出具肿瘤靶向治疗研究报告ppt课件.pptx

Theworldleaderinservingscience 出具肿瘤靶向治疗研究报告 用OKR很OK OKR诞Th前景 OKR秘制性能OKR报告概览 出具肿瘤靶向治疗研究报告 用OKR很OK ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 2 OKR诞Th前景 OKR秘制性能OKR报告概览 出具肿瘤靶向治疗研究报告 用OKR很OK ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 3 今日挑战越来越多的肿瘤生物标志物需要进行验证 发掘其潜在的临床应用价值全球信息多 但是数据信息杂乱且不规范通过新一代测序 NGS 的变种需要快速筛选出准确的相关信息 肿瘤研究中的分子标记 目前的方法很费时费力 需要从多个来源进行广泛的研究 以便将相关信息映射到变体 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 4 IonTorrentOncomine研究分析流程 NGS测序 肿瘤样本 文库制备 从FFPE样本中提取DNA和RNA包括小样品 如细针抽吸 简单灵活的测序方案使测序变得更加简单准确 简单快速的文库制备低至10ng的输入量 IonAmpliSeq technology Formalin fixed paraffin embedded FFPE IonGeneStudio S5andIonPGM Systems 测序数据分析IonReporter SoftwareandIonTorrent Oncomine KnowledgebaseReporter定义突变挖掘变异 创建自定义报告 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 5 IonTorrentOncomine数据分析流程 StreamlinessequencingrunsandcreatesBAMfiles 开始目标测序分析 Linksvariantstorelevant publishedevidence 快速生成自定义报告 Callsvariants identifiesandannotatescancerdrivers 识别可能的驱动变异 TorrentSuite Software OncomineKnowledgebaseReporter IonReporterSoftwarewithOncomine plug in Th成自定义报告 序列分析 注释和过滤 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 6 自动化的数据分析服务器 IonReporter 服务器 友好可视化界面助力数据注释内置主流的生物信息分析软件 可通过界面分析数据或后台linux界面分析数据自动化分析ampliseq靶向测序数据 对变异信息进行常见数据库注释 GO MAF OMIM等 进行cnv及fusion分析支持客户自定义数据库 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 7 自动化的数据分析服务器 IonReporter 服务器 IonReporter内置丰富的Th物学知识库帮助注释和过滤数据 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 8 OncomineKnowledgebaseReporter 问 什么是OKR 答 可以拯救您的靶向治疗研究报告的新星产品 将驱动遗传突变与已公布的治疗方案和临床试验信息相结合 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 9 OKR诞Th前景 OKR秘制性能OKR报告概览 出具肿瘤靶向治疗研究报告 用OKR很OK ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 10 11 OncomineKnowledgebaseReporter 最全面的癌症基因组注释数据库 热点突变10 000exomes COSMICdatabaseHotspotenrichmentanalysis 插入 缺失突变10 000exomes COSMICdatabaseIndel nonsenseenrichmentanalysis 拷贝数变异30 000array basedgenomesMinimalcommonregionanalysis 基因融合8 000transcriptomes COSMICProprietaryfusionanalysis THEONCOMINE KNOWLEDGEBASE TheOncomine Knowledgebase是世界上最大的整合癌症基因组数据库 数据来源于公共数据库资源 同行评议的文献和发表的临床试验 OncomineKnowledgebaseReporter 强大全面的临床证据库 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 12 注释数据类型 基因突变 扩增 缺失和融合只有与其治疗相关的生物标记 单克隆抗体 小分子抑制剂 包括HDAC和蛋白酶抑制剂 激素疗法和免疫疗法 化疗疗法只有在结合上述任何一种治疗方法的情况下才行 OncomineKnowledgebaseReporter 全球临床试验广泛覆盖65个国家和地区 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 13 OncomineKnowledgebaseReporter 针对23种实体肿瘤和13种血液肿瘤 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 14 OncomineKnowledgebaseReporter 将肿瘤突变和临床药物信息连接起来 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 15 OncomineKnowledgebaseReporter 临床信息不断更新 Oncomine KnowledgebaseReporterv3 1 更新日期 2017 12 11 Oncomine KnowledgebaseReporterv3 0 更新日期 2017 09 20 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 16 OncomineKnowledgebaseReporter 数据转化信息流程概览 Robust curated andverifiedknowledgebase癌症相关数据的高效 准确和彻底分析 基因 变异 自定义实验室生成报告 突变扩增和缺失融合 驱动基因 4标签和指南的来源65参加试验的国家和地区 15个基基因因 28指南 53标签 1 073全球临床试验 10种语言 DatabehindOncomine