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微生物分类 微生物分类系统微生物分类依据微生物分类单位和命名 微生物的分类系统 这里仅简述原核微生物和真核微生物的分纲体系 1原核生物界 Procaryotae 1 光能营养原核生物门 蓝绿光合细菌纲 蓝细菌类 红色光合细菌纲 绿色光合细菌纲 2 化能营养原核生物门 细菌纲 立克次氏体纲 柔膜体纲 古细菌纲 微生物的分类系统 2真核微生物 Eucaryoticmicrobes 真核策生物主要包括各类真菌 还有粘菌等 真菌划分各能分类单位的基本原则是以形态特征为主 生理生化 细胞化学和生态等特征为辅 丝状真菌主要根据其孢子产生的方法和孢子本身的特征 以及培养特征来划分各级的分类单位 一些病原真菌的鉴定 寄生和症状也可作为参考依据 真菌可分以下四纲 藻状菌纲菌丝体无分隔 含多个核 有性繁殖形成卵孢子或接合孢子 子囊菌纲菌丝体有分隔 有性阶段形成子囊孢子 担子菌纲菌丝体有分隔 有性阶段形成担孢子 半知菌纲包括一切只发现无性世代未发现有性阶段的真菌 粘菌也可分为四纲 即 网粘菌纲自细胞两端各自伸出长的粘丝并接连形成粘质的网络 假原质团 集胞粘菌纲分泌集胞粘菌素 形成假原质团 粘菌纲形成原质团 腐生性自由生活 根肿病菌纲形成原质团 专性寄生 亦有将之归于真菌类 微生物的分类依据 1 形态特征 个体形态镜检细胞形状 大小 排列 革兰氏染色反应 运动性 鞭毛位置 数目 芽孢有无 形状和部位 荚膜 细胞内含物 放线菌和真菌的菌丝结构 孢子丝 孢子囊或孢子穗的形状和结构 孢子的形状 大小 颜色及表面特征等 培养特征 在固体培养基平板上的菌落 colony 和斜面上的菌苔 lawn 性状 形状 光泽 透明度 颜色 质地等 在半固体培养基中穿刺接种培养的生长情况 在液体培养基中混浊程度 液面有无菌膜 菌环 管底有无絮状沉淀 培养液颜色等 微生物的分类依据 2 生理生化特征 能量代谢利用光能还是化学能 对 2的要求专性好氧 微需氧 兼性厌氧及专性厌氧等 营养和代谢特性所需碳源 氮源的种类 有无特殊营养需要 存在的酶的种类等 3 生态习性生长温度 酸碱度 嗜盐性 致病性 寄生 共生关系等 4 血清学反应用已知菌种 型或菌株制成抗血清 然后根据它们与待鉴定微生物是否发生特异性的血清学反应 来确定未知菌种 型或菌株 微生物的分类依据 5噬菌反应菌体的寄生有专一性 在有敏感菌的平板上产生噬菌斑 斑的形状和大小可作为鉴定的依据 在液体培养中 噬菌体的侵染液由混浊变为澄清 噬菌体寄生的专业性有差别 寄生范围广的谓多价噬菌体 能侵染同一属的多种细菌 单价噬菌体只侵染同一种的细菌 极端专业化的噬菌体甚至只对同一种菌的某一菌株有侵染力 故可寻找适当专化的噬菌体作为鉴定各种细菌的生物试剂 微生物的分类依据 6细胞壁成分革兰氏阳性细菌的细胞壁含肽聚糖多 脂类少 革兰阴性细菌与之相反 链霉菌属 Streptomyces 的细胞壁含丙氨酸 谷氨酸 甘氨酸和 氨基庚二酸 而含有阿拉伯糖是诺卡氏菌属 Nocardia 的特征 霉菌细胞壁则主要含几丁质 7红外吸收光谱利用红外吸收谱技术测定微生物细胞的化学成分 了解微生物的化学性质 作为分类依据之一 微生物的分类依据 8 含量生物遗传的物质基础是核酸 核酸组成上的异同反映生物之间的亲缘关系 就一种生物的 来说 它的碱基排列顺序是固定的 测定四种碱基中鸟嘌呤 和胞密啶 所占的摩尔百分比 就可了解各种微生物 分子不同源性程度 亲缘关系接近的微生物 它们的 含量相同或近似的两种微生物 不一定紧密相关 因为它们的 的四个碱基的排列顺序不一定相同 微生物的分类依据 