




已阅读5页,还剩2页未读, 继续免费阅读
版权说明:本文档由用户提供并上传,收益归属内容提供方,若内容存在侵权,请进行举报或认领
文档简介
-本文为网络收集精选范文、公文、论文、和其他应用文档,如需本文,请下载-关于细菌分类学研究的论文本文从网络收集而来,上传到平台为了帮到更多的人,如果您需要使用本文档,请点击下载按钮下载本文档(有偿下载),另外祝您生活愉快,工作顺利,万事如意! 论文 关键词:细菌;分类方法;趋势论文摘要:对细菌分类学研究的目的简单论述。对分类学研究中的多相分类方法包括经典分类,化学分类,分子分类,数值分类进行了详细的介绍,从而为临床和科研中细菌鉴定方法的选择应用提供 参考 依据。同时对分类学 发展 的研究趋势进行了简单的 总结 。 1. 细菌分类学研究的目的 原核微生物系统分类是 科学 地研究微生物多样性及它们之间相互关系的基础学科1。细菌是原核微生物的重要成员,当前主要从两个方面进行细菌分类学的研究,一是为了实用的需要,建立各种细菌的信息库,从而更有效地开发利用细菌资源及有效地控制有害细菌。许多种细菌是微生物药物活性物质的重要来源。包括假单胞菌属(pesudomonas)、微球菌属(microcoeeus)、芽孢杆菌属(bacillus)、肠杆菌属(eneturbacetrium)和别单胞菌属(atleromonas)等。早在1966年,burkholder从含溴假单胞菌分离到抗生素硝吡咯菌素(pyornlirtin)2。二是建立反映细菌进化关系的 自然 分类系统,以揭示各种细菌的本质特征和相互关系,丰富生物多样性研究的内容。 2. 细菌分类学研究方法 多相分类法是目前广泛使用的细菌分类学方法。在方法学上主要包括以下几种。 经典分类 经典分类主要指依据形态特征和生理生化特征等表观分类学指征进行分类学研究,是多相分类研究的基础。 化学分类 化学分类是根据生物细胞中某些特定化学物质的特征对生物个体进行分类的方法,是细菌属划分的主要特征之一。目前常使用的化学指征包括以下几种。 磷酸类脂分析 磷酸类脂与蛋白质、糖等共同构成细胞膜,对于物种运输、代谢及维持正常的渗透压都有重要作用。具有分类学意义的磷酸类脂是: pe、pc、pme、pg和glunus等五种。 脂肪酸组分分析 脂肪酸的链长、双键位置和数量及取代基团在细菌中具有分类学意义。脂肪酸定性分析结果限于属和属以上的分类;脂肪酸定量分析结果可为种和亚种分类提供有用的基本资料。 全细胞蛋白电泳分析 高度标准化的sds-page是对大量密切相关菌株进行比较归类的有效方法,研究证明全细胞蛋白组分和dna-dna杂交有很好相关性3。此法用于种或种以下分类单位的研究。 分子分类 分子分类是在分子水平上对生物个体的dna、rna和蛋白质进行研究分类的方法。目前经常使用的分子指征包括以下几种。 g+c mol测定 g+c mol主要用于验证已建立的分类关系是否正确。通常认为:种内菌株间g+c mol相差不超过4,属内菌株间相差不超过10。 dna同源性分析 分析dna同源性的有效手段是dna-dna杂交,适用于种水平的分类学。1987年,国际系统细菌学委员会规定,dna同源性70为细菌种的界限。dna-dna杂交常用的方法有液相复性速率法和固相膜杂交等。 dna为基础的分型方法 以dna为基础的分型方法指可将种分为不同型的技术。其中早期的rflp,缺点是图谱复杂,难于比较。选用专一识别68个碱基序列的限制性内切酶,dna片段数量就大大减少的lfrfa被认为是目前分辨率最高的dna分型法之一。但这样切出的dna片段太大,只能用脉冲场凝胶电泳分开。rapda、ardra、aflp等技术多用于种水平的研究。 rep-pcr所采用的分类信息来自于全基因组。该方法分辨率高、重现性好,在一定程度上与16s rrna基因序列比较结果相一致,可作为一种快速鉴定的方法4。rrna同源性分析 现在一般认为,rrna是研究系统进化关系的最好材料。它广泛存在,功能稳定,由高度保守区和可变区组成。最初人们通过rrna-dna杂交和寡核苷酸编目法间接研究rrna的同源性。dna-rrna杂交反映的是属与属以上水平的信息5。 研究rrna同源性最直接可靠的方法是rrna核苷酸序列分析。目前,以16s rrna序列分析的应用最为广泛。 特异引物pcr 16s rrna特异引物的设计是建立在大量序列分析基础之上的。若能设计出一系列特异引物,如属特异引物,则菌种筛选过程将大为简化。种特异的引物主要用于鉴定,结合属特异引物联合应用则可能发现新种。 3. 细菌分类学 发展 的研究趋势 今后细菌分类学的发展将集中于以下几个方面: (1) 分析方法的标准化 有研究表明,细菌的脂肪酸、磷脂与醌类组成及含量随着培养条件的变化而不同71。所以化学分类必须建立标准化的方法,这样定量才有意义,更准确,更具可比性。 (2) 多相分类方法的广泛应用及分子分类法的发展 由于各种分子生物学技术方法在分类学中的应用,细菌分类学家的研究重点已不仅是对某个分类单元的分类鉴定,而是通过分子分类的方法把分类与进化紧密的结合起来。