各种标签Tag的核苷酸与氨基酸序列

V5 tag 5 GGT AAG CCT ATC CCT AAC CCT CTC CTC GGT CTC GAT TCT ACG 3 G K P I P N P L L G L D S T 6 X His tag CAT CAT CAC CAT CAC CAT H H H H H H S tag AAA GAA ACC GCT GCT GCT AAA TTC GAA CGC CAG CAC A TG GAC A GC Flag Tag GAT TAC AAG GAT GAC GAC GAT AAG D Y K D D D D K KETAAAKFERQHMDS Myc Tag GAG CAG AAA CTC ATC TCT GAA GAG GAT CTG E Q K L I S E E D L HA Tag TAC CCA TAC GAC GTC CCA GAC TAC GCT Y P Y D V P D Y A VSV G TATACAGACATAGAGATGAACCGACTTGGAAAG Thrombin recognises the consensus sequence Leu Val Pro Arg Gly Ser Sequence CTG GTT CCG CGT GGA TCC 重组蛋白表达技术现已经广泛应用于生物学各个具体领域 特别是体内功能研究和蛋白质 的大规模生产都需要应用重组蛋白表达载体 美国 GeneCopoeia 的蛋白表达载体按照表达宿主的不同新推出 3 类 分别为表达宿主为 大肠杆菌 哺乳动物细胞的 以及慢病毒载体 宿主可以为哺乳动物细胞和原代细胞 除了必要的复制和筛选的元件 协助表达和翻译的元件外 本文将各类载体分别按照功能 标签的不同确定种类并将个标签的功能初步介绍如下 His6 His6 是指六个组氨酸残基组成的融合标签 可插入在目的蛋白的 C 末端或 N 末端 当某 一个标签的使用 一是能构成表位利于纯化和检测 二是构成独特的结构特征 结合配体 利于纯化 组氨酸残基侧链与固态的镍有强烈的吸引力 可用于固定化金属螯合层析 IMAC 对重组蛋白进行分离纯化 使用 His tag 有下面优点 1 标签的分子量小 只有 0 84KD 而 GST 和蛋白 A 分别为 26KD 和 30KD 一般 不影响目标蛋白的功能 2 His 标签融合蛋白可以在非离子型表面活性剂存在的条件下或变性条件下纯化 前者在 纯化疏水性强的蛋白得到应用 后者在纯化包涵体蛋白时特别有用 用高浓度的变性剂溶 解后通过金属螯和亲和层析去除杂蛋白 使复性不受其它蛋白的干扰 或进行金属螯和亲 和层析复性 3 His 标签融合蛋白也被用于蛋白质 蛋白质 蛋白质 DNA 相互作用研究 4 His 标签免疫原性相对较低 可将纯化的蛋白直接注射动物进行免疫制备抗体 5 可应用于多种表达系统 纯化的条件温和 6 可以和其它的亲和标签一起构建双亲和标签 Flag Flag 标签蛋白为编码 8 个氨基酸的亲水性多肽 DYKDDDDK 同时载体中构建的 Kozak 序列使得带有 FLAG 的融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高 FLAG 作为标签蛋白 其融合表达目的蛋白后具有以下优点 1 FLAG 作为融合表达标签 其通常不会与目的蛋白相互作用并且通常不会影响目的蛋白 的功能 性质 这样就有利用研究人员对融合蛋白进行下游研究 2 融合 FLAG 的目的蛋白 可以直接通过 FLAG 进行亲和层析 此层析为非变性纯化 可 以纯化有活性的融合蛋白 并且纯化效率高 3 FLAG 作为标签蛋白 其可以被抗 FLAG 的抗体识别 这样就方便通过 Western Blot ELISA 等方法对含有 FLAG 的融合蛋白进行检测 鉴定 4 融合在 N 端的 FLAG 其可以被肠激酶切除 DDDK 从而得到特异的目的蛋白 因 此现 FLAG 标签已广泛的应用于蛋白表达 纯化 鉴定 功能研究及其蛋白相互作用等相 关领域 MBP MBP 麦芽糖结合蛋白 标签蛋白大小为 40kDa 由大肠杆菌 K12 的 malE 基因编码 MBP 可增加在细菌中过量表达的融合蛋白的溶解性 尤其是真核蛋白 MBP 标签可通过 免疫分析很方便地检测 有必要用位点专一的蛋白酶切割标签 如果蛋白在细菌中表达 MBP 