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文档简介
药物化学中的氟原子 刘子宁2008年9月 1 目录 1 含有F原子的药物的发展趋势 2 F原子对药物分子的性质的影响 2 F原子取代在药物中的应用举例 3 将F原子引入分子中的方法 2 3 氟原子取代在药物化学中的应用 改变药物的物理化学性质提高代谢稳定性改善药物的作用时间增强药效消除活性代谢中间体 减少与蛋白的共价结合改善胆汁清除率 4 F原子对药物分子的物理化学性质影响 1 对分子酸碱性的影响 F原子有很强的电负性 在酸性或者碱性基团附近取代 会影响基团的酸碱性 在酸性基团 如COOH附近取代 会增强酸性 在碱性基团 如NH2附近取代 会降低碱性 在哌啶环的3 4位F取代也会降低碱性 pKa值 如CH3COOH4 76 CH2FCOOH2 59 CHF2COOH1 24CF3COOH0 23CH3CH2NH210 7 CH2FCH2NH28 97 CHF2CH2NH27 52 CF3CH2NH25 7酸碱性的改变对分子的药物动力学性质和结合能力都会有很大的影响 碱性过强 在跨膜转运过程中出现困难 使得生物利用度降低 有时碱性又是与靶点结合所必须的 两者需要寻找合适的平衡点 5 F原子对药物分子的物理化学性质影响 2 F原子取代对分子亲脂性的影响 使用LogD作为衡量分子亲脂性的指标 LogD是分子在PH 7 4时 在正辛醇和水中的分配系数 一般情况下 分子中一个H被F取代 LogD增加0 25个单位 亲脂性增加 如果在附近有碱性的氮原子 LogD增加的更加明显 但是也有很多例外的例子 当最小能量构象中 在F原子的3 1A内有氧原子 F取代反而会降低亲脂性 6 使用F原子改善代谢稳定性 亲脂性的化合物在肝脏中容易被P450酶系氧化代谢 使得口服生物利用度很低 两种策略 1 提高药物分子的极性 2 使用F原子阻断氧化的位点 利用F原子的小体积的特点 希望能不影响药物分子对靶点的亲和性 7 使用F原子阻断两个易于被氧化的苯环的4位 使得苯环不易被氧化成酚 再经过进一步的结构改造 得到SCH58235 依替米贝 FDA于2004年批准作为降血脂药物上市 8 改善药物作用时间 对R1和R2分别进行F取代和甲基取代 可以提高代谢稳定性 化合物39和40在给药24小时后 作用强度是38的两倍 将两个改造结果结合起来 化合物41 阿瑞吡坦 作为化疗止吐药物由Merck开发上市 9 减少药物半衰期 在COX 2抑制剂的研究过程中 化合物68有过长的半衰期 将F原子用Cl或者甲基取代 缩短了药物的半衰期 10 F取代对药效的影响 F取代对蛋白 配体的亲和力有着显著的影响 F取代一般会增加对蛋白的亲和力 主要是由于F取代引起的亲脂性增加而产生的 是一种非特异性的增加 会有HFClBr取代的亲和力的逐级增加 也有可能是F取代的亲和力最强 1 亲和力增加是由于F原子引起的特异性的极性的相互作用 2 蛋白质的结合位点的空间限制 11 F取代增强药效 43的作用强度是42的5倍 在4位增加一个F原子 得到44 化合物44的作用强度适度的增加 42 44有相近的清除速率 半衰期和最大血药浓度 但是44的口服生物利用度大幅增加 45 50的活性均一般 所以44作为第一个上市的DPP4抑制剂 用于治疗II型糖尿病 在48和49中 由于是未取代的 或者是烷基取代 口服生物利用度都很差 12 消除活性代谢中间体 减少蛋白的共价结合 药物会引起特异性过敏反应 这个问题很难预测 而且会引起很严重的后过 引起特异性过敏反应的原因是药物被氧化代谢 形成活性中间体 与蛋白质共价结合 引起免疫应答 使用F原子取代 可以在一定程度上消除与蛋白的共价结合 13 51是一种大麻素 1受体 CB1R 可逆激动剂 但是蛋白结合律高 口服生物利用度低 是由于存在富电子的苯氧基团 很容易被代谢氧化 通过连接两个氟原子 降低电子云密度 各个药效均提高两倍左右 使用三氟甲基吡啶 进一步提高药效 降低蛋白结合 提高生物利用度 化合物55Taranabant是Merck开发的减肥药物 正在进行后期的临床试验 14 减少药物从胆汁清除 化合物56稳定性好 在肝脏微粒体中不易被代谢 但是在胆汁中有大量的原型药物被排出 意味着在血循环到胆汁中存在着活化转运作用 使用F原子取代 药物在肝微粒体中的稳定性降低 但是降低了胆汁的清除速率 使半衰期延长 使用甲磺酰基代替乙酰基 得到化合物58Laropiprant 但是这个药物没有被FDA批准 15 使用三氟乙胺代替酰胺键 寡肽在药物研究中常常作为先导化合物来研究 可以使用三氟乙胺基来代替肽键 组织蛋白酶K是一种半胱氨酸蛋白酶 与骨吸收过程中的胶原蛋白降解相关 很多蛋白酶抑制剂都含有一个氰基 与半胱氨酸的活性位点发生亲电作用 使用三氟乙基替换60 得到一个活性更强的化合物59 但是在环状结构中 使用三氟乙基替换62 得到的61活性下降 最后进一步开发的化合物是63 16 F原子位置扫描 在凝血酶抑制剂的研究中 一方面是对凝血酶的抑制强度 另一方面是对胰蛋白酶的选择性 17 制备F原子取代分子的方法 18 常用的F取代方法 使用含氟的试剂 如F2 HF直接形成C F键 存在的主要问题是 难于操作 需要特殊设备 选择性也较差 使用含有F原子的小分子砌块 主要问题是F取代会引起异常的反应性能 19 氧化脱硫氟化法 使用亲核试剂 如HF HF水溶液 四氟化硫 SF4 DAST等 反应活性非常高 但很敏感 而且毒性大 使用氧化脱硫氟化法可以避免这些问题 20 三氟甲基的合成方法 21 在不饱和键上形成三氟甲基的方法 形成偕二氟取代的方法 22 合成三氟甲酯的方法 23
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