NGS用于指导晚期恶性肿瘤治疗PPT课件.pptx

NGS用于指导晚期恶性肿瘤治疗新进展 精准检测 精准治疗InsightonNovelMechanismsandPrecisionCare 基因检测一览 PresentedByClaudineIsaacsat2016ASCOAnnualMeeting 遗传性肿瘤重叠表型 同病异治异病同治 Sequencingis PresentedByDavidHayesat2016ASCOAnnualMeeting 测序的优势价格更低廉品质更高适用范围更广 机器 试剂盒 软件组织灵活性更高 石蜡标本 无需细胞 甚至RNA 近8年 ASCO年会上与NGS相关的摘要数目投稿 内容 NGS指导下EGFR突变型TKI耐药患者的治疗NGS指导下的肿瘤免疫治疗cfDNA检测与肿瘤治疗NGS在多种实体肿瘤治疗中的应用 肿瘤异质性 肿瘤治疗前的低频突变变成了主克隆的耐药性突变 EGFR TKI耐药机制EGFR TKI原发性耐药机制EGFR TKI获得性耐药机制 原发性耐药使用EGFR TKI后未曾出现过临床获益 EGFR TKI原发性耐药机制 10种已知的驱动基因包括 EGFR ALK KRAS HER2 BRAF PIK3CA AKTI MEKI NRAS和MET 结果表明 54 肿瘤样本只存在一种驱动基因突变 意义 驱动基因在肺癌的发展中起重要作用 根据患者的驱动基因突变检测结果 可决定是否给予患者相应的靶向治疗药物 TKI获得性耐药的临床定义 EGFRTKI单药的治疗存在EGFR敏感突变或客观临床获益疾病进展 RECIST标准 JackmanDMetal JClinOncol 2010 28 2 357 60 EGFR TKI获得性耐药的可能机制 Kim SonH ClinLungCancer2009 获得性耐药患者的管理策略 三种临床失败模式 YangJJ etal LungCancer 2013Jan 79 1 33 9 疾病控制 3个月与以往评估相比 肿瘤负荷快速增加症状评分达到2 疾病控制 6个月与以往评估相比 肿瘤负荷轻微增加症状评分达到 1 疾病控制 3个月孤立性颅外进展或颅内进展症状评分达到 1 EGFR TKI获得性耐药的治疗策略单纯局部治疗 184颅外PD患者 7 年 中 18例接受局部治疗 MSKCC经验 排除CNSPD自局部治疗时间中位TTP 10个月中位至新的全身治疗时间 22个月中位OS 41个月 YuHA etal 2012ASCOAbstract7527 PolitiK etal ClinCancerRes 2015May15 21 10 2213 20 病例符合目前肺癌治疗的模式 检测 用药 耐药 检测 用药调整循环 15 不同失败模式的生存分析 YangJJ etal LungCancer 2013Jan 79 1 33 9 病例 患者 女性 53岁 确诊肺癌5月 反复咳嗽半年余加重1月 于2016 2 19入院 2015 8 26至浙一医院就诊 查胸部CT增强 2015 8 31 示 左肺占位 肿瘤考虑 两肺感染 左侧胸腔积液 头颅MRI示 左侧枕叶结节灶 转移瘤考虑 骨ECT 2015 8 31 示 左4前肋骨代谢局限性略活跃 L5椎体骨质代谢活跃 建议行腰椎MRI 腹部CT 2015 8 31 示 左肾中级占位 临床诊断 左肺癌伴颅脑及骨转移2015 9 15排除禁忌后行CT引导下肺部穿刺 病理提示 腺癌 TTF 1 P63 NapsinA ALK lung CK7 CK5 6 Ki 67 基因检测 2015 9 23 示 EGFR21外显子发现突变 L858R 2015 9 25开始口服易瑞沙0 25gpoqd靶向治疗 2016 1 27CT引导下肺肿物穿刺活检 NGS测序结果 2016 1 30起靶向药物治疗 吉菲替尼 250MG口服QD 依维莫斯 10MG口服QD 2016 1 16 2016 2 19 2016 4 1 小结 EGFR TKI获得性耐药的治疗策略 NGS 小结 内容 NGS指导下EGFR突变型TKI耐药患者的治疗NGS指导下的肿瘤免疫治疗cfDNA检测与肿瘤治疗NGS在多种实体肿瘤治疗中的应用 Cancerisadiseaseof PresentedByDavidHayesat2016ASCOAnnualMeeting 癌症是一种 的疾病 PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 以杂交捕获法为基础的二代基因测序法可作为预测抗PD 1 PD L1治疗黑色素瘤疗效的标记物 Introduction PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 简介在进展期黑色素瘤患者中 抗PD 1治疗有30 45 的有效率 反应可能持续存在 较难辨别有效人群 因此需要有效预测标记物 Candidatebiomarkersforanti PD 1 PD L1 PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 抗PD 1 PD L1的候选标记物 克隆性增殖 突变或新的抗原 Aims PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 目标 假设 小片段基因能精确地代替基因突变负荷以杂交捕获法为基础的二代基因测序法检测236 315个基因编码区序列 突变负荷和特殊突变与临床结果的相关性 与全外显子测序所得突变负荷相比较T细胞受体测序与结果的相关性 Methods PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 方法 Mutationloadandresponse PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 突变负荷和反应 Mutationloadandresponse PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 突变负荷和反应 Mutationloadandresponse PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 突变负荷和反应 Mutationloadandsurvival PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 突变负荷和生存率 Specificmutations PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 特定突变 Specificmutations PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 特定突变 Mutationloadcomparisons PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 突变负荷比较 Mutationloadandsurvivalinunselectedpatients PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 在未选择患者中的突变负荷及生存率 在未选择患者中突变负荷与生存率无关 TCRclonality PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting TCR克隆 Potentialimplications PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 潜在临床价值及意义 Conclusions PresentedByDouglasJohnsonat2016ASCOAnnualMeeting 结论二代杂交捕获法为基础的NGS检测突变负荷与抗PD 1 PD L1疗效相关236 315个基因突变负荷的检测结果与全外显子测序结果一致通过此法检测突变负荷可能有助于临床的治疗决策和预测疗效 正在进行的工作 内容 NGS指导下EGFR突变型TKI耐药患者的治疗NGS指导下的肿瘤免疫治疗cfDNA检测与肿瘤治疗NGS在多种实体肿瘤治疗中的应用 ctDNAPPVvs tissuebiopsy NSCLC CRC Breast Others PresentedByDavidHayesat2016ASCOAnnualMeeting 背景 SerialNextGenerationSequencing NGS ofcellfreeDNA cfDNA revealsclonalevolutionofAKT1E17Kmutanttumors analysesfrompatientsenrolledonaphaseIbasketstudyofanAKTinhibitor AZD5363 PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 血浆游离DNA cfDNA 的NGS揭示AKT1E17K突变肿瘤的克隆演变 一项AKT抑制剂 AZD5363 I期篮子研究的患者分析 Background TargetableDriverOncogenes PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 背景靶向驱动致癌基因大量的肿瘤基因型分析已显著提高了肿瘤驱动基因的认识 其中一部分已成为靶向基因其中一个驱动基因 AKT1E17K突变 反复的 2 人类癌症的致癌事件 一项研究治疗意义的I期篮子研究正在进行中 其中一种pan AKT抑制剂 AZD5363 的靶向治疗具有较好的前景 当然 目前还不清楚是否同时存在其他突变 导致肿瘤细胞对AKT1E17K依赖的改变 Background Liquidbiopsies PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 背景液体活检对肿瘤发展及耐药产生的理解很大程度上依赖于取得新鲜肿瘤组织而单个病灶的活检存在很多挑战 异质性 局限的可行性 侵袭性以及价格昂贵 都可能被液体活检克服 肿瘤来源的血浆游离DNA Background Liquidbiopsies PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 检测肿瘤基因组的改变发现疾病基因组的复杂性 异质性 监测治疗中的肿瘤动力学追踪现实中耐药机制的演变 监测分子性疾病 背景液体活检 Objectives PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 目标在基因富集 含有AKT1E17K突变 的人群中 正在接受靶向治疗 尝试运用cfDNA以 1 发现及追踪AKT1E17K突变2 描述具有AKT1E17K突变的肿瘤中同时发生的突变3 监测分子耐药机制的演变 通过 平行追踪所有肿瘤突变 辨别新近获得的突变的出现 Studydesign PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 研究设计前瞻性 单中心 相关性研究合适的患者 AKT1E17K突变阳性的实体肿瘤 入组参加AZD5363的1期多中心篮子研究 一种口服的催化性pan AKT抑制剂 作用于AKT1突变的进展期实体肿瘤 NCT01226316 已知具有RAS RAF突变的肿瘤患者被排除 根据RECISTv1 1标准定义 具有可测量病灶 StudySchema PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 研究纲要 SampleCollection PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 血样本收集 Patientdemographics PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 患者统计学资料 AKT1E17KdetectedandmonitoredincfDNAbyddPCR PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 在22 25个 88 患者中 ddPCR检测到AKT1在D21 AKT1的减少预示PFS的升高 以ddPCR检测及监控cfDNA中的AKT1E17K AKT1追踪肿瘤反应持续的 21天 AKT1清除与持续的RECIST反应相关 P 0 025 AKT1mutantallelefraction MAF incfDNAhighlyconcordantbetweenddPCRandNGS PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting cfDNA的AKT1突变等位基因分数 MAF 在ddPCR和NGS中高度一致 NGSofPre treatmentcfDNA n 25 capturedtumorheterogeneity PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 治疗前cfDNA n 25 的NGS发现肿瘤异质性在8个 38 病人中检测到17种额外的改变 共21个病人具有可比较的治疗前肿瘤 发现3个 12 病人中同时出现了相关的突变 ARAF RAF1 KRAS 但是所有都对药物治疗没有反应 Slide13 PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 治疗前最常见的突变基因 NGSofLongitudinalcfDNA n 23 detectednewmutationsduringdiseaseprogression PresentedByDavidHayesat2016ASCOAnnualMeeting 在疾病进展期间 纵向血浆游离DNA n 23 的NGS检测到新突变 未发现一致的耐药改变 可能是由于入选的肿瘤类型较多 在AKT中未发现第二种突变 在治疗中 9个 39 患者出现了13种突变 结果 NGSofLongitudinalcfDNA n 23 revealedclonalevolution PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 纵向血浆游离DNA n 23 的NGS发现克隆演变平行追踪多种突变提示在疾病进展期间存在不同的克隆模式 15 65 患者中为一致 3 13 患者中为不一致 结果 Pre treatmentcfDNAcapturedtumorheterogeneity PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 治疗前的cfDNA发现肿瘤异质性 Conclusions PresentedByLillianSmythat2016ASCOAnnualMeeting 结论在这项探索性研究中 对通过基因panel捕获的cfDNA进行二代测序是可行的 并且与