常用医学统计软件简介

第十五章常用医学统计软件简介 预防医学 第一节EpiData3 02软件简介 一 EpiData的基础知识 EpiData由三种基本文件组成 QES文件 调查表文件 它的作用是定义调查表 问卷 的结构 REC文件 数据文件 它包括数据以及已经定义好的编码 CHK文件 数据录入核查文件 数据输入字段的有效性规则 字段 每个字段就是我们临床观察表中的一个小项目 它包括 1 字段的名称 2 字段的文本描述 3 字段的数据变量 二 EpiData运行界面介绍 运行EpiData exe会出现程序运行界面 图15 1 图15 1EpiData3 02软件主界面 二 EpiData运行界面介绍 第一行 EpiData菜单栏1 文件 2 数据核对 3 数据输入 输出 4 其他功能 5 工具 6 窗口设置 7 帮助 第二行 EpiData工作过程工具栏1 建立调查表文件 2 生成数据文件 3 添加核对命令 4 数据录入 5 其他功能 6 数据输出 第三行 EpiData常用的几个快捷工具按钮 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 2需要建立数据库的原调查表示意图 1 打开原始的调查表 见图15 2 一 建立调查表文件点击 建立调查表文件 按钮 选择 建立新调查表文件 图15 5输入数据库电子表 4 点击数据表预览按钮 图15 5 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 6脑血管病人血脂调查表 REC 二 建立数据文件建立 REC文件 点击 生成数据文件 按钮 选择 生成数据文件 生成 脑血管病人血脂调查表 REC 文件 图15 6 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 7自动提醒自动保存数据库对话框 点击 输入数据 按钮 打开 脑血管病人血脂调查表 REC 文件 将数据输入表格 录入完整后 软件会自动提醒进行保存 图15 7 确认保存之后就可以输入下一张表格的数据了 三 数据录入 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 8输出的文本类型数据库 点击 数据输出 按钮 选择 脑血管病人血脂调查表 REC 文件 四 数据输出 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 9输出的Excel数据库 三 使用EpiData建立临床数据录入表 Epidata提供了对字段的进一步设置功能 点击工作过程工具条中 添加核对命令 按钮 仍旧选择 脑血管病人血脂调查表 REC 这个数据文件 同样会出现我们作好的电子表格 这时软件也会自动生成同名的 CHK文件 同时会有一个数据核对窗口 如图15 10 五 优化数据表 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 10数据核对数据库窗口 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 11逻辑值设置窗口 1 Rang Legal 是定义一个字段的数字范围及合理数 例如 我们对 年龄 字段进行设置 输入 50 85 图15 11 三 使用EpiData建立临床数据录入表 Jump 跳转命令 Mustenter 如果当前字段必须输入数据 则需要使用这个规则 选择Yes Epidata的默认选择为No Repeat 如果在编辑表中Repeat选择项中选择 Yes 则前一个记录中的该字段值将自动出现在下一个记录的该字段中 Valuelabel 是将一组具有解释数值意义的文本与数值结合 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 13编辑数据标签窗口 例如 我们对 职业 这个字段进行设置 图15 13 图15 14选择数值窗口 当录入职业时 按F9键 这时会弹出一张转换表 如下 图15 14 三 使用EpiData建立临床数据录入表 图15 15数据核查结果 为了保证数据录入的可靠性 我们可以让两个人分别输入同样的一组调查表数据 Epidata提供了对两个相同数据文件的检查功能 三 使用EpiData建立临床数据录入表 六 如何核查数据文件 第二节SPSS10 01社会医学统计软件包 一 SPSS10 01主要的功能窗口 SPSS10 01主要有3大窗口 数据编辑窗口 DataEditor 结果输出窗口 Viewer 语句编辑窗口 SyntaxEditor 一 SPSS10 01主要的功能窗口 图15 16SPSS主界面窗口 整个数据编辑窗口分为标题栏 菜单栏 工具栏 编辑栏 内容区和状态栏 SPSS程序很大 命令和功能也很多 我们主要介绍菜单栏上的10个菜单命令 见图15 16 一 SPSS数据编辑窗口 一 SPSS10 01主要的功能窗口 SPSS输出窗口是用于展示SPSS的统计分析结果 其菜单命令与数据编辑窗口相似 只是减少了几个菜单项 而另加了一个Insert菜单项 在图形编辑窗口中 可以作图形转换 可存为 spo为后缀的文件 二 SPSS输出窗口 一 SPSS10 01主要的功能窗口 在语句编辑窗口 SPSS过程以命令语句形式出现 该窗口还可以编辑对话框操作不能实现的特殊过程的命令语句 窗口中所有的命令语句最终形成一个命令语句文件 可存为 sps为后缀的文件 三 SPSS语句编辑窗口 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 1 统计描述 Analyze DescriptiveStatistics FrequenciesDescriptivesExploreAnalyze CompareMeans Means这里只简单介绍Frequencies过程和Descriptives过程 一 数值变量资料的统计分析 图15 17描述统计量结果 1 结果如下 1 频数分析 Frequencies 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 18直方图 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 2 对资料进行分组 Transform Recode IntosameVariables3 对已分组资料进行频数分析步骤 输入各组组中值x和频数f 对变量值进行加权 进行Weightcases过程 进行Frequency过程 此步同原始数据资料的操作 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 