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生化考点归纳个别氨基酸代谢途径(一)1 糖胺聚糖:透明质酸硫酸软骨素硫酸角质素硫酸乙酰肝素(硫酸类肝素)还原糖:单糖+二糖(乳糖、麦芽糖、龙胆二糖)直链淀粉-1,4糖苷键支链淀粉-1,4糖苷键,-1,6糖苷键纤维素-1,4糖苷键细菌杂多糖:G+-肽聚糖、磷壁酸 G-肽聚糖、脂多糖糖蛋白糖肽键: O-糖肽键-单糖的半缩醛羟基与丝氨酸/苏氨酸残基的羟基缩合而成 N-糖肽键-单糖的半缩醛羟基与天冬酰胺/赖氨酸残基的羟基缩合而成(二)0胆固醇的衍生物:胆汁酸、孕酮、性激素、糖/肾/盐皮质激素、VD必需要脂肪酸亚油酸、亚麻酸、花生四烯酸脂双层的流动性取决于磷脂的链的不饱和程度+链长生物膜的厚度6nm生物膜分子间的作用力疏水作用、范德华力、静电力人工模拟生物膜系统脂质体+平面脂双层膜1 物质运输模式 被动运输: 顺浓度梯度运输,物质运输的速率既依赖于膜两侧物质的浓度差, 又与被运输物质的分子大小和电荷有关 扩散: 顺浓度梯度运输,只是进行小分子的扩散主动运输: 逆浓度梯度运输,伴随有光的吸收、氧化作用、ATP的水解2 脂蛋白种类及作用 种类:1 CM(乳糜微粒)-从小肠转运三酰甘油、胆固醇和其它脂质到血浆和其它组织 2 VLDL(极低密度脂蛋白)-从肝脏转运三酰甘油、胆固醇至整个组织3 LDL-转运内源胆固醇至外围组织,调节这些部位胆固醇的从头合成 4 IDL-一部分被肝吸收,一部分转变为LDL5 HDL-将胆固醇酯化后,迅速转运至VLDL和LDL3 生物膜的组成:蛋白质 脂质磷脂(甘油磷脂、鞘磷脂)糖脂(甘油糖脂、鞘糖脂)胆固醇 糖类糖蛋白、糖脂磷脂-甘油磷脂(卵磷脂、脑磷脂、心磷脂) 鞘磷脂糖脂-甘油糖脂 鞘糖脂(脑苷脂、神经节苷脂)4 流动镶嵌模型 模型:1 突出了膜的流动性,renewing膜是由脂质和蛋白质分子按二位排列的流体 2 显示了膜蛋白分布不对称性,蛋白质镶嵌、贯穿在其中5 皂化值:(1g油脂-KOH mg)皂化1g油脂所需要的KOH的mg数 碘值:(100g油脂-I2 g)100g油脂所能吸收的碘的克数 乙酰值:(中和1g乙酰化产物中的乙酸- KOH mg)中和从1g乙酰化产物中释放的乙酸所需的KOH的mg数酸值:(中和1g油脂中的游离脂肪酸- KOH mg)中和1g油脂中的游离脂肪酸所需的KOH的mg数(三)0 血红蛋白分子病:血红蛋白病 地中海贫血血红蛋白对氧的亲和能力(波尔效应-Bohr效应) 上升CO2、H+促进O2的释放, 下降BPG降低Hb对O2的亲和力血红蛋白结构Hb:4个亚基组成 成人的是22 S型曲线肌红蛋白结构Mb:一条多肽链+辅基血红素 直角双曲线氨基酸简写符号:(Asn/Asp)ND、(Gln/Glu)QE、(Lys/Phe)KF、(Trp/Tyr)WY非极性氨基酸:Ala/Ile/Leu/Met/Phe/Pro/Trp/Val不带电荷极性氨基酸:带正电荷(碱性)氨基酸:Arg/His(部分带正电荷)/Lys带负电荷(酸性)氨基酸:Asp/Glu含S氨基酸:Cys/Met人体必需氨基酸:假设来借一两本书(甲硫/蛋、色、赖、VAL、异亮、亮、苯丙、苏)生酮氨基酸:亮氨酸、赖氨酸生酮生糖氨基酸:异亮氨酸、苯丙氨酸、苏氨酸、色氨酸、酪氨酸蛋白质处在等电点时的溶解度:最低 离子强度时的溶解度:低高低胶原蛋白-三股螺旋结构的稳定Gly 稳定的力有疏水作用、氢键、范德华力原核细胞合成的起始氨基酸甲酰甲硫氨基酸真核细胞合成的起始氨基酸甲硫氨基酸免疫球蛋白G的作用:用木瓜蛋白酶处理时,释放Fab片段 用胃蛋白酶处理时,释放F(ab)2片段免疫球蛋白含有两条高分子量的重链 两条低分子量的轻链 通过S-S键相连稳定-螺旋和-折叠的因素是氢键+二面角辅酶Q的结构含异戊二烯单位的醌类带III蛋白是一种阴离子(Cl-、HCO3-)载体遍在蛋白的作用蛋白质迅速降解牛胰岛素:A链21 A链1个S-S B链30 