限制性内切核酸酶习题及答案.pdf

第三章 限制性内切核酸酶 一 填空题 1 严格地说限制性内切核酸酶 restriction endonuclease 是指已被证明是 的酶 基因工程中把 那些具有识别 的内切核酸酶统称为限制性内切核酸酶 2 年 Luria 和 Human 在 T 偶数噬菌体对大肠杆菌感染实验中首次发现了细菌的 现象 3 1970 年 Smith 和 Wilcox 从流感嗜血杆菌中分离到一种限制酶 能够特异性的切割 DNA 这个酶后来被命名为 这是第一个分离到的 类限制性内切核酸酶 4 通过比较用不同组合的限制性内切核酸酶处理某一特定基因区域所得到的不同大小的片 段 可 以构建显示该区域各限制性内切核酸酶切点相互位置的 5 类限制性内切核酸酶分子量较小 一般在 20 40kDa 通常由 亚基所组成 它们的作 用底物 为双链 DNA 极少数 类酶也可作用于单链 DNA 或 DNA RNA 杂合双链 这类酶的专一性强 它不仅对酶切点邻近的两个碱基有严格要求 而且对更远的碱基也有要求 因此 类酶既 具有 专一性 也具有 专一性 一般在识别序列内切割 切割的方式有 产 生 末端的 DNA 片段或 的 DNA 片段 作用时需要 作辅助因子 但不需要 和 6 完全的回文序列具有两个基本的特点 就是 和 7 类限制性内切核酸酶一般识别 个碱基 也有识别多序列的限制性内切核酸酶 根 据对限制性内切核酸酶识别序列的分析 限制性内切核酸酶识别序列具有 倾向 即它们在 识别序列中含量较高 8 EcoK 是 I 类限制性内切核酸酶 分子组成是 分子量是 300kDa 在这些亚基中 亚基具有 作用 亚基具有 的活性 亚基的作用则是 9 个体之间 DNA 限制性片段长度的差异叫 10 限制性内切核酸酶是按属名和种名相结合的原则命名的 第一个大写字母取自 第二 三两个字母取自 第四个字母则用 表示 11 限制性内切核酸酶 AcyI 识别的序列是 5 GRCGYG 3 其中 R Y 12 在酶切反应管加完各种反应物后 需要离心 2 秒钟 其目的是 和 13 部分酶切可采取的措施有 1 2 3 等 14 第一个分离的限制性内切核酸酶是 而第一个用于构建重组体的限制性内切核酸 酶是 15 限制性内切核酸酶 BsuRI 和 Hae 的来源不同 但识别的序列都是 它们属 于 16 由于 DNA 是由 4 种碱基组成的 所以任何限制性内切核酸酶的切割频率的理沦值应该 是 17 SalI 和 NotI 都是哺乳动物中识别序列稀有的酶 在哺乳动物基因组的 5kb 片段中 找到 NotI 切点的概率是 18 部分酶切是指控制反应条件 使得酶在 DNA 序列上的识别位点只有部分得到切割 它的理 论依据是 19 类限制酶识别DNA的位点和切割的DNA位点是不同的 切割位点的识别结合有两种模型 一种是 另一种是 20 限制性内切核酸酶通常保存在 浓度的甘油溶液中 二 判断题 1 限制与修饰现象是宿主的一种保护体系 它足通过对外源 DNA 的修饰和对自身 DNA 的限制 实现的 2 限制性内切核酸酶在 DNA 中的识别 切割位点的二级 三级结构也影响酶切效率 一般来 说 完全切割质粒或病毒 DNA 要比切割线状 DNA 需要更多的酶 最高的需要 20 倍 3 如果限制性内切核酸酶的识别位点位于DNA分子的末端 那么接近末端的程度也影响切割 如 HpaII 和 MboI 要求识别序列之前至少有一个碱基对存在才能切割 4 能够产生防御病毒侵染的限制性内切核酸酶的细菌 其本身的基因组中没有被该核酸酶识 别的序列 5 限制性图谱与限制性片段长度多态性 RFLP 图谱的最显著的区别在于前者是一个物理图谱 而后者 是 个连锁图 6 用限制性内切核酸酶 Hae 分别切割载体 DNA 和供体 DNA 后 可用 E coli DNA 连接酶进行 连接 7 已知某 内切核酸酶在一环状 DNA 上有 3 个切点 因此 用此酶切割该环状 DNA 可得到 3 个片段 8 迄今所发现的限制性内切核酸酶既能作用于双链 DNA 又能作用于单链 DNA 9 基因工程中使用的 类限制性内切核酸酶不仅有内切核酸酶的活性 而且有甲基化酶的活 性 10 DNA 多态性就是限制性片段长度多态性 11 用限制性内切核酸酶 PstI 切割质粒 pBR322 后 再用外切核酸酶 Exo 进行系列缺失 可 得到一 系列大小不同的缺失突变体 12 甘油会使许多限制性内切核酸酶的特异性发生改变 是导致 些酶的星活性的主要原因之 一 防 止的办法是在酶切反应体系中 将甘油的浓度控制在 5 以下 13 具有 EcoR 末端的外源片段只能以一个方向插入到 