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医学文献检索 张春晓2007 3 1 医学文献检索 一 医学文献检索概论二 常用医学文献资源三 网上免费医学资源四 引文检索系统简介五 网络信息资源检索 搜索引擎 第一节医学文献检索概论 文献的概念文献的类型医学文献的现状医学文献的作用文献检索的作用文献检索工具文献检索语言和种类文献检索的基本途径 一 文献的概念 是记录已有知识的一切载体的统称 即用文字 图形 符号 声频 视频等手段记录保存下来 可以交流传播的一切出版物或其它物质形态的载体 都统称为文献 记录知识的各种载体 印刷型文献 图书 期刊缩微型文献 感光材料为载体视听型文献 VCD DVD 磁带数字化文献 可通过计算机阅读或利用的文献 数据库 电子图书 人们获得知识两个主要个途径 实践 出真知文献 间接吸取知识 最主要的途径 二 文献的类型 按出版形态划分 图书 期刊 会议文献 学位论文 专利文献按载体类型分 印刷 视听 数字化按文献级别划分一次文献 作者的原始创作二次文献 将许多无序的一次文献进行收集整理 为读者提供查找文献线索的工具 三次文献 专家在二次文献的指引下 选用大量一次文献 浓缩提炼编写成的综述 专著 进展等 三 医学文献的现状 数量庞大学科交叉分散知识信息更新加快语言障碍增加重复及无用文献比例增加文献发表 时滞 问题严重 四 医学文献的作用 科学的自身发展有赖于文献的继承和积累 每一代人都是把前人或别人认识的终点作为自己的起点 科学研究必须以文献作基础和依据 科学研究必须以文献作基础和依据 准备研究的课题是否有人做过 别人已经做了哪些工作 取得哪些成就 有哪些先进经验可以借鉴 哪些教训可以引以为戒 还有哪些关键问题有待突破 将来发展趋势如何 经过全面分析后 才能根据现实条件和科学本身发展的需要来确定自己的研究课题 把尚未解决的问题作为自己的研究起点 方可避免不必要的重复 课题研究过程中遇到问题 仍需通过查阅文献寻求解决办法 成果鉴定仍需查新 五 文献检索的作用 继续教育作用 增强自学能力方法教育作用 授人以鱼 不如授人以渔 节约作用 迅速 准确 全面查阅文献文献检索的知识是一种 寻找知识 的知识衡量综合素质的标准不是谁聪明 而是谁能快速 准确地获取信息 六 文献检索工具 文献检索实际上就是利用一定的工具和手段 从一定范围的文献集合中查找到符合特定需要的文献 文献检索书刊 手工检索 文献数据库 计算机检索 一 文献检索书刊 称为目录 索引 文摘的工具型期刊或图书 如 中文科技资料目录 中国医学文摘 美国 医学索引 荷兰 医学文摘 生物学文摘 化学文摘 药学文摘 等 二 文献数据库 数据库 Database 一定范围内的文献记录及其索引的集合体 能被计算机读取 记录 Record 每条记录描述一篇文献的外表和内容特征 如题录 文摘字段 Field 构成记录的数据项 如篇名 作者 来源文档 File 数据库中一部分记录的集合 计算机信息检索 计算机信息检索是指以计算机技术为手段 通过光盘和联机等现代检索方式进行信息检索的方法计算机信息检索所依赖的技术光盘技术网络技术 计算机文献检索系统的构成 计算机硬件软件数据库通讯线路检索终端 数据库的类型和特点 事实数据库存储一般事实性资料的数据库 如美国医生咨询库PDQ PhysicianDataQuery PhysicianDataQuery 数值数据库 存储有关科研数据 数值等 如NationalInstituteforOccupationalSafetyandHealth的化学物质毒性数据库RTECS TheRegistryofToxicEffectsofChemicalSubstances 包含了10万多种化学物质的急慢性毒理实验数据 RTECS 书目数据库 二次文献数据库 检索结果是文献的线索而非原文 如Medline 全文数据库 存储原始文献的全文 超文本型数据库 存储多媒体 如美国蛋白质结构数据库PDB ProteinDataBank 该数据库可以检索和观看蛋白质大分子的三维结构 PDB Calmodulin DependentProteinKinaseFromRat VRML 从另外一个角度观察分子结构 VRML全屏 RASMol 静止图像 