A、B链2个S-S甲状腺素是含碘的氨基酸NO的生成主要来自精氨酸一碳单位提高者甘氨酸蛋白质水解成的氨基酸,或合成的氨基酸都是无旋光性的DL-消旋物氨基酸进入肽链前必须活化,部位是可溶的细胞质氨基酸的定性和定量鉴定茚三酮肽和蛋白质的鉴定双缩脲反应测定氨基酸的常用方法甲醛滴定(酚酞指示剂变色区域)得到已知氨基酸序列合成蛋白质方法基因工程克隆表达、化学合成酪氨酸可以合成甲状腺素、黑色素儿茶酚胺(多巴胺、去甲肾上腺素、肾上腺素)通过酪氨酸激酶起作用的激素胰岛素、表皮生长因子通过磷酸肌醇级联起作用的激素含氮激素1 蛋白质一级结构的测定 测定:1 测定蛋白质多肽链的数目2 拆分蛋白质多肽链3 断开多肽链S-S 巯基乙醇、过甲酸(尿素、盐酸胍、SDS使蛋白质变性,碘乙酸保护Cys上的-SH)4 分析每条多肽链aa组成氨基酸分析仪5 鉴定多肽链N-末端、C-末端 N-末端分析: 二硝基氟苯(DNFB、Sanger试剂)丹磺酰氯(DNS)异硫氰酸苯酯(PITC、 Edman降解法) C-末端分析:肼解法、羧肽酶法6 裂解多肽链成较小的片段 胰蛋白酶:断裂Arg、Lys为C-末端残基的肽段糜蛋白酶:断裂Phe、Trp、Tyr为C-末端残基的肽段 (胰凝乳蛋白酶)断裂芳香族氨基酸为C-末端残基的肽段 CNBr断裂:含Met残基的羧基参加形成的肽键,由于大多数蛋白质只含很少的Met,所以产生的肽段比较少 羟胺断裂:专一性断裂Asn-Gly之间的肽键7 测定小片段aa序列:Edman降解法、质谱法、根据核苷酸序列推定8 重建完整多肽链一级结构重叠肽拼凑法9 确定Cys残基间形成的S-S交联桥位置对角线电泳2 测定蛋白质分子量的方法?化学组成法计算(凯氏定氮法)(1)硝化-含氮有机物+浓硫酸硫酸铵 (2)用消耗的硫酸可求出样品中的含氮量 (3)再根据蛋白质中含氮量16%可求出蛋白质的含量渗透压法半透膜形成浓度差扩散系数法溶质迁移沉降分析法又叫超速离心法,蛋白质在超速离心时,因为比重不同,沉降的速度也不同,颗粒大的先沉淀,根据有关公式可求出它的分子量。 凝胶过滤法又叫分子排阻层析法,在层析柱中装入葡聚糖凝胶,具有大量微孔,允许小分子进入,从而,在洗脱液洗脱时,分子量大的先洗脱下来,分子量小的后洗脱下来,根据待测样品的洗脱体积可求出其分子量。 步骤1 称取一定量的凝胶,用水充分溶解,装柱 2 用缓冲液平衡 3 用标准分子量样品加样洗脱,作出标准曲线 4 用待测样品加样洗脱,对照标准曲线,求出蛋白质分子量 SDS-PAGE法蛋白质在其中电泳的速度取决于分子量的大小,分力量小的跑的快,根据有关公式可以求出其分子量。蛋白质形状X射线晶体衍射3 蛋白质分离纯化方法?前处理把蛋白质从原有组织中溶解出来,动物组织采用捣碎、匀浆、超声波处理,植物组织采用石英砂研磨法粗分级分离采用等电点沉淀、盐析、有机溶剂分离法细分级分离采用凝胶过滤、离子交换层析,电泳法Ms沉降法、凝胶过滤法S等电点沉淀、盐析、有机溶剂法Q离子交换层析法-带电荷蛋白质可与带相反电荷的离子交换树脂结合,然后用盐溶液洗脱,带电荷少的蛋白质先被洗脱下来,分步收集洗脱液,达到分离蛋白质的目的 吸附硅胶、氧化铝、活性碳亲和力凝集素、金属螯合物4 如何检测蛋白质被纯化的纯度? 电泳法不同蛋白质有不同的电泳迁移速度,如果在不同PH缓冲液和不同支持物中电泳均显示为一条区带,则可以认为该蛋白质是纯的。 超速离心法当为均一的分子时,蛋白质的沉降速度一致,在溶剂中形成一条明显的分界线,若为两种分子量不同的蛋白质时,则形成两个分界线。 化学分析法测定纯化后的蛋白质试样中的某种成分的含量,如血红蛋白中铁和氮的比,若已高度纯化,其比值应当与血红蛋白的分子计算值相符合。 HPLC5 蛋白质的沉淀与变性特征 沉淀:1 盐析法 2 有机溶剂法 3 重金属盐沉淀法 4 加热变性沉淀-不可逆 变性因素:1 物理因素-高温、高压、紫外线 2 化学因素-强酸、强碱、有机溶剂、重金属盐、还原性试剂 3 外界因素-机械力变性性质:1 化学基团的暴露 2 物化性质改变-溶解度降低 3 生化性质改变-易被蛋白酶水解6 获得一个高水平表达某寡聚蛋白的大肠杆菌细胞株,设计一套可能的纯化和测定寡聚蛋白分子大小的方法。 