相载体产 生的吸收峰所遮蔽,用这种方法可以检测化学反应是否发生;其次, 根据红外吸收信号的强度变化可以监测从原料到产物化学转化的 程度,进行固相反应动力学研究;另外,一般情况下都选用已经在 液相化学中得到充分优化的反应条件进行固相化合物库的合成,在 1 6 山东大学硕士学位论文 对s p o s 的产物进行评价时,只须确认期望得到的化合物是否存在 即可,而不必对全部信息进行鉴定。正因为f t i r 和s p o s 各自的这 些特点,近年来f t i r 分析及其新技术在s p o s 中的应用非常广泛。 采用k b r 压片的红外光谱法也可以直接表征连接在不溶性高分 子载体上的目标化合物,通常需5 m g 左右样品与k b r 粉末一起在玛 瑙研钵中充分混合磨细,通过压片完成样品制备后进行透射f t i r 分析【3 0 】,已经有人用此方法对固相有机合成反应做出了监测。但 是这种方法存在着一些缺点:不仅操作费时、不适于对反应进行实 时监测,还需要较多的样品量,k b r 有可能会对树脂造成形态变化 或表面污染;高分子载体很难研磨到足够小的粒径,颗粒过大造成 的红外辐射光的强烈散射会致使谱图基线发生漂移,甚至造成吸收 谱带畸变,谱图难以辨认。针对以上问题,显微红外光谱技术就显 示出其独特的优越性。显微红外光谱法就是将显微镜安装在f t i r 光谱仪上,是微量分析又是微区分析的近代技术【3 1 ,32 1 。m i c r o f t i r 技术可以用计算机对检测位置进行选点、定位、聚集,实现对样品 的自动化测量,能得到测量位置处物质分子的结构信息、化合物和 官能团空间分
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