小木虫中的好资料.doc

小木虫一篇文章的漫长投稿过程2011/3/15按理说现在自己应该正是忙着找工作和准备毕业论文的时候，但是现在毕业论文正在老板手里改，找工作的话也在等一篇文章的消息，本来不打算等的，但是多一篇论文对于本来论文就不多的我而言，无异于有一个质的提高，反正现在正在编辑手里，也等不了几天了，所以现在这两天除了等就是等，也没有其它什么可做的。自己以前就一直计划写一些自己的感想，算是对小木虫和诺贝尔学术资源网在我读博期间给予我巨大帮助的报答，我的绝大部分书和不少一部分论文，都是从上面这两个网站上无偿得到的（physebook上面的找到不少专业性的资料），如果没有这几个网站，我确实无法想象自己能够走到什么地步。我不是大牛，我只是一个即将毕业的普通的物理博士，论文也不多，够毕业的，我之所以选择写下来的原因是如果自己以后找的工作跟科研不相关的话，自己可能就更没有心情和机会来写了，这对于这个浩渺的世界当然不能算是任何损失，但是对于我自己而言，确实是一种遗憾。好了，废话不多说了，下面就说这篇文章的过程以及自己在这个过程中的感想。这篇文章是一篇实验文章，在刚做出来的时候，因为自己写文章的角度比较新，所以就我所了解的研究现状而言，别人还没有这样做过，而且当时自己是研究生第三年，反正有的是时间耗，所以就投了物理期刊类中比较好的杂志PRL，当时编辑送审了三个人，在等了两个多月之后，回来的消息是拒掉，不过三个人中还是有一个人同意的，另外两个不同意，因为涉及到比较专业的东西，说起来估计大家也没兴趣，反正就是我和导师商量之后发现那两个不同意的人中只有一个人的意见比较致命，另一个人纯属没有理解这篇论文，于是我们就详细准备了8页左右的回复，并且按照审稿人的意见修改了我们的论文，回复给了编辑。编辑在看了我们的回复之后，把我们的意见给了那两个不同意的审稿人，其中一个没太读懂的审稿人很快就回复了，但是意见比较致命的那个审稿人两个月都还没有回复，编辑认为那个审稿人不会再恢复了，所以就根据他已经收到的这个审稿人意见拒掉了我们的论文。虽然不甘心，但是这时已经将近半年了，而且想这篇文章PRL审稿中已经有一个人同意了，转到PRA的话是不是有可能直接接收了。所以虽然那个审稿人的回复依然有可以反驳的地方，而且我们也反驳了，但是，我们跟编辑说希望把我们的论文转到PRA上，结果编辑又重新找了一个审稿人来审我们的文章，在等了一个多月之后，审稿人回复不同意，这个审稿人并没有从我们写论文的角度来审稿，而是从一个不同的角度来看，那样我们文章的价值立马就降了好几个档次，他的结论依然是不同意。我们看了他的审稿意见之后，当然要继续argue，但是我当时已经感觉情况不妙了，因为我们不得不按照审稿人的角度来回答和修改这个论文，果然，虽然我们的回复编辑再次送给审稿人，审稿人回复的意见依然是不同意。从09年12月8号投PRL开始到10年6月12号，经历了四轮审稿，最后的结局是拒稿，到最后我也懒得再argue了，因为再argue也不会有啥结果。如果这个过程中有啥遗憾的话就是自己不应该把文章从PRL转到PRA，自己应该继续在PRL上跟审稿人argue，那样虽然有可能会有同样的悲剧结果，但是至少不会有遗憾。不过，过去的就算是过去了，无所谓了。下面是这次投稿过程的具体的审稿过程（这也是APS比较好的一点，可以看到各种过程的时间）CURRENT STATUS OF MANUSCRIPT: With editorsCORRESPONDENCE:SENT RECEIVED DESCRIPTION12Jul10 18Jul10 Review request to referee; report received06Jul10 Correspondence (miscellaneous) sent to author21Jun10 06Jul10 Correspondence sent to author; response received 06Jul10 Communication (miscellaneous) received from author24Jun10 Correspondence (miscellaneous) sent to author 22Jun10 Communication (miscellaneous) received from author14Jun10 15Jun10 Ed. decision and/or ref. comments to author; response rcvd17May10 06Jun10 Review request to referee; report received11May10 Acknowledgment sent to author07May10 10May10 Ed. decision and/or ref. comments to author; response rcvd10May10 Transferred from PRL to PRA19Mar10 07May10 Review request to referee; editor concludes response unlikely19Mar10 05Apr10 Review request to referee; report received02Apr10 Reminder to referee others sent (not shown) at 1-2 week intervals02Apr10 Reminder to referee others sent (not shown) at 1-2 week intervals18Mar10 Correspondence (miscellaneous) sent to author16Feb10 18Mar10 Ed. decision and/or ref. comments to author; response rcvd01Mar10 Correspondence (miscellaneous) sent to author 23Feb10 Communication (miscellaneous) received