分离纯化步骤:(1)超声波破碎细胞(前处理) (2)离心去细胞壁等杂质 (3)盐析后留沉淀(粗分级分离) (4)沉淀透析脱盐 (5)离子交换层析纯化(细分级分离) 分子量测定: 凝胶过滤色谱法7 肽键结构的特点 特点:1 具有部分双键性质 2 一般为反式构型 3 N与邻近的C形成共振杂化体,稳定性高 4 肽键亚氨基在PH 1-14内不解离8 举例说明蛋白质一级结构与功能的关系 解:任何蛋白质一级结构发生细微的改变都将可能影响其生理功能。先天性遗传疾病镰刀型细胞贫血。患者红细胞的血红蛋白中,-链的第六位氨基酸(谷氨酸)被Val代替所致,使红细胞呈镰刀状,改变了血红细胞与氧的亲和力,使红细胞输氧功能下降,且容易破裂而引起严重的贫血。9 蛋白质二级结构和超二级结构要点 解:-螺旋:1绝大多数是右手螺旋,螺距为0.54nm,直径为0.05nm,每螺旋一圈含3.6个氨基酸,每个氨基酸残基沿中心轴旋转100 2稳定性是靠链内氢键和二面角维持的-折叠:1折叠成锯齿结构,肽链有顺式和反式平行两种 2稳定性是靠链间氢键维持的-转角:1 常发生于肽链180回折时转角上 2 通常由四个氨基酸残基组成,第一个残基的羰基氧和第四个残基的亚氨基形成氢键无规则卷曲:有序的非重复结构,经常构成酶活性部位和其它蛋白质特异功能部位超二级结构:,三种类型10 促成肽平面形成的原因 原因:1 组成肽基的4个原子和2个相邻的C原子倾向于共平面,形成肽平面 2 C-N键具有部分双键的性质,防止旋转,保持酰胺基处于平面(四)0 Lineweaver-Burk双倒数作图法:1/V 1/S (1/V=Km/Vmax*1/S+1/Vmax) Eadie-Hofstee作图法:V V/S (V=Vmax-Km*V/S) 直接线性作图法:VV/SHanes-Woolf作图法:S/VS (S/V=S/Vmax+Km/Vmax) Dixon作图法求Ki:1/VI 零级反应V、C无关系 一级反应V=KC;t1/2=0.693/k 二级反应V=KC2;t1/2=1/ka 酶的抑制剂: 非专一性不可逆抑制剂-P、Hg、As化合物、重金属盐氰化物、硫化物、CO、青霉素 专一性不可逆抑制剂Ks型不可逆抑制剂-具有底物类似结构 带有活泼的化学基团 带有潜在基团,与酶的活性中心结合,使其失去活性 Kcat型不可逆抑制剂-具有底物类似结构 本身是酶的底物 带有潜在基团,与酶的活性中心结合,使其失去活性 酶按作用特点:肽链内切酶-水解肽链内部的肽键 胃蛋白酶、胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶 肽链外切酶-分别从氨基端和羧基端水解肽链包括氨肽酶和羧肽酶 按酶蛋白的活性部位特征: 1天冬氨酸蛋白酶-活性部位含有Asp残基 胃蛋白酶 2 半胱氨酸蛋白酶-活性部位含有Cys残基 大多数植物蛋白酶和组织蛋白酶 3丝氨酸蛋白酶-活性部位含有Ser残基 胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶Km值越小,表示酶和底物的亲和力越强 判断酶的优劣比活力提高倍数 总活力的回收率胰岛素和表皮生长因子的受体是一种酶酪氨酸激酶胰凝乳蛋白酶的活性中心三个氨基酸残基天冬氨酸、组氨酸、丝氨酸蛋白激酶家族:蛋白激酶A、蛋白激酶C、磷酸化酶激酶、蛋白酪氨酸激酶酶与配基结合试验的SCatchard作图表现一种罩形曲线,表明酶与配基结合具有最适温度和最适PH值1 酶活性部位的特点 特点:1 小-酶的活性部位在酶分子中只占相当小的部分 2 三维实体-没的活性部位是一个三维实体 3 不互补-酶的活性部位并不是和底物的形状正好互补(诱导契合学说) 4 裂缝-酶的活性部位位于酶分子表面的一个裂缝内 5 次级键结合-底物通过次级键与酶结合(氢键、离子键、疏水作用、范德华力) 