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文档简介

跨膜区分析 TMHMM 2 跨膜区分析 TMHMM 蛋白质含有跨膜区 提示它可能作为膜受体起作用 也可能是定位在膜上的膜蛋白的膜锚定蛋白或离子通道蛋白 跨膜区常见的分析软件有TMHMM TMPERD TMP TMHMM是一个基于马尔可夫模型预测跨膜螺旋的程序 它综合了跨膜区疏水性 电荷偏倚 螺旋长度和膜蛋白拓扑学限制等性质 可对跨膜区及膜内外区进行整体预测 由于其在区分可溶性蛋白和膜蛋白方面尤为见长 故常用于判定一个蛋白是否为膜蛋白 http www cbs dtu dk services TMHMM 2 0 SIB 步骤一 打开在线工具 http www cbs dtu dk services TMHMM 2 0 步骤二 提交序列 步骤三 参数设置 参数介绍 Extensive withgraphics 图形化显示 Extensive nographics 不以图形化显示 Onelineperprotein 每个蛋白遵行显示 步骤四 显示结果 结果解读 结果显示 P8蛋白的1 405位氨基酸位于细胞膜表面 406 426位氨基酸之间形成一个典型的跨膜螺旋区 结果显示 与该蛋白的疏水性区域分析结果基本一致
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