EcoRlI 末端的载体中 14 从 Esherichia coliK 中分离的限制性内切核酸酶命名为 EcoK 15 同一种限制性内切核酸酶切割靶 DNA 得到的片段的两个末端都是相同的 16 在限制与修饰系统中 修饰主要是甲基化作用 一旦位点被甲基化了 其他的限制性酶就 不能切割了 17 稀有酶是指那些识别序列很长又不常用的限制性内切核酸酶 三 选择题 单选或多选 1 关于宿主控制的限制修饰现象的本质 下列描述中只有 不太恰当 a 由作用于同一 DNA 序列的两种酶构成 b 这 系统中的核酸酶都是 n 类限制性内切核酸酶 c 这一系统中的修饰酶主要是通过甲基化作用对 DNA 进行修饰 d 不同的宿主系统具有不同的限制 修饰系统 2 RFLP 产生自 a 使用不同的限制性内切核酸酶 b 每种类型的染色体有两条 二倍体 c 染色体中碱基的随机变化 d Southern 印迹 e 不同探针的使用 3 型限制性内切核酸酶 a 有内切核酸酶和甲基化酶活性且经常识别回文序列 b 仅有内切核酸酶活性 甲基化酶活性由另外一种酶提供 c 限制性识别非甲基化的核苷酸序列 d 有外切核酸酶和甲基化酶活性 e 仅有外切核酸酶活性 甲基化酶活性由另外一种酶提供 4 型限制性内切核酸酶 a 由两个亚基组成 仅识别半甲基化位点 甲基化位点相对于限制位点的位置 上游或下 游 决定了 DNA 是被甲基化还是被限制 b 不同亚基的识别位点甲基化和限制活性相互排斥 MS 亚基促使甲基化 R 亚基促使限制 c 由两个亚基组成 在识别位点附近识别并进行甲基化或限制 d 在错配修复中起关键作用 因为酶结合到 DNA 上是以结构扭曲为基础而不是序列错误识 别 e 是光依赖型酶 是嘧啶二聚体进行 光反应 的关键酶 它们能使胸腺嘧啶二聚体间的 共价 键断裂 5 分析限制性内切核酸酶切割双链 DNA 所得到的 DNA 片段的长度有助于物理作图 这是因为 a 即使只用一种限制酶 因为 DNA 是线性的 所以也可以迅速确定限制性片段序列 b 内切酶在等距离位点切割 DNA 同时对于每个生物体的长度是特异的 c DNA 的线性意味着单限制性酶切片段的长度之和等于 DNA 的总长 而双酶切产生的重叠片 段 则产生模糊的图谱 d 这些内切酶的消化活性是物种特异的 e 这 技术同时为核苷酸序列提供了广泛信息 6 通过限制性片段分析 可以对等位基因进行精确的分析比较 其原因是 a 限制性内切核酸酶只切割两个变异等位基因中的 个 b 它利用限制性位点作为遗传标记 c 一个特定细胞中等位基因的核苷酸序列不会是相同的 d 它不依赖于变异等位基因产物的功能 e 限制性内切核酸酶的切点被限制在 DNA 的编码区域内 7 限制性片段长度多态性 RFLP 是 a 用于遗传的 指纹结构 模式分析的技术 b 二倍体细胞中的两个等位基因限制性图谱的差别 c 物种中的两个个体限制性图谱间的差别 d 两种物种个体间的限制性图谱差别 e 两种酶在单个染色体上限制性图谱的差别 8 为了正确地构建一个真核基因组的物理图谱 a 必须有可能清晰地分离各个染色体 通过脉冲场凝胶电泳 b 必须从单倍体细胞 配子 中分离 DNA 这样避免了由二倍体细胞中同源染色体的存在而 产生的 干扰信息 c 必须进行单个染色体分析 这只能在细胞分裂后期进行 d 必须找到对于每个染色体只切割一次的限制酶 e 必须首先分离核 DNA 和细胞器 DNA 然后对它们分别作图 9 下面有关限制酶的叙述哪些是正确的 a 限制酶是外切酶而不是内切酶 b 限制酶在特异序列 识别位点 对 DNA 进行切割 c 同一种限制酶切割 DNA 时留下的末端序列总是相同的 d 一些限制酶在识别位点内稍有不同的点切割双链 DNA 产生黏末端 e 一些限制酶在识别位点内相同的位置切割双链 DNA 产生平末端 10 因研究入噬菌体的限制与修饰现象的本质而获得诺贝尔奖的科学家是 a J Lederberg b WArber c H Smith d FSanger 11 第一个被分离的 类酶是 a EcoK b Hind c Hind d EcoB 12 双链 DNA 中一段自我互补的序列被称为回文序列 这种序列一般具有下列特征 a 有对称轴 b 两条链的 5 3 方向的序列相同 c 是 类酶的识别序列 d 可 增强基因的表达 13 在下列进行 DNA 部分酶切的条件中 控制那一项最好 a 反应时间 b 酶量 c 反应体积 d 酶反应的温度 14 在下列试剂中 那 种可以螯合 Ca2 离子 a EDTA b 柠檬酸钠 c SDS d EGTA 15 在下列工具酶中 那一种可以被 EGTA 抑制活性 a S1 单链核酸酶 