6 可运动-酶活性部位可运动性2 酶催化作用特点及调节机制 特点:三高一调(高效率、高专一性、易失活、可调节性) 调节机制:1 别构调节-调节物与别构蛋白的别构中心结合后,使蛋白的构象发生变化,从而改变蛋白质的活性 2 共价修饰-主要有磷酸化、糖基化、腺苷酸化,而改变酶的活性 3 酶原激活-某些酶先以无活性的酶原合成或分泌,再和其它物质作用,发生构象变化,形成有活性的酶分子3 酶分类编号 分类:1 氧化还原酶 2 转移酶 3 水解酶 4 裂解酶 5 异构酶 6 合成酶4 双底物酶促反应机理 机理:1 有序顺序反应机理-底物A、B与酶结合的顺序是一定的,产物P、Q释放顺序也是一定的 2 随机顺序反应机理-底物A、B与酶结合的顺序是随机的,产物P、Q释放顺序也是随机的 3 乒乓反应机理-先结合一个底物A,释放一个产物P,酶的构象发生变化,结合二个底物B,释放第二个产物Q5 酶的作用机理 专一性机理:1 结构专一性-绝对专一性 相对专一性(键、基团、族) 2 立体异构专一性-旋光异构专一性 几何异构专一性 (诱导契合假说)-酶分子的构象与作用物的构象并非吻合,而是当两者接触时,可诱导酶的构象变得与作用物吻合,然后结合成中间复合物,发生相应的化学变化 高效性机理:1 邻近效应、定向效应 2 底物形变、诱导契合 3 酸碱催化、共价催化、金属离子催化、多元催化 4 活性中心微环境6 酶活力测定方法 分光光度法利用底物和产物在紫外或可见光吸收的不同来测定 荧光法根据底物或产物的荧光性质差异来测定 同位素测定法用放射性同位素的底物,经酶作用后的产物,通过适当分离,测定产物的脉冲数,即可换算出酶的活力7 抑制作用的类型,抑制作用的动力学(米氏学说原理推导) 类型:1 不可逆的抑制作用-抑制剂与酶以共价键结合,不能用透析、超滤等方法除去抑制剂而使酶复活 2 可逆的抑制作用-抑制剂与酶以非共价键结合,可以用透析、超滤等方法除去抑制剂而使酶复活 竞争性抑制- I+EEI 竞争性抑制剂具有与底物相类似的结构,它与底物竞争酶的活性部位,形成EI,从而影响了底物和酶的正常结合,使反应速度下降 (抑制动力学)-抑制米氏方程(1),Vmax不变,Km变大 非竞争性抑制- S+ES+IESI I+EEI+SESI 非竞争性抑制剂可以和酶活性中心以外的部位结合,且不妨碍酶与底物的结合,底物与抑制剂之间没有竞争关系,形成ESI,但不能转化为产物,使反应速度下降 (抑制动力学)-抑制米氏方程(2),Vmax变小,Km不变 反竞争性抑制- I+ESESI 酶只有和底物结合后才能与抑制剂结合,形成ESI,但不能转化为产物,使反应速度下降 (抑制动力学)-抑制米氏方程(3),Vmax变小,Km变小 实际意义: 1 可阐明一些药物的作用机理,在临床上正确地使用药物 2 如在临床上使用磺胺类药物时,首次要加倍,同时一日服药4次,才能维持体内适当药物浓度,从而发挥有效的抑菌作用8 双倒数作图法的原理和反映的信息 原理:1 双倒数作图法是常用来测定酶促反应Km和Vmax值的方法2 将米氏方程(0)变为倒数的形式1/(0) 3 选择不同的S,对应相应的V,可求得1/S、1/V,绘制出直线,得到横轴截距为-1/Km,纵轴截距为1/Vmax 反映的信息:可以求得酶促反应动力学参数Km和Vmax9 酶定量测定要注意的地方(酶促反应的影响因素) 注意: 1 PH-酶因底物种类、浓度、缓冲液的成分不同而不同,不同酶最适PH不同,在最适PH时,活力最强 过酸、过碱影响酶蛋白的构象,从而影响酶的活性 影响分子中另一些基团的解离,它们的离子化状体影响酶蛋白的构象 2 温度-高温、低温可引起酶变性 3 底物浓度-要求底物浓度远远大于酶浓度,使酶达到饱和从而达到最大速度 4 酶浓度-要求底物浓度远远大于酶浓度 5 反应时间-测定酶活力要求时间越短越好 6 激活剂和抑制剂10 酶联免疫吸附测定(ELISA)的基本步骤 ELISA以待测抗原和酶标抗体的特异性结合反应为基础,通过酶活力测定来确定抗原的含量基本步骤:1 