计算机模拟技术在动物遗传育种研究中的应用ppt课件.ppt

计算机模拟技术在动物遗传育种研究中的应用 E mail 一 常规育种方案的模拟 1 系统假设 考虑单个性状其遗传受多基因控制 且在选择过程中不发生基因突变 2 参数设置 群体规模50 100 200公母比例1 4 1 9 1 24性状遗传力0 1 0 3 0 6选择世代15代 3 个体育种值估计方法 动物模型BLUP模型 4 选择方案的模拟 不同群体规模下的遗传进展群体规模越大 选择所能获得的遗传进展也越大 不同公母比例下的遗传进展短期选择时 适当降低公畜比例 可获得理想的遗传进展 而长期选择时 则应保证足够的公畜数 不同遗传力水平下的遗传进展选择性状的遗传力越高 遗传进展也越大 不同群体规模下的遗传方差变化情况 不同公母比例下的遗传方差变化情况 不同遗传力水平下的遗传方差变化情况 不同群体规模下的近交系数变化情况 1 502 1003 200 不同公母比例下的近交系数变化情况 1 1 42 1 93 1 24 不同遗传力水平下的近交系数变化情况 1 0 12 0 33 0 6 二 动物QTL定位模拟 1 参数设置 系统假定 一条总长度为100cM的染色体上存在1个影响目标数量性状的QTLQTL有2个等位基因染色体上的标记均匀分布 且标记间的重组相互独立 2 实验设计与定位方法 资源群体 F2设计 BC1设计 QTL定位方法 最大似然区间定位 3 因素水平设置 4计算机模拟方案 结果I 不同群体规模下的QTL定位效果 QTL检测效率与位置估计 扩大资源群体规模 可提高QTL的检测效率及定位的精确性和准确性当群体规模增加到一定数量 300 后 继续扩大群体对提高QTL定位精确性的效益将逐渐降低 结果I 不同群体规模下的QTL定位效果 QTL效应估计 资源群体规模过小 低于100 QTL效应估计的偏差增大 精确性降低适当扩大资源群体规模对提高QTL效应估计的准确性和精确性有益 结果 不同遗传力水平下的QTL定位效果 QTL检测效率与位置估计 性状遗传力过低 QTL的检测效率降低 h2 0 1 P 5 100 随着目标性状遗传力的升高 QTL位置估计的准确性和精确性也提高 结果 不同遗传力水平下的QTL定位效果 QTL效应估计 对不同遗传力的性状实施QTL定位 QTL效应估计的偏差及MSE有所波动 但未呈现出随遗传力变化的明显规律 结果 不同标记密度下的QTL定位效果 QTL检测效率与位置估计 未发现标记密度对QTL检测效率有明显影响在一定范围内 20 5cM 提高标记密度 可提高QTL定位的准确性和精确性 但当标记密度超过这一范围后 继续增加标记密度 则无助于QTL定位效果的改善 结果 不同标记密度下的QTL定位效果 QTL效应估计 在一定范围 20 5cM 内 提高标记密度 QTL效应估计的精确性提高 但当相邻标记间的图距进一步缩小时 则QTL效应估计的精确性则反而会降低 三 标记辅助选择方案的模拟 1 系统假设 一个闭锁群体 对单个性状连续选择10代 世代不重叠 性状的遗传受多基因和一个位于常染色体上的QTL的共同控制 1 系统假设 QTL座位有两个等位基因 Q1 Q2 每个标记座位共有5个等位基因 2 个体育种值估计方法 动物模型MBLUP 3 参数设置 群体规模60 120 180 公母比例1 5 1 9 1 19 性状遗传力0 10 0 25 0 50 0 80 QTL方差0 25 G2 QTL增效基因初始频率0 1 0 5 0 9 相邻标记间距5cM 选择世代10代 4 选择方案的模拟 产生0世代个体标记 QTL基因型和性状表型值 结果I 群体规模对MAS选择效果的影响 总育种值 结果I 群体规模对MAS选择效果的影响 多基因育种值 结果I 群体规模对MAS选择效果的影响 QTL育种值 结果 性别比例对MAS选择效果的影响 总育种值 结果 性别比例对MAS选择效果的影响 多基因育种值 结果 性别比例对MAS选择效果的影响 QTL育种值 结果 遗传力对MAS选择效果的影响 总育种值 结果 遗传力对MAS选择效果的影响 多基因育种值 结果 遗传力对MAS选择效果的影响 QTL育种值 结果 QTL增效基因初始频率对MAS选择效果的影响 总育种值 结果 QTL增效基因初始频率对MAS选择效果的影响 多基因育