from author17Dec09 08Feb10 Review request to referee; report received17Dec09 19Jan10 Review request to referee; report received31Dec09 Reminder to referee others sent (not shown) at 1-2 week intervals17Dec09 22Dec09 Review request to referee; report received10Dec09 Corr. to author (paper long; short version NOT required now)10Dec09 Acknowledgment sent to author08Dec09 Correspondence (miscellaneous) sent to author不过也有一个好消息，在这篇文章悲剧的同时，另一篇在这篇文章基础上的文章被PRA接收了，最起码自己毕业不成问题了，所以也算是没什么压力了，继续找其它期刊投稿，不能在一棵树上吊死啊。另一篇文章的审稿过程还是比较顺利的，当时本来继续打算把第二篇文章也投PRL的，结果一看前面那篇悲剧了，连忙把第二篇中的讨论扩展开来，直接投PRA了，不管怎样，只要发表了就行了。更为重要的是加上自己以前发的一篇文章，自己够毕业的了，所以，选择合适的期刊还是比较重要的。CURRENT STATUS OF MANUSCRIPT: Editorially approved for publicationCORRESPONDENCE:SENT RECEIVED DESCRIPTION01Jul10 Editorially approved for publication01Jul10 Correspondence (miscellaneous) sent to author 28Jun10 Communication (miscellaneous) received from author28Jun10 Correspondence (miscellaneous) sent to author24Jun10 28Jun10 Ed. decision and/or ref. comments to author; response rcvd11Jun10 20Jun10 Review request to referee; report received10Jun10 Correspondence (miscellaneous) sent to author02Jun10 10Jun10 Ed. decision and/or ref. comments to author; response rcvd25May10 02Jun10 Review request to referee; message received (not a report)25May10 26May10 Status update sent to author01Apr10 25May10 Review request to referee; report received29Mar10 Acknowledgment sent to author29Mar10 Correspondence (miscellaneous) sent to author回到第一篇悲剧的文章上来，因为我具体做的是光学方面的，所以，接下来我们选择的期刊是OE，这个期刊是付费期刊，投起来应该相对容易一些，但是，天不遂人愿，可能送到了相同一批审稿人手里了，当时OE送了两个审稿人，一个审稿人第二天就回了，第二个审稿人两个月之后都还没有回，编辑就根据一个审稿人的意见把文章给拒了，本来想接着argue的，但是一想，argue的结果估计还是一样，而且还浪费时间，所以，就选择了重投。下面是OE的拒信，Manuscript ID: 132466Title: *Author: *Dear Dr. *We regret to advise you that your manuscript has not been accepted for publication in Optics Express. The reviewer comments are included below.Thank you for submitting your manuscript to Optics Express.If you have any questions, please contact the journal assistant at .We hope that we will be able to serve you in the future.Sincerely,Gerd LeuchsAssociate Editor, Optics Express在被OE拒了以后，选择的范围就小了很多了，当时想起来的有JMO和OC，因为导师对JMO不太了解，而且最近在OC上发过论文，所以就选择投OC了。现在说起来方便，但是改起来就没有那么方便了，尤其是每个期刊的格式不一样，幸好用的是Latex，可以直接使用他们提供的模板，但是参考文献格式的修改也是一件让人很不愉快的事情。于是，在10年11月2号投了OC，在今年的2月8号，终于等到了这篇文章接收的消息，现在还没有正式的刊号，正在等着出版。从09年11月第一次投稿开始，一直到11年的2月份正式接收，一共用了15个月的时间，这并不是一个很长的时间，但也不短，在这15个月的漫长投稿-修改-argue-继续投稿的过程中，自己确实学到了很多投稿过程中事情，也明白了不少道理。自己以前一直觉得只要自己做的东西自己觉得好就行了，管现在研究的主流是什么，只要我认为主流研究不好，我就不用，时间会证明自己是多么牛X，现在并不这么认为了，虽然我现在依然坚持我学术上的观点，但是现在写论文我总是尽量的从好的方面评论别人的工作，即使自己认为其中的某些研究有错，也采用的是中立的转述语气，再也不会攻击别人的观点了。