待测蛋白吸附到惰性表面 2 用非特异性蛋白封闭表面其余位点 3 第一抗体处理,与酶偶联的第二抗体处理 4 加入酶的底物 5 检测有色产物的形成11 焦磷酸酶催化焦磷酸水解生成正磷酸,大肠杆菌的焦磷酸分子质量为120kD,由六个相同亚基组成,该酶的一个活性单位定义为在标准条件下15min内水解10mol底物的酶量,每毫克酶的最大反应速度为2800单位 (1)当底物浓度远远大于Km时,每毫克酶每秒钟可以水解多少摩尔底物? (2)在4mg酶中存在多少摩尔活性部位?(假设每个亚基一个活性部位) (3)酶的转换数是多少? 解:(1)X=2800*10*10-6/15*60=31.1*10-5mol (2) n=m/M=6*4*0.001/121*103=20*10-8mol (3) TN=Kcat=底物分子数/活性中心数=31.1*10-6/5*10-8=62212 从一种植物叶中得到了粗细胞提取液,每ml含蛋白质32mg,在提取条件下,10l提取液的催化反应速率为0.14mol/min,取50ml提取液,用硫酸铵盐分析,将饱和度0.3-0.6的沉淀物,再溶于10ml水中,此溶液的蛋白质浓度为50mg/ml,从中取出10l,测定其反应速度为0.65mol/min。 计算:(1)提取过程中,酶的回收百分率;(2)酶的提纯倍数 解:酶的回收百分率=总活力2/总活力1 酶的提纯倍数=比活力2/比活力1 比活力=酶活力/mg蛋白质=总活力/总蛋白 总活力=比活力*总蛋白 比活力1=0.14/32*10*10-3=14/32 总蛋白1=50*32=1600 总活力1=比活力1*总蛋白1=14/32*1600 比活力2=0.65/50*10*10-3=65/50 总蛋白2=50*10-500 总活力2=比活力2*总蛋白2=65/50*500 (1) 酶的回收百分率=总活力2/总活力1=93% (2) 酶的提纯倍数=比活力2/比活力1=313 称取25mg蛋白酶粉制成25ml酶溶液,从中取出0.1ml酶液,以酪蛋白为底物,用Folin-酶比色法测定酶活力,得知每小时产生1500ug酪氨酸,另取2ml酶液,用凯氏定氮法测得蛋白氮为0.2mg(蛋白质中的氮的含量比较固定,为16%)。若以每分钟产生1ug酪氨酸的酶量为1活力单位计算。据上述数据求:(1)1ml酶液中所含蛋白质量;(2)比活力;(3)1g酶制剂的总蛋白含量及总活力 解:(1)(0.2/2)/16%=X/100% X=0.625mg (2) 0.1ml酶液的酶活力=1500/60=25U 1ml酶液的酶活力=25*10=250U 比活力=250/0.625=400U/mg (3) 1g酶制剂为1000ml的酶液 总蛋白=0.625*1000=625mg 总活力=比活力*总蛋白=400*625=2.5*105U(六)0激素分类含N激素 甾醇类激素(固醇类激素)-肾上腺皮质激素、性激素 维生素D和胆固醇都有的结构环戊烷多氢菲 转氨酶的辅酶B6(磷酸吡哆醛、磷酸吡哆醇、磷酸吡哆胺) 羧化酶的辅酶生物素(传递CO2) 转酰基的辅酶泛酸(CoA-SH) 变位酶(丙二酰CoA)的辅酶B12(钴胺素)丙酮酸脱氢酶,-酮戊二酸脱氢酶,转酮酶的辅酶B1(硫胺素) H原子、电子传递NAD+/NADP+/ CoQ1 激素的作用机理机理:1 腺苷酸环化酶(cAMP酶)途径激素受体复合物经过G蛋白活化cAMP酶,使ATPcAMP,经过级联放大,产生相应的生理变化 2 Ca2+级肌醇三磷酸(IP3)作用途径激素受体复合物经过G蛋白活化磷酸肌醇酶,使PIP2IP3 打开Ca2+通道,Ca2+内流形成Ca2+/CaM复合物 PIP2DAG 激活蛋白激酶,产生相应的生理效应 3 酪氨酸激酶途径-激素受体复合物激活酪氨酸激酶活性,使酪氨酸残基磷酸化,产生相应的生理效应 4 固醇类激素调节途径-激素穿过质膜与受体结合成激素受体复合物,进入细胞核,加大转录速度,产生特殊的蛋白质2 