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文档简介
一 重要的英文缩写ORF:开放阅读框 RF:阅读框 ORC:复制起始复合物 ori:复制原点ARS:自主性复制序列hnRNA:核内不均一RNA snRNA:核内小RNA、IS:插入序列 Tn:复合转座子、homebox:同源异型盒 homeodomain:同源异型域IPTG:异丙基硫代-D-半乳糖苷TATAbox:位于-25-30 bp处的TATAAAAG序列CAATbox:位于-70-78 bp处的CCAATG序列GCbox:-90区OCTbox:八核苷酸序列框TF:转录因子 RFC:复制因子C IHF:宿主整合因子SSB:单链结合蛋白Ribozyme:核酶intron:内含子 exon:外显子、PCNA:增殖细胞核抗原PDI:蛋白质二硫键异构酶 PPI:肽酰脯氨酸顺反异构酶、SRP:信号肽识别颗粒、 DP:停泊蛋白,SRP受体NLS:核定位序列、promoter:启动子 terminator:终止子 attenuator:衰减子enhancer:增强子 silencer:沉默子CAP:降解物基因活化蛋白SD序列:核糖体结合序列HLH:螺旋-环-螺旋TIFs:转录起始因子 GTFs:基础转录因子、UCE:上游控制元件 UAS:上游激活序列 UBF:上游结合因子PSEbox:近侧序列元件TAF:TBP相关因子 TBP:TATA识别结合蛋白、NM:核基质 MAR:基质结合区域SNP:单核苷酸多态性RecA:是大肠杆菌中recA基因座的产物,具有双重功能,能激活蛋白酶并能改变单链DNA 分子。蛋白酶-激活活性控制SOS 反应;核酸酶活性涉及重组修复途径。二 名词解释1、(1)origin:DNA复制是从DNA分子上特定位置开始,此位置称复制起点,是DNA复制所必需的一段特殊的DNA序列。(2)复制叉:DNA正在复制的分叉部位称为复制叉(replication fork)(3)复制眼:复制的DNA(尤其是双向复制)在电镜下象只眼睛称复制眼(泡)(4)复制子:基因组中具有一个复制起点和一个复制终点并能在细胞中自主复制的单位。2、(1)滚筒式复制:一种单向复制的特殊方式,一般是环状单链分子在复制过程中先形成共价闭环的双链分子(复制型),然后其正链在特定位置切开,游离出一个3-OH末端,然后在DNA聚合酶催化下,以环状负链为模板从正链3-OH末端加入脱氧核苷酸使链不断延长,通过滚动而合成出新的正链。(2)D-型:一种单向复制的特殊方式,双链在固定点解开进行复制,但两条链的合成高度不对称,一条链先复制,另一条保持单链而被取代,在电镜下看呈D-环型。待一条链复制到一定程度露出另一条链的复制起点,另一条链才开始复制。(3)式复制:环状DNA的一种双向复制方式,双链从起点处解开并双向复制,呈型状,直到复制终点。3、有意义链:正链,编码链,和RNA同义 无意义链:负链,模板链,和RNA反义4、内含子:在RNA原初转录本中被切除,而最终不表达的片段 外显子:在RNA原初转录本中剪接中保留并连在一起最终表达的片段5、兼并密码子:编码同一氨基酸的一组密码子 偏爱密码子:兼并密码子中使用频率最高的密码子6、无义突变:发生在终止密码处,使有义密码变成终止密码或者终止密码变成有义密码 错义突变:由有义密码的点突变引起,突变结果只改变一个氨基酸,改变后产生一个性质相似的氨基酸7、信号肽:分泌和跨膜蛋白在合成过程中N端共有序列,它能引导跨膜和分泌性蛋白的肽链通过内质网膜和到达内质网腔。最终被内质网上的信号肽酶切除,因此成熟的分泌蛋白N端无信号肽 导肽:为线粒体定位信号,富含带正电荷的氨基酸,丝氨酸含量特别高8、抑制基因突变:第二次点突变抑制了第一次突变造成的表现型,使野生型表现型得以恢复(并非真正的恢复突变) 移码突变:在核苷酸链上插入或删去一个碱基,就会导致其后的密码子的阅读框发生改变的现象9、基因组:对一般二倍体高等生物,能维持配子或配子体正常功能的最低数目的一套染色体DNA 