可以融合在蛋白的 N 端或 C 端 纯化 融合蛋白可通过交联淀粉亲和层析一步纯化 结合的融合蛋白可用 10mM 麦芽糖 在生理缓冲液中进行洗脱 结合亲和力在微摩尔范围 一些融合蛋白在 0 2 Triton X 100 或 0 25 Tween 20 存在下不能有效结合 而其他融合蛋白则不受影响 缓冲条 件为 pH7 0 到 8 5 盐浓度可高达 1M 但不能使用变性剂 如果要去除 MBP 融合部分 可用位点特异性蛋白酶切除 检测 可用 MBP 抗体或表达的目的蛋白特异性抗体检测 GST GST 谷胱甘肽巯基转移酶 标签蛋白本身是一个在解毒过程中起到重要作用的转移酶 它 的天然大小为 26KD 将它应用在原核表达的原因大致有两个 一个是因为它是一个高度 可溶的蛋白 希望可以利用它增加外源蛋白的可溶性 另一个是它可以在大肠杆菌中大量 表达 起到提高表达量的作用 GST 融合表达系统广泛应用于各种融合蛋白的表达 可以 在大肠杆菌和酵母菌等宿主细胞中表达 结合的融合蛋白在非变性条件下用 10mM 还原 型谷胱甘肽洗脱 在大多数情况下 融合蛋白在水溶液中是可溶的 并形成二体 GST 标 签可用酶学分析或免疫分析很方便的检测 标签有助于保护重组蛋白免受胞外蛋白酶的降 解并提高其稳定性 在大多数情况下 GST 融合蛋白是完全或部分可溶的 纯化 该表达系统表达的 GST 标签蛋白可直接从细菌裂解液中利用含有还原型谷胱甘肽 琼脂糖凝胶 Glutathionesepharose 亲和树脂进行纯化 GST 标签蛋白可在温和 非变 性条件下洗脱 因此保留了蛋白的抗原性和生物活性 GST 在变性条件下会失去对谷胱甘 肽树脂的结合能力 因此不能在纯化缓冲液中加入强变性剂如 盐酸胍或尿素等 如果要去除 GST 融合部分 可用位点特异性蛋白酶切除 检测 可用 GST 抗体或表达的目的蛋白特异性抗体检测 HA HA 标签蛋白 标签序列 YPYDVPDYA 源于流感病毒的红细胞凝集素表面抗原决定簇 9 个氨基酸 对外源靶蛋白的空间结构影响小 容易构建成标签蛋白融合到 N 端或者 C 端 易于用 Anti HA 抗体检测和 ELISA 检测 c Myc C Myc 标签蛋白 是一个含 11 个氨基酸的小标签 标签序列 Glu Gln Lys Leu Ile Ser Glu Glu Asp Leu 这 11 个氨基酸作为抗原表位表达在不同的蛋白质框架中仍可 识别其相应抗体 C Myc tag 已成功应用在 Western blot 杂交技术 免疫沉淀和流式 细胞计量术中 可用于检测重组蛋白质在靶细胞中的表达 eGFP eCFP eYFP mCherry 分别是增强型绿色荧光蛋白 增强型黄绿色荧光蛋白 增强型黄绿色荧光蛋白 单体红色荧 光蛋白 具有不同的激发波长发射波长为 均由野生型荧光蛋白通过氨基酸突变和密码子优 化而来 就 eGFP 而言 相对于 GFP 其荧光强度更强 荧光性质更稳定 同时载体中构 建的 Kozak 序列使得含有 eGFP 的融合蛋白在真核表达系统中表达效率更高 mCherry 是从 DsRed 演化来的性能最好的一个单体红色荧光蛋白 可以和 GFP 系列荧光蛋白共用 实现多色标记体内 外实验表明 mCherry 在 N 端和 C 端融合外源蛋白时 荧光蛋白活 性和被融合的目标蛋白功能相互没有明显影响 这些荧光标签蛋白 其融合表达目的蛋白后具有以下优点 1 不用破碎组织细胞和不加任何底物 直接通过荧光显微镜就能在活细胞中发出绿色荧光 实时显示目的基因的表达情况 而且荧光性质稳定 被誉为活细胞探针 2 其自发荧光 不需用目的基因的抗体或原位杂交技术就可推知目的基因在细胞中的定位 等情况 3 同时细胞内的其它产物不会干扰标签蛋白检测 从而使其检测更显得快速 简便 灵敏 度高而且重现性 4 其低消耗 高灵敏度检测 十分适用于高通量的药物筛选 因此现 eGFP 表达标签被广 泛地应用于基团表达调控 转基因功能研究 蛋白在细胞中的功能定位 迁移变化及药物 筛选等方面 5 mCherry 红色荧光蛋白在标记病毒颗粒 研究病毒和宿主细胞之间更有得天独厚的优 势 如用 mRFP 或 mCherry 标记 HIV 病毒颗粒 研究 H1V 和宿主细胞问的相互作用 以及 HIV 侵染宿主细胞的过程 用 mRFP 标记慢病毒颗粒 研究慢病毒在小鼠体内的复 制过程等 荧荧光素光素酶酶 