脂溶性维生素和水溶性维生素 脂溶性维生素:1 A-成分-视黄醛 作用-构成视觉细胞内的感光物质,增强机体抵抗力 缺乏病-夜盲症,干眼病,免疫功能下降 2 D-成分-麦角钙化醇(D2)、胆钙化醇(D3) 作用-促进钙磷的吸收 缺乏病-佝偻病、软骨病 3 E-名称-生育酚 作用-与生殖功能有关,有抗氧化作用,促进血红素合成 4 K-成分-萘醌 作用-促进肝脏合成凝血酶和凝血因子 水溶性维生素:1 B1-硫胺素 抗脚气病维生素,多发性神经炎丙酮酸脱氢酶,-酮戊二酸脱氢酶,转酮酶的辅酶 2 B2-核黄素 FMN FAD 3 B6-磷酸吡哆醛、磷酸吡哆胺 转氨酶的辅酶 4 B12-钴胺素,防止恶性贫血,传递一碳单位 变位酶(丙二酰CoA)的辅酶 5 C-抗坏血酸,抗氧化作用 6 泛酸-CoA-SH,转乙酰基 7 叶酸-THF,传递一碳单位 8 生物素-传递CO2 羧化酶的辅酶 9 烟酰胺-NAD+/NADP+ 抗癞皮病维生素3 抗生素抗菌机制(和蛋白质合成联系起来) 机制:1 抑制核酸的合成-放线菌素、丝裂霉素、利福霉素阻碍DNA的复制RNA的合成 2 抑制蛋白质的合成-氯霉素、红霉素、环己亚胺 3 改变细胞膜的通透性-多肽类抗生素 4 干扰细胞壁的生成-青霉素 5 作为抗代谢物-抗霉素A、寡霉素(七)1 高能化合物类型 类型:1 磷氧键型-OP- 如ATP 2 氮磷键型-NP- 如磷酸肌酸 3 硫酯键型-OS- 酰基COA 4 甲硫键型-SC- S-腺苷甲硫氨酸2 化学渗透学说 要点:1 电子经呼吸链传递释放的能量,将质子泵到内膜外侧,形成电化学势梯度、浓度梯度 2 质子电化学势梯度、浓度梯度经ATP合酶F0通道回流,F1催化ADP+PiATP3 呼吸链(电子传递链) 过程:NADH-Q还原酶CoQ细胞色素还原酶细胞色素C细胞色素氧化酶 琥珀酸-Q还原酶 O2+4H+2H2O 抑制剂: 鱼藤酮、安密妥抗酶素ACN_、CO 磷酸化部位:1 NADH-Q还原酶CoQ 2 CoQ细胞色素还原酶 3 细胞色素C细胞色素氧化酶O24 氧化磷酸化 解偶联剂2,4-二硝基苯酚 抑制剂寡霉素(八)0 反应式:1 EMPG+2NAD+2ADP+2Pi2丙酮酸+2NADH+2ATP+2H2O+2H+ 2 丙酮酸氧化丙酮酸+CoA-SH+NAD+乙酰CoA+CO2+NADH+H+3 TCA乙酰CoA+3NAD+FAD+GDP+PiCoA-SH+CO2+3NADH+FADH2+GTP+2H+4 PPPG-6-P+2NADP+H2ORu5P+2NADPH+CO2+2H+ NADH在肌肉氧化释放2ATP 心脏、肝脏3ATP EMP胞液 TCA线粒体 PPP胞液 糖异生肝脏线粒体 脂肪酸-氧化胞液线粒体 脂肪酸合成胞液 胆固醇代谢肝脏(胞液、内质网)酮体生成肝脏线粒体 尿素循环线粒体胞液 rRNA、mRNA、tRNA细胞核 蛋白质核糖体1 糖酵解过程,及其关键酶 关键酶:磷酸果糖激酶 柠檬酸、ATP AMP、ADP、F-2,6-2P 丙酮酸激酶 丙氨酸、ATP 己糖激酶 G-6-P、ATP 所有的酶:过程:GluG6PF6PF-1,6-2P3-磷酸甘油醛1,3-二磷酸甘油酸3-磷 磷酸二羟丙酮 酸甘油酸2-磷酸甘油酸PEP丙酮酸 意义:生物体共同经历的途径,氧气供应不足时提供能量和碳骨架2 三羧酸循环过程,及其关键酶,生成能量的计算,生物学意义 关键酶:柠檬酸合酶 异柠檬酸脱氢酶NADH、ATP(乙酰CoA、草酰乙酸、琥珀酸) -酮戊二酸脱氢酶 TCA一次底物水平磷酸化 二次脱羧CO2 三次关键酶 四次脱氢 能量计算:P113 所有的酶:过程:丙酮酸乙酰CoA 草酰乙酸柠檬酸异柠檬酸-酮戊二酸琥珀酰CoA琥珀酸延胡索酸苹果酸 意义:1 为机体提供大量的能量,1分子葡萄糖经过糖酵解,三羧酸循环后能产生32ATP,能量利用率达到40% 2 三羧酸循环是糖代谢、蛋白质代谢、脂肪代谢、核酸代谢及次生物质代谢联络的枢纽,它的中间产物可参与其它代谢途径A 