磷脂脂肪酸(PLFA)微生物鉴定系统.ppt

全自动微生物鉴定系统Sherlock MicrobialIdentificationSystems 台湾冷泉港生物科技股份有限公司胡栋2010 4 目录 产品原理介绍配置介绍产品优势应用领域 产品原理介绍 Sherlock MicrobialIdentificationSystem全自动微生物鉴定系统 细胞脂肪酸图谱鉴定 Sherlock MIS为美国MIDI公司依据自20世纪60年代以来对微生物细胞脂肪酸的研究经验 开发的一套根据微生物中特定短链脂肪酸 C9 C20 的种类和含量进行鉴定和分析的软件 权威 分获美国CDC 国土安全局和FDA认证 独一无二 唯一脂肪酸微生物鉴定系统产品唯一采用氢气做载气的脂肪酸分析系统 该软件可以操控Agilent公司的6850 7890型气相色谱 通过对气相色谱获得的短链脂肪酸的种类和含量的图谱进行比对 从而快速准确地对微生物种类进行鉴定 生物标记物Biomarker 不饱和脂肪酸蛋白质核酸类脂磷脂多糖etc 生物标记物在不同细菌中的分布谱不同鉴定细菌 生物标记物 脂肪酸 细菌细胞内有300多种脂肪酸成分细菌脂肪酸成分相对稳定Plasmidlossorgain mutationshavenoeffectonfattyacidcomposition细菌脂肪酸易于提取 定性和定量 操作方法 1 MIS主要用来分析及鉴定在人工培养基中纯化培养的微生物 2 Sherlock利用样品的前处理过程和气相色谱分析 GasChromatography 去产生定性及定量脂肪酸再现性成份描述 3 从未知的微生物中萃取出脂肪酸而后自动化的被定量且利用Sherlock的软件来鉴定检测出脂肪酸的成份 脂肪酸鉴定与传统微生物鉴定比较的优势 操作流程 细菌培养 皂化 甲基化 萃取 气相分析 鉴定报告 目录 产品原理及介绍配置介绍产品优势应用领域 MIS系统构成 AgilentTechnologiesgaschromatographs GC MIDImicrobialdatabasesMIDIpatternrecognitionsoftware GC硬件选择 6890 6850 目前6890升级为7890 微生物菌种库 迄今为止微生物鉴定系统中最大的菌库并细分为超过100 000个株型 一步直接鉴定到株型 这是传统方法做不到的 Sherlock microbemethodsandlibraries LIBRARY菌种库 MIS软件选择 汽化管和标准品 Sherlock 6 1Software DataExportTrackerRapidMethodElectronicRecordsandSignatures ERS etc CustomLibraries LibraryGenerationSystem LGS 生产过程中自有菌株的QC迅速鉴定生产过程中的污染物便于与未发表分类学的生物体确立类似性便于收录 编辑培养物 ClusterAnalysis LibraryGenerationSystem LGS DendrogramplotsPrinciplecomponentanalysiswith2 Dplotsandhistograms图表可输出 DENDROGRAM StrainTracking Tracker便于查找污染源跟踪感兴趣菌株迅速确定大型流行病的爆发可以实时 亦可离线操作 DataExport DataExport数据 脂肪酸谱图 与菌种库匹配结果等 EXCEL表格ACCESS数据库 趋势分析自制报告格式批次样品报告微生物POPULATION研究文章发表DATAMINING GC谱图 REPORT Report ResultSummaries InstrumentThroughput shortpreparationautosampler SingleTower 45samplesDualTower 90samples 1 0persample inc reagents gases calibrationstandards glassware andculturemedia 目录 产品原理及介绍配置介绍产品优势应用领域 overBiochemicalTests 脂肪酸成分在细菌中结构 含量十分稳定样品需求量少脂肪酸分析基于种的数据库 定性判断准确 实验周期短 获取结果快 成本低 0 80USD 样本库容量大thestrainlevelversusthespecieslevel Bacillusanthracis Anthrax Brucellamelitensis Brucellosis Burkholderiamallei Glanders Burkholderiapseudomallei Melioidosis Francisellatularensis Tularemia Yersiniapestis Plague 15challengeorganisms Bioterrorismlist 产品优势 最大的菌库 操作简便 微量样品 速度快 精度高 独创21种细菌武器数据库 检测成本低 目标 采取了其它方法进行验证DNA basedidentification菌株溯源2 DPlotclusteringDendrogramclustering 目录 产品原理及介绍配置介绍产品优势应用领域 MIS系统应用领域 灭菌控制 SterilityControl 饮用水及废水 Drinking WasteWater 环境学 Environmental 植物及土壤 PlantandSoil 生态学 bionomics 医学 临床 Medical Clinical 工厂 Industrial 食物 Food 兽医学 Veterinary 经典案例 1 2001年11月在美国成功鉴定炭疽 Bacillusanthracis 病例2 2004年获得AOACOfficialMethodsofAnalysisSM 美国分析化学家组织官方分析法 3 美国联邦调查局 FBI 和美国国家环保署 EPA 用该方法检测可能带有炭疽杆菌的邮件4 军事医学科学院与江苏省疾病控制中心联合用该方法进行了 人源和猪源猪链球菌的同源性研究 环境微生物及水处理应用案例 1 在2000年美国自来水服务公司在研究对比自来水管道网中高BOM和低BOM时细菌生物膜的成分时 就采用MIDI公司的MicrobialIdentificationSystem鉴定了大量的菌群 