Descriptives对话框 图15 19 Options对话框 图15 20 2 描述统计 Descriptives 图15 21描述性统计量显示 结果如下 显示描述统计量 见图15 21 2 描述统计 Descriptives 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 Analyze CompareMeans One samplesTTestIndependent samplesTTestPaired samplesTTestOne wayANOVAAnalyze GeneralLinearModel Univariate 2 统计推断 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 例 有83例患者的血小板资料 问患者的血小板与正常人的平均值150 109 L 有无统计学意义 同时估计患者血小板的可信区间 步骤 1 Analyze CompareMeans One samplesTTest 打开对话框 2 把变量血小板转到右边的 TestVariables 栏中 见图15 22 15 23 1 单样本t检验 One SamplesTTest 2 统计推断 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 t检验对话框 图15 22 Options对话框 图15 23 图15 24单样本t检验结果 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 例如有一个189例患者的临床资料 问不同性别之间的收缩压 bp1 舒张压 bp2 分别是否相同 步骤 1 Analyze CompareMeans Independent samplesTTest 把变量bp1 bp2转到 TestVariables 栏中 2 把变量sex转到 GroupingVariable 栏中 激活 DefineGroups 对话框 定义两组的两个值 然后单击ok按钮 返回 见图15 27 2 统计推断 2 成组设计两样本t检验 Independent samplesTTest 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 27两独立样本t检验对话框 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 28两独立样本t检验描述性统计量 3 检验 单击 OK 按钮即可 结果如下 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 29两独立样本t检验结果 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 结果显示 收缩压和舒张压的方差齐性检验的F值分别为0 092和1 118 说明方差齐 收缩压P 0 015 0 05 不同性别间差异有显著性 但不同性别的舒张压差异无显著性 P 0 057 0 05 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 例如有20名患者 按性别和年龄配成10对 随机分到两组 一组服用新药 另一组服用安慰剂 然后观察某实验指标 问新药和安慰剂的疗效有无差别 2 统计推断 3 配对t检验 Paired samplesTTest 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 30配对比较t检验 分析步骤如下 Analyze CompareMeans Paired samplesTTest 打开对话框 从左侧同时选中两个成对变量 转到 PairedVariables 栏中 t检验对话框结果类似单样本t检验 P 0 158 0 05 尚不能说明新药和安慰剂的疗效不同 结果见图15 30 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 例如有一个189例患者的临床资料 问不同意识程度之间的收缩压 bp1 舒张压 bp2 分别是否相同 分析步骤如下 Analyze CompareMeans One wayANOVA 打开对话框 把变量bp1 bp2转到 DependentList 栏 2 统计推断 4 单因素方差分析 One wayANOVA 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 把变量意识程度转到 Factor 栏中 单击 Contrasts 按钮 激活对话框 选择 Polynomial 单击 Continue 按钮返回 单击 PostHoc 按钮 激活对话框 若方差齐时选择Bonferroni两两比较方法 方差不齐时选择Tamhane sT2方法 单击 Continue 按钮返回 单击 Options 按钮 激活对话框 选择Descriptive和Homogeneity of variance选项 单击 Continue 按钮返回 单击 OK 即可 具体见图15 31 15 32 15 33 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 31单因素方差分析对话框图15 32Contrasts对话框 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 结果如下 包括各组变量值的描述统计 图15 34 方差齐性检验 图15 35 从方差分析表中可知 不同意识程度之间的收缩压 舒张压相等 P分别为0 922 0 108 均 0 05 两两比较表省略 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 34一般描述性统计量 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 35方差齐性检验结果 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 例如16只家兔按种属分成4个区组 每个区组中的4只家兔分别在不同室温下 5 10 15 20度 测血糖浓度 问不同室温下家兔的血糖浓度是否相同 步骤 Analyze GeneralLinearModel Univariate 打开对话框 从左侧选中变量 血糖浓度 转到 DependentVariable 栏中 处理因素选入 FixedFactor 栏中 