数据库结构 数据库结构分为物理结构和逻辑结构 字段field 数据库database 描述某一事物的个体的某一方面 描述某一事物个体的整体特征 描述某一事物个体的集合 数据库逻辑结构 常见数据库字段 检索系统 检索系统是一种软件系统 它的作用是为人提供一条利用存储在数据库中的数据的途径 每种数据库都有与之相配套的检索系统 一 系统运算符 检索方式 检索方式 基本检索 basicsearch 高级检索 advancedsearch 专家检索 expertsearch 常用光盘数据库 七 文献检索语言和种类 文献检索语言 是检索系统中的各种标识系统 如作者 期刊名排序规则 一套规范化的词汇 分类系统 等文献外表特征检索语言文献内容特征检索语言 一 文献外表特征检索语言 文献题名索引系统 书名 刊名 等著者索引系统文献序号索引系统 如专利号引文索引系统 参考文献 二 文献内容特征检索语言 分类检索语言主题检索语言 1 分类检索语言 按学科 专业集中文献 从知识分类的角度揭示多种不同文献在内容上的区别和联系 提供以学科分类为出发点的文献信息检索途径 如中国图书馆分类法 国际疾病分类等应用最多的是等级体系分类系统 构成具有上位类和下位类之间隶属 同位类之间并列的等级体系 中国图书馆分类法 分22个大类 一级类目 用22个汉语拼音字母 A K N V X Z 列出 如A为马列毛邓 B为哲学宗教 G为文化 科学 教育 体育 O为数理科学 化学 Q为生物科学 R为医药卫生 T为工业技术 Z综合性图书等 在字母后用阿拉伯数字表示下位类目的划分 中国图书馆分类法 R类 R医药 卫生1预防医学 卫生学2中国医学3基础医学4临床医学5内科学6外科学71妇产科学72儿科学73肿瘤学74神经病与精神病学75皮肤病学与性病学76耳鼻咽喉科学77眼科学78口腔科学79外国民族医学8特种医学9药学 可细分至六 七级类目 R医药 卫生 一级 R6外科学 二级 R65外科学各论 三级 R656腹部外科学 四级 R656 1急腹症R656 2腹部疝R656 3腹壁 五级 R656 31腹壁炎症 六级 R656 32腹壁损伤 中国期刊网分类表 2 主题检索语言 用于表达文献主题内容的词语标识系统主题词法关键词法 1 主题词法 医学主题词表 MeSH MedicalSubjectHeadings 主题词不一定就是图书或论文中出现的词语 主要是对一个概念的同义词 近义词及拼法变异词适当归并 以保证词语与概念的唯一对应采用参照系统将某些非主题词指向采用主题词以及显示相关主题词 采用类似分类的方法编制主题词分类索引和等级索引 如有关 肺癌 的主题词 肺癌 Lungcancer非小细胞肺癌 从PubMed数据库查询 非小细胞肺癌 2 关键词法 Keywords 将能表达文献主要内容 起关键作用的词或词组抽取出来 按字序编排的一种检索系统 它不进行词语规范化 不需要查主题词表 如篇名是 癌基因和抑癌基因在肺癌研究中的应用和发展趋势 优点 直接取自最新文献 词语不必规范化 在计算机检索系统中得到更广泛的应用 缺点 由于对同一事物 选用的词可能不尽相同 故查准率 查全率较低 PubMed 将检索词语和主题词比较 八 文献检索的基本途径 篇名途径著者途径刊名途径主题词途径关键词途径分类途径限定检索范围 Limit 复合检索 布尔逻辑检索 检索史组合检索追溯法 限定检索范围 Limit 如对学科范围 年限 检索词的位置等进行限制 也可在前一次检索的基础上 进行二次检索 从而减少误检 复合检索 布尔逻辑检索 可以同时将两个或两个以上的检索词直接输入检索框内进行检索 如 与 或 和 非 中文数据库检索语法符号的对应关系为 和 英文数据库检索语法符号的对应关系为 AND OR 和 NOT 如检索 肺癌的早期诊断 方面的文献 可以在检索框内输入 肺癌 早期诊断 如检索有关热或者湿度对多发性硬化作用的英文文献 可以在检索框内输入 heatORhumidity ANDmultiplesclerosis 检索史组合检索 将已经使用过的检索策略再进行各种逻辑组合 形成新的检索策略 可节省检索时间 如检索 女性肺癌 方面文献的结果用 1 表示 检索 Meta分析 方面文献的结果用 2 表示 1AND 2 就表示检索有关 女性肺癌方面的Meta分析 文