ChemDraw 教程－3.doc

ChemDraw 教程3Written by Anan WuXiamen UniversityChapter 7 常用绘制技巧及其它功能7.1 用快捷键标记原子 用ChemDraw快捷键可快速标记原子，原子所属官能团和提供原子的特性。文件CS ChemDraw HotKeys.txt位于Program FilesCambridgeSoftChemOffice2004ChemDrawChemDraw Items目录中，包含ChemDraw中提供的快捷键的定义。可以用文本编辑器编辑这个文件来增加或修改快捷键。 用快捷键编辑原子有以下描述的五种方法。7.1.1 定位快捷标记原子 定位标记原子的方法：l 绘制一化学结构。l 将光标移动至原子点出定位，此时出现一蓝色亮斑。l 按快捷键，标记将被添加到定位的原子处，如果标记为元素，那么系统将自动添加适当数目的H。见图7-1图7-1 定位快捷标记原子7.1.2 选择工具快捷变换原子 用选择工具变换标记原子的快捷方法：l 绘制一化学结构。l 用选择工具，然后将光标定位某原子，此时出现选择框。l 按快捷键，将快捷变换成新标记的原子，如果标记为元素，那么系统将自动添加适当数目的H。见图7-2 图7-2 选择工具变换标记原子7.1.3 标记被选择结构中的原子 标记被选结构中原子的快捷方法：l 绘制一化学结构。l 使用选择工具选择部分原子。l 按快捷键（c），其连接键被全部选择的原子或官能团将被标记，快捷键所对应的元素或符号被加入到结构中。见图7-3 图7-3 选择部分原子 按快捷键C 7.1.4 运用默认的快捷键 在ChemDraw中设置了一些默认的快捷键，这些键不能在CS ChemDraw HotKeys.txt文件中编辑。默认的快捷键及操作功能如下：l Enter 键：打开原子标记文本框。l Space：删除原子标记。l /键：当指向定位原子时，显示原子属性对话框。如果指向键，则打开键属性对话框。l =键：显示列举俗名对话框。l . 键：增加一个连接点。7.1.5 快捷键效果当在一个含有氮元素和氢组成的基团上加一个键时，氢原子的数目将自动增减以满足结构的正确性。例如，用CH2标记一个原子后，加入或删除一个键后氢原子数目的变化如下：l 在丁烷的C3处，用快捷方式标记一个基团CH2。l 用键工具或文字工具将鼠标定位在C3原子处，此时出现蓝色亮斑。l 单击加入一个键，此时被标记的CH2基团会变为CH。l 在3的基础上定位已添加的键并删除该键，标记的基团会由CH变回为CH2。7.2 多中心结构和多连接标记通过调整多中心连接可绘制有意义的络合物结构，例如，二茂铁(Cp)2Fe。绘制多中心连接结构的基本步骤是绘制结构的一个分子部分，通过选择和复制，建立其它分支部分，然后用键从络合配体的中心点（多中心节点）连接到中心原子上。因为用键连接的多中心节点不止一个，所以把键称之为多中心建，见图7-4。图7-4 二茂铁多中心结构7.2.1 多中心节点的建立建立一个多中心节点的方法：l 绘制一个要定义多中心节点的结构，例如：环戊二烯基。l 从Structure菜单中选择Add Multi-Center Attachment。此时环戊二烯基中心显示一个星号，表示它有一个中心节点（图7-5）。图7-5 环戊二烯有一个中心节点7.2.2 多中心键的绘制l 选择实键工具l 指向环戊二烯的中心星号，单击或拖动鼠标建立一个单键。l 在键的端点标记一个铁原子注意：要使得二茂铁中的键看起来像从环中引出来的，应该选择单键后从Object菜单中选择Sent to Back命令。一旦加了一个单键后，星号将会消失。但可利用键工具或者选择工具将鼠标移动至节点上检查星号是否依然存在。重复上面操作可绘制出二茂铁的结构，见图7-4。7.3 结构整理利用Structure菜单中的Clean up Structure 命令和通过规范键长和角度可整理分子，使之得到规范化的结构。如果只选择了部分原子，使用Clean up Structure 时其它原子和键将不受影响。整理结构的方法：l 用选择工具选择将整理的结构或者结构的一部分。l 从Structure菜单中，选择Clean Up Structure命令，结构将被规范化。见图7-6 图7-6 整理前 应用Clean up Structure后7.4 不定结构的绘制利用Structure菜单中的Add Variable Attachment命令，可以绘制保持化学组成相同而结果不同的异构体。例如图7-7中所示的二溴基苯的三个异构体。图7-7 二溴基苯的三个异构体对于图7-7的三个异构体，可以通过不定连接，将三个异构体表示为如图7-8所示。绘制不定连接结构和绘制多中心结构类似。图7-8 二溴基苯的不定结构绘制不定结构步骤：l 绘制一个需要不定结构的结构片断，例如苯环。l 用选择工具选择这个结构。l 从Structure菜单中，选择Add Variable Attachment, 此时一个星号将出现在这个结构的中心，见图7-9l 选择建工具在结构中心的多连接点定位，拖动鼠标绘制一个单键，得到图7-8的结构。图7-9 不定结构的中心连接点7.5 颜色处理利用ChemDraw的颜色处理功能，可以绘制化学彩图。在ChemDraw中，每一个文档，画面和所用的工具都有一个调色板，可以从一个由背景色，前景色，和各种颜色组成的调色板中给任意图形结构选颜色。7.5.1 Color 菜单Color菜单实际上是一个选色板，见图7-10，用于给绘制窗口的图形结构和文本着色。其中Foreground色彩是用来给新的图形结构着色的，other色彩可以用来给被选择的图形结构改变颜色。图7-10 Color 菜单7.5.2 给图形结构着色任何可以用选择工具选择的图形结构都可以被着色。给图形结构着色的方法：l 用选择工具选择需要着色的图形结构，文字，元素标识。l 从Color菜单中，选择一种颜色。注意：单个键，化学结构的一部分或全部，方框，曲线，箭头，轨道等图形都可以被着色。空心图形结构的边框可以被着色，内部的空心不能。但是内部如果还有图形结构被选择后，内部的图形结构可以。(注：空心还是填充的图形结构可以通过Curves菜单来调节，其中Closed是指空心结构，Filled和Shaded对应于填充