9 杂合率要判断微生物之间的亲缘关系 须比较它们的 的碱基顺序 最常用的方法是 杂合法 其基本原理是 解链的可逆性和碱基配对的专一性 提取 并使之解链 再使互补的碱基重新配对结合成双链 根据能生成双链的情况 可测知杂合率 杂合率越高 表示两个 之间碱基顺序的相似越高 它们间的亲缘关系也就越近 微生物的分类依据 10核糖体核糖酸 r NA 相关度在 相关度低的菌株之间 rRNA同源性能显示它们的亲缘关系 Rrna DNA分子杂交试验可没定Rrna的相关度 揭示Rrna的同源性 11rRNA的碱基顺序 的碱基顺序由 转录来的 故完全具有相对应的关系 提取并分离细菌内标记的 SrRNA 以核糖核酸消化 可获得各种寡核苷酸 测定这些寡核苷酸上的碱基顺序 可作为细菌分类学的一种标记 微生物的分类依据 12核糖体蛋白的组成分析分离被测细菌的 和 核糖体蛋白亚单位 比较其中所含核糖体蛋白的种类及其含量 可将被鉴定的菌株分为若干类群 并绘制系统发生图 13其它如脂类分析 核磁共振 NMR 谱 细胞色素类型以及辅酶 的种类 所含异间二烯侧链的长度 等 微生物的分类单位和命名 生物最基本的分类单位是种 species 其上是属 genns 科 family 目 order 纲 class 和门 phyllum 等 门 纲 目 科 属名的字首字母要大写 除属名外不印成斜体字 属 种名印刷用斜体字下划线 如酿酒酵母在分类系统中的归属情况为 微生物的分类单位和命名 门 真菌门Eumycophyta纲 子囊菌纲Ascomyeetes亚纲 原子囊菌亚纲Protoascomycetes目 内孢霉目Endomyctales科 内孢霉科Endomycetaceae亚科 酵母亚科Sacchromycetoideae属 酵母属Sacchromyces种 酿酒酵母S cerevisiaeHansen微生物的命名 与其他生物一样 采用国际上通用的双名法 学名通常由一个属名加一个种的加词构成 出现在分类学文献中的学名 往往还加上首次定名人 外加括号 现名定人和现名定名年份 但在一般使用时 这几个部分总是省略的 微生物的分类单位和命名 例如 由Ehrenberg于1838年定名为Vibriosubtilis 枯草弧菌 的细菌 到1872年 Cohn发现弧状不是该菌的特征 它的特征是杆状具芽孢 故将它转到芽孢杆菌属 称为枯草芽孢杆菌 简称枯草杆菌 其学名为Bacillussubtilis Ehrenberg Cohn1872 再如 可使许多科的植物生肿瘤的土壤杆菌属细菌称为根癌土壤菌 学名为Agrobacteriumtumefaciens Smith寄居于温血动物肠道下部的埃希氏菌属细菌称为大肠埃希氏菌 简称大肠杆菌 其学名为Excherichiacoli Migula Castellani Chalmers1919 葡萄球菌属呈金黄色葡萄球菌 学名为StaphylococcusaureusRosenbach1884 呈铜绿色的假单胞菌 即绿脓杆菌 学名为Pseusomonasaeruginosa Schroeter Migula1920 微生物的分类单位和命名 有时 从自然界分离到的某一微生物纯种 与典型的特征不完全符合 而不相符的这一特性又是稳定的 则将这种微生物称为典型种的变种 variety 简称var 在实验室里获得的变异型则称为亚种 subspecies 简称subsp 变种或亚种的学名按 三名法 构成 微生物的分类单位和命名 例如 有一种芽孢杆菌 能产生黑色素 其余特征与典型的枯草杆菌完全符合 该菌学名为Bacillussubstilisvar niger 枯草芽孢杆菌黑色变种 同种