糖代谢产生的碳骨架最终进入TCA氧化B 脂肪分解产生的甘油可通过糖有氧氧化进入TCA,脂肪酸经-氧化产生乙酰CoA可进入TCA C 蛋白质分解产生的氨基酸经脱氨基后可进入TCA,同时,TCA的中间产物可作为氨基酸的碳骨架接受NH3合成非必需氨基酸其它代谢产物是最终可以通过TCA化为CO2、H2O,并放出能量3 戊糖磷酸途径过程及生物学意义 关键酶:G-6-P脱氢酶 部位:胞液过程:氧化阶段GG-6-PRu5P非氧化阶段Ru5PG-6-PGG-6-PRu5PG-6-P 意义:1 体内许多合成代谢的供氢体NADPH 2 是代谢中间产物,为代谢提供原料4 糖异生过程 过程:1 G-6-PG G-6-P酶 2 F-1,6-2PF6P F-1,6-2P酶 3 丙酮酸PEP 丙酮酸羧化酶、PEP羧激酶5 乙醛酸途径(存在于植物、微生物) 关键酶:异柠檬酸裂合酶、苹果酸合酶途径:P1596 糖原合成及降解 合成:关键酶-糖原合酶 GG-6-PG-1-PUDPG糖原 降解:关键酶-糖原磷酸化酶(A有活性被磷酸化) 糖原G-1-PG-6-PG7 在柠檬酸循环各个反应中并没有出现氧,但柠檬酸循环却是有氧代谢的一部分,请解释 原因:1 柠檬酸循环包括几部脱氢反应,而NAD+、FAD则是它们的电子受体 2 循环需要经过电子传递链完成,而水是传递链的最终电子受体,只有在有氧的条件下,才能将电子传递到O2和H+,完成电子传递链的传递,所以8 葡萄糖酵解过程第一步GG-6-P,催化酶有己糖激酶和葡萄糖激酶,说明两种酶的调控特点 己糖激酶是一个别构酶,可被其产物G-6-P、ATP别构抑制 葡萄糖激酶是一个诱导酶,由胰岛素促成,只有当葡萄糖浓度相当高时,它才起作用9 乙酰CoA在含碳化合物中代谢的作用 作用:1 乙酰CoA是丙酮酸氧化脱羧产生的,作为代谢中的一个重要产物,在含碳化合物代谢中起重要桥梁作用 2 进入TCA氧化分解为CO2和H2O,产生大量能量 3 以乙酰CoA为原料合成脂肪酸,进一步合成脂肪 4 以乙酰CoA为原料合成酮体,作为肝输出能源的方式 5 以乙酰CoA为原料合成胆固醇,可转化为胆汁酸,类固醇酯10 丙酮酸是重要的中间产物,以丙酮酸为底物的不同酶促反应 1 丙酮酸+CoA-SH+NAD+乙酰CoA+NADH+CO2+H+ 2 丙酮酸+CO2+ATP草酰乙酸+ADP+Pi 3 丙酮酸+NADH+乳酸+NAD+ 4 丙酮酸乙醛5 丙酮酸+谷氨酸丙氨酸+酮戊二酸11 磷酸果糖激酶催化收到哪些物质的调控,这些物质调控的生理意义 调控:柠檬酸、ATP AMP、ADP、F-2,6-2P 意义:1 柠檬酸、ATP大量存在时,糖酵解过程受抑制,F-2,6-2P可以激活该过程,F-2,6-2P受到葡萄糖、磷酸果糖激酶2和磷酸果糖磷酸酶2的调节2葡萄糖过甚时,磷酸果糖磷酸酶2受到抑制,磷酸果糖激酶2激活, 糖酵解加速,F-2,6-2P增多3葡萄糖缺乏时,磷酸果糖磷酸酶2激活,磷酸果糖激酶2受到抑制, 糖酵解减缓,F-2,6-2P减少12比较底物水平磷酸化、光合磷酸化、与氧化磷酸化的异同 底物水平磷酸化-指产物在氧化还原反应中,分子内部能量重新分布,使无机磷酸酯化,形成高能磷酯键,在酶的作用下,将能量传递到ADP,再结合PPi形成ATP 光合磷酸化-与光合作用相偶联,发生在叶绿体,光解水,在光合链上进行电子传递,光照引起的电子传递在叶绿体内囊体膜两侧产生了H+浓度差,H+顺浓度梯度推动了ATP的生成 氧化磷酸化-与生物氧化相偶联,发生在线粒体,生成水,在呼吸链上进行电子传递,生物氧化中的电子传递在叶绿体内囊体膜两侧产生了H+浓度差,H+顺浓度梯度推动了ATP的生成(九)1 脂肪酸-氧化途径 关键酶:肉碱脂酰转移酶 抑制剂-丙二酰CoA部位:胞液线粒体途径:脂肪酸脂酰CoA烯酰CoA羟脂酰CoA酮脂酰CoA脂酰CoA 活化氧化水合氧化断裂2 脂肪酸的合成 关键酶:乙酰CoA羧化酶 抑制剂-软脂酰CoA 激活剂-柠檬酸、异柠檬酸 部位:胞液 ACP酰基载体蛋白 过程: 