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文档简介
SigmaPlot10.0,ImagePro-Plus6.0,等软件的使用,邓志钦,2019/12/18,1,主要内容,1运用SigmaPlot10.0做全程图,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,4运用SigmaPlot10.0做断点柱状图,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,6运用ImagePro-Plus6.0截图,7运用ImagePro-Plus6.0分析灰度值,8ImagePro-Plus6.0定标,2019/12/18,2,1运用SigmaPlot10.0做全程图,1运用SigmaPlot10.0做全程图,2019/12/18,3,1运用SigmaPlot10.0做全程图,1点击“File”“Import”“File”,找到你对应的文件,打开格式为“*.TXT”的文件。或者快捷键“Ctrl+L”,2019/12/18,4,1运用SigmaPlot10.0做全程图,2点击“Import”打开格式为“*.TXT”的文件。,2019/12/18,5,1运用SigmaPlot10.0做全程图,3点击“Import”。,2019/12/18,6,事件,时间(s),电流(nA),4把事件一栏删除,保留时间和电流。,2019/12/18,7,1运用SigmaPlot10.0做全程图,5“时间”栏,从0开始;点击散点图,开始作图。,2019/12/18,8,1运用SigmaPlot10.0做全程图,5选择“XYpair”,X轴是时间,Y轴是电流。,2019/12/18,9,1运用SigmaPlot10.0做全程图,2019/12/18,10,1运用SigmaPlot10.0做全程图,6双击,对图形进行编辑。“LinesThickness”调整线条厚度,“ScalingRange”调整坐标刻度范围;“TicksTickintervalsMajorTick”调整坐标刻度间隔。保存文件,可以作为模板。,坐标轴标题22号,TimesNewRoman,字符和单位之间要空一格,,画出横线,说明加药时间,横线厚度同样0.5,按需调整坐标刻度范围,字体20号。坐标轴厚度,0.5。,2019/12/18,11,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,2019/12/18,12,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,1以制作加药稳定后的瞬时图为例。单击,选中加药稳定后一点。,2019/12/18,13,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,2返回“data”窗口,图中绿色标记的就是这时间中0,40,80mV所对应电流。以这5个电流为基础作瞬时图。,3从图中可以看到,这5个电流所对应的事件是:457-461。这时候打开,2019/12/18,14,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,4双击,打开signal2文件夹里的“Cfsview”应用程序。,2019/12/18,15,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,5点击“FileOpen”,选择这个细胞所对应的“*.DAT”文件。,2019/12/18,16,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,6直接输出生成瞬时图文件。点击“FileExportAs”,更改文件类型*.TXT和文件名,点击保存。,2019/12/18,17,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,7点击“OK”,2019/12/18,18,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,8更改“Frames”内容为刚才选中的这一时间段所对应的事件即:“457.461”(中间两个点需在英文状态下输入),点击“Export”,2019/12/18,19,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,9打开“SigmaPlot10.0”,打开刚才用signal2保存的文件。,2019/12/18,20,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,10点击线条图(第一栏第一个),选择“XYpair”,点击“下一步”,“s”为X轴,“chan0”为Y轴,点击“下一步”。,2019/12/18,21,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,11双击纵坐标轴,“Scaling”“Scaletype”,选择“Linear”更改类型。点击横坐标,同样更改类型。,2019/12/18,22,2运用SigmaPlot10.0和signal2做瞬时图,12双击,对图形进行编辑。“TickLabelFactorout1e-3”调整横坐标,保存文件,可以作为模板。,坐标轴标题22号,字符和单位之间要空一格.,说明处理因素,按需调整坐标刻度范围,字体20号。坐标轴厚度,0.5。,TickLabelFactorout1e-3”调整横坐标,2019/12/18,23,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,2019/12/18,24,1返回“data”窗口,图中绿色标记的就是这时间中0,40,80mV所对应电流。复制电流到Excel表格中,按顺序或倒序排序,用电流/电阻(pA/pF)得到这一个细胞的电流密度。同理,获得5个以上的数据,作为统计,得到meanstd.err。,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,2019/12/18,25,2用电流/电阻(pA/pF)得到这一个细胞的电流密度。同理,获得5个以上的数据,作为统计,得到meanstd.err。