化学信息学第一讲FGQ.ppt

2020 3 26 1 化学与生物信息学 化学学院农药与化学生物学教育部重点实验室 冯国强 2 中国科学院化学研究所博士 先后在英国谢菲尔德大学 剑桥大学 利兹大学从事过博士后研究 现任华师化学学院教授 博导 gf256 冯国强 个人介绍 办公室 化学楼540实验室 化学楼530 532 3 21世纪是信息的时代 如果我们把 检索工具 比作知识的宝库 那么 文献检索 就是打开知识宝库的一把钥匙 科技改变了我们获取信息的方式 4 据美国科学基金会统计 一个科学研究人员花费在查找和消化学术资料上的时间需占全部科研时间的51 计划思考占8 实验研究占32 书面总结占9 美国科学基金会NSF NationalScienceFoundation 总结写报告9 5 科研工作中与信息相关的问题 如何在海量的信息中快速检索到相关的 高质量的信息 如何有效地分析目前的研究进展并确定新的研究方向 如何及时跟踪某研究方向的最新进展 如何有序管理所检索到的大量文献 如何迅速提高论文写作的效率 如何全面了解所发表论文及其期刊的影响力确定投稿方向 信息检索贯串整个科研过程 6 如何获取我们所需要的信息 Aretheseenough NO 7 这门课你将学到 化学文献基础知识如何检索文献 重点 Chemicalinformatics 欢迎步入化学信息学 8 是一门应用信息学方法解决化学问题的学科 Cheminformatics ChemicalInformatics Themixingofinformationresourcestotransformdataintoinformation andinformationintoknowledge Brown1998 Agenerictermthatencompassesthedesign creation organization management retrieval analysis dissemination visualisation anduseofchemicalinformationintoknowledge Paris2000 以化学 化工 计算机与信息技术为基础的边缘学科 它涉及化学化工信息的获取 管理 处理与控制 计算推演与模拟和图形表示的技术与方法 什么是化学信息学 9 化学 化工文献学文献信息检索个人资料管理 化学知识体系的计算机表示 管理与网络传输化学结构 化学反应的计算机表示 化学数据库技术化学信息的网际通讯语言 化学图形化学信息可视化和虚拟技术 化工制图 涵盖六个方面的内容 化学信息学领域范围 10 化学信息学领域范围 化学信息的解析与处理化学实验设计 实验数据处理 图谱分辨与解析生物分子的信息解析 多元分析和数据挖掘技术 化学知识的计算机推演结构与性质关系 分子及其聚集体系的计算机计算与模拟 分子与材料设计 化学反应分析与设计 化工过程计算与模仿 化学教育与教学的现代技术与远程信息资源 11 课程目的 熟练使用检索工具 快速检索信息资源 充分利用信息资源 有效识别信息资源 课程安排 9周 课堂讲授与讨论上机实践与练习 12 考核 教材 参考书 13 第一章科技文献基础知识 科技文献的基本常识 继承功能 传递交流功能 文献的属性 知识性 记录性 物质性 文献的级别 一次文献 二次文献 三次文献 文献的功能 文献是记录知识内容的信息集合体 是人类进步和发展的经验总结 是科技情报的源泉 14 书目 题录索引 文摘 词典 名录指南 手册 年鉴 评述 论文丛集百科全书 二次文献 原始文献 一次文献 三次文献 文献整理 重组 浓缩 检索工具 参考性文献 文献结构示意图 15 文献的分类 科技期刊科技图书专利文献科技报告会议文献 学位论文技术标准产品资料电子出版物 16 文献数量迅猛增加 现代化学文献特点 17 文献种类繁多 形式多样类型 图书 期刊杂志 科技报告 学位论文 会议资料文献载体 印刷型 缩微型 机读型文献性质 一次文献 二次文献 三次文献 电子文献与网络检索普及化学数据库 Scifinder Reaxys ISIWebofKnowledge等 全文数据库 ACS RSC Elsevier WileyInterScience数据库 18 科技文献的检索方法 科技文献的检索途径 著者途径序号途径分类途径其它途径 如著作目录 作者索引等 如标准号索引 登记号索引等 如分类目录 分类索引等 如分子式索引 书名索引等 19 查阅科技文献的基本原则 科技文献的检索方法 1 掌握部分文献检索工具 目录 题录与摘要索引 述评与文摘指南几种重要的数据库几种检索性期刊利用www与计算机文献检索系统参考工具书 20 科技文献的检索方法 2 确定跟踪浏览的重要期刊 权威性刊物 如J Am Chem Soc 有关专业刊物 如J Org Chem 消息性刊物 如C ENews ScienceNews科普性刊物 如ScientificAmerican 3 阅读文献时注意参考文献的引证 21 Top化学杂志 NatureIF 36 28ScienceIF 31 201NatureChem IF 20 524Angew Chem Int Ed IF 13 455J Am Chem Soc IF 9 907Chem Comm IF 6 169Chem Sci IF 7 525 Chem Rev IF 40 197AccountsChem Res IF 21 64Chem Soc Rev IF 28 76 2011年影响因子 22 文献的检索方法 1 直接法 从浏览原始文献中直接查出与课题相关的文献线索 依据文献线索查原始文献 2 追溯法 依据文献所附的参考文献为线索查找文献的方法 3 工具法 利用文摘和索引等检索工具进行检索 23 2012 CitedReferences 2000 1998 2001 1993 2010 TimesCited RelatedRecords 2004 1999 2002 1994 2009 Citing 2011 从一篇高质量的文献出发沿着科学研究的发展道路 TimesCited越查越新 CitedReferences越查越旧 RelatedRecords相同参考文献或同时被引用的文献 越查越深 24 第二章科学研究方法和科技论文写作 一 科学研究的方法 1 科研课题的选题 要具有创新性和先进性要注意实际性要考虑科学上的可行性要抓住关键性的时机 1 选题原则 25 历史和现状的调查实地考察文献调查资料的整理研究方案的制定 2 调查研究 26 科研实验中的基本步骤 1 理论准备 2 实验方案的设计与制定 3 实验器材与原料的准备 4 实验过程中的观察与记录 5 实验结果的整理与数据的分析评价 6 实验报告 二 科技论文的写作与参考文献的引证 摘要 标题 作者 引言 参考文献 结果 28 讨论 结论 致谢 附加材料 实验方法 29 1 科技论文的写作 1 标题 2 摘要 3 引言 4 实验方法 5 结果与讨论 6 结论 7 致谢 8 参考文献 9 附加信息材料 1 引证原则 及时性 珍贵性 准确 相关性 2 引用格式 不同杂志要求不同 关注每种杂志的投稿须知 2 参考文献的引证 30 1 请从网上查阅你感兴趣