即便是这样，自己现在所做的研究依然在遭受着同样的命运，因为与主流研究不符，我的论文总是因为各种各样的原因被拒掉，比如说我正在等消息的这一篇，意见是我的文章应该投向综述性的杂志而不是PRA，在我向回复编辑argue之后，编辑继续送审，估计这回的可能性也不大，但是自己心里还是抱有一线希望，因为毕竟自己在这项工作上花费的时间和心血实在是太多了，下面是正在等的这篇文章的记录CURRENT STATUS OF MANUSCRIPT: With editorsCopyright/Right to Publish receivedCORRESPONDENCE:SENT RECEIVED DESCRIPTION02Mar11 07Mar11 Review request to referee; report received28Feb11 02Mar11 Review request to referee; message received (not a report)11Feb11 22Feb11 Ed. decision and/or ref. comments to author; response rcvd10Jan11 07Feb11 Review request to referee; report received10Jan11 10Jan11 Review request to referee; message received (not a report)07Jan11 Acknowledgment sent to author07Jan11 Correspondence (miscellaneous) sent to author07Jan11 Right to publish signature received不过，自己现在把这些看的比较淡了，倒不是说淡泊名利了，我现在也希望自己明天就在牛X的期刊上发论文，只是说自己能够比较平静的来看待这个过程了。自己到现在都还记得自己第一篇文章被杂志接收时那种高兴的心情，真的是无法用言语来表达的那种爽；自己现在也记得自己第一次受到拒信时心情的低落，以至于对自己的研究也产生了严重地怀疑。现在，自己再发表一篇文章自己虽然会感到高兴，但是远远没有第一篇文章接收时那种欢呼雀跃的感觉，自己到现在为止也收了不少拒信，现在都能平静的接受了。不能发表并不代表着自己的研究没有价值，我依然相信这一点，但是，如果没有以前自己发表的那些论文，自己当然不可能像现在这么蛋定了。因为我只是一个很普通的博士生，我的研究还是需要得到这个学界的承认我才能评价自己所做东西的价值，而论文的发表是学界承认的第一步，而且发表的期刊越好，自己的起点也就越高。所以，能够发表在好杂志上的论文尽量都往好杂志投，大不了等好杂志拒了再往差一点的杂志投，但是，这里面就需要注意一个时间的问题，关键是看你自己有没有时间等，如果就差这么一篇论文毕业，还是尽快发表的好，因为为了一个可能性耽误了毕业的话，确实有点不划算。当然，这个还是要看每个人自己。回首自己读博的这五年，确实也浪费了不少时间，也做出了一些东西，怎么说呢，一个普通人要想博士毕业，还是有可能的，科研并不是那么神秘的东西，但是要想真正做出一些东西，确实是需要花费不少时间和一些天赋的，虽然我自己做出的东西不值一提，我周围确实有不少人在博士期间做出了很好的成果的。自己以后有可能就要跟科研拜拜了，因为自己并不是那么喜欢科研，相比较而言，自己还是喜欢那种安静平淡的生活，所以目前找工作主要也是进高校当老师，科研只是副业，主要还是当老师，有可能收入不高，但是，无所谓了。也以此文纪念我博士期间的研究生涯。【求助/交流】PCR产物的琼脂糖电泳图片 小木虫(金币+1):奖励一下，鼓励发有价值的话题silicare(金币+1):鼓励上图 2010-12-20 08:16:25这是用3个DNA模板对14对SSR引物的PCR产物的电泳图。用的是20微升的体系buffer 2微升mg（2.5mM） 2微升dDTP（2.5mM）1.5微升模板 1微引物（10um） 上游 1微升 下游 1微升Taq 1U退火温度我用的温度范围为什么同一引物有的出有的不出，麻烦大家帮看一下引物能用吗？体系还有什么问题。谢谢了！这是DNA的电泳图。从2003年开始读硕士到现在已经经过了漫长的8年的时间，前几天论文送审结果回来，有一个审稿人给了修改后重申的意见。觉得对自己的打击力度很大，痛过之后静静的思考，重新审视自己的论文，觉得尽管审稿人有些话说的有点严厉，不过自己的论文确实有些问题，自己安静下来，改了一段时间，现在觉得差不多了，写一点自己的感想，希望兄弟姐妹们引以为戒，一次通过博士毕业论文的盲审。 首先从内容方面，大家把自己做的与引用的尽量分开，提炼突出自己做的事情来。我的论文的写作中，因为当时在国外，与我这个领域的一些最初的专家在一起，我文献搜集的很多，阅读的也很多。所以在每一章写自己的东西的时候我都进行了大量的讨论，与别人做的进行对比，结果就是把自己的东西和别人的东西放在一起，结果就往往被理解成是教科书式的罗列，没有创新性。痛定思痛，我分析了以上的情况之后，把对文献的引用与讨论部分全部放在了绪论部分，在下面的章节里不再叙述别人的东西，突出自己的东西。 论文中的错别字与格式的问题。其实在开始写论文的时候还想好好注意这些的，可是写毕业论文是个枯燥又很累的过程，写到后来就没有心思好好对这些东西进行修改与美化了，结果错别字还有不少。回来之后我打印了三本，送给我读博士的师弟师妹，让他们帮我读一遍找找错别字和排版方面的问题，我自己也拿一本，逐字逐句的进行了修改。修改过程中确实发现很多句子说的不好，有些句子不够简化，最后我发现经过师弟师妹以及我自己的检查，发现了上百处可以更改的地方。所以我给大家的建议是送审之前最好也请别人和自己一起再把论文中的小地方认真检查一遍。导师太忙，不会做这种事情，只有找同学了。我在国外的时候看到过别人做的这样的服务，就是找个同学，两个人到图书馆，找个地方，逐字逐句的把论文读一遍，遇到问题就记下来，马上修改。可惜当时我没有能够好好借鉴，不然也不至于此。 论文中的图表，最好在写之前就用EXCEL做好，因为论文尽量用黑白的打印，所以曲线什么的区