KnowledgebaseReporter OncomineKnowledgebaseReporterDecember2017 48个基因 147个基因 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 17 IonReporter workflow VCF文件 生成实验室报告 研究实验室 Oncomine KnowledgebaseReporter US FDA治疗药物信息US NCCN 临床指南EMAl治疗药物信息ESMO临床指南全球临床试验 遗传变异 关联相关的信息 发布的治疗方案和全球临床试验 PreviouslyapprovedunderID24306Nochange OncomineKnowledgebaseReporter 数据库本地化 信息不易外泄 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 18 OncomineKnowledgebaseReporter 操作流程 上传文件 vcf格式文件或其zip压缩包仅支持oncomine品牌试剂盒 过滤您的报告并检查内容过滤 生成自定义报告生成报告 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 19 OncomineKnowledgebaseReporter 支持给出靶向治疗建议 OncomineKnowledgebaseReporter 不同类型肿瘤样本全覆盖 Oncomine FocusAssay Oncomine ComprehensiveAssay Oncomine SolidTumorAssay Oncomine Pan CancerCell FreeAssay Oncomine cfDNAAssaysforLung Breast Colon Oncomine TumorMutationLoadAssay IonAmpliSeq ImmuneRepertoireAssayPlus TCR Oncomine ImmuneResponseResearchAssay Oncomine LungcfTNAResearchAssay Oncomine BreastcfDNAResearchAssayv2 Oncomine MyeloidResearchAssay NEW NEW NEW Oncomine BRCAResearchAssay ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 20 OncomineKnowledgebaseReporter 三大优点 快 耗时短 3分钟内可生成一份报告上手快 易学 易于使用的图形用户界面易用 仅3步操作 上传 过滤 生成报告 即使实验工作者和医生 都能迅速分析数据 狠 严格细致的数据管理 两个独立的资深评审专家共同审查整合四大数据库信息直面解决客户生信短板问题 成熟的分析流程帮助客户大力节省生信成本实验数据绝对保密 本地服务器操作 无需担心实验数据外泄问题 准 使用的全球信息 将你的样本分别与认证药品 临床指南和全球临床试验相匹配 报告内容丰富 可信度高季度更新 放心享用最新靶向治疗临床信息标准化工作流程 为实验室或研究环境中每个操作员的一致输出创建标准化工作流和模板 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 21 OKR诞Th前景 OKR秘制性能OKR报告概览 出具肿瘤靶向治疗研究报告 用OKR很OK ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 22 OncomineKnowledgebaseReporter 用药指导报告 报告内容包括 变异及治疗方案概要 相关治疗方案汇总 每种药物具体信息 全球临床试验信息 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 23 报告 样本癌症类型 突变汇总 变异详细信息 实体肿瘤 报告的页眉和页脚 可自定义公司名称 公司图标和联系方式等 样本癌症类型索引 报告重点 索引 目录报告重点 驱动性突变 可用疗法和临床试验的数目实体肿瘤突变汇总 报告中会显示所有基因变异的相关信息 癌症类型信息的来源以及全球临床试验状况 变异详细信息 基因名 氨基酸改变 编码 变异ID 基因座 突变位置 等位基因频率 转录 变异影响等 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 24 报告 样本癌症类型 突变汇总 变异详细信息 血液肿瘤 血液病突变汇总 报告中会显示所有基因变异在该癌症类型和其他癌症类型中的靶向治疗方案以及临床试验的数目 靶向治疗方案的适用和禁忌症会通过颜色进行区分 髓系癌症类型有额外的标记类型 治疗 风险分层和癌症分类 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 25 报告 基因变异相应靶向治疗方案汇总 对于每一个基因变异 每个信息来源公布的治疗方案都提供一个证据标签 在当前癌症类型中在其他癌症类型中在当前及其他癌症类型中禁忌症适用及禁忌症无证据 全球临床试验也被标记 并标注出其最新测试的分期 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 26 报告 目前来源的靶向药物信息 对于每一个基因变异 每种治疗方法都有一个摘要信息因数据来源而异 美国食品药品监督管理局 FDA 美国国立综合癌症网络 NCCN 欧洲药品管理局 EMA 欧洲肿瘤内科学会 ESMO 全球临床测试 ClinicalTrials ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 27 报告 目前来自FDA靶向药物信息 美国食品药品监督管理局 FDA 癌症类型标签日期基因变异分类适应症及用法参考文献 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 28 报告 目前来自NCCN靶向药物信息 美国国立综合癌症网络 NCCN 癌症类型基因变异分类NCCN推荐类别人群范围 治疗人群 参考文献 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 29 报告 目前来自EMA靶向药物信息 欧洲药品管理局 EMA 癌症类型标签日期基因变异分类参考文献 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 30 报告 目前来自ESMO靶向药物信息 欧洲肿瘤内科学会 ESMO 癌症类型基因变异分类ESMO推荐类别人群范围 治疗人群 参考文献 ForResearchUseOnly Notforuseindiagnosticprocedures 31 报告 目前来自ClinicalTrails靶向药物信息 全球临床测试 ClinicalTrails 测试编号和测试名称癌症类型