1 400 文章发表在APPLIEDANDENVIRONMENTALMICROBIOLOGY APilotStudyofBacteriologicalPopulationChangesthroughPotableWaterTreatmentandDistribution 2 2006年浙江大学土水资源与环境研究所采用MIDI公司的MicrobialIdentificationSystem以10种已知菌株为例 对Sherlock微生物鉴定系统 SherlockMIS 的细菌鉴定准确性及培养基 活化时间和取样区域等因素对鉴定结果的影响进行了研究 结果表明该系统对TSBA培养基培养细菌的鉴定准确率很高 文章发表在ACTAPEDOLOGICASINICA 土壤学报 SherlockMIS系统应用于土壤细菌鉴定的研究 3 2005年德国的Coimbra大学应用MIDI公司的MicrobialIdentificationSystem鉴定了采集于2个地理区域的6个不同凿洞的地下水样本中的微生物种类 文章发表在AppliedandEnvironmentalMicrobiology PresenceandPersistenceofLegionellaspp inGroundwater MarineScience Microbiologyofstripedbassgrowninthreeaquaculturesystems FoodMicrobiol14 255 264 Nedoluha P C Westhoff D WaterQualityApilotstudyofbacteriologicalpopulationchangesthroughpotablewatertreatmentanddistribution AppEnvironMicrobiol66 268 276 Norton C D LeChevallier M W Characterizationofbacterialisolatesfromspringsbyfattyacidanalysis Abst95thAnnMtgAmerSocMicrobiolp442 Meldrum J R Stetzenbach L D AppliedandEnvironmentalMicrobiology Diversity persistance andvirulenceofAeromonasstrainsisolatedfromdrinkingwaterdistributionsystemsinSweden AppEnvironMicrobiol63 2708 2715 K hn I Allestam G Huys G Janssen P Kersters K Krovacek K Stenstrom T A Acetogenicandsulfate reducingbacteriainhabitingtherhizoplaneanddeepcortexcellsoftheseagrassHalodulewrightii AppEnvironMicrobiol65 5117 5123 Kusel K Pinkart H C Drake H L Devereux R Sedimentmicrobialcommunitystructureandmercurymethylationinmercury pollutedClearLake California AppEnvironMicrobiol66 1479 1488 Macalady J L Mack E E Nelson D C Scow K M EffectsofpHandoxygenandammoniumconcentrationsonthecommunitystructureofnitrifyingbacteriafromwastewater AppEnvironMicrobiol64 3584 3590 Princic A Mahne I Megusar F Paul E A Tiedje J M WaterResearch Insitupolychlorophenolbioremediationpotentialoftheindigenousbacterialcommunityofborealgroundwater WaterRes35 2496 2504 Mannisto M K Salkinoja Salonen M S Puhakka J A 2001 FEMSMicrobiologyEcology Characterizationoftheculturableeterotrophicbacterialcommunityinasmalleutrophiclake PriestPot FEMSMicrobiolEcol35 295 304 Edwards M L Lilley A K Timms Wilson T H Thompson I P Cooper I 2001 InternationalJournalofSystematicbacteriology Desulfocellahalophilagen nov sp nov ahalophilic fatty acid oxidizing sulfate reducingbacteriumisolatedfromsedimentsoftheGreatSaltLake IntJSystBacteriol49 193 200 Sphingomonasalaskensissp nov adominantbacteriumfromamarineoligotrophicenvironment IntJSystEvolMicrobiol51 73 79 Vancanneyt M Schut F Snauwaert C Goris J Swings J Gottschal J C Halomonasmarisflavaesp nov ahalophilicbacteriumisolatedfromtheYellowSeainKorea IntJSystEvolMicrobiol51 1171 1177 Yoon J H Choi S H Lee K C Kho Y H Kang K H Park Y H InternationalJournalofSystematicandvolutionar