在未来几年内16s rdna/rrna作为重要的系统发育分子仍将发挥主导作用,但是其它保守分子将更多的用于系统发育研究,如rna聚合酶p, hsp60基因,延伸因子tu, 23s rdna/rrna, rdna转录间隔区等。 (3) “在线分类”的发展 现代 细菌分类研究越来越依赖于internet,我们不仅需要大量的分子生物学和系统发育分析软件,更离不开网上丰富的信息资源。因此,oren和stackebrandt于2002年提出了原核生物“在线分类”(online taxonomy)的概念6。 (4) 分类学研究与细菌资源研究结合 很多科研单位己注意到将系统分类与细菌资源的开发研究相结合,例如日本的北理研究所、理化研研究所、明治制药等。 参考 文献 1 宋延龄, 杨亲二, 黄永青. 物种多样性研究与保护m. 浙江 科学 技术出版社, 1998. 2 burkholder pr, pfister mr, leitz hf. production of a pyrrole antibiotic by a marine baeterium. applied mierobial, 1966, 14: 649-653. 3 kersters,k.,pot,b.,dewettinck,d., et al. indentification and typing of bacteria by protein eletrophoresis. in: priest p g,ramos-cormenzana a,and tyndall b ed. bacterial diversity and systematics. new york: plenum press, 1994. 4 张建丽, 刘志恒. 链霉菌的rep-pcr基因指纹分析.微生物学报, 2004,44(4): 281-285. 5 de smedt, j., de ley,j. intra-and intergeneric similarities of agrobacterium ribosomal ribonucleic acid j syst bacteriol, 1977, 27: 222-240. 6 oren, a. and stackebrandt, e. prokaryote taxon
温馨提示
- 1. 本站所有资源如无特殊说明,都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
- 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等,如果需要附件,请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
- 3. 本站RAR压缩包中若带图纸,网页内容里面会有图纸预览,若没有图纸预览就没有图纸。
- 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
- 5. 人人文库网仅提供信息存储空间,仅对用户上传内容的表现方式做保护处理,对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑,并不能对任何下载内容负责。
- 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容,请与我们联系,我们立即纠正。
- 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。
最新文档
- 分布式存储数据一致性维护-洞察及研究
- 智能家居语音交互的生态构建-洞察及研究
- 炼钢自动化系统设计-洞察及研究
- 医疗设备交易链上审计-洞察及研究
- 药物代谢与疗效关联-洞察及研究
- 全球化布局挑战-洞察及研究
- 2025年滑雪杖行业研究报告及未来发展趋势预测
- 2025年红外线传感器行业研究报告及未来发展趋势预测
- 2025年黄瓜行业研究报告及未来发展趋势预测
- 2025年互联网+再生资源回收行业研究报告及未来发展趋势预测
- 共青团入团团章知识考试题库300题(含答案)
- 2025贵州贵安城市置业开发投资有限公司招聘32人考试参考题库及答案解析
- 露天煤业安全生产培训课件
- 2025全国科普日科普知识竞赛题库及答案
- 2025年全国医学基础知识试题(附答案)
- 食堂安全培训课件
- 【课件】角的概念+课件+2025-2026学年人教版(2024)七年+数学级上册+
- 2025企业劳动合同范本新版
- 2025年防雷检测专业技术人员能力认定考试题库及答案
- 《房屋市政工程生产安全重大事故隐患判定标准(2024版)》解读
- 美发裁剪理论知识培训课件
评论
0/150
提交评论