区组因素选入 RandomFactor 栏中 单击 OK 即可 见图15 36 2 统计推断 5 随机区组设计的方差分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 36Univariate对话框 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 37 双因素设计方差分析结果 结果表明不同室温下家兔的血糖浓度不相同 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 1 统计描述 Analyze DescriptiveStatistics FrequenciesCrosstables频数分析 Frequencies 可产生频数表 计算构成比 也可以绘出条图或圆图 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 例 有一组临床病人的资料 观察性别和意识程度情况 步骤 1 Analyze DescriptiveStatistics Frequencies 打开对话框 2 从左侧选中性别和意识程度两变量 转到 Variables 栏中 3 单击 Charts 按钮 打开对话框 选中BarCharts或PieCharts选项 单击 Continue 返回后 单击 OK 即可 见图15 38 图15 39和图15 40 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 38Frequencies对话框 二 分类资料的统计分析 图15 40Charts对话框 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 39format对话框 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 41分类资料描述统计量 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 42分类变量直条图 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 列联表分析 Crosstables 可产生四格表 R C表 计算率或构成比 同时进行 2检验 2检验在SPSS中的过程 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 43分类频数表资料数据库结构 在数据编辑窗口中确定行变量 列变量 频数变量 图15 43 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 必须指定频数变量 Data WeightCases 前面已阐述过 Analyze DescriptiveStatistics Crosstables 打开对话框 把行变量和列变量分别从左侧转到右侧的Rows和Columns栏中 单击 Statistics 按钮 激活对话框 根据不同资料 不同的研究目的 在对话框中选入不同的分析指标 然后单击 Continue 返回后 单击 OK 即可 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 44卡方检验主要对话框 如何在Statistics对话框中选入不同的分析指标 图15 44 二 分类资料的统计分析 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 下面结果里 2 26 066 P 0 000 表明不同喂养方式的婴儿腹泻发生率不同 具体结果见图15 45 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 45卡方检验结果 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 Analyze菜单 NonparametricTests Two Independent SamplesTestsTestsforSeveralIndependentSamplesTwo Related SamplesTestsTestsforSeveralRelatedSamples 三 非参数检验 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 1 成组设计两样本均数比较的非参数检验 Two Independent SamplesTests 如比较两种手术方案患者的生存日数间的比较 假设生存日数呈偏态分布 在 Testtype 复选框组中选中最常用的 Mann WhitneyU 复选框 图15 46 三 非参数检验 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 46成组比较秩和检验对话框 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 47两组比较秩和检验结果 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 2 配对设计两样本均数比较的非参数检验 Two Related SamplesTests 在 Testtype 复选框组中选中最常用的 Wilcoxon 复选框 即配对设计两样本均数比较的秩和检验 结果如下 WilcoxonSignedRanksTest 图15 48 结果中P 0 154 说明两种方法相同 三 非参数检验 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 48配对设计秩和检验结果 三 非参数检验2 配对设计两样本均数比较的非参数检验 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 3 成组设计多样本均数比较的非参数检验 TestsforSeveralIndependentSamples 和区组设计多样本均数比较的非参数检验 TestsforSeveralRelatedSamples 它们的基本对话框分别如下 与方差分析中不同的是 它们不提供多重比较 主要对话框见图15 49 15 50 三 非参数检验 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 49成组设计多样本秩和检验图15 50随机区组设计多样本秩和检验 二 主要统计方法的软件实现及结果解释 图15 51完全随机设计秩和检验主要结果 NParTests主要