b 末端转移酶 c 碱性磷酸酶 d Bal31 核酸酶 16 限制性内切核酸酶可以特异性地识别 a 双链 DNA 的特定碱基对 b 双链 DNA 的特定碱基序列 c 特定的三联密码 d 以上都正确 17 在下列酶中 催化反应不需要 ATP 的是 a EcoK b EcoB c T4DNA 连接酶 d BamHI 18 下列关于限制性内切核酸酶的表示方法中 正确一项的是 a Sau 3A I b E coR I c hind d Sau 3A 1 19 限制性内切核酸酶的星号活性是指 a 在非常规条件下 识别和切割序列发生变化的活性 b 活性大大提高 c 切割速度大大加快 d 识别序列与原来的完全不同 20 下面哪 种不是产生星号活性的主要原因 a 甘油含量过高 b 反应体系中含有有机溶剂 c 含有非 Mg2 的二价阳离子 d 酶切反应时酶浓度过低 21 DNA 被某种酶切割后 电泳得到的电泳带有些扩散 下列原因哪一项不太可能 a 酶失活 b 蛋白质 如 BSA 同 DNA 结合 c 酶切条件不合适 d 有外切核酸酶污染 22 关于回文序列 下列各项中 是不正确的 a 是限制性内切核酸酶的识别序列 b 是某些蛋白的识别序列 c 是基因的旁侧序列 d 是高度重复序列 23 关于宿主控制的限制修饰现象的本质 下列描述中只有 不太恰当 a 由作用于同 DNA 序列的两种酶构成 b 这一系统中的核酸酶都是 类限制性内切核酸酶 c 这一系统中的修饰酶主要是通过甲基化作用对 DNA 进行修饰 d 不同的宿主系统具有不同的限制 修饰系统 四 简答题 1 现分离到 X82 噬菌体的一个突变型 它同野生型的噬菌斑相当不同 并已分离到这两种 噬菌体 的 DNA 请设计 个实验 初步鉴定是点突变 插入突变还是缺失突变 2 说明 SangerDNA 测序法的原理 3 在酶切反应缓冲液中加入 BSA 的目的是什么 机理是什么 4 Fredfick 和 McClarin 等用一个由 13 个碱基对的 DNA 片段与 EcoRl 反应 然后分离到酶 和 DNA 共结晶的复合物 通过 X 射线分析发现了什么 5 有些噬菌体和质粒常常编码一些抗限制性酶的蛋白以中和宿主的限制系统 你认为噬菌 体和质粒 还有哪些可能的方式避免宿主的限制作用 6 某学生在用 EcoRI 切割外源 DNA 片段时 出现了星号活性 请分析可能的原因 7 在序列 5 CGAACATATGGAGT 3 中含有一个 6bp 的 类限制性内切核酸酶的识别序列 该位 点的序列可能是什么 8 下面几种序列中你认为哪一个 哪些 最有可能是 类酶的识别序列 GAATCG AAATYr GATATC ACGGCA 为什么 9 用连接酶将 Sau 3Al GATC 切割的 DNA 与经 BamHl Gq GATCO 切割的 DNA 连接起来后 能够被 BamHI 切割的机率有多大 用百分比表示 10 用 Klenow 酶填补的办法可使 5 黏性末端转变成平末端 这种方法常使 DNA 上的某些限 制 酶的识别位点消失 请问 对于下列限制酶 用这种方法处理会不会使它们的识别序列都消 失 BamH 1 G GATCC Taq I T CGA BssH II G CGCGC 11 请推测细菌的染色体上是否会有编码识别 8 个碱基的内切酶 怎样验证 12 当两种限制性内切核酸酶的作用条件不同时 若要进行双酶切 应采取什么措施 五 问答题 1 什么是细菌的限制 修饰系统 restriction modificationsystem R M system 2 细菌的限制 修饰系统有什么意义 3 说明限制性内切核酸酶的命名原则要点 4 I 类限制酶具有哪些特点 在基因工程中有什么作用 5 类限制酶有哪些特点 6 何谓限制性内切核酸酶的切割频率 7 什么是限制性内切核酸酶的星号活性 受哪些因素影响 8 双酶消化法 doubledigests 绘制限制性内切核酸酶酶谱的原理 9 什么是 DNA 多态性 DNApolymorphism 10 限制性片段长度多态性 restrictionfragmentlengthpolymorphism RFLP 11 计算下列三种酶各自在某染色体 DNA 序列上识别位点间的平均距离 Alu I 5 AGCT 3 EcoR 1 5 GAATrC 3 3 TCGA 5 3 CTTAGG 5 Acy 5 GPuCGPyC 3 3 CPyGCPuG 5 注 Py 任何一种嘧啶 Pu 任何一种嘌呤 12 在细菌质粒 pBPI 的四环素抗性基因 tetR 的中间有一个 Hind 的切点 用 Hind 切割果 蝇基因 组 DNA 以 pBP1 为载