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文档简介

蛋白相互作用分析和预测 蛋白相互作用预测机理 expression orthology domainco occurrence post translationalmodifications sub cellularlocationidentifiedbyexperimentalmethods GeneOntology 基因功能分类标准体系GeneOntologyConsortium GO的发起组织 的数据库中有3大独立的ontology被建立起来 biologicalprocess生物过程 molecularfunction分子功能及cellularcomponent细胞组分 而这三个ontology下面又可以独立出不同的亚层次 层层向下构成一个ontologies的树型分支结构 可以说 GO是生物学的统一化工具 信号传导通路查询 已发表蛋白相互作用数据库分析 IntActHPRDDIPBioGRIDMINTstring PIPs人的蛋白相互作用预测 APID AgileProteinInteractionDataAnalyzer string http string db org 基因表达分析 GEO 近年来 利用高通量方法检测基因表达越来越普及 诸如微阵列杂交和基因表系列分析 SAGE 可以同时测量数以万计的基因转录子 genetranscript 基因表达大棚车 GEO GeneExpressionOmnibus 则是归档和自由分发科研人员提交的高通量基因表达数据的公共仓库 目前 GEO存储了大约10亿单个基因表达的数据 来自于100多种生物 内容广泛涉及到各种生物学问题 这些大容量的数据可以使用用户友好的以Web为基础的工具进行有效的挖掘 检索和可视化表达 GEO的网址是www ncbi nih gov geo 癌基因组表达差异分析 CGAP计划是一项由NCI建立和主持的交叉学科的计划 用来产生用于解码肿瘤细胞的分子结构所需的信息和技术工具 CGAP被分为五个互补的自主部分 每一个都有它自己的目的 信息学工具和资源 TheHumanTumorGeneIndex hTGI 人类肿瘤基因索引指明了在人类肿瘤发生过程中的基因表达 MolecularProfiling MP 分子表达谱展示了用前列腺作为例子来从分子水平分析人类组织样品的概念 TheCancerChromosomeAberrationProject CCAP 癌症染色体变异计划 CCAP 描述了同恶性转移相关的染色体改变 TheGeneticAnnotationIndex GAI 遗传注解索引指明和描绘了同癌症相关的多态性 TheMouseTumorGeneIndex mTGI 小鼠肿瘤基因索引 mTGI 确定了在小鼠肿瘤发生过程中的基因表达 为什么要有CGAP 在过去的二十年中 我们已经了解到遗传学改变是所有癌症的根结所在 为此 CGAP将统一最新的技术 以及那些
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