《生物信息软件设计与开发》课程教学大纲.doc

生物信息软件设计与开发课程教学大纲陆枫，周艳红，邹昂一、 课程名称：生物信息软件设计与开发 Bioinformatics Software Design & Development二、课程编码：0703631三、学时与学分：40/2.5 (其中讲授24学时，上机实践16学时)四、先修课程：生物信息学, 面向对象程序设计, 数据结构与算法, 数据库技术五、课程教学目标1.帮助学生掌握开发生物信息网络资源服务平台（以下简称生物信息平台）的基本知识，了解目前设计开发生物信息平台的整体流程，熟悉流程中相应步骤的软件开发工具和制作方法；2.指导学生利用相应的软件工具仿照范例制作出生物信息平台的各种模块，使学生掌握生物信息平台软件设计开发的基本技能。六、适用学科专业生物信息技术七、基本教学内容与学时安排绪论（2学时）生物信息软件设计与开发的基本任务和主要内容建设生物信息平台的基本概念生物信息平台的基本制作流程生物信息平台的总体建设规划（2学时）建设生物信息平台的目的及功能定位生物信息平台建设的技术解决方案及相应开发工具生物信息平台的总体内容规划生物信息平台建设的项目开发规范生物信息平台页面制作（2学时）定位生物信息平台的整体形象生物信息平台网络页面设计生物信息平台网络页面制作生物信息平台数据库制作（4学时）数据库需求分析数据库设计建立数据库表数据库实施数据库的运行维护简单数据的web浏览制作（2学时）工作背景简介JSP基础知识数据库web浏览网页设计简单数据web浏览的JSP制作流程功能子模块制作网页的整合发布JavaBean的设计与制作（2学时）JavaBean基本概念JavaBean的制作目的制作JavaBean的语法规范和使用方式数据库web检索中JavaBean的设计与开发数据的web动态表格展示（2学时）MVC程序开发模式简介数据web动态表格展示的JSP制作流程控制子模块的开发显示子模块的开发业务处理逻辑的开发数据的web动态结构化展示（2学时）结构化信息的数据结构数据web动态结构化展示的JSP制作流程结构化显示子模块的开发数据的web动态图形展示（2学时）事物处理的基本概念SVG的基本概念数据web动态图形展示的JSP制作流程图形显示子模块的开发生物信息软件的网络发布（2学时）自建软件工具的web改造及网络发布Internet公共软件的网络安装与发布生物信息平台的发布（2学时）平台的硬件架构策略平台的网站发布平台的web服务评测生物信息平台中后台数据库制作上机实践（8学时）原始数据分析与数据库设计Oracle安装与数据库建表数据入库提供业务处理逻辑的JavaBean开发生物信息平台前台网络功能模块制作上机实践一（8学时）数据库的网络检索服务流程设计检索模块的制作开发检索结果的概要信息浏览检索结果的详细信息浏览生物信息平台前台网络功能模块制作上机实践二（任选）数据库的网络检索服务流程设计检索模块的制作开发检索结果的结构化展示生物信息平台前台网络功能模块制作上机实践三（任选）