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文档简介
高斯混合模型GMM实现 matlab(1)以下matlab代码实现了高斯混合模型:function Alpha, Mu, Sigma = GMM_EM(Data, Alpha0, Mu0, Sigma0)% EM迭代停止条件loglik_threshold = 1e-10;%初始化参数dim, N = size(Data);M = size(Mu0,2);loglik_old = -realmax;nbStep = 0;Mu = Mu0;Sigma = Sigma0;Alpha = Alpha0;Epsilon = 0.0001;while (nbStep 1200)nbStep = nbStep+1;% E-步骤%for i=1:M% PDF of each pointPxi(:,i) = GaussPDF(Data, Mu(:,i), Sigma(:,:,i);end%计算后验概率beta(i|x)Pix_tmp = repmat(Alpha,N 1).*Pxi;Pix = Pix_tmp ./ (repmat(sum(Pix_tmp,2),1 M)+realmin);Beta = sum(Pix);% M-步骤%for i=1:M%更新权值Alpha(i) = Beta(i) / N;%更新均值Mu(:,i) = Data*Pix(:,i) / Beta(i);%更新方差Data_tmp1 = Data - repmat(Mu(:,i),1,N);Sigma(:,:,i) = (repmat(Pix(:,i),dim, 1) .* Data_tmp1*Data_tmp1) / Beta(i);% Add a tiny variance to avoid numerical instabilitySigma(:,:,i) = Sigma(:,:,i) + 1E-5.*diag(ones(dim,1);end% Stopping criterion 1 %for i=1:M%Compute the new probability p(x|i)%Pxi(:,i) = GaussPDF(Data, Mu(:,i), Sigma(i);%end%Compute the log likelihood%F = Pxi*Alpha;%F(find(Frealmin) = realmin;%loglik = mean(log(F);%Stop the process depending on the increase of the log likelihood%if abs(loglik/loglik_old)-1) loglik_threshold%break;%end%loglik_old = loglik;% Stopping criterion 2 %v = sum(abs(Mu - Mu0), abs(Alpha - Alpha0);s = abs(Sigma-Sigma0);v2 = 0;for i=1:Mv2 = v2 + det(s(:,:,i);endif (sum(v) + v2) Epsilon)break;endMu0 = Mu;Sigma0 = Sigma;Alpha0 = Alpha;endnbStep(2)以下代码根据高斯分布函数计算每组数据的概率密度,被GMM_EM函数所调用function prob = GaussPDF(Data, Mu, Sigma)%根据高斯分布函数计算每组数据的概率密度Probability Density Function (PDF)%输入-%o Data:D x N,N个D维数据%o Mu:D x 1,M个Gauss模型的中心初始值%o Sigma: M x M,每个Gauss模型的方差(假设每个方差矩阵都是对角阵,%即一个数和单位矩阵的乘积)% Outputs -%o prob:1 x N array representing the probabilities for the%N datapoints.dim,N = size(Data);Data = Data - repmat(Mu,N,1);prob = sum(Data*inv(Sigma).*Data, 2);prob = exp(-0.5*prob) / sqrt(2*pi)dim * (abs(det(Sigma)+realmin);(3)以下是演示代码demo1.m%高斯混合模型参数估计示例(基于EM算法)%2010年11月9日data, mu, var, weight = CreateSample(M, dim, N);/生成测试数据Alpha, Mu, Sigma = GMM_EM(Data, Priors, Mu, Sigma)(4)以下是测试数据生成函数,为demo1.m所调用:function data, mu, var, weight = CreateSample(M, dim, N)%生成实验样本集,由M组正态分布的数据构成% % GMM模型的原理就是仅根据数据估计参数:每组正态分布的均值、方差,%以及每个正态分布函数在GMM的权重alpha。%在本函数中,这些参数均为随机生成,%输入%M:高斯函数个数%dim:数据维数%N:数据总个数%返回值%data : dim-by-N,每列为一个数据%miu: dim-by-M,每组样本的均值,由本函数随机生成%var: 1-by-M,均方差,由本函数随机生成%weight: 1-by-M,每组的权值,由本函数随机生成% -%随机生成不同组的方差、均值及权值weight = rand(1,M);weight = weight / norm(weight, 1);%归一化,保证总合为1var = double(mod(int16(rand(1,M)*100),10) + 1);%均方差,取110之间,采用对角矩阵mu = double(round(randn(dim,M)*100);%均值,可以有负数for(i = 1: M)if (i = M)n(i) = floor(N*weight(i);elsen(i) = N - sum(n);endend%以标准高斯分布生成样本值,并平移到各组相应均值和方差start = 0;for (i=1:M
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