乙酰CoA乙酰ACP 乙酰CoA羧化酶 乙酰乙酰ACP羟丁酰ACP丁烯酰ACP 丙二酰CoA丙二酰ACP 丁酰ACP软脂酰ACP软脂酰3 胆固醇合成途径 关键酶:HMG-CoA还原酶部位:肝脏(胞液、内质网)转化:胆汁酸、孕酮、性激素、糖/肾/盐皮质激素、VD过程:乙酰CoA甲羟戊酸异戊酰焦磷酸鲨烯C304 酮体的生成(乙酰CoA的代谢结局)关键酶:HMG-CoA合酶部位:肝脏过程:乙酰CoA乙酰乙酰CoAHMG-CoA乙酰乙酸-羟丁酸 丙酮5 脂类降解与合成的比较 降解 合成 原料 脂肪酸、NAD+、FAD 乙酰CoA、NADPH场所 胞液线粒体 胞液 载体 CoA ACP(酰基载体蛋白) 反应历程 活化氧化水合 启动装载缩合还原氧化断裂 脱水还原释放 转移机制 肉碱载体 TCA转运 C的增减 以乙酰CoA形式减少2C 以乙酰CoA形式增加2C(十)1 氨基酸代谢过程氨的来源:氨基酸脱氨基生成的氨基酸氨基转运:NH4+谷氨酰胺谷氨酸丙氨酸(肌肉肝脏) 氨的排泄:直接释放NH3 在肝脏合成尿素排泄氨基酸分解的步骤:1 经过脱氨基作用转化为谷氨酸、天冬氨酸、NH3 2 NH3与天冬氨酸的氮原子结合,经过尿素循环生成尿素 3 氨基酸的碳骨架经氧化转化为中间产物进入TCA 氨基酸脱氨基:氨基酸+-酮戊二酸-酮酸+谷氨酸 谷氨酸+草酰乙酸-酮戊二酸+天冬氨酸 谷氨酸+NAD(P)+ +H2ONH3+-酮戊二酸+NAD(P)H+H+氨基酸碳骨架的氧化途径: 1 乙酰CoA途径-丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸丙酮酸乙酰CoA(丙氨酸、半胱氨酸、甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸)甘氨酸丝氨酸丙酮酸乙酰CoA 苏氨酸乙醛乙酸乙酰CoA乙酰乙酰CoA乙酰CoA(亮氨酸、Lys、苯丙氨酸、酪氨酸、色氨酸)乙酰CoA2 -酮戊二酸途径-精氨酸、组氨酸、谷氨酰胺、谷氨酸、脯氨酸 3 琥珀酰CoA途径-异亮氨酸、甲硫氨酸、Val 4 延胡索酸途径-苯丙氨酸、酪氨酸 5 草酰乙酸途径-Gln、Glu2 尿素循环 关键酶:氨甲酰磷酸合酶 抑制剂:N-乙酰谷氨酸 部位:线粒体胞液过程:氨基酸谷氨酸NH3氨甲酰磷酸瓜氨酸精氨琥珀酸精氨酸 氨基酸谷氨酸天冬氨酸 鸟氨酸瓜氨酸(五)0 IGC识别的密码子:IA/C/U GC/U UA/G 帽子结构:O型m7GPPP I型m7G5PPPNmPNP- II型m7G5PPPNmPNmP-核糖体-原核生物亚基70S-30S/50S 真核生物亚基80S-40S/60Sr RNA-80%m RNA-5%t RNA-15%(含修饰核苷酸最多的RNA是t RNA)t RNA中含有T(存在于TC环中)嘌呤毒素抑制蛋白质的合成的终止(氨酰t RNA的类似物) A-DNA75%湿度-2.5nm B-DNA92%湿度-螺距3.4nm Z-DNA 螺距4.6nm 左手螺旋蛋白质:-螺旋-螺距0.54nm(3.6aa) 3.613-螺旋 直径 0.5nm DNA:双螺旋-螺距3.4nm(10个核苷酸),直径 2nm 外侧的磷酸与核糖通过3,5-磷酸二酯键连接 ATP是能量和磷酸基团转移的重要物质GTP供给肽链合成所需的能量CTP参与卵磷脂的合成UTP参与单糖转变为多糖的合成核酸的嘌呤和碱基的最大吸光度260nm 蛋白质最大吸收波长:280nm(苯丙氨酸、色氨酸、酪氨酸)逆转录酶的功能:1 RNA指导的DNA聚合酶2 利用RNA为模板,合成RNA-DNA分子 3 再形成双链DNA 4 有Rnase H活力,专一水解RNA-DNA分子中的RNA核糖核苷二磷酸脱氧核苷二磷酸需要核糖核苷还原酶 硫氧还蛋白+谷氧还蛋白信号跨膜传递的第二信使cAMP 、cGMP、IP3、DAG染色质中DNA是

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