来源于生物体内的荧光素 常见的有萤火虫荧光素酶 海肾荧光素酶和 Guassia 荧光素酶 这些荧光素酶作为 报告蛋白 被用于分子生物学研究中 这种技术被称为报告基因检测法 或萤光素酶检测法 Luciferase Assay 跟普通融合蛋白标签不同 使用荧光素酶构建 的报告基因可用作目的基因的定量分析 因此常用于研究启动子 miRNA 3 UTR 克隆的 功能与调控 因为它们对目的基因的调控可以是渐变的 而不是简单的开和关两种状态 优点 灵敏度高 检测幅度宽 不是哺乳动物细胞内源性基因 重复性好 与 HTS 兼容 等 萤火虫和海肾荧光素酶已经被广泛应用于协同报告并进行均一化研究 由于它们都是 快速 容易和高灵敏的监测方法 而且萤火虫和海肾荧光素酶是理想的双基因报告系统 因为它们来源于不同的生物进化方向 蛋白结构和底物差异都很大 在实验中不会产生相 互影响 基于荧光素酶的特性 我司研发提供的 Secrete Pair Dual Luminescence Assay Kit 可用于分析双报告系统中 Gaussia 荧光素酶 GLuc 和分泌型碱性磷酸酶 SEAP 活性 GLuc 和 SEAP 均为分泌型报告蛋白 无需裂解细胞即可便捷的从细胞培养液中取得样本 并对实验结果进行精准的实时分析 Avi Tag AviTag 标签蛋白是一个 15 个氨基酸的短肽 具有一个单生物素化赖氨酸位点 与已知 天然可生物素化序列完全不同 可以加在目标蛋白的 N 端和 C 端 融合表达后 可被生物 素连接酶生物素化 为了纯化重组蛋白选用低亲和性的单体抗生物素蛋白或抗生物素蛋白 衍生物 除了用于蛋白质分离纯化 还用于蛋白质相互作用研究 Avi Tag 标签系统具有以下几大优点 1 无论在体外或者体内 几乎所有的蛋白都可以在一个独特的 Avi Tag 位点轻易且有效地 被生物素化 2 生物素化是通过酶和底物的反应来实现 反应条件相当温和而且标记的专一性极高 3 生物素 AviTag 只有 15 个氨基酸 对蛋白空间结构的影响非常小 SNAP Tag SNAP Tag 是新一代的蛋白标签技术 不仅专一性极高而且稳定 最大的优点是适用于 多种环境下的蛋白质检测与纯化 如活细胞内 溶液中 或固态相 如 SDS PAGE gels 等 SNAP Tag 是从人的 O6 甲基鸟嘌呤 DNA 甲基转移 O6 alkylguanine DNA alkyltransferase 获得 无论体内还是体外 SNAP Tag 都能与底物高特异性地共价 结合 使蛋白标记上生物素或荧光基团 如荧光素和若丹明 SNAP 所带的活性巯基位 点接受了苯甲基鸟嘌呤所携带的侧链苯甲基基团 释放出了鸟嘌呤 这种新的硫醚键共价 结合使 SNAP 所带的目的蛋白携带上了苯甲基基团所带的标记物 苯甲基鸟嘌呤在生化条 件下稳定 并且没有其他蛋白会和这类物质作用 所以 SNAP 标签反应是高特异的 检测检测 生物素或各种颜色荧光的底物 如荧光素 若丹明 可渗透进入细胞 方便快捷地 进行活细胞内 SNAP Tag 融合蛋白的标记与检测 它们也可特异性地标记大肠杆菌 酵 母和哺乳动物等细胞抽提液或已经纯化的蛋白液中的 SNAP tag 融合蛋白 将纯化的或未纯化的 SNAP Tag 融合蛋白与表面固定了苯甲基鸟嘌呤的基质混合 蛋白 即可特异与底物作用 形成共价键 融合蛋白间接被固定在了基质表面上 可以达到更方 便快捷地研究蛋白功能或纯化蛋白的目的 Halo Tag HaloTag 标签蛋白是一种脱卤素酶的遗传修饰衍生物 可与多种合成的 HaloTag 配基有 效地共价结合 这个分子量为 33KDa 的单体蛋白能融合在重组蛋白的 N 端或 C 端 并 在原核和真核系统中表达 HaloTag 配基是小分子化学物 能够在体外或体内与 HaloTag 蛋白共价结合 这些配基 由两个关键组分组成 1 一个通用的 HaloTag 反应联结子 结合 HaloTag 蛋白 2 一个功能基团 例如荧光染料或亲和媒介 能够共价和特异性结合多种合成的报告基团和亲和配基的特性 使得 HaloTag 蛋白能够 用于检测和亲和结合或固相化固定目的蛋白 SUMO SUMO 标签蛋白是一种小分子泛素样修饰蛋白 Small ubiquitin likemodifier 是 泛素 ubiquitin 类多肽链超家族的重要成员之一 在一级结构上 SUMO 与泛素只有 18 的 同源性