,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,2019/12/18,26,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,3按下列格式排好,制作点线图。,X轴,Y1轴,Y2轴,2019/12/18,27,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,4单击,点“下一步”,“dataformat”选择“XmanyY”完成。,2019/12/18,28,3运用SigmaPlot10.0做I-V曲线,5按需对图形进行编辑。,2019/12/18,29,4运用SigmaPlot10.0做断点柱状图,2019/12/18,30,4运用SigmaPlot10.0做断点柱状图,1组间差异很大,需要对柱状图做出调整。,2019/12/18,31,4运用SigmaPlot10.0做断点柱状图,2双击坐标轴,点击“Breaks”“Showbreaks”更改合适的断点位置,点击“确定”。再对图形做出合适的编辑,如柱子颜色,组间距离,线条粗细,字体字号等。,2019/12/18,32,4运用SigmaPlot10.0做断点柱状图,2019/12/18,33,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,2019/12/18,34,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,1打开目标图像。点击“Edit”“Showbreaks”“Duplicate/CroptoAOI”,2019/12/18,35,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,2点中新创建的图像,点击“Bestfitequalization”使图像均衡化。,2019/12/18,36,3选择菜单栏的“Measure”“Count/Size”,打开“Count/Size”对话框。,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,2019/12/18,37,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,4选择“Count/Size”对话框中的“SelectRanges”。打开“Segmentation”对话框,拖动对话框中“histogramBased”框条和时间轴,保证每个时间点时红色部分填充满细胞,使细胞与背景尽量分开。完成后选择“ApplyMask”“Closd”。,2019/12/18,38,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,5完成后点击一次“Count/Size”对话框中的“Count”。这时候看到已经有106个点被标记。“Count/Size”对话框中的“Measure”点击“SelectMeasurements”,打开测量选项对话框。,2019/12/18,39,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,6选择测量选项对话框中:“Area”,“Center-X(mass)”,“Center-Y(mass)”和“Roundness”四个测量选项。分别对它们进行编辑范围。,2019/12/18,40,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,7编辑“Area”,“Center-X(mass)”,“Center-Y(mass)”和“Roundness”四个测量选项范围,同时观察左边红色部分的变化,使得细胞面积都在这个范围内。完成后点击“OK”,第二次点击“Count/Size”对话框中的“Count”,这时候看到已经只有27个点被标记。,2019/12/18,41,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,8第二次点击“Count/Size”对话框中的“Count”,这时候看到已经只有27个点被标记。,2019/12/18,42,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,9点击菜单栏“Measure”“TrackObjiets”,打开对话框,点击对话框中“”图标,开始测量。,2019/12/18,43,5运用ImagePro-Plus6.0快速测量细胞面积,10测量完成后,点击图标“”,对离群值进行剔除,然后输出结果到Excel,就可以算出面积和体积了。,2019/12/18,44,6运用ImagePro-Plus6.0截图,2019/12/18,45,6运用ImagePro-Plus6.0截图,1点击“Edit”“AOI”调出AOI对话框。点击AOI对话框中“Add”,增加一个区域,命名,保存。,2019/12/18,46,6运用ImagePro-Plus6.0截图,2打开图像,点击下方按钮,选中需要截图的区域。“Ctrl+C”打开PowerPoint文档,“Ctrl+V”。直接复制粘贴选中的区域。,2019/12/18,47,6运用ImagePro-Plus6.0截图,3按时间轴,把细胞序列切换到你感兴趣的时间点。双击AOI对话框中刚才所命名的文件。“Ctrl+C”打开PowerPoint文档,“Ctrl+V”。直接复制粘贴选中的区域。,2019/12/18,48,7运用ImagePro-Plus6.0分析灰度值,2019/12/18,49,7运用ImagePro-Plus6.0分析灰度值,1打开图像,打开“Count/Size”对话框。,2019/12/18,50,7运用ImagePro-Plus6.0分析灰度值,2选择“Count/Size”对话框中的“SelectRanges”。打开“Segmentation”对话框,拖动对话框中“histogramBased”框条,保证红色部分填充满你的条带,使条带与背景尽量分开。完成后选择“ApplyMask”“Closd”。,2019/12/18,51,7运用ImagePro-Plus6.0分析灰度值,3完成后点击一次“Count/Size”对话框中的“Count”。这时候看到已经有106个点被标记。“Count/Size”对话框中的“Measure”点击“SelectMeasurements”,打开测量选项对话框。选
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