功能基因组:由表达基因构成的基因组10、衰减子:在合成代谢基因内部受环境影响,有终止子功能,形成不完整mRNA,降低基因表达的DNA序列终止子:在一个基因3端或操纵子3具有转录终止功能的DNA序列启动子:操纵子中位于操纵基因一端的核苷酸序列,其中含有以校正遗传起始的一切信号,并决定RNA合成的最大速度增强子:在真核生物中,增强启动子起动效率的某些序列绝缘子:沉默子:在真核生物中,对启动子起动效率起负调控作用的序列11、溶源途径:噬菌体感染大肠杆菌后,其基因组与细菌染色体整合,成为细菌染色体DNA的一部分,随着细菌染色体的复制而复制,不引起噬菌体的组装和细菌的裂解溶菌途径:噬菌体DNA从细菌染色体上分离,形成环状,其上操纵子按一定时间顺序表达,利用寄主复制、转录、翻译系统,并利用寄主的营养物质合成自己的酶、外壳蛋白及基因组,组装成噬菌体颗粒,溶破细菌释放出噬菌体颗粒12、持家基因:在每个细胞都表达的基因,即其功能对每个细胞都需要的基因奢侈基因:只在特定细胞中表达低丰富蛋白和酶的基因13、应答元件:诱导型转录因子结合的顺式元件诱导因子:识别并特异地结合在起始位点上游元件上,其活性受调控,在特定时间、条件或特定的组织中合成或被活化上游因子:识别并特异地结合在起始位点上游元件上,其活性不受调控,可结合和作用于具有其识别序列的元件上,可提高启动效率基础因子:与RNApol结合形成位于起始位点周围的复合体,据顶转录起始位点上游元件:启动子上游的顺式作用元件14、顺式作用元件:是指那些与结构基因表达调控相关、能够被基因调控蛋白特异性识别和结合的特异DNA序列。包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等反式作用因子:能与顺式作用元件结合的可扩散蛋白15、转录因子:真核RNA聚合酶不能识别DNA上的结合位点,识别这些序列的是调节转录的反式作用因子基础转录因子:是启动子在起动RNA合成时的必需因子,与RNApol结合形成围绕在起始位点周围的复合物,其结合通用启动子序列,能在任何细胞中转录,而不依赖与组织特异性的调控序列上游转录因子:识别并特异地结合在上游顺式元件上,其活性不受调控,可作用于具有其识别序列的任何启动子上,可提高启动效率诱导型转录因子:识别并特异地结合在上游顺式元件上,其活性受调控,在特定时间、条件或特定的组织中合成或被活化16、RNA编辑:在mRNA水平上发生的碱基取代、插入或缺失RNA剪切:mRNA前体在核酶的作用下剪去内含子的加工可变剪切:mRNA按照不同方式剪接,产生两种或多种mRNA的剪切17、同源异型盒:是DNA上编码一类与发育有关的调控蛋白上与DNA结合的结构域的序列同源异型域:这一调控蛋白上与DNA结合的结构域同源异型蛋白:同源异型基因:18、cDNA:互补DNAcccDNA:共价闭合环状DNA反义RNA:和mRNA序列互补的小分子,起调节因子作用19、5UTR:mRNA上5端的非编码区,与mRNA和核糖体的识别和结合有关3UTR:mRNA上3端的非编码区,与加polyA尾巴有关,与mRNA的未定性有关20、的抗终止蛋白:抗终止信号;21、端粒:真核生物染色体的末端特殊序列,由简单而串联重复的序列组成 端体:22、单复制子:整个基因组只含有一个复制原点和一个复制终点的复制子多复制子:基因组含有多个复制原点和多个复制终点的复制子23、编码:成熟mRNA相邻三个碱基决定一种氨基酸读码:氨酰tRNA与mRNA三联体密码的相互识别24、引物酶:即DnaG,负责DNA复制起始阶段RNA引物合成的酶 引发体:由DnaB解旋酶和DnaG引物酶及其它蛋白因子构成的复制体25、组成型表达:一个启动子若仅含有为基础因子和上游因子所识别的元件,则此启动子能在任何类型的细胞中进行转录和表达26、分子伴侣:细胞中帮助新生肽链正确组装,形成成熟蛋白质,而本身不是最终功能蛋白质分子的组成成分的分子27、共翻译易位:正在翻译的核糖体通过信号肽插入内质网上的特殊通道结合于内质网上,并使正在延伸的肽链转移至内质网内,切去信号肽后,蛋白质停留在内质网内,或通过高尔基体转移至溶酶体,或形成分泌小泡分泌出去28、锌指结构:一种DNA结合结构域,其中2个His和2个Cys与Zn配位使锌指成环,锌指由78个氨基酸联结29、蓝白斑筛选:某些质粒带有大肠杆菌的半乳糖苷酶基因片段,在半乳糖苷酶基因的基因区外又另外引入了一段含多种单一限制酶位点的DNA序列。这些位点上如果没有克隆外源性DNA片段,在质粒被导入lac-的大肠杆菌后,质粒携带的半乳糖苷酶基因将正常表达,与大肠杆菌的半乳糖苷酶基因互补,产生有活性的半乳糖苷酶,加入人工底物X-gal和诱导剂IPTG后,出现蓝色的菌落。如果在多克隆位点上插入外源DNA片段,将使lac Z基因灭活,不能生成半乳糖苷酶,结果菌落出现白色。由于这种颜色标志,重组克隆和非重组克隆的区分一目了然30、同源重组:减数分裂过程中染色体间的物质交换,即DNA分子的断裂和在重组酶作用下的交换连接位点专一重组:在专一酶的作用下,在DNA特定位点上发生断裂和重接,从而产生精确的DNA重排的DNA重组方式转座重组:转座子在基因的许多位点反复插入而实现的重组Holliday结
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